霍乱弧菌的聚合酶链反应法检测介绍
1、普通聚合酶链反应法 核酸扩增技术,即聚合酶链式反应(polymerase chainreaction,PCR),其基本原理是设计、合成两条寡核苷酸,作为引物,对应于待测病原微生物某一段特异性序列的两端,然后在体外模拟DNA体内复制的过程反复扩增,使靶序列放大上万倍甚至上百万倍而被检测出来。一般选择霍乱肠毒素(cholera enterotoxin,CT)基因ctx的保守序列作为靶基因。一些非产毒株(如环境来源的菌株)有可能通过基因水平转移获得毒力基因成为产毒株,若仅检测ctx基因容易造成漏检。因此,霍乱弧菌的其他重要基因,如毒力协同调节菌毛A基因(tcp A)、o抗原基因(rfb)、外膜蛋白基因(omp)以及毒力表达调控基因(toxR)等也被选用为PcR的靶基因,这大大提高了检测的特异度. 2、多重PCR法 与常规PCR相比,多重PCR一次反应可检测多个基因,节省了时间和成本。国内、外许多学者选用霍乱弧菌的毒素基因......阅读全文
霍乱弧菌的聚合酶链反应法检测介绍
1、普通聚合酶链反应法 核酸扩增技术,即聚合酶链式反应(polymerase chainreaction,PCR),其基本原理是设计、合成两条寡核苷酸,作为引物,对应于待测病原微生物某一段特异性序列的两端,然后在体外模拟DNA体内复制的过程反复扩增,使靶序列放大上万倍甚至上百万倍而被检测出来。
聚合酶链反应原理介绍
PCR是体外酶促合成特异DNA片段的新方法,主要由高温变性、 低温退火和适温延伸三个步骤反复的热循环构成:即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的最
DNA的化学检测项目介绍聚合酶链反应技术
聚合酶链反应技术介绍: 聚合酶链反应技术诊断幽门螺旋杆菌是否存在仅需微量的DNA,而不需要活菌存在(这不同于其他幽门螺旋杆菌检测方法),它不仅可以检测胃内幽门螺旋杆菌,还可望检出胃以外部位,如牙斑、粪便内的幽门螺旋杆菌,还可用于流行病学调查,它的敏感性远远超过了其他方法,有利于确定细菌感染的来源及
应用套式聚合酶链反应(nPCR)检测技术的介绍
根据HIV-1 gag.pol和env基因序列设计了套式聚合酶链反应(nesled polymerasechain reaction,nPCR)引物。将外周血单个核细胞裂解液先用外侧引物扩增,其产物再经内侧引物扩增,直接走凝胶电泳判定结果。nPCR的敏感性。较常规PCR高100~1000倍,可检
关于聚合酶链反应模板的介绍
单、双链DNA或RNA都可以作为PCR的样品。若起始材料是RNA,须先通过逆转录得到第一条cDNA。虽然PCR可以仅用极微量的样品,甚至是来自单一细胞的DNA,但为了保证反应的特异性,还应用ng级的克隆DNA,μg水平的单拷贝染色体DNA或104拷贝的待扩增片段作为起始材料,模板可以是粗品,但不
聚合酶链反应的循环参数介绍
预变性模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。 [5] 变性步骤循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败
聚合酶链反应的常规应用介绍
用于治疗感染性疾病,肿瘤及遗传病。感染性疾病PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上,只要样本有一个病原体存在,PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝,而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的
何谓实时荧光聚合酶链反应定量检测?
在普通PCR扩增系统中,加入一个与靶基因序列特异互补的双荧光标记探针。5′端标记荧光发射集团,3′端标记荧光淬灭集团,当探针完整时,后者抑制前者而不发光。有靶基因存在时,在PCR复性阶段,探针与靶基因互补,PCR延伸中,由于Taq酶有5′-3′的外切酶活性,引物沿模板延伸至标记探针结合处,将5′端报
聚合酶链反应的常见问题介绍
PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。假阴性不出现扩增条带。PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及溴乙锭的使用, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板
HCV-cDNA/聚合酶链反应的相关介绍
(HCV cDNA/Polymerase Chain Reaction,RTPCR)测定肝和血清中HCV RNA。 本法是将HCV RNA逆转录为HCV DNA,选用高度保守的5′非编码区引物扩增放大后作电泳观察结果。本法较灵敏。由于肝和血清中HCV RNA出现较抗-HCV为早,一些HCV感染
基因诊断的聚合酶链反应方法介绍
21世纪,基因分析和基因工程技术有了革命性的突破,这主要归功于聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的发展和应用。应用PCR技术可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小时内体外扩增数十万至百万倍。扩增的片段可以直接通过电泳观察,也可用于进一步的分析。这样,
定量聚合酶链反应
中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定 义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应,对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
反向聚合酶链反应
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶,切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段,将切出的DNA区段环化,然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
聚合酶链反应的过程
标准的PCR过程分为三步:DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′
