PNAS：RNA剪接调控研究方面新的进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪接成为成熟的mRNA一般需要在多种蛋白质及snRNA的帮助下，经历两步转酯剪接反应来完成。目前对于第二步剪接反应的调控知之甚少。 冯英研究组在前期工作中发现了一种特殊的mRNA前体，该前体在剪接反应已经开启的情况下，仅将转酯反应进行到第一步即停止，第二步反应则被完全抑制。冯英研究员指导的博士生李璜等研究人员对造成这一特殊现象的机制进行了深入研究。利用多种体外、体内的剪接模型以及定点突变，研究组发现剪接位点附近形成的RNA二级结构会显著抑制第二步剪接反应的发生;同时还发现单链DNA结合蛋白FUBP1通过与剪接沉默子(ESS)元件结......阅读全文
PNAS：RNA剪接调控研究方面新的进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应：RNA的内含子部分
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子；被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个
RNA剪接为什么会出错
“这项研究不仅提出了用小分子药物治疗维斯科特-奥尔德里奇综合征的新目标，而且为RNA剪切的基础生物学提供了新的线索，这是一个重要的但尚未完全被理解的过程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte说，他是Salk基因表达实验室的教授和Roger Guillemin主席。患
关于RNA剪接的基本介绍
RNA剪接 （RNA splicing）是指从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。RNA剪接机制的研究,是80年代生物化学和分子生物学领域中最有生机的研究课题之一,它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至
关于RNA剪接的定义介绍
RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程,通过RNA剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mRNA,它对生物的发育及进化至关重要。所以RNA剪接识别是正确理解基因表达过程的重要一步,而剪接的识别的关键是依赖于剪接位点的判定。真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
Nature：针对RNA转录和剪接的新观点！
细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子；它被核膜包围着，容纳着基因组。然而，细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室，就像水中的油滴。在过去两年中，这些称为液滴状“凝聚物（condensates）”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今，在一项新的研究中
简述RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必
PNAS：游戏玩家教你设计RNA
研究人员发现，与计算机相比，网络游戏玩家可以更好的预测和设计RNA折叠。这一发现能为新兴的分子工程领域带来什么样的启示呢？ RNA可以被弯曲、成环和扭转形成多种不同的结构，这种自我装配的分子在生物学和生物工程领域具有关键性的作用，其应用前景非常广阔。许多研究者们都在设计能够折叠
《PNAS》:RNA“质检员”被发现
在8月14日的《PNAS》网络版上，来自日本京都大学的研究人员发表的最新研究成果发现，脊椎动物细胞内有一套严格的"质量管理"机制来确保只有正确的信息从细胞核传递到细胞质，以防止不可靠信息在蛋白质合成过程中发挥作用。 DNA复制过程是以DNA双链中的一条链为模板合成的RNA，而由于合成蛋白组的核糖体在
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日，国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制，揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向
METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接
RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点，对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能详。事实上，大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点，这提示还有其他m6A甲基化酶。确实，在METTL3之后，METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶，但是它的底物远不如METTL3
Nature：首次发现RNA剪接与衰老之间存在因果关系
生物通报道：衰老是各种破坏性慢性疾病的一个重要危险因素，但是，随着时间推移生物学因素如何影响“细胞何时以及多快的衰老”，在很大程度上仍然是未知的。现在，由哈佛大学T.H. Chan公共卫生学院带领的一个研究小组，将细胞机器——其在一个称为“RNA剪接”的过程中切割和重新连接RNA分子——的一个核
研究揭示甘蔗花叶病毒干扰RNA剪接促进侵染
近日，中国农业大学植物保护学院教授周涛课题组在甘蔗花叶病毒（SCMV）相关研究上获得了新进展。研究发现，SCMV侵染改变了玉米八氢番茄红素合成酶基因（ZmPSY1）的转录本可变剪接模式，因此促进病毒侵染。相关成果发表于《植物生理学报》。 SCMV是我国和非洲玉米生产上的一种主要病原，广泛分布于世
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
PNAS颠覆性发现：RNA自行打包
利兹大学的研究人员解析了简单RNA病毒生命周期中的关键阶段，开辟了抵御病毒疾病的新战线。 研究人员首次在单分子水平上观察到了单链RNA病毒的核心遗传物质(基因组)将自己打包进入蛋白衣壳的全过程。利兹大学Peter Stockley教授介绍说，这项结果颠覆了人们对病毒包装过程的普遍认知，
PNAS：小分子RNA引发肥胖代谢问题
科学家发现了机体生物事件链中的一种关键分子，这些事件会导致脂肪肝疾病，2型糖尿病和其他与肥胖有关的代谢异常疾病。通过阻挡这种分子，研究人员就能够扭转肥胖小鼠中其引发一些病理发展。这项研究结果刊登在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上。MIR-34A是一种小分子RNA，在肥胖小鼠和患有脂肪肝的患者
张建之教授PNAS解析RNA编辑
如果一些编码位点的RNA编辑受损，就会引起严重的疾病。因此，一些人认为编码性RNA编辑是对人体有利的。 近年来的基因组研究显示，人类基因组中有超过一千个编码位点受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)编辑。许多这样的RNA编辑事件属于非同义替换。 现在
PNAS：病毒小RNA抑制登革病毒复制
每年有超过100个国家报道了近100百万例登革病毒(Dengue virus，DENV)感染性疾病，包括50万例登革出血热。伊蚊属的埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)是DENV的主要传播者。MicroRNA(miRNA)是一类具有调控功能
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日，国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
PNAS：研究反义RNA的一条捷径
双链DNA在转录过程中打开，其中一条链生成作为蛋白翻译模板的信使RNA。偶尔，另一条DNA也能产生一个反义的RNA分子(asRNA)，这种反义RNA的序列与信使RNA互补。许多细胞中都存在这样的asRNA，但人们并不了解这些分子有何功能。近日，科学家们开发了一个分离和鉴定反义RNA的新
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学