八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展

多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时,多倍化是植物进化和育种应用的重要机制,对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今,广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体,其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展,高质量的单倍型基因组解析成为可能,但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物着丝粒是确保染色体在细胞分裂中精准分离的关键结构,其主要功能由组蛋白H3变体CENH3介导。蛋白H3标记动粒组装位点。因此,八倍体草莓的CENH3特异性抗体的制备与着丝粒准确鉴定至关重要,是探讨多倍体遗传习性的基础。近日,中国科学院昆明植物研究所朱安丹专题组整合了不同类型数据,构建了八倍体草莓完全分型基因组,解析了八倍体草莓的着丝粒演化特征。该研究以栽培草莓Albion×Akihime的杂交F1后代EA78为材料,评估不同分型策略发现,Trio-binning能够全局分型但连续性较低,Hi-C仅能够局部分型但连续性高。基于此,研究提出......阅读全文

八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展

多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时,多倍化是植物进化和育种应用的重要机制,对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今,广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体,其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展,高质量的单倍型基因组解析成为可能,但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物

解析四倍体攸茶(Camellia-meiocarpa-Hu)单倍型基因组

在植物的奇妙世界里,油茶作为重要的木本食用油料植物,有着超 2300 年的栽培历史,其用途广泛,在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶(Camellia meiocarpa Hu)是其中一员,它叶茂花大果丰,极具农业利用潜力。然而,四倍体攸茶的染色体水平基因组数据匮乏,且多倍体油茶物种高质量基因

单倍型与基因型的区别

  更进一步的讲,单倍型也是指一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性(SNPs)。一个单倍型内的这类统计学关联性和等位基因的确认被认为是可以明确的识别所有其他多态区域。这些信息对于探查普通疾病的基因学非常有用,也被用于人类单倍体型图计划(HapMap)中。基因在一条染色体上的组合称单元

八倍体红颜草莓端粒到端粒完整基因组图谱发布

  近日,中国农业科学院郑州果树研究所草莓种质改良团队联合中国农科院深圳农业基因组研究所联合发布八倍体栽培品种红颜草莓的端粒到端粒完整基因组,系统解析了八倍体草莓亚基因组结构和遗传分化,并解析了亚基因组的表观遗传进化机制。相关成果发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。  

基于SNPs-研究的单倍型图谱计划

寻找标记SNPs 的国际遗传变异图谱计划,即国际单倍型图谱计划(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式启动,2003 年中国承担了“国际单倍型图谱计划”10% 的任务,这表明我国基因科学研究能力的提高和在国际生命科学领域学术地位的提升。该计划的启动将为人类致病基

昆明植物所等揭示八倍体草莓的起源和遗传分化特征

  草莓(Fragaria)具有重要的经济和营养价值。现代八倍体栽培草莓(F. × ananassa)起源于两个八倍体野生种弗州草莓(F. virginiana)和智利草莓(F. chiloensis)的种间杂交。然而,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先,同源染色体交换和不完全谱系分选等问题,学术

野生二倍体草莓系统发育和杂交渐渗研究获进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495536.shtm

“北京方案”,使造血干细胞单倍型移植成可行

  白血病是危害人类健康的重大疾病之一,造血干细胞移植是治愈白血病最有效的手段。造血干细胞是血液系统中的成体干细胞,是一个异质性的群体,具有长期自我更新的能力和分化成各类成熟血细胞的潜能。它是研究历史最长且最为深入的一类成体干细胞,对研究各类干细胞具有重要的指导意义。我国的医学家们在不断探索的道路上

Nature-Genetics:多种技术解析草莓基因组

  近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。  一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少?  世界各地广泛种植的凤梨草

细胞型操作实验——采用-HO-产生二倍体

实验材料酵母菌株NE2AAY1017AAY1018质粒PCY204仪器、耗材YPD 平板培养管SC-ura平板5-FOA平板实验步骤第1天把菌株9-1在YPD平板上划单克隆,于30°C下培养第3天上午,把菌株9-1的菌落接种到5mlYPD培养液中,于30°C下培养。将YPD平板置于4°C下储存以备第

中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱

  由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队,在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据介绍,谷子为二倍体,基因组小、自花

我国学者绘制全球首张精细普通菜豆单倍型图谱

  近日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外6家科研单位对来自19个国家的683份普通菜豆资源的全基因组进行重测序,并在纬度跨度、光照时间长短差异明显的四地(黑龙江哈尔滨、河南南阳、贵州毕节和海南三亚)开展了三年的主要农艺性状的表型鉴定,明确了普通菜豆

