数据平台让水稻更易“读懂”以水稻为研究对象的数据库
水稻生物学数据库众多、信息量大，但大多是生物学原始数据；国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能；国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者，一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”（http://www.ricedata.cn/），让难题迎刃而解。 经过10多年的建设，该平台已发展成为一个以水稻为研究对象，融贯多学科的综合性数据库。其所载内容已被他人引用超过350次，它以网站形式为用户提供信息，日访问IP数超过500个，在国内外农学类信息系统中，访问量名列前茅。 据悉，研究人员开发系谱数，创建中国水稻品种及其系谱数据库，收录国内外水稻品种和育种材料等数据近1.5万份；构建优异稻种资源数据集和大品种指纹数据集，收集优异稻种资源数据共计5379份。 “本数据库是国内有关水稻品种资料最全，且唯一带有系谱追溯功能的数据库。”中国水稻研究所教授鄂志......阅读全文
数据平台让水稻更易“读懂”－以水稻为研究对象的数据库
水稻生物学数据库众多、信息量大，但大多是生物学原始数据；国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能；国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者，一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”（http://www.riced
系谱分析
在遗传病诊断时进行系谱分析有助于区分单基因病和多基因病，以及属于哪一种遗传方式；有助于区分某些表型相似的遗传病以及由于遗传性而出现的不同遗传方式。进行系谱分析应注意下列问题：①系谱的系统性、完整性和可靠性。系谱分析时必须有一个系统完整和可靠的系谱，否则可以导致错误的结论。完整的系谱应有三代以上有关患
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
深圳将建食品安全监管－追溯和信用管理数据库
9月28日，记者从最新一期政府公报获悉，深圳市人民政府办公厅印发的《深圳市信息化发展“十三五”规划》（以下简称《规划》）显示，其间深圳将建设统一的食品安全监管与服务信息系统，并将在2020年建成国内基础设施覆盖率最广、综合服务能力国内领先的宽带中国示范城市。 据《规划》显示， 到2020年，深
基因测定方法系谱分析法
非整倍体测交法可以用来测定基因属于哪一个常染色体。用常染色体隐性突变型纯合体（a/a)和野生型二倍体（+/+）杂交，再用子一代杂合体(a/+)和隐性亲本回交,在它们的子代中表型是野生型的和表型是突变型的各占50%（见孟德尔定律）。杂交 a/a × +/+↓回交 a/+ × a/a↓回交子代 a/
基因测定方法系谱分析法
在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果，他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。 据
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果，他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。据介绍，这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里，亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因，以及追踪其演变历史。目前，数据库
大规模基因比较助力系谱图研究
Emily和Alan Lemmon希望生物学家可以利用他们的技术绘制系谱图。 Emily Moriarty Lemmon永远不会忘记她在读研究生时，为建立青蛙系谱图而付出的努力。为了了解不同种类青蛙之间如何彼此相关，她需要评估尽可能多的DNA差异，但是时间和资金大大限制了她可以确定和测试的
基因定位方法介绍系谱分析法
系谱分析法基因定位在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种
分子生物学常用数据库汇总及推荐
分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式；主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用，可能参与哪些生物学行为等进行一些初步
基因测定的方法系谱分析法介绍
在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗
研究人员建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来，随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展，衰老相关多组学数据层出叠见。然而，目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组，与北京基因组研究所（
动物所等建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来，随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展，衰老相关多组学数据层出叠见。然而，目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组，与北京基因组研
刘耀光院士等专家打造水稻生物学重磅综述
近日，华南农业大学生命科学学院刘耀光院士联合中国科学院遗传发育所李家洋院士、清华大学谢道昕院士等国内20位专家共同撰写题为“Rice functional genomics： Decades' efforts and roads ahead” 的水稻生物学研究大综述，并在线发表于SCIE
