荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的...

荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的影响与应用实时荧光定量PCR技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针或相应的荧光染料来实现其定量功能的。由于其精准度好、灵敏度高,在分子生物学研究和医学研究等方面得到了广泛的应用,尤其是在基因表达差异分析方面。基因表达差异分析一般是比较不同时空样本或不同处理样本(药物处理,物理处理和化学处理等)之间特定基因的表达差异。当检测出某个基因的表达是上调或下调时,我们并不知道这种表达差异是源自于它本身表达量的变化,还是样本量大小或者操作导致的RNA的损失等其他原因导致表达量的变化。为了减少实验偏差并产生准确的表达水平,RT-qPCR往往需要考虑几个变量(如操作误差或RNA提取量、得率及变异等)进行归一化处理。目前,RT-qPCR标准化最常用的方法是使用内参基因进行均一化处理。什么是内参基因?理想情况下,在所有发育阶段和不同实验处理的反应中,内参基因在不同组织的所有样本中应具有相......阅读全文

荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的...

荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的影响与应用实时荧光定量PCR技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针或相应的荧光染料来实现其定量功能的。由于其精准度好、灵敏度高,在分子生物学研究和医学研究等方面得到了广泛的应用,尤其是在基因表达差异分析方面。基因表达差异分析一般是比较不同

荧光定量pcr为什么能够测基因表达差异

荧光定量PCR会加入带有荧光基团的探针,探针是能和目的基因结合的单链DNA,如果合成双链DNA后,荧光基团就会激活发光,所以实时检测反应物的荧光强度,反应的就是双链DNA的浓度,由于合成双链DNA的速率和模板浓度有关,所以和参考曲线比较以后是可以计算出模板的相对浓度,当模板是信号RNA是,其反应的就

荧光定量PCR实验中的内参基因

通常它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。内参基因通常是持家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的内参基因包括GAPDH、β-actin(BETA-acti

定量方法知多少之相对定量法详解

在荧光定量PCR检测实验中可以采用多种方法来进行基因的定量。定量的方法也取决于实验的目标。当实验者对待测样品中的核酸的具体拷贝数比较感兴趣时,可以选择绝对定量。如果实验者关注的是实验样本与对照样本之间的倍数变化,无需精确测定拷贝数,则选择相对定量。目前相对定量方法适用于大多数基因表达研究,可分析对照

定量PCR目的基因与内参的Ct值差异大怎么解决

定量PCR目的基因与内参的Ct值差异大怎么解决实时荧光定量 PCR技术用于检测插入的外源基因拷贝数 自 1994 年,第一例转基因植物产品 Flavr Savr TM 西红柿在美国上市,到 2003 年底,世界范围内转基因作物已遍布 18 个国家和地区,种植面积达 167.2 万英亩 (6770 万

定量PCR目的基因与内参的Ct值差异大怎么解决

定量PCR目的基因与内参的Ct值差异大怎么解决实时荧光定量 PCR技术用于检测插入的外源基因拷贝数 自 1994 年,第一例转基因植物产品 Flavr Savr TM 西红柿在美国上市,到 2003 年底,世界范围内转基因作物已遍布 18 个国家和地区,种植面积达 167.2 万英亩 (6770 万

实时荧光定量pcr结果分析

  实时荧光定量PCR技术是指在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光集团,利用荧光信号来实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板浓度进行定量分析。  病原学检测是动物疾病确诊的关键点,而聚合酶链式反应(PCR)是目前病原检测的最常用的分子生物学技术,具有高敏感性的特征。PCR技术发展已日趋完

怎样分析荧光定量pcr结果分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算. 一般都是相对量.则用delta delta CT方法来计算.举例如下:对照组基因A的CT值为20,内参(比如βactin)CT值15.实验组基因A CT值18,内参CT值14. 首先算加样量:delta CT=15-14=1.2的1次方是2.也就是说实验组的加样量

怎样分析荧光定量pcr结果分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算. 一般都是相对量.则用delta delta CT方法来计算.举例如下:对照组基因A的CT值为20,内参(比如βactin)CT值15.实验组基因A CT值18,内参CT值14. 首先算加样量:delta CT=15-14=1.2的1次方是2.也就是说实验组的加样量

荧光光定量PCR结果的分析方法

荧光PCR的分析方法对荧光定量PCR结果的分析方法我们分为两种:绝对定量分析法和相对定量分析法。1、绝对定量分析方法,起始浓度的对数跟循环数的线性关系,标准曲线由已知拷贝数的标准品绘制,根据样品的Ct值,可求样品的模板量。(1)标准品的制备:1V的样品原液(i)+9V稀释缓冲液,得到ii;1V的ii

荧光定量PCR——qPCR的原理及应用

  qPCR的英文全名是Real-timeQuantitative PCR Detecting System。即实时荧光定量核酸扩增检测系统,也叫实时定量基因扩增荧光检测系统,简称qPCR。  上世纪八十年代Cetus Corporation公司的化学家Kary Mullis发明了PCR,如今DNA

实时荧光定量PCR(Realtime-PCR,QPCR,荧光定量)分类以...

实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)分类以及实验步骤介绍实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)技术(Real-time quantitative PCR),是指在(QPCR,荧光定量)反应体系中加入荧光基因,利用荧光信号积累实时监测整个(

关于PCR内参基因选择策略

   关于内参基因的选择很多初级的实验人员很少会去思考这个问题,因为摆在面前的只有两种选择,β-actin和GAPDH,甚至在很多人长期的观念中对于内参的认知也仅仅停留在是一个表达量相对较高较稳定的看家基因,对于分子层面相对表达量的一个重要参照而已,至于为什么要选这两种,还有没有其他

关于PCR内参基因选择策略

关于内参基因的选择很多初级的实验人员很少会去思考这个问题,因为摆在面前的只有两种选择,β-actin和GAPDH,甚至在很多人长期的观念中对于内参的认知也仅仅停留在是一个表达量相对较高较稳定的看家基因,对于分子层面相对表达量的一个重要参照而已,至于为什么要选这两种,还有没有其他的内参,人们的回答往往

一文掌握MIQE指南的RTqPCR发表数据的实用方法

考虑到mRNA转录的高度动态特性以及样品处理和下游处理步骤中引入的潜在变量,RT-qPCR工作流程的每个步骤的标准化方法对于可靠和可重现的结果至关重要。MIQE为这种方法提供了一份包含85个参数的清单,以确保质量结果符合任何期刊的接受标准。接下来,小编将为大家详细介绍如何应用MIQE指南来建立一个可

荧光定量PCR标准曲线有几个梯度

  相对定量  相对定量得到的结果为特定样本中目的基因相对于另一参照样本的量的变化。  在某些不需要对基因进行绝对定量,只需要确定基因相对表达差异的情况下,如某样品在经过某种处理后目的基因表达量是增加了还是减少了,用相对定量的方法就可以得到结果,相对定量是一种更普遍、更简单的方法。  内参基因  实

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用deltadeltaCT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用deltadeltaCT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价