利用454技术进行结核杆菌全基因组测序有效追踪疫情传播

众所周知,肺结核多数是由结核分枝杆菌感染肺部引起的肺部感染性疾病,已成为一个严重威胁人类健康的疾病。世界卫生组织(WHO)统计表明,全世界每年发生结核病800~1000万,每年约有300万人死于结核病,是造成死亡人数最多的单一传染病。1993年WHO宣布“全球结核病紧急状态”, 认为结核病已成为全世界重要的公共卫生问题。我国是世界上结核疫情最严重的国家之一。 然而细菌也一直处于不断突变及进化的过程中,要对症下药就需要知道细菌的准确分型。传统的细菌分型技术仅针对细菌的某几个基因进行检测,在传染病疫情爆发时往往缺乏更具体的信息,于是在全基因组测序费用不断下降的现在,研究者们也在尝试用新一代的检测技术对细菌进行分型,以发现传染病爆发的传播模式和几率。 近期,据《PLoS Medicine》杂志报道,有研究者们利用454技术对86例人结核分枝杆菌进行了全基因组测序,并与传统分型技术结果进行了比较。这86例细菌是从......阅读全文

涡流技术全解析02

1、涡流检测技术的特点是什么? 涡流检测是一种应用较广泛的无损检测技术,是五大常规无损检测方法之一,该检测方法具有如下技术特点:  ①检测速度快,易于实现自动化由于涡流检测的基本原理是电磁感应,涡流检测只适用于能产生涡流的导电材料。涡流检测线圈激励后所形成的电磁场实质是一种电磁波,具有波动性和粒子性

涡流技术全解析02

  1、涡流检测技术的特点是什么?    涡流检测是一种应用较广泛的无损检测技术,是五大常规无损检测方法之一,该检测方法具有如下技术特点:    ①检测速度快,易于实现自动化   由于涡流检测的基本原理是电磁感应,涡流检测只适用于能产生涡流的导电材料。涡流检测线圈激励后所形成的电磁场实质是一种

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

DNA测序技术的现状和发展(四)

1.1.3.2 模板制备程序完全的体外大规模模板制备工作是达成高通量、低价格测序技术的前提。已广泛使用的乳液PCR扩增技术就是一种很好的方法。不过,由于很难在热循环测序反应中保证乳液微滴的稳定性,因此最开始实验的模板扩增方法是恒温扩增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助细菌的帮助就能扩增

多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术

  来自北卡罗来纳大学教堂山分校,NIH等处的研究人员利用一种新型方法,分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态,从而可以更好研究这一转录因子的功能,这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况,相关成果公布在Nature杂志上。   对于这一成果,来自法国国家科学研究中心的François

盘点全基因组检测CRISPR脱靶位点的几种重要技术

  在2013年,来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限:会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性,即该技术可以发生非特异性切割,引起基因组非靶向位点的突变,这样会造成研究结果的不确定

全基因组测序用于临床之前,技术性挑战仍然存在

  据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预

基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术

  通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编

结核杆菌的生化反应

  结核分枝杆菌不发酵糖类。与牛分枝杆菌的区别在于结核分枝杆菌可合成烟酸和还原硝酸盐,而牛分枝杆菌不能。热触酶试验对区别结核分枝杆菌与非结核分枝杆菌有重要意义。结核分枝杆菌大多数触酶试验阳性,而热触酶试验阴性; 非结核分枝杆菌则大多数两种试验均阳性。热触酶试验检查方法是将浓的细菌悬液置68℃水浴加温

结核杆菌的相关介绍

  结核杆菌侵入人体后引起的结核病是一种具有强烈传染性的慢性消耗性疾病。它不受年龄、性别、种族、职业、地区的影响,人体许多器官、系统均可患结核病,其中以肺结核最为常见。90%以上的肺结核是通过呼吸道传染的。肺结核患者通过咳嗽、打喷嚏、高声谈笑,使带有结核杆菌的飞沫喷出体外。健康人吸入结核杆菌后便会感

结核杆菌感染途径介绍

结核菌主要通过呼吸道传播。传染源主要是排菌的肺结核病人的痰。传染的次要途径是经消化道进入体内,此外还可经皮肤传播。

概述尿液结核杆菌检查

  (1)24小时尿液抗酸杆菌检查 结核杆菌是抗酸杆菌中的一种。24小时尿液浓缩作直接涂片抗酸染色后作抗酸杆菌检查,方法简单,结果迅速,阳性率可达50%~70%,但包皮垢杆菌、草分支杆菌也是经常在尿液中存在的抗酸杆菌,因此尿液中的抗酸杆菌并不等于结核杆菌。但是反复多次的这种检查,均能找到同样的抗酸杆

结核杆菌:揭秘“白色瘟疫”

结核分枝杆菌是结核病的重要致病菌,可侵及全身各器官,肺结核是结核病最常见的临床类型,痰结核菌阳性患者是肺结核的重要传染源。感染结核菌后是否发病取决于感染菌量和宿主抵抗力,免疫功能低下人群如AIDS、糖尿病、矽肺及使用免疫抑制剂治疗者均为结核菌易感人群。结核病的病例复杂多样,以渗出病变为主,或以增殖病

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

什么是全血粘度测定?

