科学家解开绒螯蟹“断肢”重生秘密
中华绒螯蟹是深受国人喜爱的水产品种,其产业规模十分庞大。在养殖过程中,中华绒螯蟹受到外界刺激时容易“断手断脚”,这对其经济价值造成很大影响。近日,上海海洋大学水产与生命学院教授王成辉团队与合作伙伴一起,在中华绒螯蟹基因组与断肢再生研究领域取得新进展。相关研究已在发表于《科学进展》。中华绒螯蟹染色体水平基因组特征 受访者供图完成全基因组测序和组装中华绒螯蟹是国人餐桌上最常见的螃蟹品种,也是高经济价值的水产甲壳动物。全国有28个省市区养殖中华绒螯蟹,其产业规模庞大。但由于其染色体数目多(2n),基因组重复序列高,长期以来一直面临基因组组装困难的问题。为解决上述问题,王成辉团队和上海海洋大学水产与生命学院教授李晨虹、德国波茨坦大学教授Michael Hofreiter、美国内布拉斯加大学奥马哈分校教授吕国庆等合作,利用第三代测序技术,并结合BioNano光学图谱和Hi-C高通量染色......阅读全文
Nature新闻:基因组测序追踪超级病菌
研究人员通过基因组测序最终了解了去年困扰英国剑桥一家新生儿特护病房达数月之久的超级细菌疫情。他们将这一案例报告在11月14日的《柳叶刀传染病》(Lancet Infectious Disease)杂志上,标志着首次科学家们通过测序病原体基因组积极控制了一场持续爆发的疫情。 在两天内Ro
The-scientists盘点最热门的基因组测序
The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,以飨读者。 一种新病毒 种属:果蝠疱疹病毒(FBAHV1) 基因组:149,459bp 日本北海道大学的研究团队测序了一种新病毒的基因组序列,并将结果发表在六月十八日的Journal of Virology杂志上。
当宏基因组遇上单细胞测序
日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
Nature-Methods发布基因组测序新工具
十月十七日Nature Methods杂志发表的一项研究显示,新测序技术与新算法的结合可以为人们揭示复杂基因组的详细信息。加州大学戴维斯分校和Pacific Biosciences公司的研究人员的FALCON-Unzip算法能够将长读取测序数据装配成高度准确、连续和正确定相的二倍体基因组。 随
HiSeqXTen开创基因组测序的新时代
新年伊始,Illumina公司在第32届摩根大通保健大会上重磅推出最强大的测序仪:HiSeq X Ten。这一套测序系统包括10台HiSeq X测序仪,适合群体规模的测序项目。据Illumina介绍,HiSeq X Ten首次让$1000的基因组测序成为现实。以Illumina成熟的
近期最热门的基因组测序成果
生物通报道:The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。 种属:甜瓜(Cucumis melo) 西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有
-Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
Nature:实时、便携式基因组测序
埃博拉病毒(EBOV)感染人类会引起致命的出血热,发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情,死亡人数已经超过11,000人。今年一月份,就在人们以为这场疫情正式结束之际,塞拉利昂又出现了新的病例。 本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到
基因组测序的方法和临床应用
基因组测序主要有两种方法 鸟枪法 和克隆重叠群法。临床全外显子测序是针对人类全部基因的外显子进行检测,适用于一些难以判断病因的复杂遗传病的诊断,是一种常用的基因组测序方法。
人类基因组测序的缘起
虽然公众对于开展人类基因组测序已经翘首以待,但是为这项计划举办的首次协调会却令人泄气。1984年夏季,美国能源部(DOE)健康与环境研究项目主任查尔斯·德利西(Charles DeLisi)召开了专家会议,旨在评估人类基因组测序技术的可行性。自20世纪80年代早期以来,能源部的研究人员一直在致力
我国率先完成菊花全基因组测序
中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心对外发布消息称,由他们共同发起的科研团队,在菊花全基因组计划获重大进展的同时,还完成了重要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息发掘。此举使我国成为世界上首次完成菊属植物菊花全基因组测序的国家。 据了解,菊属植物染色体结构复杂,包含从2n=18到
中药材“甘草”基因组测序完成
科技日报东京10月27日电 (记者陈超)日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡
近期最受关注的基因组测序研究
想象一下有人递给你一杯奶昔,要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下,这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子,这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提
简述全基因组测序的技术路线
