Science重要成果：蛋白质组绘图新技术

蛋白质分子量的测定：SECMALS－与传统校正法（一）

溶液中蛋白质的物理性质和行为取决于与蛋白质的纯化和构成及其自身固有属性相关的多种因素。 尺寸排阻色谱 (SEC) 是一种强大的工具，常用于分析蛋白质的回收率、分子量和聚集性。 SEC 的工作原理涉及在样品流经多孔的惰性色谱柱基质时对样品进行分离。 较小的分子进入填料孔内，而较大的分子则被排除在外

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验

基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法，能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙

北京大学首次用小分子钯催化剂激活特定蛋白质

　　近日，北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组首次利用小分子钯催化剂激活了活细胞内的特定蛋白质，相关研究成果在《自然—化学》杂志在线发表。 　　利用化学小分子调控生物大分子是化学与生命科学交叉领域内受到长期关注的问题，而如何在活体环境下实现高度特异的调控是目前面临的最大挑战之一。 　　陈鹏课题组

蛋白质是重要的生物大分子氨基酸的结构性质

蛋白质是重要的生物大分子，其组成单位是氨基酸。组成蛋白质的氨基酸有20种，均为α-氨基酸。每个氨基酸的α-碳上连接一个羧基，一个氨基，一个氢原子和一个侧链R基团。20种氨基酸结构的差别就在于它们的R基团结构的不同。　　根据20种氨基酸侧链R基团的极性，可将其分为四大类：非极性R基氨基酸（8种）；不带

Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学

　　科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。　　基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用

            实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液

Folin酚法(Lowry)测定蛋白质的分子量应的注意事项

仪器有分光光度计 台式离心机 精密天平 三角瓶 烧杯 量筒 移液器 Folin—酚试剂法最早由Lowry确定了蛋白质浓度测定的基本步骤。以后在生物化学领域得到广泛的应用。这种蛋白质测定法是最灵敏的方法之一。过去此法是应用最广泛的一种方法，由于其试剂乙的配制较为困难（现在已可以订购），近年来逐渐被考马

“阿尔法折叠3”来了，极大提升对蛋白质—分子结构的预测能力

阿尔法折叠3通过准确预测蛋白质、DNA的结构以及它们如何相互作用，改变对生物世界和药物发现的理解。图片来源：深度思维/Isomorphic Labs《自然》8日报道了结构生物学最新进展——阿尔法折叠3的问世。它能以高准确率预测蛋白质与其他生物分子相互作用的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相

《Nature》蛋白质组发现明星分子KRAS为胰腺癌“充电”新机制

凝胶过滤法和SDS法哪个更加准确测定蛋白质分子量

蛋白质的形状影响凝胶过滤时候的行为，分子形状长的蛋白质在凝胶过滤的时候有类似于分子较大的蛋白的行为，用SDS-PAGE测定的蛋白质分子量应该比较准确，因为变形后的蛋白质迁移速度只取决于蛋白质分子大小。

常用的一些测定蛋白质分子量的几种方法介绍

1．凝胶过滤法　　凝胶过滤法分离蛋白质的原理是根据蛋白质分子量的大小。由于不同排阻范围的葡聚糖凝胶有一特定的蛋白质分子量范围，在此范围内，分子量的对数和洗脱体积之间成线性关系。因此，用几种已知分子量的蛋白质为标准，进行凝胶层析，以每种蛋白质的洗脱体积对它们的分子量的对数作图，绘制出标准洗脱曲线。未知

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙

若做的蛋白质分子量很小（10KD）应怎么做WB？

1）可选择孔径0.22um的PVDF膜或者NC膜，转膜时间缩短，另外可采用Tricine-SDS-PAGE体系；2）也可以选择PSQ 膜，同时缩短转移时间。也可以将两张膜叠在一起，再转移。其他按步骤即可。

哺乳动物细胞真核表达产物接近天然高等生物蛋白质分子

　哺乳动物细胞真核表达系统在表达过程中有翻译后修饰和折叠的功能，这一特点使其蛋白更接近天然蛋白，具备天然蛋白必须的空间结构和修饰，与天然蛋白有相同的生物活性，哺乳动物细胞表达系统在功能蛋白、抗体生产、临床疫苗的研发和生产中应用较为广泛。　　原核表达系统具有表达水平高、操作简单、周期短、易于大规模高密

Nature重磅蛋白质组发现明星分子KRAS为胰腺癌“充电”新机制

　　关键词：蛋白质组，SILAC，KRAS，癌症 　　来自德州大学的Giulio Draetta教授及其同事发现胰腺癌细胞表面的一种名为syndecan-1(SDC1)的蛋白质可以响应胞内KRAS的信号，并促进巨噬细胞的破坏作用。这项研究发表于最新的《Nature》杂志。 　　Letter |

怎样估计－2D－胶上蛋白质点的分子量和－pI－值？

可以用 BioRad 生产的 2D 胶标准蛋白来校准。也可以用体系内已知蛋白来做比对。

分子探针还是分子铁锤？

　　这一期的《Nat. Chem. Biol.》有一篇题为“The promise and peril of chemical probes”的评论文章，二十几个作者都是化学生物领头人，其中包括Stuart Schreiber和Brian Shoichet这样的大腕。文章回顾了早期分子探针的缺陷并对