研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装

近日,西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料,整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组

首个半野生型单倍型甜瓜T2T基因组装成功

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511997.shtm甜瓜( Cucumis melo  L.)是一种重要的园艺作物,位居十大水果之列。甜瓜分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜两个亚种,多样性丰富。长期的人工选择导致严重的驯化瓶颈,栽培品种的遗传多样

二倍体的染色体倍性的介绍

  染色体倍性是指细胞内同源染色体的数目,只有一组称为“单套”或“单倍体”(haploid,2x),两组称为“双套”或“双倍体”(diploid)。  多倍体又分异源多倍体(Allopolyploidy)和单源多倍体(Autopolyploidy),前者的染色体来自不同种。  在双套生物中,有一个过

新方法破解高杂合物种单倍型基因组组装难题

  近日,南京农业大学梨工程技术研究中心教授张绍铃团队在《基因组研究》在线发表最新研究成果。该研究将单花粉原生质体分离的新方法与单细胞DNA扩增技术相结合,并采用“条形码”生物信息学策略整合了12个花粉细胞的单倍体特征序列数据,从而开发出一种高杂合物种单倍型基因组组装的新方法。  论文通讯作者张绍铃

马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功

中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队,对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装,获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒(T2T)的基因组完成图(DM8.1),并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中,发现了

什么是倍半二倍体?

倍半二倍体是一种异源多倍体的奇数染色体数目变异,其染色体数目是个体或细胞含有其中一个亲本的全部染色体,另一个亲本的半数染色体。

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数 二倍体细胞 近二倍体细胞 四倍体细胞 非整倍体细胞 多异倍体             实验步骤

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数实验步骤二倍体细胞实验步骤展开 近二倍体细胞实验步骤展开近二倍体细胞实验步骤展开四倍体细胞实验步骤展开非整倍体细胞实验步骤展多异倍体实验步骤

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数 二倍体细胞 近二倍体细胞 四倍体细胞 非整倍体细胞 多异倍体             实验步骤

六倍体-的概念

六倍体 是有六个相同的或不同种的染色体组时期的细胞或个体。是整倍性数目系列之一。

六倍体小麦来源

AABBDD六倍体小麦是AABB四倍体与含有D染色体组的二倍体Ae.squarrosa杂交后形成的双二倍体。而野生异源四倍体二粒小麦(AABB)根据已掌握的证据,很可能起源于野生二倍体乌拉尔图小麦(Triticumurartu,AA)于一个未知或几个其染色体组和显存的山羊草属的Sitopsis组中某

三倍体简介

  三倍体为每一个细胞中具有三套完整的染色体组即3n,即每一号染色体有3条相同个体。自1960年以来,在人类仅记载10余例,核型有69,XXX;69,XXY;69,XYY及其与二倍体形成的嵌合体或异源嵌合体。人类三倍体属染色体数目成倍改变,是一种染色体数目异常的染色体型畸变。

八倍体的概念

中文名称八倍体英文名称octoploid定  义有八套染色体组的细胞或个体。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)

三倍体的来源

三倍体是由一个四倍体产生的配子与一个二倍体产生的配子通过受精方式结合的。假设已知的四倍体是由二倍体经过秋水仙素处理后得到的,设二倍体为AABB,那么四倍体就应该是AAAABBBB,他们分别产生的配子为AABB和AB,结合之后就变成AAABBB。在上述过程中,我们把AA或BB叫做一对同源染色体。减数分

三倍体的特点

三倍体,遗传学名词,是指含有三组染色体的细胞或生物。三倍体生物因难以进行减数分裂形成配子,故常不育。

天然六倍体生物举例

同源六倍体甘薯异源六倍体普通小麦、普通黑麦、燕麦、猕猴桃、某些菊花品种(如滁菊)注:尤其是对于植物而言,倍性差异导致的性状差异可能会非常小。有时甚至无法界定两个不同倍性的个体是否为同一个种,而同一属下不同种生物倍性不同的例子更是比比皆是。所以本段中所列举的六倍体生物只是常见情况,一般不应当认为该生物

什么是三倍体

  三倍体:含有三组染色体的细胞或生物。三倍体生物因难以进行减数分裂形成配子,故常不育。  三倍体为每一个细胞中具有三套完整的染色体组即3n,即每一号染色体有3条相同个体。  自1960年以来,在人类仅记载10余例,核型有69,XXX;69,XXY;69,XYY及其与二倍体形成的嵌合体或异源嵌合体。

同源异倍体的概念

中文名称同源异倍体英文名称autoheteroploid定  义由同源染色体组形成的异倍体。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)