上海药物所合作研究发现一种新组蛋白表观遗传修饰
美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室联合中科院上海药物研究所、美国加州大学圣地亚哥分校、法国Joseph Fourier大学等单位研究人员合作完成的关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文于9月18日在《细胞》杂志上在线发表。这也是上海药物所与赵英明教授合作的化学蛋白质组学研究中心在组建过程中取得的重要研究进展。 组蛋白修饰参与调控许多重要的细胞生物学过程,如激活或抑制基因转录、DNA修复等表观遗传学现象,并与如肿瘤、神经退行性、自身免疫等许多疾病的发生、发展密切相关。组蛋白翻译后修饰的研究经过数十年积累,共发现了90多个组蛋白修饰位点。目前仍是表观遗传学领域的一个研究热点。此项研究通过综合运用蛋白质组学、化学衍生化、生物化学等方法,对组蛋白修饰进行了系统性研究,共鉴定出130个组蛋白修饰位点,发现了67个新组蛋白修饰位点,该研究增加了约70%的组蛋白修饰的新位点。同时,此项研究确证了组蛋白的一种新修饰......阅读全文
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
表观遗传学药物有望解决癌症治疗难题
表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。这样的措施将大大有
什么是表观遗传学
是研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰,即探索从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴学科。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等。而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
《科学》推出“表观遗传学”专题
10月29日出版的《科学》杂志刊登专题——《表观遗传学》(Epigenetics)。专题导言文章《什么是表观遗传学》(What Is Epigenetics?)说,多细胞有机体的细胞名义上拥有同样的DNA序列(因而拥有同样的遗传指令系统),但是它们却维持着不同的显型。这种记录了发育和环
上海药物所合作研究发现一种新组蛋白表观遗传修饰
美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室联合中科院上海药物研究所、美国加州大学圣地亚哥分校、法国Joseph Fourier大学等单位研究人员合作完成的关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文于9月18日在《细胞》杂志上在线发表。这也是上海药物所与赵英明教授合作的化学蛋白质组学研究中
著名遗传学家表观遗传学新成果
可卡因成瘾性的一个主要挑战在于,在戒断期之后的高复发率。但新的研究表明,在药物戒断过程中,我们DNA的变化可能为更有效的成瘾疗法开发,提供了有希望的方法。 加拿大麦吉尔大学和以色列巴尔依兰大学的研究人员,将这项研究结果发表在最近的《Journal of Neuroscience》。他们指出,戒
Cell发现表观遗传学肥胖开关
世界就是这么不公平,有些人喝凉水都发胖,有些人怎么吃也胖不了。近年来科学家们发现,个体的肥胖倾向是由基因决定的。然而Cell杂志发表的一项最新研究表明,表观遗传学调控也在其中起到了关键作用。 Max Planck研究所的J. Andrew Pospisilik领导团队对遗传背景完全相同的小鼠和
坚持锻炼的表观遗传学意义
众所周知,体育锻炼能够改善包括代谢、肺活量在内的多项身体机能。那么体育锻炼是怎样在分子水平上施加影响的呢? 人们发现,锻炼能促进肌肉重塑,改变肌肉的纤维结构和蛋白组成。“坚持体育锻炼对健康很有帮助,能够防治一系列常见疾病,比如心血管疾病和二型糖尿病。理解锻炼有益健康的具体机制,可以帮助我们进一
Science:表观遗传学的“神秘花园”
许多研究者都在探寻各种复杂性状背后的遗传学基础。然而,大家往往忽视了天然表观遗传学变化为表型带来的多样性。表观遗传学突变发生在DNA序列之外,将其与DNA序列突变区分开是一项富有挑战性的工作。 在本期Science杂志上Cortijo等人向人们展示,表观等位基因( epialleles
Cancer-Cell专题:癌症表观遗传学
癌症中的基因调控与反调控一直是人们关注的热点,现在这一领域已经取得了很大的进展。Cell旗下的Cancer Cell杂志本月特别推出专题,推荐了四篇有代表性的癌症表观遗传学文章。 Vulnerabilities of Mutant SWI/SNF Complexes in Cancer 癌症
颠覆传统认知,表观遗传学之谜
尽管大多数生物体都是利用基因组上的甲基标记来监控基因表达,淡水原生动物Oxytricha trifallax却利用这些标记踢走了垃圾DNA(95%的基因组序列)。这一研究发现驳斥了以往研究做出的通常携带四个细胞核的单细胞纤毛虫无甲基化DNA的结论。 论文的第一作者、普林斯顿大学的博士后
