高质量基因组揭示草果特有风味物质生物合成

近日,华南农业大学联合怒江绿色香料产业研究院、中国农业科学院深圳基因组研究所、广东药科大学等8家单位完成了草果(Amomum tsao-ko)高质量基因组组装工作及解析草果特有风味物质生物合成。相关研究在线发表于Horticulture Research。 草果是姜科豆蔻属重要的香料作物,也是传统的中药材。成熟的干果具有独特的香气和辛辣味而被人们广泛用作香料。草果具有重要的经济和药用价值,在我国云南、广西、贵州等地被广泛栽培。由于草果分子育种技术尚处在基础研究阶段,独特香气形成的生物学机制尚未清楚,草果基因组及相应的香气合成分子机理研究对后续草果产业的发展具有重要意义。 研究人员通过高深度的三代测序(ONT)技术(100×深度)获得了202g测序数据,使用NECAT和Racon软件对基因组进行组装以及抛光,获得了2.08Gb大小的contig级别基因组,其中N50= 4.7Mb,随后使用Hi-C数据进......阅读全文

高质量沙漠蝗虫基因组测序完成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481733.shtm 近日,美国农业部农业研究院(ARS)的一项研究公布了第一个高质量沙漠蝗虫基因组。这项研究是ARS的Ag100Pest计划的一部分。该计划旨在破译对农业和环境产生影响的100种害虫

谷子高质量图基因组“面纱”揭开

谷子即小米,起源于中国,作为粮食作物深受老百姓喜爱。近日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队,通过对谷子种质资源的基因组分析,组装了首个谷子高质量图基因组,系统阐明了谷子起源及驯化改良的过程,并创制了谷子图基因组精准高效育种方法,为培育谷子突破性品种提供了理论基础和

高质量的巴戟天基因组图谱发布

      中药材巴戟天来源于茜草科植物巴戟天(Morinda officinalis How)的干燥根,是我国著名的“四大南药”和“十大广药”之一,具有1700余年药用历史,并收载于历版《中华人民共和国药典》。巴戟天在广东省的栽培面积最大,产量占全国总产量的90%以上,肇庆市高要、德庆等地为历史道

菊科植物为何是进化最为成功的植物?

  菊科植物丰富的物种多样性和超强的环境适应性,常被视为在进化上最为成功的植物,但是其背后的分子遗传机制尚不明确。  近日,北京市农林科学院杨效曾团队和北京大学李磊团队在权威期刊《自然·通讯》上发表题为“Comparative genomics reveals a unique nitrogen-c

最新发现合成类胡萝卜素新的底盘细胞

中国农业科学院麻类研究所功能因子利用与生物合成创新团队研究人员从水稻根际土壤中分离得到一株新的红酵母,在染色体水平上首次获得了红酵母高质量基因组信息,并首次发现红酵母发酵代谢物具有很好的抗炎特性。该研究为合成类胡萝卜素细胞工厂的构建提供理论基础。相关研究结果最近发表在《国际生物大分子杂志》(Inte

生物质气化合成燃料关键技术及示范项目通过验收

  记者从中科院广州能源研究所获悉,由该所承担的科技部国际科技合作项目“生物质气化合成燃料关键技术及示范项目”通过了专家组验收。这标志着我国在突破生物质气化合成燃料关键技术方面取得重大进展。  这一国际科技合作项目于2008年正式启动。期间,中科院广州能源所通过引进消化意大利先进的生物质富

生物质资源、生物质发电现状及前景

  我国可作为能源利用的农作物秸秆及农产品加工剩余物、林业剩余物和能源作物等生物质资源总量每年约4.6亿t标准煤。目前,我国生物质能年利用量约3500万t标准煤,利用率仅为7.6%。图片来源于网络  2016年非化石能源在我国电力装机容量结构中的占比达到36.6%,但在发电量中的占比则仅为28.9%

