蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测序由日本Kazusa DNA研究所以S.Tabata博士领导的研究组,于1994年开始对集胞藻(Synechocystis sp. PCC6803)作分析,已于1996年完成。最近他们又基本完成了对鱼腥藻(Anabaena sp. PCC7120)的全序列测定。集胞藻6803的基因组大小为3,573,470bp,含有3168个编码蛋白的潜在基因,占全基因组87%。它的基因密度为1.1kb/基因,一个基因表达的产物平均长度为326个氨基酸残基,这些都是细菌基因组的典型数据。在3168个潜在基因中,1416个基......阅读全文
关于叶绿体基因组--cpDNA的基本介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA(cpDNA)是双链环状,缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
Nature:藻类基因组解读叶绿体秘史
我们初学生物时接触得最早的就是光合作用,光合作用利用二氧化碳、水和太阳能合成有机物。世界上最重要的光合作用真核生物(植物)多半并不是自己演化出光合作用能力的,它们的叶绿体是从其他生物中“拿来”的。 这些叶绿体来源于真核宿主吞食的光合细菌,这一过程被称为初级内共生。随后,红藻和绿藻中的叶绿体
细胞化学基础叶绿体基因组--cpDNA
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA(cpDNA)是双链环状,缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核
关于叶绿体基因组的基本特点的介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA(cpDNA)是双链环状,缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
武汉植物园在淫羊藿叶绿体基因组研究中获进展
淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物,是我国常用大宗中药材,具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源,存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶绿体基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定,但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。 中国科学院武汉植物园副研究员张
绿潮藻叶绿体基因组进化机理研究取得新进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503670.shtm石莼属海藻是一类具有重要生态功能和开发潜力的经济海藻,同时也是一类可以暴发性生长导致绿潮灾害的大型绿藻,在全球范围内广泛分布。近日,中国科学院海洋研究所海洋生态环境基因组学团队围绕石莼
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
叶绿体和光合色素
一、叶绿体 叶片是光合作用的主要器官,而叶绿体(chloroplast,chlor)是光合作用最重要的细胞器。(一)叶绿体的发育、形态及分布1.发育 高等植物的叶绿体由前质体(proplastid)发育而来,前质体是近乎无色的质体,它存在于茎端分生组织中。当茎端分生组织形成叶原基时,前质体的双层膜中
分析和比较各种基因组数据的多面手
Partek®是一家致力于开发与整合用于生命科学研究数据分析软件的公司。该公司的系列软件包括――Partek® Flow™, Partek® Genomics Suite™, and Partek® Pathway™――可以提供基因组数据分析的整体解决方案,也是唯一一家可以提供
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用实验
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用 试剂、试剂盒 Ham F10 培养基 胎牛血清
比较基因组杂交技术在肿瘤研究中的应用实验
比较基因组杂交(CGH) 可以提供肿瘤细胞全基因组染色体拷贝数改变的信息 [1]。与常规细胞遗传学分析不同,CGH 无需细胞培养,因此只要是可以获得 DNA 的临床标本,包括存档的石蜡包埋组织,都可以进行该实验 ra。CGH 可以在正常染色体上定位扩增或缺失的 DNA 序列,从而显示出重要基因的位点
叶绿体的结构和功能特点
叶绿体 ——也是双层膜状的细胞器,与线粒体类似,有自己的遗传物质,能够自己分裂增殖,自制本身所需的一些蛋白质。主要功能是进行光合作用,借由光能产生营养物质,也就是吸收光能,转变成化学能,并借此将无机物(二氧化碳和水)合成为有机物(糖类)。光表示光能,合表示合成。
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物,具有非常丰富的物种多样性和特有性,是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图 中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下,以报春苣苔属植物为材料,率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行
武汉植物园完成掌叶木和伞花木的叶绿体基因组解