分子荧光和分子磷光

　　分子和原子一样，也有它的特征分子能级，分子内部的运动可分为价电子运动、分子内原子在平衡位置附近的振动和分子绕其重心的转动。因此分子具有电子能级、振动能级和转动能级。　　分子从外界吸收能量后，就能引起分子能级的跃迁，即从基态跃迁到激发态，分子吸收能量同样具有量子化的特征，即分子只能吸收等于二个能级

新一代“阿尔法折叠”登场，预测范围从蛋白质扩展到其他生物分子

　　英国“深度思维”（DeepMind）公司日前公布了新一代“阿尔法折叠”（AlphaFold-latest），不仅准确性显著提高，预测范围还从蛋白质扩展到其他生物分子，包括配体。该模型已可以预测蛋白质数据库（PDB）中的几乎所有分子，预测精度可以达到原子级。　　对抗癌分子的结合（PORCN）、关键

Nature子刊：揭示渐冻症致病蛋白质SOD1构象转化分子机制

　　武汉大学梁毅教授团队和中国科学院上海有机所交叉中心刘聪研究员团队合作，在 Nature Communications 期刊发表了题为：Cryo-EM structure of an amyloid fibril formed by full-length human SOD1 reveals i

陈颖：基于分子生物学和蛋白质组学的食品真伪鉴别技术

　　 2014年7月31日，第二届国际检验检测技术与装备博览会在北京国家会议中心隆重召开（以下简称检博会）。本届博览会以“高端技术，服务民生”为主题，以“质检、科技、国际”为特色，秉着“搭建国际平台，服务检测市场”的宗旨，为科技服务水平提升、检验检测行业和谐发展、科技成果交流与合作、检验检测仪器拓展

一文读懂蛋白质转印原理－大分子量蛋白转印有哪些技巧

　　通过凝胶电泳分离蛋白后，蛋白质被转移到固体膜载体上进行后续步骤。有效的转印依赖于膜的选择、所使用的转印设备的类型以及转印缓冲液的组成。　　转印条件　　蛋白的有效转印依赖于蛋白质从凝胶中迁移出来，也依赖于蛋白在膜上的滞留。像凝胶电泳一样，转印步骤将带负电荷的蛋白转印到带正电荷的电极上。转印效率受所

用圆二色光谱蛋白质与小分子作用后的构象变化实验步骤

 实验步骤1. 准备样品        准确配制7.5 μg/mg的VB12溶液、5 μg/mg牛血清白蛋白溶液、pH=4的牛血清白蛋白溶液、pH=8的牛血清白蛋白溶液、pH=4的牛血清白蛋白+ VB12溶液和pH=8的牛血清白蛋白+ VB12溶液。蛋白质溶液中加入VB12后，需要放置一段时间，使蛋

SDS－聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质分子量

一、原理用聚丙烯酰胺凝胶电泳法分离鉴定蛋白质（protein），主要依赖于电荷效应和分子筛效应。再与标准样品对照即可确定各区带的成分。要利用凝胶电泳测定某样品的蛋白质分子量就必须去掉其电荷效应，使样品的蛋白质分子的迁移率完全取决于分子量。如在电泳体系中加入一定浓度的十二烷基硫酸钠（Sodiumdod

蛋白质根据蛋白质结构进行分类

纤维蛋白（fibrous protein）：一类主要的不溶于水的蛋白质，通常都含有呈现相同二级结构的多肽链许多纤维蛋白结合紧密，并为单个细胞或整个生物体提供机械强度，起着保护或结构上的作用。球蛋白(globular protein)：紧凑的，近似球形的，含有折叠紧密的多肽链的一类蛋白质，许多都溶于水

蛋白质的蛋白质的提取技术

选择材料及预处理 　　以蛋白质和结构与功能为基础，从分子水平上认识生命现象，已经成为现代生物学发展的主要方向，研究蛋白质，首先要得到高度纯化并具有生物活性的目的物质。蛋白质的制备工作涉及物理、化学和生物等各方面知识，但基本原理不外乎两方面。一是得用混合物中几个组分分配率的差别，把它们分配到可用机械方

蛋白质转印法检定蛋白质

蛋白质转印法检定蛋白质     蛋白质经SDS-PAGE后，胶片浸入转印缓冲液，蛋白质可被转印到硝化纤维纸（nitrocellulose） 上，先经?素洗去SDS，并使蛋白质回?原态抗原性，可使用抗体进?免疫染色 （Towbin et al, 1979）。仪器用具：电泳转印槽 （Hoefer Tra

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析—凝胶蛋白质激酶分析

试剂、试剂盒Tris-HClDTT盐酸胍尿素激酶分析缓冲液仪器、耗材SDS-PAGE实验步骤1. 准备下列材料：SDS-PAGE 要用到的所有试剂50 mmol/L Tris-HCl，室温（pH 8.0)，1 mmol/L DTT6 mol/L 盐酸胍，50 mmol/L Tris-HCl，室温（p

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验—蛋白质激酶C

试剂、试剂盒PKC 分析缓冲液组蛋白 HI 储存液磷脂酰丝氨酸甘油二油酸脂实验步骤1. 在冰浴的离心管内配制如下 20 μl 反应混合物：5X PKC 分析缓冲液                                        4 μl10 mg/ml 组蛋白 HI 储存液      

分子构型与分子构造的区别

构造一般都是指有机物的原子连接的方式，构型主要指基团的空间排列不同，特别是立体异构。结构是用元素符号和短线表示化合物(或单质)分子中原子的排列和结合方式的式子。有机物中构造包括结构式，结构简式、短线构造式、键线构造式、路易斯构造式。其中结构式就是所有原子间都有短线连接的，画起来最复杂。