高质量基因组揭示草果特有风味物质生物合成
近日，华南农业大学联合怒江绿色香料产业研究院、中国农业科学院深圳基因组研究所、广东药科大学等8家单位完成了草果（Amomum tsao-ko）高质量基因组组装工作及解析草果特有风味物质生物合成。相关研究在线发表于Horticulture Research。 草果是姜科豆蔻属重要的香料作物，也是传统的中药材。成熟的干果具有独特的香气和辛辣味而被人们广泛用作香料。草果具有重要的经济和药用价值，在我国云南、广西、贵州等地被广泛栽培。由于草果分子育种技术尚处在基础研究阶段，独特香气形成的生物学机制尚未清楚，草果基因组及相应的香气合成分子机理研究对后续草果产业的发展具有重要意义。 研究人员通过高深度的三代测序（ONT）技术（100×深度）获得了202g测序数据，使用NECAT和Racon软件对基因组进行组装以及抛光，获得了2.08Gb大小的contig级别基因组，其中N50= 4.7Mb，随后使用Hi-C数据进......阅读全文
黄连基因组公布，黄连生物碱生物合成机制被公开
2021年6月，湖北中医药大学刘义飞研究组联合中国中医科学院中药所陈士林团队、湖北省药品监督检验研究院汪波、聂晶团队、华中农业大学王学奎团队等单位合作在Nature Communications杂志在线发表了题为“Analysis of the Coptis chinensis genome r
半合成生物传感器揭示辅酶A代谢平衡
CoA半合成生物传感器以及对CoA代谢平衡的重新诠释 受访者供图 CoA由维他命B5在体内合成，是人体内最重要的代谢物（辅酶）之一，其参与体内众多代谢通路，比如三羧酸循环、氨基酸代谢、蛋白翻译后修饰以及基因表达调控等。“已有研究证明，神经退行性疾病、肥胖以及肿瘤等代谢性疾病的发生发展都与C
昆虫性信息素生物合成分子机制获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500834.shtm 近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业昆虫基因组学创新团队发表了东方粘虫和劳氏粘虫染色体水平参考基因组，破解了东方粘虫、劳氏粘虫和草地贪夜蛾的性信息素生物合成通路，找到了性信息
半合成生物传感器揭示辅酶A代谢平衡
中国科学技术大学生命科学与医学部特任教授薛林课题组与德国马克思普朗克医学研究所教授Kai Johnsson合作，构建并利用半合成生物传感器揭示辅酶A（CoA）细胞内的代谢平衡。10月31日，相关研究成果在线发表于《自然-化学生物学》。CoA半合成生物传感器以及对CoA代谢平衡的重新诠释 受访者供图C
研究揭示丝状真菌天然产物生物合成新机制
丝状真菌具有强大的次级代谢产物合成能力，可以产生结构复杂多样、具有广泛生物活性的化合物。目前，许多丝状真菌的次级代谢产物或其衍生物都已被开发成重要药物应用于临床中，包括青霉素、他汀类降血脂药物和抗真菌药物棘白菌素。探索丝状真菌次级代谢产物的生物合成机制，对于进一步挖掘次级代谢产物资源和开发新型药
昆明植物所揭示吡啶环生物合成新机制
生物碱是存在于自然界有机体中的一类含有负氧化态氮原子的环状化合物，其数量众多，结构复杂，大多具有广泛的生物活性，由其开发的药物约占全部植物药的40%以上。有关生物碱的研究是目前天然药物化学领域的重点和热点。吡啶生物碱作为生物碱的一类，其中的吡啶环是其发挥药效活性的关键基团。前人的研究表明大部分吡
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA（二）
5. 仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入1倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。 6. 在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。 7. 如DNA不形成絮状沉淀,则可用500
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA（一）
基因组DNA的提取概 述基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DN
咖啡基因组咖啡因、香气和风味的完美混合
