阿尔茨海默症模型小鼠全脑Aβ斑块及其周围结构的全景图
在全脑范围同时获取多种结构的高分辨图谱,对于剖析脑功能及阿尔茨海默症(AD)等神经系统疾病的发病机制具有重要意义。当前,已有的成像技术和方法在实现大尺度、高分辨率的多种脑结构元素同步成像方面,面临挑战。近日,中国科学院上海药物研究所MOST与图像融合技术服务部在Frontiers in Neuroscience上,发表了题为High-Resolution Digital Panorama of Multiple Structures in Whole Brain of Alzheimer's Disease Mice的研究论文。该研究基于显微光学切片断层成像(Micro-Optical Sectioning Tomography,MOST)系统获得的全脑Nissl染色数据集,设计了针对相邻灰度区间内多种结构元素的信息提取及重建策略,首次实现了基于Nissl染色的小鼠全脑Aβ斑块分布可视化,在同一小鼠全脑中构建了Aβ斑块及......阅读全文
绘制全细胞神经介观图谱的光学多层干涉断层成像
大脑的神经回路是极其复杂的网络,包含数十亿个神经元细胞,这些细胞间又存在着数以百亿计的连接。如果只了解其中单个分子或单个神经细胞的工作机理而不了解多个神经元细胞之间连接之后的网络结构和集体行为方式,则无法理解大脑复杂且高等的功能行为,也无法解释很多脑部疾病的致病机理。目前成像技术众多,但仍然缺乏
一种绘制全细胞神经介观图谱的光学多层干涉成像方法
大脑的神经回路是极其复杂的网络,包含数十亿个神经元细胞,这些细胞间又存在着数以百亿计的连接。如果只了解其中单个分子或单个神经细胞的工作机理而不了解多个神经元细胞之间连接之后的网络结构和集体行为方式,则无法理解大脑复杂且高等的功能行为,也无法解释很多脑部疾病的致病机理。目前成像技术众多,但仍然缺乏
科学家解析小鼠海马单神经元全脑投射规律
2月2日,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心联合华中科技大学苏州脑空间信息研究院、海南大学、中国科学院昆明动物研究所、临港实验室、上海脑科学与类脑研究中心等,在《科学》(Science)上在线发表了题为Whole-brain spatial organization of hippocampal
高分辨质谱到底“高”在哪里?
高分辨质谱 用低分辨质谱测定时,分子的质量数都是整数表示,如CO、N2、C2H4和CH2N的质量都是28。如果用高分辨质谱测定就能得到如C2H4=28.031299,CH2N=28.018723,因此,根据高分辨质谱所测得的精密质量就可以对结构加以剖析和区别 小分子化合物确定结构式有多种方法
Immune-Cell-Atlas-数据集包含哪些细胞类型
Immune Cell Atlas 数据集通常包含多种免疫细胞类型,常见的有: 1.T 细胞:如 CD4+ T 细胞(包括 Th1、Th2、Th17 等亚型)、CD8+ T 细胞、调节性 T 细胞等。 2. B 细胞:包括初始 B 细胞、记忆 B 细胞、浆细胞等。 3. 自然杀伤(NK)细胞。 4.
单细胞测序基准数据集有哪些特点?
单细胞测序基准数据集通常具有以下特点:高质量和准确性:数据经过严格的质量控制和处理,具有较低的噪声和错误率,以确保分析结果的可靠性。多样性:涵盖多种细胞类型、组织来源和实验条件,能够全面评估分析方法在不同情况下的性能。标注详细:包括已知的细胞类型、标记基因、细胞状态等信息,为评估分析结果的准确性提供
Immune-Cell-Atlas-基准数据集有哪些优势?
Immune Cell Atlas 基准数据集具有以下几个显著的优势: 1. 细胞类型的全面性 - 涵盖了众多不同类型和亚型的免疫细胞,为研究免疫细胞的多样性和异质性提供了丰富的资源。 2. 大规模和系统性 - 包含了大量的样本和细胞数据,使得研究结果更具代表性和普遍性,能够
最大活跃DNA转座子数据集构建
DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。记者6月24日获悉,中国科学院动物研究所研究员张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模DNA转座子活性筛选,构建了目前最大活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果日前在线发表于《细胞》杂志。DNA转座子约占人类基
中国最新最完整蛇类特征数据集出炉
截至2023年1月,中国共记录312种蛇类,是世界上蛇类多样性最丰富的国家之一。物种特征决定其在环境中的生存能力,在进化生物学、生态学和保护生物学研究中具有重要作用。但是,目前还没有关于我国蛇类形态学、生活史和生态学等特征的完整数据库。日前,《生物多样性》杂志发表了目前中国最新、最完整的蛇类特征
最大活跃DNA转座子数据集构建
科技日报讯 (记者陆成宽)DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。记者6月24日获悉,中国科学院动物研究所研究员张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模DNA转座子活性筛选,构建了目前最大活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果日前在线发表于《细胞》杂
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
单细胞测序基准数据集的选择标准
选择单细胞测序基准数据集的标准通常包括以下几个方面: 1. 数据质量和可靠性 - 低噪声、低错误率,经过严格的质量控制步骤,例如对低质量细胞的有效过滤。 2. 代表性 - 涵盖广泛的细胞类型、组织和生理/病理状态,能够代表常见的研究场景和问题。 3. 标注完整性和准确性
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
Immune-Cell-Atlas-数据集的规模有多大?
