关于RNA剪接的基本介绍
RNA剪接 （RNA splicing）是指从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。RNA剪接机制的研究,是80年代生物化学和分子生物学领域中最有生机的研究课题之一,它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化问题都是有力的推动,另外,核酸分子的催化功能的发现拓宽了人们对于酶的认识。......阅读全文
PNAS：RNA剪接调控研究方面新的进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪
简述RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必
Nature：针对RNA转录和剪接的新观点！
细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子；它被核膜包围着，容纳着基因组。然而，细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室，就像水中的油滴。在过去两年中，这些称为液滴状“凝聚物（condensates）”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今，在一项新的研究中
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
关于RNA聚合酶的基本信息介绍
RNA聚合酶（RNA polymerase）是以一条DNA链或RNA为模板，三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶，因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称转录酶。
关于核糖体RNA的基本内容介绍
核糖体RNA，即rRNA，是细胞内含量最多的一类RNA，也是3类RNA（tRNA，mRNA，rRNA）中相对分子质量最大的一类RNA，它与蛋白质结合而形成核糖体，其功能是在mRNA的指导下将氨基酸合成为肽链 [1] （肽链在内质网、高尔基体作用下盘曲折叠加工修饰成蛋白质，原核生物在细胞质内完成）
关于基因剪接的简介
基因组中或基因组间发生遗传信息的重新组合，被称为DNA重组（DNA recombination），其中发生在基因组中的DNA重组又称DNA重排。包括同源重组、特异位点重组和转座重组等类型，广泛存在于各类生物。体外通过人工DNA重组可获得重组体DNA，是基因工程中的关键步骤。
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达，这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa，称为“小活化RNA”（saRNA）。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日，国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制，揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向
METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接
RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点，对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能详。事实上，大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点，这提示还有其他m6A甲基化酶。确实，在METTL3之后，METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶，但是它的底物远不如METTL3
信使RNA的基本信息介绍
信使RNA（mRNA）最早发现于1960年，在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成，具有以下特点。 1.含量低，占细胞总RNA的1%~5%。 2.种类多，可达105种。不同基因表达不同的mRNA。 3.寿命短，不同mRNA指导合成不同的蛋白质，完成使命后即被降解。细菌mRN
RNA聚合酶的基本介绍
RNA聚合酶（RNA polymerase）：以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5′-三磷酸合成RNA的酶。 催化转录的RNA聚合酶是一种由多个蛋白亚基组成的复合酶。如大肠杆菌的 RNA聚合酶有五个亚基组成，其分子量为480000，含有α，β，β’，σ，ω等5种不同的多肽，其中α为两个分
RNA干扰回复实验的基本介绍
RNA干扰回复实验，主要是为了说明Off-target效应。 Off-target效应 Off-target effects（脱靶效应）最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出（Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can I
RNA探针的基本信息介绍
RNA探针是一类很有前途的核酸探针，由于RNA是单链分子，所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针，这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的，标记效率往往不高，且受到多种因素的制约。这类RNA探针主要用于研究目的，而不是用于检测。例如，
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
关于RNA沉默的分类介绍
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS)； 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(t
关于反义RNA的来源介绍
细胞中反义RNA的来源有两种途径：第一是反向转录的产物，在多数情况下, 反义RNA是特定靶基因互补链反向转录产物, 即产生mRNA和反义RNA的DNA是同一区段的互补链。第二种来源是不同基因产物，如OMPF基因是大肠杆菌的膜蛋白基因，与透性有关，其反义基因MICFZE则为另一基因。
关于RNA编辑的分类介绍
RNA编辑主要类型有： ①简单编辑，单碱基转变的转录后调节； ②插入编辑，插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失，其机制是转录链的跳格； ③泛编辑，插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶，其机制是编辑序列由外源反义引导RNA（ gRNA）提供，gRNA在编辑体（editosome）核蛋
关于卫星RNA的特点介绍
Schneider（1969年）在烟草环斑病毒中首次发现了卫星RNA,他们通常有以下几个特点： 1、多个卫星RNA分子可与辅助病毒基因组存在于同一衣壳中。 2、对宿主植物无独立的侵染性。 3、其复制和包装全部依赖于辅助病毒而后者不依赖于前者。 4、不具有mRNA活性。 5、与辅助病毒的
关于RNA干扰的发现介绍
RNAi是在研究秀丽新小杆线虫（C. elegans）反义RNA（antisense RNA）的过程中发现的，由dsRNA介导的同源RNA降解过程。1995年，Guo等发现注射正义RNA（sense RNA）和反义RNA均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par-1基因的表达，该结果不能使用反义
单链RNA的基本信息介绍
一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒（如脊髓灰质炎病毒）的ssRNA可直接起mRNA作用，转译早期蛋白质，包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下，以ssRNA（正链）为模板
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日，国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
关于卫星RNA的加工的介绍
在具侵染性小分子RNAs的复制机制中,RNA的加工最令学者们兴趣,即是在多聚体形式与相关的线状和环状单体之间的切割与连接过程。1986年有学者发现烟草环斑病毒ToRSV与卫星RNA 正链二聚体在接点处自我切割,产生具有感染性的线状单休。随后,又发现包含有ASBV的正链与负链的二聚体的体外转录休能
关于RNA的自我复制的介绍
进一步的研究还发现一些RNA病毒如R17、f2、MS2等,可以以RNA为模板直接复制新的RNA。这些病毒都属于最简单的类型。例如,MS2的RNA只含有大约350个核苷酸,仅编码三种蛋白质：外壳蛋白,附着蛋白（attachment protein,其功能主要是使病毒能附着于寄主细胞并进入其内部）、
研究揭示甘蔗花叶病毒干扰RNA剪接促进侵染
近日，中国农业大学植物保护学院教授周涛课题组在甘蔗花叶病毒（SCMV）相关研究上获得了新进展。研究发现，SCMV侵染改变了玉米八氢番茄红素合成酶基因（ZmPSY1）的转录本可变剪接模式，因此促进病毒侵染。相关成果发表于《植物生理学报》。 SCMV是我国和非洲玉米生产上的一种主要病原，广泛分布于世
Nature：首次发现RNA剪接与衰老之间存在因果关系
生物通报道：衰老是各种破坏性慢性疾病的一个重要危险因素，但是，随着时间推移生物学因素如何影响“细胞何时以及多快的衰老”，在很大程度上仍然是未知的。现在，由哈佛大学T.H. Chan公共卫生学院带领的一个研究小组，将细胞机器——其在一个称为“RNA剪接”的过程中切割和重新连接RNA分子——的一个核
关于微RNA的历史发现介绍
MicroRNA（miRNA）是一类内生的、长度约20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNAs也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNAs的组合来精细调控某个