研究人员已经对咖啡的基因组进行了测序，从而揭示了植物中咖啡因的演化并对这一大众饮料的广受欢迎的风味和香气提出了见解。该基因组序列还给科学家们一种用来快速定位在具体咖啡染色体上特定基因的工具，这是一种可帮助他们改善咖啡育种、加速研发新咖啡品种并增加咖啡植物对像气候变化及害虫等环境应力抵抗力的资源。
国产猕猴桃有望进入“精准设计育种”时代
中华猕猴桃与阔叶猕猴桃无缺口基因组图谱，受访者供图 在耕地面积有限的情况下，大幅提高农作物产量和品质是保证农业安全的必然途径。随着我国农业大数据与现代生物技术的应用，越来越多的物种进入育种4.0即精准设计育种时代。作为我国重要果业资源的猕猴桃产业也面临着从高产量向高品质的转变。近日中科院武汉植物
染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成
橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中，橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络 比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业，天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性，是任何国家必须具备的重要战略
研究首次揭示桃果实慢溶质性状形成分子机制
慢溶质桃因独特的肉质特点近年逐渐进入市场，其果实具有较长的硬熟期，最终仍能正常软化。近日，中国农业科学院郑州果树研究所桃遗传育种团队在《植物生物技术杂志》（Plant Biotechnology Journal）上发表研究论文。该研究首次揭示类受体蛋白激酶PpTHE1调控桃果实慢溶质形成机制，为桃果
高质量枸杞基因组被公开
2021年6月3日，Nature旗下期刊Communications Biology发表了宁夏农林科学院曹有龙研究员团队与福建农林大学刘仲健教授团队等合作完成的“Wolfberry genomes and the evolution of Lycium (Solanaceae)” 的重要成果。该
揭秘基因组“暗物质”
记国家自然科学基金重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制” 在人类遗传信息传递过程中，非编码RNA不参与编码蛋白质，占全部RNA的98%，如同宇宙中神秘的“暗物质”，是生命活动调控的“幕后推手”。 2014年起，中国科学家发起重大研究计划，并于2023年底完成结束评估。 在
揭秘基因组“暗物质”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516832.shtm非编码核糖核酸（以下简称非编码RNA）在生命活动调控的各个方面发挥着重要作用。研究非编码RNA对了解生命调控的本质不可或缺，是当前生命科学研究前沿热点。2014年，国家自然科学基金重大
什么是生物质和生物质废物？
生物质是指一切通过绿色植物的光合作用所形成的有机物质,包括微生物、植物和动物,及其排泄物、垃圾及有机废水等源自生物体的有机物质。生物质废物是人类在利用生物质的过程中生产和消费产生的废弃物,它仍然属于生物质的宏观范畴,但是能量密度、可利用性等都有显著的降低。
成都生物所揭示青藏高原特有蜥蜴物种体色两性异型的遗传进化机制
体色在动物生存、繁殖和个体交流过程中发挥着重要作用。蜥蜴因丰富多彩的体色而闻名于动物界。蜥蜴体色变异不仅存在于物种和种群之间，而且常呈现两性异型。尽管蜥蜴黑色素产生机制已较为清晰，但红色、橙色和蓝色等色彩尤其是两性异型体色的遗传基础尚不清楚。 分布于青海省海南藏族自治州的贵德沙蜥，为探讨体色两性异型
薹菜风味物质的顶空固相微萃取气质联用分析
薹菜风味物质的顶空固相微萃取-气质联用分析摘 要：利用顶空固相微萃取和气相色谱- 质谱联用分析技术，对春、秋两个季节栽培的3 个薹菜品种进行风味物质成分分析。共检测鉴定出了腈类、酯类、醛类、酮类、醇类等11 类化合物。其中(E)-2- 丁烯酸二乙酯、1-丁烯基-4- 异硫氰酸酯、2,4- 已二烯-1
生物质光催化转化制备合成气再获新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517061.shtm
中瑞生物质气化合成燃料技术合作取得进展
