Cell：新研究揭示人类5000多个必需基因表型图谱
在一项新的研究中，来自美国怀特海德研究所和布罗德研究所的研究人员利用一种新颖的、集合的、基于成像的筛选方法系统性地评估了5000多个人类必需基因的功能。 他们的分析利用CRISPR/Cas9来敲除基因活性，并形成了一种首创的资源，能够通过空间和时间分辨率了解和可视化观察基因在一系列细胞过程中的空间和时间分辨率。他们的研究涵盖了超过3100万个细胞，包括数百个不同参数的定量数据从而能够预测基因如何工作和共同运作。相关研究结果于2022年11月7日在线发表在Cell期刊上，论文标题为“The phenotypic landscape of essential human genes”。 论文共同通讯作者、怀特海德研究所成员Iain Cheeseman说，“在我的整个职业生涯中，我一直想看看当一个必需基因的功能被消除时，细胞中会发生什么。如今，我们可以做到这一点，不仅仅是针对一个基因，而是针对在培养皿中分裂的人类细胞中的每一个......阅读全文
小鼠大脑皮层基因活性图谱问世
一国际研究小组最新发表在《神经细胞》杂志上的论文称，他们使用一种最新测序技术，首次成功描绘出小鼠大脑基因活性的完整图谱。该图谱覆盖了整个基因组的所有基因，十分详细地显示了小鼠大脑皮层各层次的基因活性情况。研究人员指出，该研究成果不仅有助于科学家进一步理解哺乳动物大脑的组织结构情况，
单倍体基因型的图谱计划介绍
国际人类单倍型图谱计划（简称单倍型图谱计划）是由6个国家建立的研究联盟正在投入一项大规模的基因组学计划，旨在查明普通疾病背后隐藏的基因。经过国家公共机构与私营公司几个月的共同努力，美国国家卫生研究院（NIH)昨天宣布，已集资1亿美元用于在3年时间里构建一个所谓的单倍型（haplotype）图谱。
首次绘制小麦表观基因组图谱
最近，英国利物浦大学的科学家们，对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化，进行了首次全基因组范围的调查，这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读：权威期刊发布首个小麦单体型图谱。 表观遗传标记是一种化学标签，将自己附着在DNA上
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个
分子图谱检测和基因检测的区别
（1）细胞周期是指连续分裂的细胞，从一次分裂完成时开始到下次分裂完成时为止，即甲图中f～l；细胞周期包括分裂间期和分裂期，乙图中各细胞都处于分裂期，还缺少分裂间期的细胞．（2）核仁逐渐解体，核膜逐渐消失发生在前期，即甲图中的bc（hi）段，对应于乙图中的B图．（3）染色体数目加倍发生在后期，即乙图中
迄今最全斑马鱼基因图谱发布
一个国际科研团队在5日出版的《自然·遗传学》杂志上发布了迄今最全面的斑马鱼基因图谱。斑马鱼是医学和生命科学研究领域使用量第二大的动物模型，这一成果将帮助科学家们更好地研究各种癌症、心脏病和神经退行性疾病，以及在研究中用斑马鱼模型取代哺乳动物模型。 最新研究由DANIO-CODE联盟开展，该联盟由
揭秘：帝王蟹的基因组图谱
科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱 帝王蟹 唐伯平供图 帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图 帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图 近日，《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱，即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹（Paralithodes platypus）的基因组
物理图谱进行基因定位的方法介绍
原核生物 DNA分子上缺乏天然的容易识别的标记，可用限制图谱和部分变性图的测定来弥补这一不足。各种限制性核酸内切酶具有各自的识别顺序。这些识别顺序可以作为DNA部位的标记，用不同的限制酶处理同一DNA分子，通过对酶切产生的DNA片段的大小和位置的分析，可以绘制出某一 DNA分子的限制图谱。此外，每一
华人博士Cell绘制第三类脂肪遗传图谱
来自达纳法伯癌症研究所的科学家们从成人体内分离出了一种新型能量消耗脂肪细胞，他们称这种细胞可能具有治疗肥胖的潜力。相关成果发布在7月12日的《细胞》(Cell)杂志上，并将出版在7月20日的纸质版上。 文章的资深作者是著名的哈佛学者Bruce Spiegelman，其研究小组长期从事脂
植物表型分析系统—植物表型的名词解释
“植物表型是指能够反映植物细胞、组织、器官、植株和群体的结构及功能特征的物理、生理和生化性质，其本质实际是植物基因图谱的时序三维表达及其地域分异特征和代际演进规律”。这是目前所见最精辟的定义。 那么什么是高通量植物表型的？高通量植物表型技术是从器官、个体到群体水平上高通量、自动化获取产量、抗性
《Cell》逆转明星基因致癌传统认知
科学家们早就知道在肿瘤细胞中，MYC蛋白产物c-Myc水平增高与包括转移速度增加、复发和死亡率在内的不良临床结果相关。尽管数十年来的研究生成了关于这一主题数以千计的文章，然而直到现在都始终未能精确地解释c-Myc是如何在广泛的肿瘤类型中发挥效应的。 从大规模研究中涌现出的流行理论是在肿瘤细
－Cell：癌基因控制干细胞活性
近日，刊登在国际杂志Cell上的一项研究论文中，来自海德堡干细胞研究所等机构的研究人员通过对胚胎干细胞进行研究发现了可以控制胚胎发育暂停的因子。我们都知道，在很多类型的癌症中都会产生大量的MYC（癌基因），而且MYC产生地越多，肿瘤的恶性程度就会愈发明显。 研究者指出，MYC同样在胚胎干细胞中
Cell：基因定位听命于谁？
生物通报道 来自美国国立卫生研究院下属国家癌症研究所(NCI)的科学家们，利用新型的大规模成像技术绘制出了个别基因在人类细胞核中的空间位置，并确定了50个细胞因子是基因正确三维(3D)定位的必要条件。这些空间定位对基因表达、DNA修复、基因组稳定性和其他的细胞活动起重要的作用。这项研究发布在8
Cell：不让基因沉默的RNAi途径
“这项研究的独特之处在于――之前，我们知道RNAi能用于调控基因，或者完全关闭基因。而这项研究中，我们发现的是一种通过piRNA途径，保护基因不被沉默的RNAi机制，这种机制能作为一种保护形式，让基因得以表达。” ――Darryl Conte Jr.博士 生物机体采用了多种战略方法来