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,
鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展
在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学
孙方霖:表观遗传学-后基因组时代的领舞者
DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时,国家自然
《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类
药物遗传学概述
药物遗传学(pharmacogenetics)是生化遗传学的一个分支学科,它研究遗传因素对药物代谢动力学的影响,尤其是在发生异常药物反应中的作用。 临床医生在使用某些药物时,必须遵循因人而异的用药原则。因为在群体中,不同个体对某一药物可能产生不同的反应,甚至可能出现严重的不良副作用,这种现象
表观遗传学热点酶的作用机制
加州大学圣芭芭拉分校的研究人员发现大肠杆菌的Dam酶在DNA上移动进行修饰时会发生“跳跃”,并对其物理特性和行为进行了分析,这一研究成果能为生物医学研究和其他科学应用提供帮助。该文章发表在Journal of Biological Chemistry杂志上。 大肠杆菌的适应机制使其能依
表观遗传学研究获重大突破
同济大学高绍荣团队首次从全基因组水平上揭示了小鼠植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程,并发现宽的H3K4me3修饰在植入前胚胎发育过程中对基因表达发挥重要调控作用。相关成果9月15日在线发表于《自然》。 高绍荣研究组利用极少量的细胞检测了小鼠植入前胚胎发育各个
JCB:“流放”DNA的表观遗传学修饰
皮肤细胞在发挥作用时启动的基因与肝细胞完全不同,而其他基因需要保持关闭。将基因“流放”到细胞核边缘,是能够一举关闭大量基因的重要途径。Johns Hopkins大学的一项新研究揭示了DNA被发配到细胞核边疆的具体机制,这一过程对于控制基因表达和决定细胞命运至关重要。相关论文发表在近期的Journ
表观遗传学有助解释妊娠高血压
弗吉尼亚联邦大学(VCU)医学院的研究者发现,一种关键酶的基因表达变化可能会导致有先兆子痫的孕妇出现高血压,并使她们形成血栓的易感性增加。这些结果可为孕妇高血压和血栓形成的最佳治疗方法提供线索,高血压和血栓形成可能会阻断孕妇内脏器官的血流,并且导致器官衰竭。 研究者一直致力于从分子层面
Nature报道表观遗传学新发现
日前,芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。 RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序(RNA binding motif,RBMs)1、2、3的结合来控制细胞
PNAS首次评估表观遗传学突变率
Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的
Nature综述:表观遗传学预测癌症弱点
由Bellvitge生物医学研究协会癌症表观遗传与生物学研究组Manel Esteller领导的研究组,发表题为“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的综述文章,概况了近期在应用表观遗传
Nature:癌症与表观遗传学重编程
延胡索酸(fumarate)是细胞三羧酸循环的一种中间产物。它天然存在于蔬菜水果中,也被用作调味的食物添加剂。Nature杂志发表的一项最新研究表明,代谢物延胡索酸过多会造成表观遗传学重编程,进而推动癌症发展。 遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌(HLRC)是一种罕见的人类癌症,会引起皮肤肿瘤和肾癌。
Nature:遏制哮喘的表观遗传学酶
研究人员发现重编程小鼠体内促哮喘的免疫细胞可以减少气道损伤和炎症,并有可能促成哮喘患者的新治疗。 研究人员能够重编程的促哮喘细胞是一种称为Th2细胞的免疫细胞,他们确定了一种可以修饰这些细胞DNA的酶。该酶可作为开发过量Th2细胞导致的慢性炎症疾病,尤其是过敏性哮喘的新疗法的一个靶点。相关
PerkinElmer发布表观遗传学和NGS新品
在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上,PerkinElmer公司展示了一系列新产品,包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。 表观遗传学新品 表观遗传学生化工
表观遗传学关于DNA甲基化
表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核
清华大学Cell子刊发表表观遗传学新成果
组蛋白修饰和DNA甲基化是重要的表观遗传学修饰,决定着基因组的表观遗传学景观。组蛋白修饰和DNA甲基化能共同起作用调控基因的表达,但人们并不清楚它们在作用机制和功能上的具体关联。 清华大学和洛克菲勒大学的研究团队发现,改变DNA甲基转移酶的组蛋白识别区域会影响表观遗传学景观和小鼠的胚胎干细胞。