科学家合作构建再生生物学多组学数据库
随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展，再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期，助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长，亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库，以存储世界范围内的组学研究数据为基础，推动再
研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库
随全球人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来，随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展，衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前，尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库. 中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）研究员鲍一明研
基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的
科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物，同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累，使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此，研究人员构建了相关的水稻数据库，主要包括RAP-DB（日本农业生物资源研究所构建的水稻注释
中科院上海植物逆境生物学中心发现水稻miRNA新功能
中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组利用STTM技术大规模沉默水稻miRNA，并发现了多种miRNA的新功能，为进一步深化miRNA功能研究和水稻遗传改良提供了有效资源。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 miRNA是一类在生物体内普遍存在的非编码、长度约21个核苷酸的小分子R
三校联合组建玉米水稻小麦生物学协同创新中心
中国农业大学、西北农林科技大学、华中农业大学6月10日在京宣布组建“玉米水稻小麦生物学协同创新中心”，力争用5到10年，将中心全面建成国际一流的主要粮食作物生物学学术创新高地、良种和新技术研发基地。 据中国农业大学校长柯炳生介绍，中心借国家出台《高等学校创新能力提升计划》（2011计
钙镁磷肥抑制水稻镉吸收微生物学机制获揭示
近日，农业农村部环境保护科研监测所重金属生态毒理创新团队首席科学家刘仲齐研究员团队发现，钙镁磷肥对水稻根际土壤微生物群落结构有显著影响，通过调控菌群驱动的铁氮耦合循环，显著抑制水稻对镉的吸收。相关成果发表于《危险材料杂志》。 土壤镉污染问题严重危害粮食安全生产，施加钙镁磷肥能够有效抑制水稻镉吸收
6月中国学者Nature文章井喷
六月份，国内学者在Nature及其重要子刊上发表文章井喷，不仅在本刊Nature上发表生物类研究成果多篇，而且在Nature重要子刊，比如Nature Genetics(最新影响因子超Cell)上也发表了几项引入注目的研究成果。 首先上海交通大学医学院与德克萨斯大学西南医学中心发表文章
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
种质资源库管理系统软件能帮助用户完善种子管理工作
种质资源库管理系统软件是用于种质信息、中间材料信息、设备、设施管理、储藏管理以及出入库管理的专用软件，能够方便用户查询种子信息、录入种子信息，避免种子信息的混乱，以及流通过程数据的丢失，完善种子管理工作。 种质资源库管理系统软件可以对小麦、玉米、水稻等作物种质及中间材料等育种资源进行信
甘肃规划重要产品追溯体系建设－追溯信息互通共享
甘肃省政府办公厅18日披露，到2020年，甘肃将基本建成重要产品追溯信息平台，追溯信息实现互通共享。 据重要产品追溯体系建设的实施意见，甘肃已对群众生命财产安全和公共安全有重大影响的食用农产品、食品、药品、农业生产资料、特种设备、危险品、稀土产品等为重点，分类指导，分步实施，推动生产经营企业
重庆将建食品追溯体系
日前，记者从重庆市政府网获悉：重庆将建重要产品追溯体系。到2020年，重庆市食用农产品、食品、药品、农业生产资料、特种设备、危险品都将纳入重要产品追溯范围，基本形成追溯数据统一共享交换机制，初步实现有关部门、地区和企业追溯信息的互通共享。 在食用农产品方面，重庆将建立食用农产品质量安全全程追溯
古老DNA追溯黑死病起源
一项对古代基因组的研究显示，14世纪在现在的吉尔吉斯斯坦暴发的一场瘟疫中，许多人死于引起鼠疫的耶尔森氏菌菌株，该菌株产生的病原体在几年后又导致了黑死病。 “这就像找到了所有菌株聚集的地方。”该研究的共同负责人、德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的古遗传学家Johannes Kraus
食品可追溯的作用
A 事后反馈 找出质量问题所在，追责、持续改进； B 监督预防 因为有追溯体系的建立，每个关键环节进行监控与记录，则事后可追查问责到人， 使得坏人不敢肆意为所欲为，一定程度杜绝其坏念头; C 售后服务 有追溯体系则老百姓购买食品时可进行追溯查询，判断食品真假， 既防伪防劣又让老百姓
昌平草莓安全可追溯
近期，随着北京农业嘉年华的举办，昌平的草莓迎来了销售旺季。许多市民在嘉年华园区或在昌平其他景点游玩后，往往会到园区东侧的“草莓休闲体验带”亲自采上几盒新鲜的草莓，这里有1万栋草莓温室大棚供市民进行采摘体验。 就在不久前，昌平区20家草莓生产基地代表共同宣读《2016昌平草莓安全生产自律公约》