补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...
补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙酸水溶液二甲基甲酰胺仪器、耗材 聚丙烯酰胺凝胶电泳光化学反应装置Sep-pak C18 胶片旋转真空干燥仪SigmacoteX 射线片实验步骤 一、材料与设备1. 聚丙烯酰胺凝胶电泳装置。2. 光化学反应装置(360 nm 长波长):建议采用 Rayons RPR-100 光化学反应装置 ( The Southern New England Ultraviolet Company,Branford,USA )。其他紫外光源 ( 如 Stratalinker ) 也都可以使用。此外,长波长的手提紫外灯(如 Model UVG......阅读全文
补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...
补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用
实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液
补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验
基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法,能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用
实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。
亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用
亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反
Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比
Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,
植物介导地上地下互作研究取得进展
从土壤颗粒到植物叶片,从动物牙齿到肠道表皮,地球上几乎每一个表面都有微生物的存在。这些微生物在诸如养分物质循环、动植物健康、生态多样性等方面起到至关重要的作用。早期的研究发现,植物作为媒介可以像“电话”一样为地上和地下生物传递信息。然而,地上地下微生物组是否也能通过植物进行传递尚不清楚。在近期完
植物介导地上地下互作研究取得进展
从土壤颗粒到植物叶片,从动物牙齿到肠道表皮,地球上几乎每一个表面都有微生物的存在。这些微生物在诸如养分物质循环、动植物健康、生态多样性等方面起到至关重要的作用。早期的研究发现,植物作为媒介可以像“电话”一样为地上和地下生物传递信息。然而,地上地下微生物组是否也能通过植物进行传递尚不清楚。在近期完
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体 DNA 模板 试剂、试剂盒d
RNA介导的基因沉默实验
实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c
线虫与大豆早期互作分子调控机制研究取得进展
大豆孢囊线虫(Heterodera glycines)严重威胁大豆生产。线虫有精准的化学感知系统,能识别寄主根部分泌的信号物质,进而实现定向定位和侵染寄主。揭示线虫化感系统分子调控机制,可为阐明其寄主识别过程、开发新型特异性杀线剂提供关键支撑。 近期,中国科学院东北地理与农业生态研究所在解析大
浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络
近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding
中国水稻研究所揭示作物与杂草互作分子机制
日前,中国水稻研究所种质创新团队与浙江大学等单位合作对近年来作物与杂草互作与进化的分子机制进展进行了综述,并提出该领域重要科学问题和今后研究方向,相关论文在线发表在《植物科学趋势》上。 该文揭示了野生植物、作物和杂草之间存在复杂的进化关系。作物驯化自野生植物,人类祖先把许多“草”变成了作物,即
RNA的提取与核酸的颜色反应
一. 目的学习用浓盐法从酵母中提取RNA掌握用等电点法沉淀RNA观察核酸的颜色反应,了解核酸定性与定量测定的原理熟练掌握普通离心机的使用方法二. 原理酵母繁殖快,生长周期短;其细胞质中的核酸大部分是RNA,而DNA很少;RNA提取液与菌体分离比较容易。因此,酵母是提取RNA的好材料。将RNA从细胞中
Journal-of-Neurosci:微小RNA分子调节应激的行为反应
慢性压力会影响我们的情绪和行为。神经精神科和行为神经遗传学的科学家们研究了大脑如何响应应激的分子机制。对于第一次,他们可以将应力相关的脑区域中微小RNA分子miR19b水平的变化,与小鼠异常行为联系起来。这些发现有助于更好地了解我们的大脑应对压力的办法。 各地阿龙Alon Chen陈导演的“马
我所提出聚集态蛋白质相互作用组的交联解析新方法
近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作
聚集态蛋白质相互作用组的交联解析方法获揭示
近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作
双分子消除反应的研究
双分子消除反应是双分子反应的一种,双分子消除反应为19世纪20年代,克里斯托夫·英果尔德(Christopher Kelk Ingold)与罗伯特·鲁宾逊((Robert Robinson)展开了一连串有机化学的研究,提出了许多现代有机化学里的观念,像是亲核性、亲电性、SN1反应、SN2反应、E1反
RNA干扰的发现与研究
RNAi是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA(antisense RNA)的过程中发现的,由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA(sense RNA)和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达,该结果不能使用反义RN
整合素分子介导Treg细胞在炎症反应中的活性
调节性T细胞(Treg)是一类特异性表达FoxP3,具有特殊功能的CD4+T细胞亚群,它对于抑制有害的T细胞反应具有十分重要的作用,然而其在T细胞稳态调节过程中的作用,以及在炎症反应过程中为何作用受限的具体原因至今不清楚。一些研究指出TGF-b信号参与了Treg的免疫抑制效应,然而具体TGF-b
研究分子互作——Nicoya-SPR-技术的新应用案例
Nicoya SPR数据让您的文章更上一层楼!2016年,加拿大滑铁卢大学的Dr. Dieckmann和他的团队用核磁共振波谱法检测最低CaM浓度和逐渐增加的CaM浓度与NOS肽结合的构象,并结合SPR技术,发现当CaM浓度增加时,相互作用的强度也增强了,并导致了蛋白构象变化。SPR数据在确定相互作
RNAseq综述(九)
通过研究RNA分子内的相互作用来研究RNA的结构核糖体RNA和tRNA构成细胞的大部分RNA。它们与其他结构非编码RNA一起在细胞中发挥各种作用,例如从基因调节到翻译。现存主要有两种研究RNA结构的方法:基于核酸酶的方法和化学探针方法。核糖核酸酶消化于1965年首次用于研究RAN(tRNA(Ala)
解析了直立穗基因和粒形基因间的分子和遗传互作效应
水稻品种产量潜力的提高,归功于株型的改良。而粳稻育种中,由弯曲穗型到直立穗型是十分重要的株型转变,但直立穗品种一般表现出外观品质较差等不良效应。水稻粒形、垩白等外观品质性状均属于复杂的数量性状。育种家很难通过传统方法来高效地改良水稻外观品质。通过分子标记辅助选择得到含有优异等位基因的近等基因系,
分子间的重排过程
分子间的重排可看作是几个基本过程的组合。例如,N-氯代乙酰苯在盐酸的作用下发生重排:先是发生置换反应产生分子氯,然后,氯与乙酰苯胺进行亲电取代反应得到产物。