全基因组测序的技术路线:提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行DNA簇(Cluster)制备,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通
关于全基因组测序的应用介绍
全基因组测序的应用:通过生物信息手段,分析不同个体基因组间的结构差异,同时完成SNP及基因组结构注释。 DNA突变可诱发癌症。吸烟过程中所释放的>60种致癌化学物质可与DNA结合并对DNA链上的鸟嘌呤和腺嘌呤进行化学修饰从而产生大的加合物,该加合物改变了DNA双螺旋的结构,如果不被核苷酸剪切修复
个人基因组测序预测能力遭质疑
一项新的研究给全基因组测序对每个人都很有用的说法泼了一盆冷水。图片来源:N.J. Roberts等,《科学—转化医学》 “每个人都将拥有自己的基因组序列,并且可以将这些信息装在一个U盘中”——生物医学家曾这样给我们描绘一幅美妙的蓝图,当脱氧核糖核酸(DNA)测序变得很廉价时,这一
2013年中国海洋与湖沼十大科技成果评选结果揭晓
12月30日,中国海洋湖沼学会公布了“2013年度中国海洋与湖沼十大科技成果”。经海洋与湖沼领域相关单位、专家学者推荐,通过理事投票,“蛟龙”号深海考察等10项2013年度在国际或国内产生重大影响的海洋湖沼领域的科技成果入围。评选结果如下: 1.蛟龙号深海考察取得丰硕成果 “蛟龙”号通过三个
Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序
四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。 研究人员用G&T-seq对220个小鼠
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
科学家进行基因组测序-成功破译金雕基因组
作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区
螯合程度的检测分析
如果配体和银离子结合后,紫外可见区有变化,可以用紫外光谱测定反应进行的程度;如果没有光信号变化,也可以使用电化学手段,用银-氯化银电极测定体系游离银离子浓度;如果是固体的话,只能用溶剂洗涤固体,将游离银离子洗脱,然后用原子吸收或其他手段检测银离子含量。
螯合物的应用介绍
在水污染化学、分析化学、有机和生化等方面的应用十分广泛,如水中金属离子的分离分析、水的软化、分级沉淀、纤维染色、清洗金属、浮选、杀菌、蛋白质的水解与合成以及稳定维生素等。工业工程螯合物在工业中用来除去金属杂质,如水的软化、去除有毒的重金属离子等。比如重金属生产和使用的工厂使用重金属捕捉剂来沉淀重金属
螯合物的相关应用
在水污染化学、分析化学、有机和生化等方面的应用十分广泛,如水中金属离子的分离分析、水的软化、分级沉淀、纤维染色、清洗金属、浮选、杀菌、蛋白质的水解与合成以及稳定维生素等。工业工程螯合物在工业中用来除去金属杂质,如水的软化、去除有毒的重金属离子等。比如重金属生产和使用的工厂使用重金属捕捉剂来沉淀重金属
微量元素氨基酸螯合物的螯合物的基本结构
螯合物是指1个或多个配位基团与金属离子之间的配位反应所形成的环状结构产物,金属氨基酸螯合物是可溶性金属盐的金属离子与氨基酸以一定数量的摩尔比(通常为1∶1~3)共价化合的产物。氨基酸的氨基和羧基与金属微量元素离子螯合,是以氧和氮作配位原子,配位体2个配位原子之间相隔2个或3个以上原子与中心金属离子共
今年底要测序3000个基因组
1月17日,美国《国家科学院院刊》刊发了一组文章,描述了地球生物基因组计划(EBP)的目标、迄今的成就和下一步的行动。这意味着旨在绘制地球上所有植物、动物、真菌和其他微生物基因组图的EBP进入一个新阶段,从试点项目转向全面测序。“EBP特辑报道了生物学史上最大规模协同工作的本质和激动人心之处。”EB
科学家完成古老绿藻基因组测序
已知最小的真核生物Micromonas之一的电子断层切片( 0.5微米厚) 一个国际研究小组日前对两株被认为属于同一种藻类的古老绿藻进行了基因组测序,结果发现二者的基因只有90%相同。由于研究所用的绿藻位于真核生物生命树底部,科学家认为,这一发现为研究藻类以及陆地植物的进化提供了新线索
全基因组测序提高罕见病诊断率
每4300人中就有1人患有线粒体疾病,并会导致进行性的不治之症。这种疾病是最常见的遗传疾病之一,但对临床医生来说很难诊断,这是因为它们可以影响许多不同的器官,并与许多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因检测制度诊断。 近日,英国研究人员的一项新研究为尚不能被确诊的患者带来了希望。该
全基因组测序提高罕见病诊断率
每4300人中就有1人患有线粒体疾病,并会导致进行性的不治之症。这种疾病是最常见的遗传疾病之一,但对临床医生来说很难诊断,这是因为它们可以影响许多不同的器官,并与许多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因检测制度诊断。 近日,英国研究人员的一项新研究为尚不能被确诊的患者带来了希望。该研
国际研究小组完成团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学9日报告说,一个有德国研究者参加的国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物,一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、