Immune Cell Atlas 数据集的规模会随着研究的进展和数据的不断更新而有所变化。 一般来说,它可能包含数万个甚至数十万个单细胞的数据,涵盖了来自不同个体、组织、疾病状态和实验条件的免疫细胞样本。 然而,确切的规模需要参考最新的、权威的相关研究和数据库发布的信息。
助力研究脑疾病-中国科研人员建立了海马“数据库”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517144.shtm中新网上海2月2日电(记者 郑莹莹)海马脑区(又称:海马)是脑科学研究当中最受关注的脑区之一。在人类大脑中,这个脑区外形酷似海洋生物海马,因而被称为海马脑区。海马神经环路的异常和病变是
我国首次举办国际脑图谱学会科学年会
第18届国际脑图谱学会科学年会6月10日在北京国家会议中心开幕,这是我国首次承办该年会,由北京大学具体承办。 年会将持续到14日结束,近2500名来自世界各知名大学和研究机构的脑图谱与相关交叉领域的专家学者齐聚一堂,深入讨论人类脑功能研究领域的最新科研成果。 国际脑图谱学会成立于1
绘制全细胞神经介观图谱的光学多层干涉断层成像方法
大脑的神经回路是极其复杂的网络,包含数十亿个神经元细胞,这些细胞间又存在着数以百亿计的连接。如果只了解其中单个分子或单个神经细胞的工作机理而不了解多个神经元细胞之间连接之后的网络结构和集体行为方式,则无法理解大脑复杂且高等的功能行为,也无法解释很多脑部疾病的致病机理。目前成像技术众多,但仍然缺乏
“科学高光故事集”短视频征集活动启动
由中国科协网、科学网联合抖音发起的“科学高光故事集”短视频征集活动于日前正式启动。本次活动面向社会公众,广泛征集科学家及科学故事相关短视频。视频要求以“科学高光故事集”为主题,或用故事的方式来科普,讲述科学故事,或聚焦科技工作者,展现新时代科学家精神。本次活动将选取60个精彩作品入围,入围作品将入选
Cell:科学家绘制果蝇全脑神经图谱
神经系统科学的一个主要任务就是了解大脑神经元与特定行为间的联系。在一项新的研究中,研究人员使用计算机视觉和机器学习技术,构建出一个大型的全脑神经图谱数据库。这些全脑神经图谱揭示了激活成年果蝇中的一部分神经元的行为影响。相关论文近日发表于《细胞》杂志。 “该研究的终极目标是将神经元回路与特定的行
草鱼全基因组序列图谱绘制完成
近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一
牡蛎全基因组序列图谱绘制完成
牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物 牡蛎养殖 近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,
如何使用-Biostars-进行关于-Immune-Cell-Atlas-数据集的数据偏差评估?
要使用 Biostars 来获取关于 Immune Cell Atlas 数据集的数据偏差评估的帮助,您可以按照以下步骤进行操作: 1. 访问 Biostars 网站:打开您的浏览器,输入 Biostars 的网址(https://www.biostars.org/ )。 2. 注册或登录:如果
研究揭示疼痛分辨力稳定且特异的神经指标
近日,中国科学院心理健康重点实验室胡理研究组利用脑电和功能磁共振成像技术揭示了疼痛分辨力稳定且特异的神经指标。相关成果已在线发表于Cell子刊Cell Reports Medicine,题为Selective and Replicable Neuroimaging-based Indicators
B类先导专项“脑功能联结图谱与类脑智能研究”结题验收
8月31日,中国科学院在北京召开B类战略性先导科技专项“脑功能联结图谱与类脑智能研究”结题总体验收会议。总体验收专家组由中科院院士王志珍、贺福初、赵国屏、强伯勤、张钹、郭雷等来自科研机构、高校、医院的科技专家,以及来自科学技术部、财政部、国家卫生和计划生育委员会、工业和信息化部等国家有关部门的管
全球高精度长时序冻融数据集发布
土壤冻融是指土壤中的水分随着温度变化在固态冰与液态水之间反复变化的过程,在学术上被称为“相变”。这一过程深刻影响着地球表层的能量平衡、水循环和碳通量,被形象地称为地球表层的“呼吸”。冻融过程还表现出一定的“记忆效应”,即前期的冻融状态会通过改变土壤热传导和水文特性,影响后续的地表能量与水分分配,
iChallenge子数据集PALM研究获新进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516705.shtm
中国蛇类DNA条形码参考数据集发布
中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物所)研究员车静课题组联合国内科研团队开展合作,首次系统性构建了中国蛇类DNA条形码参考数据集(COI),对中国蛇类多样性进行了评估。日前,相关研究成果发表于《分子生态学资源》(Molecular Ecology Resources)。 据了解,两栖爬行
业界首个开源车路协同数据集发布
2月24日,业界首个基于真实场景的车路协同自动驾驶数据集DAIR-V2X正式发布,并面向用户提供下载使用。该数据集由清华大学智能产业研究院(AIR)联合北京市高级别自动驾驶示范区、北京车网科技发展有限公司、百度Apollo、北京智源人工智能研究院共同发布。据了解,此次发布的数据集首次实现在相同时空下
提供-Immune-Cell-Atlas-数据集分析的详细步骤
以下是一个使用 Seurat 包对 Immune Cell Atlas 数据集进行分析的大致步骤: 1. 数据导入和预处理 - 安装并加载所需的 R 包,如 Seurat。 - 读取单细胞测序数据,通常是一个表达矩阵。 - 进行初步的数据质量控制,例如去除低质量细胞(
Immune-Cell-Atlas-数据集的下载地址是什么?
您可以通过以下途径获取 Immune Cell Atlas 数据集: 1. 欧洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute,EBI)的数据库:https://www.ebi.ac.uk/2. 美国国家生物技术信息中心(National Center for