基于SNPs研究的单倍型图谱计划
寻找标记SNPs 的国际遗传变异图谱计划，即国际单倍型图谱计划(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式启动，2003 年中国承担了“国际单倍型图谱计划”10% 的任务，这表明我国基因科学研究能力的提高和在国际生命科学领域学术地位的提升。该计划的启动将为人类致病基因的寻找提供一条捷径。在DNA 上位置比较接近的很多SNPs，会组成单倍型块并作为一个整体遗传。通过极少数的几个标记SNPs，可以识别出不同的单倍型块。单倍型图谱 (HapMap)被认为是DNA 的基本结构单位，大约由5 000~20 000 对碱基组成。不同种族、不同个体之间的基因组序列大约99.9% 都具有一致性，正是0.1%的碱基排列顺序的差异决定了人类的遗传多态性，即人与人之间的个体差异。HapMap 计划就是研究这0.1% 差异的排列顺序。HapMap 计划的目标在于，确定人类基因组中普通模式的D N A ......阅读全文
基于SNPs－研究的单倍型图谱计划
寻找标记SNPs 的国际遗传变异图谱计划，即国际单倍型图谱计划(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式启动，2003 年中国承担了“国际单倍型图谱计划”10% 的任务，这表明我国基因科学研究能力的提高和在国际生命科学领域学术地位的提升。该计划的启动将为人类致病基
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍，谷子为二倍体，基因组小、自花
我国学者绘制全球首张精细普通菜豆单倍型图谱
近日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外6家科研单位对来自19个国家的683份普通菜豆资源的全基因组进行重测序，并在纬度跨度、光照时间长短差异明显的四地（黑龙江哈尔滨、河南南阳、贵州毕节和海南三亚）开展了三年的主要农艺性状的表型鉴定，明确了普通菜豆
单倍型与基因型的区别
更进一步的讲，单倍型也是指一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性（SNPs）。一个单倍型内的这类统计学关联性和等位基因的确认被认为是可以明确的识别所有其他多态区域。这些信息对于探查普通疾病的基因学非常有用，也被用于人类单倍体型图计划（HapMap）中。基因在一条染色体上的组合称单元
单倍体基因型的图谱计划介绍
国际人类单倍型图谱计划（简称单倍型图谱计划）是由6个国家建立的研究联盟正在投入一项大规模的基因组学计划，旨在查明普通疾病背后隐藏的基因。经过国家公共机构与私营公司几个月的共同努力，美国国家卫生研究院（NIH)昨天宣布，已集资1亿美元用于在3年时间里构建一个所谓的单倍型（haplotype）图谱。
单倍体基因型的图谱计划的意义
HapMap还将产生截止2013年尚很难预料的知识上的进展。未来可以在患者的遗传构成的基础上实现个体化医疗，从而得到最好的效果并将副作用降至最低。与长寿和抗病能力有关的遗传变异将被确定，从而产生具有广泛益处的新疗法。对任何新知识而言，HapMap既带来新的挑战，又带来不可预料的空前的机遇。
单倍体基因型的图谱计划的目的
项目的目标并不是直接确定与疾病相关的基因，而是通过确定单倍型，使单倍型图成为用于进行关联研究的一个工具。在关联研究中，研究人员将患者的单倍型与健康人（对照）的单倍型相比较。如果与对照相比，某一种单倍型在患者中经常出现，影响该疾病的基因可能就存在于这个单倍型内部或附近。 常见的疾病如癌症、中风、
八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展
多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时，多倍化是植物进化和育种应用的重要机制，对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今，广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体，其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展，高质量的单倍型基因组解析成为可能，但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物
研究发现基于单原子层的新型单光子源
中国科学技术大学教授潘建伟、陆朝阳等与来自华盛顿大学的许晓栋、香港大学的姚望合作，首次在类石墨烯单原子层半导体材料中发现非经典单光子发射器，从而将量子光学和二维材料这两个重要领域连接起来，打开了一条通往新型光量子器件的道路。相关成果日前在线发表于《自然—纳米技术》杂志。同期“新闻视角”栏目撰文评
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
叶绿体和线粒体基因组变异检测获突破
近日，《公共科学图书馆―综合》发表了中国农业科学院油料作物研究所博士后曾长立与合作导师伍晓明研究建立的能高通量检测叶绿体和线粒体基因组遗传变异的新方法。 据曾长立介绍，叶绿体和线粒体基因组作为植物细胞质基因组，对光合作用、呼吸作用等重要生命过程具有重要意义。 研究叶绿体和线粒体基因组
生物物理所女娲基因组资源研究取得进展
遗传变异图谱是研究人群演化史、医学遗传学、基因型-表型关联的基础。此前，大多数全基因组测序相关研究主要集中在欧洲血统人群。已有研究表明，罕见和低频的变异往往特定于人群或样本，尤其是与疾病相关的变异。针对特定人群的基因组数据可以为全基因组关联研究、区域适应性研究、用药指导等提供更准确的参考。 单
单精子分型实验——－－基于单体型传递的分离偏斜实验
实验步骤单精子细胞分析非常适用于对单体型父系传递的研究，尤其是在致病单体型相对于正常单体型可能存在优势传递的情形下。Spermseg(http://gakon.uchicago.edu/mepeek/software/spermseg) 就是专门为分析单精子细胞单体型分离而开发的计算机程序。在这些病
农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征
