基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究生余进博士，美国康涅狄克大学Bernard Goffinet教授共同完成该项工作。苔类（liverworts）是植物界的一个门，属于苔藓植物三个主要分支（苔、藓、角苔）之一，其起源历史可追溯至4亿年前。作为一个古老的植物类群，苔类植物多样性却非常丰富，目前全世界有苔类7300余种，隶属15目，87科，300余属，其深层次系统演化关系尚有很大争议。近年来，随着高通量测序技术的发展，植物系统发育基因组学获得了快速的发展，转录组（transcriptome）数据被广泛应用于植物系统发育基因组学中。转录组是某一特定状态下基因组的所有转录本，数......阅读全文
首本有关秋海棠属植物形态解剖的专著出版
近日，深圳市仙湖植物园研究员李凌飞、高级工程师杨蕾蕾主编的专著《秋海棠属植物形态解剖图鉴》（中英双语版）由中国农业出版社正式出版发行。记者获悉，这是迄今为止国际上第一本有关秋海棠属植物形态解剖的专著。《秋海棠属植物形态解剖图鉴》封面。李凌飞供图该专著对秋海棠属的起源与分布、分类系统、引种栽培与育种历
国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会在版纳园召开
6月27日至7月1日， 国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics）在中科院西双版纳热带植物园召开，来自十多个不同国家的三十余名科研人员参加了研讨会。 本次研讨会历时五天，
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析，相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示，莲基因组大约有2.7万个基因，全长9.3亿个
武汉植物园在淫羊藿叶绿体基因组研究中获进展
淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物，是我国常用大宗中药材，具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源，存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶绿体基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定，但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。 中国科学院武汉植物园副研究员张
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优，国际市场上的商品名为“medang”，和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群，但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日，中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar
武汉植物园发现桃基因组转座元件的进化机制
桃原产于我国，驯化和栽培历史超过三千年，桃花形态和颜色多样，集中在早春时节开放，成为春季主要的观赏景观之一，自2千多年前成书的《诗经》开始，一直是历代诗人反复歌咏的对象。而桃的果实风味鲜美、营养丰富，深受人们喜爱。桃自交亲和且基因组很小（230Mb左右），但品种间的表型差异相当丰富。 中国科学
植物DNA条形码研究项目2010年度会议在昆明召开
会 场 中国科学院大科学装置开放研究项目—依托种质资源库的植物DNA条形码研究年度进展会议于8月12日至13日在中国科学院昆明植物研究所召开，其间还举办了第二期“植物DNA条形码技术培训班”。来自中科院昆明植物研究所、中科院植物研究所、中科院华南植物园、中科院武汉植物园、中科院
基因组所小鼠组织新转录本鉴定研究取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用新一代测序数据，运用生物信息学方法，在小鼠的几个组织中发现了几千个新的转录本。该研究成果的完成拓宽了转录组数据分析的思路，有利于更全面地认识小鼠的转录组组成，并进一步补充了其基因组的注释，相关成果论文在frontiers in genetics
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
Nat－Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结
版纳植物园能源植物小桐子花序分生组织转录组分析获进展
能源植物小桐子(Jatropha curcas)为大戟科多年生木本植物，其种子油是加工生产生物燃油的优质原料。中国科学院西双版纳热带植物园能源植物分子育种组前期研究发现，用细胞分裂素处理能源植物小桐子，可以增加其小花总数和雌花数，并能诱导产生两性花，从而提高其种子产量。 该研究组的潘帮珍博士及
中科院上海辰山植物园荷花花蕾转录组分析获进展
近日，记者从上海辰山植物园（中科院上海辰山植物科学研究中心）获悉，该园观赏植物资源与创新利用研究组的研究人员在荷花花蕾转录组分析及SSR标记开发开展研究中获得重要进展，相关研究结果已在线发表于学术期刊《公共科学图书馆·综合》。 据悉，目前全球荷花品种已达2000个，但花色较为单一，缺乏蓝色、紫
深圳市化学基因组学重点实验室通过建设计划论证
2010年9月16日，深圳市科技工贸和信息化委员会组织专家在深圳对依托北京大学深圳研究生院的深圳市化学基因组学重点实验室―省部共建国家重点实验室培育基地的建设计划进行可行性论证。科技部基础研究司、深圳市科技工贸和信息化委员会有关负责同志以及依托单位的领导和实验室工作人员参加了会议。
版纳植物园完成蓖麻基因组bZIP家族鉴定与表达分析
