SD序列的翻译影响

一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。SD序列与起始密码子AUG之间的序列对翻译起始效率的影响则表现在碱基组成和间隔长度两个方面。实验结果表明,SD序列后面的碱基若为AAAA或UUUU,则翻译效率最高,而为CCCC或GGGG的翻译效率刚分别是最高值的50%和25%。紧邻AUG的前3个碱基对翻译起始效率也有影响,对于大肠杆菌β一半乳糖苷酶的mRNA而言,在这个位置上最佳的碱基组合是UAU或CUU,如果用UUC,UCA或AGG取代之,酶的表达水平降为1/20。 SD序列与起始密码子之间的精确距离保证了mRNA在核糖体上定位后,翻译起始密码子AUG正好处于核糖体中的P位,这是翻译启动的前......阅读全文

核酸序列扩增法的定义

中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定  义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN

关于尾随序列的基本介绍

  尾随序列指真核基因组转录单位中位于3'末端不翻译为肽链的部分,在遗传信息由DNA转录为mRNA过程中尾随序列同时被转录。真核细胞的mRNA长度约1〜2kb;包括前导序列、编码区及尾随序列;后者的长度有时可达lkb。

非编码序列的概念

中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定  义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

表达序列标签图的定义

中文名称表达序列标签图英文名称expressed sequence tag map定  义标明表达序列标签在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

什么是基因的核心序列?

中文名称核心序列英文名称core sequence定  义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

人体鱼序列征的概述

  人体鱼序列征(sirenomelia seguence)即并腿畸胎序列征,因其形体与神话中的美人鱼相似而得名。此种畸形少见,发生率约1/24000-1/67000(由于以往将此种畸形归于尾发育不全,发生率可能被低估)。此种畸形的形成可能与血管窃血现象有关。即一条由卵黄动脉衍化而来的粗大畸形血管起

随机序列库的纯化实验

            实验方法原理 实验材料 DNA 库 试剂、试剂盒 氢氧化铵

侧翼序列的主要组成

侧翼序列包括前导区、尾部区、调控区,调控区又包括启动子、增强子、终止子等:1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'U

简单重复序列的功能特点

SSR 标记具有高度重复性、丰富的多态性、共显性、高度可靠性等优点,但由于其需要对所研究物种的一系列微卫星位点进行克隆和测序分析,以便设计相应的引物,这是非常费时、费力和代价昂贵的工作,没有足够的投资、人力和时间,是不可能实现的,因而给它的利用带来了一定困难。

DNA微序列技术

·         Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing, 

DNA-序列分析技术

            实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略  目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的

DNA-序列分析技术

试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪

序列排比额概念

中文名称序列排比英文名称sequence alignment定  义核酸或蛋白质序列的比较分析法。将序列之间的相同和不同部分排列出来,由此显示序列间的相关性或同源性程度。常借助计算机软件进行分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

什么是回文序列?

遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中心,对称中心两侧碱基关于该对称中心对称,可形成互补。故回文序列能够形成

DNA-序列分析技术

DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干

核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋

蛋白质翻译后修饰的验证问题

Why are proteins, detected by mass spectrometry, not validated by site-specific antibodies?The modified motif could be detected by mass spectrometry (

清华学者揭示新的mRNA翻译终止机制

   2016年12月1日,清华大学生命科学学院、结构生物学高精尖创新中心高宁课题组和合作者在《Nature》在线发表题为Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2的研究论文。该论

生物学的翻译是什么意思?

翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达还包括转录)过程中的第二步(转录为第一步),翻译是根据遗传密码的中心法则,将成熟的信使RNA分子(由DNA通过转录而生成)中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如转运RNA(tRNA)、

关于翻译后修饰蛋白质的介绍

  前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、

Science:本不应出现的蛋白挑战翻译法则

  在额颞痴呆FTD(也称额颞叶变性FTLD)和肌萎缩侧索硬化ALS等遗传性神经退行性疾病中,细胞内有一种神秘蛋白在累积。这些本不应被翻译出来的蛋白很可能就使疾病中的罪魁祸首。现在,研究人员揭开了上述蛋白的神秘面纱,有望使它们成为治疗的新靶标。   FTD 和ALS属于同一类神经退行性疾病,二

关于密码子翻译起始效应的介绍

  mRNA浓度是翻译起始速率的主要影响因素之一,密码子直接影响转录效率,决定mRNA浓度。如单子叶植物在“翻译起始区”的密码子偏性大于“翻译终止区”,暗示“翻译起始区”的密码子使用对提高蛋白质翻译的效率和精确性更为重要,因此,通过修饰编码区5′端的DNA序列,来提高蛋白质的表达水平将有望成为可能。

试管内成功再现抑制mRNA翻译的过程

    生命是根据基因的设计图被制作出来的蛋白质起作用而延续的。蛋白质的合成首先是DNA信息被一部分mRNA转录,接着mRNA与蛋白质的合成工场“核糖体”会合,核糖体按照mRNA的信息去与氨基酸连接(叫做“翻译”)。这就是生物的基本结构。      近年,人们知道了仅仅20几个碱基连接的“mic

原核细胞体外翻译系统

实验材料 适用于杯状 DNA 的 S30 提取物 适用于线状 DNA 的 S30 提取物 适用于环状 DNA 的 T7S30 提取物 试剂、试剂盒 无核酸酶的水 [35S] 标记的甲硫氨酸 1 mmol L 缺少中硫氨酸的氨基酸混合物 缺少氨基酸的 S30 反应混合液 仪

评论:别因“翻译”误伤科学

   近日,一项国际研究团队对我国雾霾的研究在网络上被一些网友质疑。研究报告认为,中国目前的雾霾成分与英国伦敦1952年的“夺命雾霾”成分不同,而这些网友认为,这样的研究结果是预设的,不可信。  细看这则700多字的报道,科学家只是比较了雾霾成分的酸碱度和颗粒大小的比较:伦敦“夺命雾霾”颗粒是强酸性

原核细胞体外翻译系统

            实验材料 适用于杯状 DNA 的 S30 提取物 适用于线状 DNA 的 S30 提取物   适用于环状 DNA 的 T7S30 提取物

原核细胞体外翻译系统

实验材料 适用于杯状 DNA 的 S30 提取物 适用于线状 DNA 的 S30 提取物 适用于环状 DNA 的 T7S30 提取物试剂、试剂盒 无核酸酶的水 [35S] 标记的甲硫氨酸 1 mmol L 缺少中硫氨酸的氨基酸混合物 缺少氨基酸的 S30 反应混合液仪器、耗材 —70℃ 冰箱 微量移