掌叶木和伞花木是我国特有的无患子科植物,分别所属的掌叶木属和伞花木属是无患子科的单种属。近期,中国科学院武汉植物园研究人员通过浅层基因组测序技术组装了这两种植物的叶绿体基因组,为开展针对性种群遗传学研究和保护工作等提供重要的理论数据。在2021年公布的《国家重点保护野生植物名录》中,掌叶木和伞花木均
水生所蓝藻越冬和复苏的分子机理研究取得新进展
蓝藻细胞如何越冬是研究蓝藻水华形成的一个重要环节。微囊藻等水华蓝藻以营养细胞形式越冬,并不形成厚壁孢子,这类蓝藻越冬的分子机理也是蓝藻生物学研究的难点之一。近年来,中国科学院水生生物研究所的研究人员发现,如果不经过低温预处理,寒冷(5℃)和光照的双重胁迫可导致蓝藻死亡;但如果在15
比较基因组杂交芯片介绍
比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative g
比较基因组杂交芯片介绍
比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative gen
比较基因组杂交方法介绍
比较基因组杂交是将消减杂交、荧光原位杂交相结合,用于检测DNA序列的拷贝数变异并将其定位在染色体上的方法。CGH 只能检测不平衡的染色体改变。结构染色体变异,例如:平衡的相互易位或倒位不能被检测出来,因为拷贝数没有变化。CGH最初设计是用来检测单一副本缺失的,所以它的的区带长度至少5~10Mbarr
比较原核生物和真核生物基因组的结构特征
异:1、原核生物基因组很小,一般只有一条染色体;而真核生物基因组结构庞大。2、原核dna分子的绝大部分是用来编码蛋白质的,只有非常小的一部分不转录,这与真核dna的冗余现象不同。3、原核生物dna序列中功能相关的rna和蛋白质基因,往往丛集在基因组的一个或几个特定部位,形成功能单位或转录单位,它们可
科学家成功解析叶绿体基因转录蛋白质机器构造
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能,吸收二氧化碳,释放氧气,是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中,叶绿体基因要么被废弃,要么逐渐转移到细胞核染色体中,导致多数陆地植物叶绿体基因组只保留了110-130个基因。其中,大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合
叶绿体ATP酶的组成和功能
催化在叶绿体中合成ATP的酶与线粒体中的ATP酶十分相似。叶绿体中ATP酶也像门把位于类囊膜外侧。存在于不垛叠的类囊膜中。ATP酶可分为CF1和CF0两部分。CF0插在膜中,起质子通道作用,CF1由α3、β3、γ、δ、ε亚基组成,α、β亚基有结合ADP的功能,γ亚基控制质子流动,δ亚基与CF0结合,
叶绿体ATP酶的组成和功能
催化在叶绿体中合成ATP的酶与线粒体中的ATP酶十分相似。叶绿体中ATP酶也像门把位于类囊膜外侧。存在于不垛叠的类囊膜中。ATP酶可分为CF1和CF0两部分。CF0插在膜中,起质子通道作用,CF1由α3、β3、γ、δ、ε亚基组成,α、β亚基有结合ADP的功能,γ亚基控制质子流动,δ亚基与CF0结合,
叶绿体ATP酶的组成和功能
催化在叶绿体中合成ATP的酶与线粒体中的ATP酶十分相似。叶绿体中ATP酶也像门把位于类囊膜外侧。存在于不垛叠的类囊膜中。ATP酶可分为CF1和CF0两部分。CF0插在膜中,起质子通道作用,CF1由α3、β3、γ、δ、ε亚基组成,α、β亚基有结合ADP的功能,γ亚基控制质子流动,δ亚基与CF0结合,
水生所质疑光合膜形成机理获七实验室联合研究结果支持
光合作用是生物圈的能量基础,而光合作用发生于称为类囊体膜的光合膜上,因而光合膜形成机理成为生物学的重要问题之一。欧洲学者曾于2001年在PNAS同一期发表两篇论文(98: 4238-4242; 98: 4243-4248),分别在蓝藻(集胞藻)和高等植物(拟南芥)报道了一种蛋白VIPP1
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物,属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊,形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
科学家揭示德保苏铁叶绿体基因组特征
广西大学植物生理生态与进化课题组在苏铁植物的基因组学研究方面取得新进展,首次用苏铁的叶绿体全基因组重建了苏铁植物的系统进化树,揭示托叶铁科为非单系起源,该研究成果近日发表在《科学报告》上。 据介绍,研究人员通过对德保苏铁展开二代测序,获得了德保苏铁基因组几百万条的短片段,用先进的算法进行组装,
细胞质雄性不育与叶绿体基因组
CMS 与叶绿体的关系还存在很大的争议。相对于植物线粒体而言,叶绿体基因组较为保守也较小(120~160 kb),因此对它的认识要比对线粒体深入的多。研究发现植物叶绿体一般分为4个区:两个反向重复区,大单拷贝区和小单拷贝区。已有多种植物叶绿体的物理图谱被构建。对高粱的 CMS 系及相应保持系的叶绿体
连接叶绿体和植物细胞死亡的新的易位子相关组分研究
3月11日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员Chanhong Kim研究组等完成的题为TIC236 gain-of-function mutations unveil the link between plastid division and plastid p
英国研究构建叶绿体RNA聚合酶原子模型
叶绿体中的RNA聚合酶比较独特,它拥有比蓝藻还多的亚基,转录机制也更复杂。为进一步探究叶绿体RNA聚合酶的结构,英国约翰英纳斯中心科研人员使用冷冻电镜,对从白芥菜提取出来的叶绿体RNA聚合酶样本进行成像,并研究分析了其中的21个亚基等结构的作用,建立了原子水平的数据模型。该模型揭示了超氧化物歧化