Cell：癌基因控制干细胞活性
近日，刊登在国际杂志Cell上的一项研究论文中，来自海德堡干细胞研究所等机构的研究人员通过对胚胎干细胞进行研究发现了可以控制胚胎发育暂停的因子。我们都知道，在很多类型的癌症中都会产生大量的MYC（癌基因），而且MYC产生地越多，肿瘤的恶性程度就会愈发明显。 研究者指出，MYC同样在胚胎干细胞中
Cell：神经发育基因如何影响体重？
剑桥大学和洛杉矶儿童医院的研究人员带领全球科学家进行了一项独特的合作研究，他们已经确定了一组连接大脑体重中心的生物分子。 1月17日，发表在Cell杂志的一篇文章，在剑桥大学Sadaf Farooqi博士、洛杉矶儿童医院的Sebastien Bouret博士带领下，研究团队发现了指导大脑发育过
Cell：最大规模的蛋白质互作组网络图谱
人类大约有2万个蛋白质编码基因，尽管自十年前首次完成人类基因组测序以来取得了一些显著的进展，对于这些蛋白质如何在细胞内发挥功能，科学家们仍然只详细了解了其中的一小部分。 作为人类基因组计划的延伸，蛋白质组学领域正在致力揭示蛋白质是如何执行由生成它们的基因所编码的过程的。一些先进的工具已帮助鉴别
华人学者Cancer－Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
80后浙大教授《Cell》全球首次绘制哺乳动物细胞图谱
来自浙江大学医学院干细胞与再生医学中心，浙江大学生命科学研究院等处的研究人员发表了题为“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq”的文章，利用低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序平台，全球首次绘制出了哺乳动物细胞图谱。 这一研究成果公
同期两篇Cell论文：癌细胞周围免疫细胞的特征图谱
两个独立的研究组绘制了人类肿瘤周围数千个免疫细胞之间的关联图谱，并确定了这些免疫细胞的分类。其中一个研究组分析的是肾癌，他们发现具有不同临床结果的肿瘤也具有不同特的免疫细胞特征，这可以用于评估癌症患者的预后情况；另外一个研究组则在肺癌中发现即使是早期肿瘤，也出现了免疫细胞活性的紊乱。 这两篇文
Cell：首次在单细胞水平描绘肝癌微环境中的免疫图谱
2017年6月16日，北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape o
Cell、Nature－Medicine：绘制第三大常见癌症肠道细菌全图谱
很早，我们就知道癌症是由于不良生活习惯引起的，比如不健康的饮食或吸烟。近年来生活在我们身体内和身体上的微生物作为关键参与者进入了这个研究舞台，比如科学家们发现胃癌可以由单一细菌物种：幽门螺杆菌引起，但是关于全世界第三大常见癌症——结直肠癌的肠道细菌的影响，一直还没得到解答。 为了回答这个问题，
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称，他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序，得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下，玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
单倍体基因型的图谱计划的目的
项目的目标并不是直接确定与疾病相关的基因，而是通过确定单倍型，使单倍型图成为用于进行关联研究的一个工具。在关联研究中，研究人员将患者的单倍型与健康人（对照）的单倍型相比较。如果与对照相比，某一种单倍型在患者中经常出现，影响该疾病的基因可能就存在于这个单倍型内部或附近。 常见的疾病如癌症、中风、
美基因图谱研究将癌症重新“归类”
美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为，这将为癌症诊断和治疗提供新思路。 ５日发表在美国《细胞》杂志上的研究，对３３种癌症、１万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析，确认约
美绘出DNA一修饰因子基因图谱
据美国物理学家组织网7月21日报道，美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示，5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高，最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。
棉花“甲基化基因图谱”首次绘成
30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果：他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”，即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异，为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。 几十年来，科学家们发现，许多动植物的表观特征，既可用基
卢煜明小组破解胎儿基因图谱
据香港明报报道，一出《哈利波特——混血王子的背叛》，令香港中文大学化学病理学讲座教授及其研究小组，突破地从孕妇血浆中的DNA，破解到其胎儿基因图谱，日后医学界可用更安全的方法，凭抽血便可诊断胎儿是否带有多种严重遗传病，避免现行以针刺进子宫抽羊水或绒毛膜出现的1%流产风险，但此法的
基因测序描绘个体化医疗产业图谱
随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高，现代医学正在经历巨大的变革，由传统标准化医疗模式向个体化医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制，也为“量体裁药”式的个体化医疗提供了有力工具，医学领域面临新的机遇。不过，业内人士表示，尽管市场空间可观，
小须鲸全基因组图谱获破译
11月25日，韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱，并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之，由陆生向水生演化，和陆生偶蹄动物如牛、猪等