  全血粘度是一个综合性指数,它是血浆粘度、血细胞压(比)积、红细胞变形性和聚集能力、血小板和白细胞流变特性的综合表现,是血液随不同流动状况(切变率)及其他条件而表现出的粘度,切变率低时血粘度高,随切变率的逐渐升高粘度逐渐下降,最后趋向一个平稳的数值。全血粘度的测定能为临床许多疾病,尤其是血栓前及血

全蛋白含量测定方法大全

  ①凯氏定氮bai法:将du蛋白质转化为氨,用酸zhi吸收后滴定  ②双缩dao尿法:灵内敏度低,多肽键容+碱性Cu2+=紫色络合物,不同蛋白质的显色相似  ③紫外吸收法比较灵敏,蛋白质的中的络氨酸和色氨酸残基在280nm出的光吸收  ④Folin-酚试几法(lowry法):灵敏度高,磷钼酸-磷钨

什么是全血粘度测定?

  全血粘度是一个综合性指数,它是血浆粘度、血细胞压(比)积、红细胞变形性和聚集能力、血小板和白细胞流变特性的综合表现,是血液随不同流动状况(切变率)及其他条件而表现出的粘度,切变率低时血粘度高,随切变率的逐渐升高粘度逐渐下降,最后趋向一个平稳的数值。全血粘度的测定能为临床许多疾病,尤其是血栓前及血

土壤全钾测定方法详解

    土壤全钾的测定是用氢氧化钠(NaOH)熔解,火焰光度法。原理是用NaOH熔融土壤使其增加盐基成分.促进硅酸盐的分解,以利于各种元素的溶解。样品经碱熔后,使难溶的硅酸盐分解成可溶性化合物。用酸溶解后可不经脱硅和去铁、铝等手续,稀释后即可直接用火焰光度法测定。具体操作步骤如下;(1)待测液制备。

SDI测定仪全解

SDI测试仪因计量测试数据,验证重复率高,低配件低消耗。成为反渗透系统中SDI(污染指数)值的测定的。下面我们将向您详解SDI测定仪使用技巧 SDI测定仪详细说明: 1 按照图1的示例将各个设备连接在一起。将压力调节阀调至207Kpa。2 在装入膜过滤器之前,用样本水对盛放设备进行冲洗出去悬浮微粒。

煤炭全水分测定仪测定方法详解

应用范围用于测定煤、焦炭、粮食、烟草和其他有机物质的水分。性能特点▼  单片机自动控制、测量准确、性能稳定。▼  分析快,操作简便。▼  具有微波、红外两种烘干方式,自动称量样重。烘干时间方式可任意设定,微机烘干效率高、时间短、节能。对于焦炭、易燃物及金属含量较高的煤、铁矿物质用于红外烘干方式。▼

华大基因参与破译虎尾海马全基因组

  2016年12月15日,由中国科学院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院共同组成的研究小组,联合破译了虎尾海马(Hippocampus comes)的全基因组,有关研究成果以封面文章的形式发表在Nature杂志上。  海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高

全基因组测序确定脑瘤的基因变异

  日前,圣犹达儿童研究医院(St. Jude Children's Research Hospital)的研究人员在新研究中鉴别出了一种儿童脑瘤亚型一半以上患者的致病性突变。此外他们还证实这些肿瘤对已经在研发中的一些药物敏感。这项研究论文刊登在了近期出版的《自然-遗传学》(Nature Genet

454测序识别早期HIV耐药性突变

回顾性研究分析表明即使最低水平的耐药性突变也会导致早期治疗失败 2月17日《传染病杂志》(Journal of Infectious Disease)在线公布的一项研究称HIV病毒群体中少至1%的HIV耐药性突变会对临床结果产生显著影响。这篇论文由罗氏旗下454生命科学公司与耶鲁大学医学院研究人

第二代测序技术:高速发展的高通量测序技术

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测

全基因能合成多长的片段?

全基因合成理论上没有长度限制。但是由于克隆技术,载体容量等因素存在,一般全基因合成长度不超过10kb。

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

全基因合成的步骤是什么?

全基因合成包括:设计合成引物;PCR拼接序列;克隆到载体;测序验证。

虎尾海马全基因组破译

  中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。  海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片

英、中等国科学家将建耐药结核杆菌基因数据库

  英国牛津大学24日发布消息说,该校将与中国等国的研究人员合作,对来自世界多个地区的结核杆菌样本展开全基因组测序,建立耐药结核杆菌的基因数据库,以便提高对耐多药结核病的诊断和用药效率。  病菌的耐药性问题近年来日渐严峻,耐药结核病更呈迅猛上升趋势。据世界卫生组织介绍,耐多药结核病是耐药结

首个基于全基因组测序技术的食源性疾病分子溯源网络

  食源性疾病是全球范围内重要的食品安全问题,早期发现和查明病因是防控食源性疾病的重要保证。随着新一代基因组测序技术的发展,基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和暴发溯源调查中已显示出极大的应用价值和发展潜力,逐渐成为国际研究热点,欧美相关国家已相继开展研究和布局。在国