近日，中国农业科学院作物科学研究所（以下简称作科所）水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型（gcHap）数据集，全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征，提出亚洲栽培稻多起源（驯化）假说，并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”
研究开发出基于红细胞的单原子纳米酶
12月6日，中国科学院生物物理研究所研究员高利增和北京交通大学教授张金华在《先进科学》杂志发表论文，提出了一种红细胞模板化策略，以其丰富的血红蛋白作为铁源制备铁单原子纳米酶。 纳米酶是一类具有类酶催化性能的纳米材料，是新一代人工酶，在生物医学领域有着广泛的应用前景。自2007年首次发现四氧化三
分子标记基于图谱克隆基因
图位克隆(Map—bascd cloning））是近几年随着分子标记遗传图谱的相继建立和基因分子定位而发展起来的一种新的基因克隆技术。利用分子标记辅助的图位克隆无需事先知道基因的序列，也不必了解基因的表达产物，就可以直接克隆基因。图位克隆是最为通用的基因识别途径，至少在理论上适用于一切基因。基因
解析四倍体攸茶（Camellia－meiocarpa－Hu）单倍型基因组
在植物的奇妙世界里，油茶作为重要的木本食用油料植物，有着超 2300 年的栽培历史，其用途广泛，在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶（Camellia meiocarpa Hu）是其中一员，它叶茂花大果丰，极具农业利用潜力。然而，四倍体攸茶的染色体水平基因组数据匮乏，且多倍体油茶物种高质量基因
“北京方案”,使造血干细胞单倍型移植成可行
白血病是危害人类健康的重大疾病之一，造血干细胞移植是治愈白血病最有效的手段。造血干细胞是血液系统中的成体干细胞，是一个异质性的群体，具有长期自我更新的能力和分化成各类成熟血细胞的潜能。它是研究历史最长且最为深入的一类成体干细胞，对研究各类干细胞具有重要的指导意义。我国的医学家们在不断探索的道路上
张亚平院士等Y染色体数据分析研究取得进展
记者从中科院昆明动物所了解到，在张亚平院士带领下，该所彭旻晟、贺军栋、樊隆等人开发出针对DNA芯片数据中Y染色体单核苷酸多态性位点的分析策略。相关研究11月27日在线发表于《欧洲人类遗传学》。 随着全基因组关联分析广泛应用于人类遗传学工作之中，相关的DNA芯片(微阵列)也不断得到发展。许多
SNPs(single－nucleotide－polymorphism)的概念
SNPs(single nucleotide polymorphism ， SNP ，发音为 “snips”), 主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的 DNA 序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的 90% 以上。 SNP 在人类基因组中广泛存在，平均
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
首个半野生型单倍型甜瓜T2T基因组装成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511997.shtm甜瓜（ Cucumis melo L.）是一种重要的园艺作物，位居十大水果之列。甜瓜分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜两个亚种，多样性丰富。长期的人工选择导致严重的驯化瓶颈，栽培品种的遗传多样
南京农大棉花遗传育种研究发权威期刊
棉花是重要的经济作物，也是纺织工业的主导原料，在世界及我国国民经济中占重要地位。随着植物基因组计划的不断发展，对作物进行分子设计和基因工程改良是21世纪植物科学领域中的重要课题。目前，国内外研究人员在棉花遗传育种工作中取得了一定的进展。 五月二十四日，南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验
基于分子成像的肿瘤分子分型研究取得突破
恶性肿瘤是分子水平上高度异质性的疾病，传统的病理形态学诊断已不能适应肿瘤精准诊治的发展需求，急需开发分子诊断技术，从分子水平研究肿瘤发生发展的病理学机制及生物学行为。 肺癌发病率和死亡率居世界恶性肿瘤之首，且呈逐年上升趋势。肺癌具有超级异质性的特性：个体异质—不同患者表皮生长因子受体（EG
基于分子成像的肿瘤分子分型研究取得突破
恶性肿瘤是分子水平上高度异质性的疾病，传统的病理形态学诊断已不能适应肿瘤精准诊治的发展需求，急需开发分子诊断技术，从分子水平研究肿瘤发生发展的病理学机制及生物学行为。 肺癌发病率和死亡率居世界恶性肿瘤之首，且呈逐年上升趋势。肺癌具有超级异质性的特性：个体异质—不同患者表皮生长因子受体（EG
基于分子成像的肿瘤分子分型研究取得突破
恶性肿瘤是分子水平上高度异质性的疾病，传统的病理形态学诊断已不能适应肿瘤精准诊治的发展需求，急需开发分子诊断技术，从分子水平研究肿瘤发生发展的病理学机制及生物学行为。 肺癌发病率和死亡率居世界恶性肿瘤之首，且呈逐年上升趋势。肺癌具有超级异质性的特性：个体异质—不同患者表皮生长因子受体（EGF
新方法破解高杂合物种单倍型基因组组装难题
近日，南京农业大学梨工程技术研究中心教授张绍铃团队在《基因组研究》在线发表最新研究成果。该研究将单花粉原生质体分离的新方法与单细胞DNA扩增技术相结合，并采用“条形码”生物信息学策略整合了12个花粉细胞的单倍体特征序列数据，从而开发出一种高杂合物种单倍型基因组组装的新方法。 论文通讯作者张绍铃
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了
基于单层过渡金属硫化物的单光子源研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500273.shtm
基于单层过渡金属硫化物的单光子源研究获进展
近日，华南师范大学物理与电信工程学院/广东省量子调控工程与材料重点实验室副研究员朱起忠与香港大学博士翟大伟、教授姚望合作，在单层过渡金属硫化物的激子特性方面取得重要研究进展。他们在理论上提出了基于层内激子产生偏振与轨道角动量锁定的单光子源及其阵列的方案。相关研究发表于国际权威学术期刊Nano L