单链构象多态性的结构及应用

单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的,当有一个碱 基发生改变时,会或多或少地影响其空间构 象,使构象发生改变,空间构象有差异的单 链DNA分子在聚丙烯酰胺凝胶中受排阻大 小不同。......阅读全文

构象异构体的分子链构象

晶体中的高分子链构象晶体中的分子链构象有螺旋形构象、平面锯齿形构象等。1、两个原子或基团之间距离小于范德华半径之和时,将产生排斥作用。2、分子链在晶体中的构象,取决于分子链上所带基团的相互排斥或吸引作用的情况。3、有规立构高分子链在形成晶体时,在条件许可下总是尽量形成时能最低的构象形式。4、基本结构

关于蛋白质结构的侧链构象介绍

  蛋白质结构:残基侧链上的原子根据希腊字母表的顺序(α、β、γ、δ、ε等)来命名,如Cα指的是对应残基上最接近羰基的碳原子,而Cβ则是次接近的。Cα通常被认为是主链骨架的组成原子。这些原子之间的键对应的二面角则相应以χ1、χ2、χ3等来命名,如赖氨酸侧链上第一、二个碳原子(即Cα和Cβ)之间共价键

单链DNA的结构特点

单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

单链RNA的结构特点

中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定  义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与

关于蛋白质主链构象的结构单元的简介

  1)α-螺旋Pauling等人对α-角蛋白(α-keratin)进行了X线衍射分析,从衍射图中看到有0.5~0.55nm的重复单位,故推测蛋白质分子中有重复性结构,并认为这种重复性结构为α-螺旋(α-helix).  α-螺旋的结构特点如下:  ①多个肽键平面通过α-碳原子旋转,相互之间紧密盘曲

PCRSSCP(聚合酶链反应单链构象多态)实验步骤

一. 样品的制备1. 设计引物。用Oliga6.0对目的基因进行分析,设定引物,引物长度18-21个碱基,扩增片段以200-300bp最为合适。2. PCR扩增并检测。根据不同的引物挑选适合的退火温度进行PCR扩增。扩增产物用2-2.5%的琼脂糖胶跑水平电泳检测,上样量3-5ul。PCR产物为 10

毛细管电泳色谱仪在基因突变分析中的应用

毛细管电泳色谱仪简称毛细管电泳仪(CE),是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。

RNA构象的结构特点

中文名称RNA构象英文名称RNA conformation定  义RNA分子的空间结构,构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

毛细管电泳色谱仪分析基因突变的方法

基因突变分析是遗传性疾病基因诊断和致病基因分离鉴定的基础,突变是一个或多个脱氧核糖核苷酸的构成、复制或表形功能的异常变化,即遗传物质结构改变引起遗传信息改变。随着对疾病病因和发病机制研究的不断深入,人类对疾病的认识逐渐深入到基因诊断的水平,传统技术多用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离野生型DN

双链构象多态分析法介绍

  双链构象多态分析(double -strand conformation analysis,DSCA) 是利用荧光标记引物,通过PCR 扩增出相关的研究片段作为荧光标记参照(fluorescence labeled reference,FLR)DNA分子。然后,用标记参照物FLR 分子与待测PC

线性烷烃构象的结构特点

线性烷烃构象(linear alkane conformation),拥有交错式(staggered)、重叠式(eclipsed)与间扭式(gauche)。乙烷是最简单的含有C-C单键的化合物,如果乙烷分子中的一个碳原子不动,另一个碳原子围绕C-C键旋转时,则一个碳原子上的三个氢原子相对另一个碳原子

环己烷构象的结构特点

环己烷构象(cyclohexane conformation),可分椅式(chair)、船式(boat)、扭船式以及半椅式。若环己烷分子中碳原子在同一平面上时,其C—C键角为120度,存在较大的角张力。实际上分子自动折曲而形成非平面的构象,在一系列构象的动态平衡中,椅式构象(ch air con f

高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用

        高效毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机

毛细管电泳仪在核酸分析中的应用

毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。一、在DNA测序中的应

高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用

         高效毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转

基因多态性的检测方法

1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变,用限制酶切割基因组时,所产生的片段数目和每个片段的长度就不同,即所谓的限制性片段长度多态性,导致限制片段长度发生改

构象异构体的结构特点

种由C—C单键绕σ键旋转而产生的叫构象异构,所形成的异构体称为构象异构体.旋转而产生的异构体称为旋转异构体或构象异构体。当C—C单键旋转时,可以有无数个构象异构体,极限构象有顺叠、顺错、反错和反叠等。在顺叠构象中,两个碳上连接的氯原子和氯原子之间相距最近,产生强排斥作用,内能最高,属该分子最不稳定的

构象异构体的应用

在不同的构象异构体之间,由于非键合原子之间作用力的不同,使构象异构体在物化性质方面均表现一定的差异。构象分析正是以化合物适当的基态、过渡态和激发态的构象,对化合物的物化性质进行分析和解释。这方面的内容因很广泛,在此只能做一般的介绍。对于构象异构体的稳定性,前面已经以乙烷、丁烷、十氢化奈和取代环己烷为

核酸突变检测技术

基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。它的分类方式包括1)根据基因结构的改变方式,基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两种类型;2)根据遗传信息的改变方式,基因突变又可以分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。基因突变的检测方法:从基因突变的性质来看,检

简述微流控芯片检测基因突变

基因突变主要是指高等动物、低等动物受到各种因素的作用下,基因出现改变,包括单个碱基、多个碱基的改变,使用微流控芯片可以检测基因突变,例如秀丽隐杆线虫cwn-1突变、循环系统肿瘤细胞基因突变。一般而言,所有疾病相关基因逐渐被克隆基因突变包括单链构象多态性、限制性片段长度多态性所取代,其中,单链构象多态

SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的

利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究或成可能

  近日,中国科学院生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述,全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用。  随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加,如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能,发展基于或靶向RNA的新疗法,成为了当前研究的热点。相关

SNP的检测知识

SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人

单链互补DNA的定义

中文名称单链互补DNA英文名称single-strand cDNA;sscDNA定  义在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

单链-cDNA-的合成实验

一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶(100~200U/ul)SUPERaseIN

单链-cDNA-的合成实验

实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液

单链-cDNA-的合成实验

本方案利用的是总RNA,因为如果使用18SrRNA作内对照,在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA,以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X

关于外显子的应用机理介绍

  应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。

外显子应用机理

应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。

PCRSSCP的原理特点、操作方法和应用1

随着分子生物学技术的发展,检测基因结构和突变的方法不断涌现.尤其是PCR技术问 世以后,各种与PCR相结合的基因检测技术进一步推动了基因研究的发展.如不对称 PCR产物的直接测序、核糖核酸酶酶切法(Ribonuclease cleavage,RNAase)、限制性 片段长度多态性分析(Res