向红豆杉“取经”如何高效合成抗癌明星药

  想高效合成分子结构复杂的抗癌明星药紫杉醇,人类还得向珍惜濒危植物红豆杉“取经”。  7月15日,中国农业科学院(深圳)基因组研究所(以下简称基因组所)和湖南农业大学等合作,于《自然—植物》在线发表了南方红豆杉染色体级别的高质量参考基因组,并全面解析了紫杉醇生物合成的遗传基础。  难以为继:抗癌明

动植物营养互作提高活性物质生物利用度获揭示

广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所畜禽加工研究团队在动植物营养互作提高活性物质生物利用度研究方面取得新进展。相关研究发表于Food Research International。程镜蓉副研究员、研究生沈双伟为该论文共同第一作者,刘学铭研究员为通讯作者。虾青素是一种强抗氧化剂,具有抗氧化、抗炎和抗

合成类胡萝卜素新的底盘细胞发现了

记者5月22日从中国农业科学院麻类研究所获悉,该所功能因子利用与生物合成创新团队研究人员从水稻根际土壤中分离得到一株新的红酵母,在染色体水平上首次获得了红酵母高质量基因组信息,并首次发现红酵母发酵代谢物具有很好的抗炎特性。该研究为合成类胡萝卜素细胞工厂的构建提供理论基础。相关研究结果最近发表在《国际

研究揭示环孢霉素合成机理及生物学功能

10月2日,国际学术期刊mBio 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所王成树研究组题为Cyclosporine biosynthesis in Tolypocladium inflatum benefits fungal adaptation to the env

中国热科院在益智显微结构、风味与药效物质积累方面取得新进展

近日,中国热科院品资所南药与健康研究中心团队首次对益智绘制了显微结构、超微结构、风味感官和全谱代谢组时空图谱,揭示了益智果皮辣味、假种皮甜味和种子苦味的关键风味代谢物。研究发现主要药效物质圆柚酮与苦味显著正相关,主要富集在种皮,提出种皮苦味程度可作为评价益智中圆柚酮含量高低的指标。研究结果为深入理解

Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组

  据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。  在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。  目前虽然许多病毒未

我国首次成功破译茶树基因组

   茶作为最早饮料,其相关的可信记录可以推至公元前三世纪--商代时期。茶叶不仅在中国而且在世界范围内具有巨大的经济和文化价值。日前,我国科学家经过七年研究,终于率先在国际上破解了茶树的基因组。   相对于“世界三大饮料植物”中的咖啡和可可而言,茶树基因组具有高杂合、高重复和基因组庞大等特点。由中科

关于米曲霉蛋白酶的基因分析介绍

  相同培养条件下的不同米曲霉菌株之间进行了比较基因组学和蛋白质组学的研究,分析酱油发酵过程中米曲霉的关键基因和蛋白对酱油风味产生的影响。通过米曲霉3.042(中国卿米曲霉RIB40(日本)菌株的基因姐学比较,发现与酱油风味物质形成相关的特异基因。围绕米曲霉3.042及其诱变菌株米曲霉100-8的蛋

时空组学技术为葱属植物育种应用提供新线索

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511819.shtm 11月7日,记者从深圳华大生命科学研究院获悉,该院与西北工业大学研究团队基于时空组学技术,揭示葱属植物重要性状形成和演化的分子机制,将为推动葱属作物进入分子育种新阶段提供新线索

我国学者在中药五味子药效成分木脂素的生物合成途径解析方面取得进展

图 五味子联苯环辛烯型木脂素生物合成及其起源进化  在国家自然科学基金项目(批准号:U23A20511、82204576)等资助下,中国医学科学院药用植物研究所刘海涛研究员团队、东北林业大学徐志超教授团队与中国医学科学院药用植物研究所刘久石副研究员等合作,在中药五味子药效成分木脂素的生物合成途径解析

菊科植物为何是进化最为成功的植物?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506504.shtm科技日报记者 马爱平菊科植物丰富的物种多样性和超强的环境适应性,常被视为在进化上最为成功的植物,但是其背后的分子遗传机制尚不明确。近日,北京市农林科学院杨效曾团队和北京大学李磊团队在权

山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制

  山苍子,是我国南方家喻户晓的一种香树,其果实有香气,无毒,可治疗急性肺炎,有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄  4月3日,《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色