霍乱弧菌的血清凝集法检测
根据弧菌O抗原不同,分成Ⅵ个血清群,第Ⅰ群包括霍乱弧菌的两个生物型。第Ⅰ群A、B、C三种抗原成份可将霍乱弧菌分为三个血清型:含AC者为原型(又称稻叶型),含AB者为异型(又称小川型),A、B、C均有者称中间型(彦岛型)。 1992年10月在印度东南部又发现了一个引起霍乱流行的新血清型菌株(01
聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例
聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例1990年Hoshina等首行应用聚合酶链反应(PCR)成功检出胃粘膜活检标本内的Hp。我院从今年1995的1月份开始,在短短3个月中对70例胃镜受检者应用PCR检测幽门螺杆菌,并采用目前广泛使用的快速尿素酶试验作了对比,收到满意效果,报告如下。1 材料和方法1.1
原位聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称原位聚合酶链反应英文名称in situ PCR定 义在DNA模板分子原来所在的位置处(如细胞、组织中)进行聚合酶链反应的技术。能够直接指示出DNA模板的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
Alu聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称Alu聚合酶链反应英文名称Alu-PCR定 义从复杂来源样品中特异扩增人基因组DNA的方法。Alu是人基因组中特有的高度重复序列,散布于整个人的基因组中。设计能识别Alu保守区序列的聚合酶链反应引物,就能特异地扩增获得人基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二
阻抑聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称阻抑聚合酶链反应英文名称suppression PCR定 义抑制非特异扩增、而选择性扩增那些只知道部分序列目的DNA的一种聚合酶链反应方法。即先在所有的DNA 5′端加上人工接头,设计引物一个与人工接头互补,另一个与目的DNA互补,非特异PCR产物由于两端有颠倒重复序列,退火时会自身形成环
阻抑聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称阻抑聚合酶链反应英文名称suppression PCR定 义抑制非特异扩增、而选择性扩增那些只知道部分序列目的DNA的一种聚合酶链反应方法。即先在所有的DNA 5′端加上人工接头,设计引物一个与人工接头互补,另一个与目的DNA互补,非特异PCR产物由于两端有颠倒重复序列,退火时会自身形成环
竞争聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称竞争聚合酶链反应英文名称competitive PCR;cPCR定 义在反应体系中加入已知含量的内参照竞争模板,该模板与待测模板可以等效扩增,扩增过程中或扩增结束后,可用某些手段区分和定量待测物和竞争物的扩增产物,比较两者的量即可知待测模板含量的一种定量聚合酶链反应技术。应用学科生物化学与
影响聚合酶链反应的引物设计相关介绍
要扩增模板DNA,首先要设计两条寡核苷酸引物,所谓引物,实际上就是两段与待扩增靶DNA序列互补的寡核苷酸片段,两引物间距离决定扩增片段的长度,两引物的5’端决定扩增产物的两个5’末端位置。由此可见,引物是决定PCR扩增片段长度、位置和结果的关键,引物设计也就更为重要。 引物设计的必要条件是与引
霍乱重出江湖?武汉大学官方回复
7月9日,武汉大学工学部宿舍疑似发现一例霍乱病例,并且全栋学生都进行了统一肛拭子检测。武汉武昌区卫健委10日回应:已有疾控人员开展工作,还没有明确到底是不是霍乱。7月10日,武汉大学校医院发布通知,提醒学生加强夏季肠道传染预防。霍乱弧菌是人类霍乱的病原体,霍乱是一种古老且流行广泛的烈性传染病之一。曾
聚合酶链反应的反应特点
特异性强PCR反应的特异性决定因素为:①引物与模板DNA特异正确的结合;②碱基配对原则;③Taq DNA聚合酶合成反应的忠实性;④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性,使反应中模
聚合酶链反应的控制方式
PCR反应的缓冲液 提供合适的酸碱度与某些离子镁离子浓度 总量应比dNTPs的浓度高,常用1.5mmol/L底物浓度 dNTP以等摩尔浓度配制,20~200umol/LTaqDNA聚合酶 2.5U(100ul)引物 浓度一般为0.1 ~ 0.5umol/L反应温度和循环次数变性温度和时间 95℃,3
反向聚合酶链反应的定义
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶,切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段,将切出的DNA区段环化,然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
聚合酶链反应的基本步骤
主要分为三大步骤:高温变性、低温退火、适温延伸。分别添加引物、模板、Taq酶、dNTP和缓冲液等反应物混合,在约为95℃环境下,双链DNA氢键断裂解旋为单链;单链与人工设计的引物在约为60℃温度下,按照碱基互补配对的原则相结合;并升温到72℃左右,利用Taq酶延伸合成一条新的与模板DNA链互补的半保
关于聚合酶链反应的概述
PCR技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出优点。 PCR技术最早由美国Cetus公司人类遗传研究室Kary Mullis及同事于1985年发现并研制成功的;最早的应用报道是Saiki等1985年将PCR技术应用于β-
聚合酶链反应克隆的原理
中文名称聚合酶链反应克隆英文名称PCR cloning定 义应用聚合酶链反应的技术获得DNA分子克隆的方法。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
聚合酶链反应的污染来源
1、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。2、PCR试剂的污染:主要是由于在PCR