蓖麻是双子叶胚乳型植物的典型代表，是大戟科中重要的油料作物，其种子油被广泛地应用在工业上。bZIP(basic leucine zipper)转录因子广泛分布于真核生物中，在植物中涉及多种生物进程，其中ABF亚族更是ABA信号途径中重要的调控因子。 中国科学院西双版纳热带植物园分子遗传
版纳植物园揭示壳斗科植物的基因组大小进化
物种的基因组大小是物种形成和多样化中最近处的性状。通过测定物种的基因组大小，有助于了解物种的染色体倍性和基因组进化，为全基因组测序提供基础数据，提高基因组多样性的生物信息学研究的效率。前人对植物基因组大小进化的研究多集中于温带草本类群，并且未与系统发育和地理分布相关联，对热带木本植物的基因组大小
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物，鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加，如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来，通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合，对植物基因组结构和特点深入解析，将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种
国家植物园：为植物保护贡献中国智慧
植物是地球生物多样性的核心组成部分，与人类生存和发展息息相关。设立活植物收集区，围绕植物进行科研、保护、展示与科普教育，这便是人类为神奇植物打造的温暖家园——植物园。 作为全球植物多样性最丰富的国家之一，中国拥有已知的高等植物3.7万余种，约占全球的1/10。中国植物园（树木园）迁地保护植物2
徐扬生散文集《黄昏的神仙湖》新书首发
4月22日，中国工程院院士、香港中文大学（深圳）校长徐扬生散文集《黄昏的神仙湖》新书首发暨分享会在香港中文大学（深圳）图书馆举行。这是继前作《摆渡人》出版6年之后徐扬生的又一全新作品集。记者获悉，《黄昏的神仙湖》于今年3月在深圳出版社出版。该书收录了徐扬生新近散文作品35篇，记录了他在成长、阅读、工
全球最大真空望远镜坐落云南抚仙湖畔
全球最大的真空太阳望远镜近日通过专家鉴定，在抚仙湖畔正常运转。 由云南天文台承担的国家重点基础研究发展规划项目，大型设备专项“一米新真空太阳望远镜”坐落在云南天文台抚仙湖太阳观测与研究基地。鉴定委员会由艾国祥院士、朱能鸿院士、张力教授等天文学和相关工程技术领域的学者、专家组成，经过现场测试和质
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校，NIH等处的研究人员利用一种新型方法，分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态，从而可以更好研究这一转录因子的功能，这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况，相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果，来自法国国家科学研究中心的François
研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
深圳启动生活垃圾分类公众教育“蒲公英计划”
净化大地就是要净化心灵，深圳生活垃圾分类公众教育蒲公英计划昨日启动，首批12位垃圾分类达人成为特聘垃圾分类志愿讲师，仙湖植物园、公园管理中心等4家“垃圾分类微课堂”也被授牌，深圳要打造成“人人知道分类，人人参与分类”的先锋城市。 打造不一样的先锋城市 据介绍，蒲公英计划是要建设市、区、街道、
武汉植物园发现蕨类植物叶绿体基因组进化的过渡形态
目前已知的蕨类植物叶绿体基因组在组织结构上表现为两种基本类型：一是核心型，高等核心薄囊蕨类水龙骨目和树蕨目具此类型;另一是基部型，见于其他蕨类基部类群。与基部型相比，核心型叶绿体基因组的反向重复区和大单拷贝区的rpoB-psbZ区(BZ区)发生过复杂的基因组重排，同时它们还丢失了5个相同的tRN
华南植物园揭示锥属物种基因组变异的驱动机制
遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研究的重要议题。已有研究表明，不同物种间的基因组变异模式存在一定的相似性，并受到多种进化力量的影响。然而，关于不同进化机制对相似基因组变异景观形成的贡献以及不同机制间复杂的互作模式尚不清楚。此外，已有研究多是基于近期快速辐射产生的物种或者少量分化时间较长的物种对，
华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图 中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行
招标公告：佛山仙湖实验室系统气相色谱仪
项目概况系统气相色谱仪 招标项目的潜在投标人应在佛山市禅城区汾江中路121号东建大厦27楼获取招标文件，并于2022年03月10日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号：XH202206-01-001项目名称：系统气相色谱仪预算金额：60.0000000 万元（人民币）最
Nature子刊发布重磅测序技术：基因组和转录组平行测序
四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序，同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。 研究人员用G&T-seq对220个小鼠
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描2
Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o