研究揭示葡萄驯化的基因秘密

  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所揭示了葡萄驯化过程中的基因渐渗历史,研究为葡萄基因组设计育种提供理论参考。相关研究成果在线发表在《美国国家科学院院刊(Proceedings of the National Academy of Sciences, PNAS)》。  研究首次利用机器学习手

全球首个血橙高质量基因组发布

5月19日,重庆市农科院发布消息,该院果树所柑橘创新团队杨蕾、洪林、王敏、李霜等研究人员发布了国际首个血橙高质量基因组。相关研究成果以学术论文近日在国际期刊《科学数据》发表。杨蕾介绍,血橙是一种极具特色的甜橙品种,具有较高的花青素含量,其含有的多种成分对人体健康有益。目前,国内血橙主要在川渝地区种植

接近完整:高质量白菜基因组图谱发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组,揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》(Plant Biotechno

全球首个血橙高质量基因组发布

5月19日,重庆市农科院发布消息,该院果树所柑橘创新团队杨蕾、洪林、王敏、李霜等研究人员发布了国际首个血橙高质量基因组。相关研究成果以学术论文近日在国际期刊《科学数据》发表。杨蕾介绍,血橙是一种极具特色的甜橙品种,具有较高的花青素含量,其含有的多种成分对人体健康有益。目前,国内血橙主要在川渝地区种植

首个藜麦高质量参照基因组公布

  英国《自然》杂志2月8日在线发表的一篇植物科学论文,公布了首个藜麦高质量参照基因组。这项新成果将促进藜麦的遗传改良和育种策略,有望提高全球粮食安全。  藜麦是一种营养丰富、无麸质、血糖指数低的作物,所含人体必需的氨基酸、纤维、脂肪、碳水化合物、维生素能和矿物质达到出色的平衡,是唯一一种单体植物,

抗根肿病芜菁高质量参考基因组发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/478019.shtm 芸苔属植株在长期对抗根肿病菌的过程中CR基因的进化模型   课题组供图 近日,华中农业大学教授张椿雨、教授杨庆勇团队与沈阳农业大学教授朴钟云团队合作,发布了抗根肿病的欧

我国学者揭示吸血蝙蝠专门以吸血为食的演化适应机制

  吸血蝙蝠,是专门以吸血为食的蝙蝠。是哺乳类唯一专门以吸血为食的类群。血液里边不仅含有大量的细菌和病毒,而且营养物质也极度缺乏——碳水化合物和维生素太少,盐含量过多。专门以血液为食对物种生存是一个极大的挑战。  昆明动物所的研究表明,吸血蝙蝠演化出了专性食血的特殊适应。研究人员对普通吸血蝙蝠(拉丁

研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库

近日,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构,在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展,研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本,分别构建了包含1.6亿

我所发表生物质光催化转化制合成气的综述文章

原文地址:http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202304/t20230419_6741130.html  近日,我所生物能源研究部生物能源化学品研究组(DNL0603组)王峰研究员团队与大连理工大学王敏研究员团队合作,受邀发表了生物质光催化转化制备合成气的综述文章。

大连化物所发展出利用生物质合成共聚酯单体新方法

  近日,中国科学院院士、中科院大连化学物理研究所催化与新材料研究室(十五室)研究员张涛与研究员王爱琴/李宁团队,联合生物能源化学品研究组研究员(DNL0603)王峰团队,发展出一种利用乙醛和丙烯酸酯的生物质合成共聚酯单体新方法。  随着现代社会的快速发展,各行各业对性质可调的共聚酯需求越来越高。聚

大连化物所发展出利用生物质合成共聚酯单体新方法

  近日,中国科学院院士、中科院大连化学物理研究所催化与新材料研究室(十五室)研究员张涛与研究员王爱琴/李宁团队,联合生物能源化学品研究组研究员(DNL0603)王峰团队,发展出一种利用乙醛和丙烯酸酯的生物质合成共聚酯单体新方法。  随着现代社会的快速发展,各行各业对性质可调的共聚酯需求越来越高。聚