10月14日，由瑞典出资450万瑞典克朗建立的中瑞生物质气化合成燃料中试实验室在Midsweden university建成。联合实验室的建立得到了瑞典政府及企业界的大力支持。 中国科学院广州能源研究所负责燃气重整净化、组分调变及燃料催化合成系统的设计和建设。广州能源所生物质化
合成基因组学公司推出DNA生物打印的数字生物转换器
2017年8月，合成基因组学公司（Synthetic Genomics，SG）研究团队发布了一款数字生物转换器（digital-to-biological converter），能够将描述DNA、RNA或蛋白质的数字化信息发送到设备，并将其打印成原始生物材料的合成版本。该项研究发表在最新出版的《
烹饪对多品种南瓜营养风味变化的影响获揭示
在国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金等项目资助下，广东省农业科学院蔬菜研究所研究员钟玉娟团队成功揭示了烹饪对多品种南瓜营养风味变化的影响。相关成果近日发表于《食品化学-X》（Food Chemistry：X）。南瓜营养丰富，深受消费者喜爱，为了探究不同烹饪方式对其口感、营养和风味的影响，
红斑狼疮遗传暗物质生物学功能获揭示
上海交通大学医学院附属仁济医院风湿病学研究所教授沈南团队通过研究整合表观遗传学、3D基因组学及CRISPR技术，阐明了在狼疮发病关键通路中起重要调控作用的非编码RNA在特定免疫细胞亚群中异常表达的分子遗传学机制，为今后系统鉴定大量SLE非编码遗传因子的生物学功能及发展细胞特异性干预手段提供了新的研究
黄连助力解析小檗碱型生物碱生物合成机制
黄连是一种珍贵的中药材，其药用价值在神农本草经和本草纲目中均有记载。研究表明，黄连中的药用活性物质主要是小檗碱、黄连碱、药根碱、等原小檗碱类生物碱，并且这类物质被报道在心血管、糖尿病和癌症等的防治中具有重要作用。然而，由于基因组资源的限制，目前关于黄连地下根茎中丰富的原小檗碱型生物碱形成的进化机
胡萝卜基因组序列草图绘出－特有基因决定颜色营养价值
来自美国的一个研究小组称，他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序，绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称，这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程，对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。 胡萝卜和生菜、
托品烷生物碱生物合成途径的进化起源方面取得进展
在植物进化的特定时期，植物获得了生产结构丰富且功能多样的天然产物的能力，呈现出结构相似的天然产物集中于系统发育树上近源物种的分布特征。而部分结构相似的天然产物却零散地分布于系统发育树上远源物种中，如托品烷生物碱、类固醇和环烯醚萜等。当前，科学家主要通过单个酶的独立进化来阐明天然产物零散的分布特征
昆明植物所在进化起源方向最新进展
在植物进化的特定时期，植物获得了生产结构丰富且功能多样的天然产物的能力，呈现出结构相似的天然产物集中于系统发育树上近源物种的分布特征。而部分结构相似的天然产物却零散地分布于系统发育树上远源物种中，如托品烷生物碱、类固醇和环烯醚萜等。当前，科学家主要通过单个酶的独立进化来阐明天然产物零散的分布特征。实
菊科植物为何是进化最为成功的植物？
菊科植物丰富的物种多样性和超强的环境适应性，常被视为在进化上最为成功的植物，但是其背后的分子遗传机制尚不明确。 近日，北京市农林科学院杨效曾团队和北京大学李磊团队在权威期刊《自然·通讯》上发表题为“Comparative genomics reveals a unique nitrogen-c
基因组研究：揭示偏头痛的生物学根源
在偏头痛的研究中，研究人员第一次发现了新的5个遗传区域与偏头痛相关。这项研究为理解偏头痛的原因和生物因素打开了新的研究大门。 研究人员发现了12个与偏头痛相关的遗传区域。其中8个区域在控制脑电路中发挥着重要的作用，其中2个区域的相关基因主要作用为维持健康脑组织。这些信号通路的调节对于遗传易感性
高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成
9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。