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大连化物所等团队利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中科院分子细胞科学卓越创新中心(上海生物化学与细胞生物学研究所)研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。研究团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,确定了IκBα是FBP1......阅读全文

分子生物学蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨

分子生物学蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨

磷酸化和非磷酸化蛋白分子量一样吗

理论上讲是不一样的,磷酸基图大概9.9KD左右,磷酸化后条带按道理应该发生迁移

去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化

在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子标记效率低。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5'

去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化

            实验方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子标记效率低。 实验材料

去磷酸化的平端或5'凹端DNA分子的磷酸化

实验方法原理 在 T4 多核苷酸激酶的正向反应中,带有平端、5' 凹端或分子内切口的 DNA 底物比 5' 突出端的分子标记效率低。实验材料 T4 噬菌体多核苷酸激酶试剂、试剂盒 乙酸铵EDTA乙醇咪唑缓冲液聚乙二醇仪器、耗材 液体闪烁计数仪Sephadex G-50 离心柱Seph

含5’突出羟基端的DNA分子磷酸化

本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌体多核苷酸激酶的催化下,以放射性标记的形式重新将磷酸加到核酸上,这是一种广泛应用于 32P 标记探针的技术。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌

含5’突出羟基端的DNA分子磷酸化

实验方法原理 本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌体多核苷酸激酶的催化下,以放射性标记的形式重新将磷酸加到核酸上,这是一种广泛应用于 32P 标记探针的技术。实验材料 T4 噬菌体多核苷酸激酶DNA试剂、试剂盒 乙酸铵EDTA乙醇T4 噬菌体多核苷酸激酶缓冲液仪器、耗材

含5’突出羟基端的DNA分子磷酸化

            实验方法原理 本方案用磷酸酶去除核酸的 5' 磷酸根,然后在 T4 噬菌体多核苷酸激酶的催化下,以放射性标记的形式重新将磷酸加到核酸上,这是一种广泛应用于 32P 标记探针的技术。

生物大分子是什么?脂肪是不是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子是什么?脂肪是生物大分子吗?

  生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。  脂肪不是生物大分子。  脂类是油、脂肪、类脂的总称。脂肪由C、H、O三种元素组成。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘

用交换反应进行5'突出端DNA分子的磷酸化

            实验方法原理 T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的交换反应(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一个标记 5' 端 DNA 的快速方法。与正向反应不同的是,它无需 DNA

用交换反应进行5'突出端DNA分子的磷酸化

T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的交换反应(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一个标记 5' 端 DNA 的快速方法。与正向反应不同的是,它无需 DNA 去磷酸化。正向反应在略偏酸性(pH 6.4)的咪唑缓冲液中进行,以刺激酶促去

用交换反应进行5'突出端DNA分子的磷酸化

实验方法原理 T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的交换反应(Van de Sande et al. 1973; Berkner and Folk 1977) 是一个标记 5' 端 DNA 的快速方法。与正向反应不同的是,它无需 DNA 去磷酸化。正向反应在略偏酸性(pH 6.4)的咪唑

生物细胞分子的功能

  DNA 是负责遗传的主要分子,由 A、C、T、G 四种不同的单元依任意的顺序排列,例如一个有 10 个单元的 DNA 分子,会有 4 的 10 次方种不同的排列顺序,各种生物的遗传虽然均由 DNA 分子负责,由于排列顺序的差异,以致造成相互间极大的不同;RNA 是负责传递遗传讯息的分子,它将 D

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物分子的提取概述

       生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。        生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,

生物分子的提取概述

生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的提取液

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

什么是磷酸化与去磷酸化

磷酸化,将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质(protein)上的过程。其中除去磷酸基团的酶称为磷酸酶。 蛋白质磷酸化可发生在许多种类的氨基酸(蛋白质的主要单位)上,其中以丝氨酸为多,接着是苏氨酸。去磷酸化:磷酸基团的除去,对许多生物起着“开/关”作用。防止质粒载体的自身连接,最常用于质粒进行单

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...  经过了免疫学的热潮,20世纪中叶开始兴起了又一门新的学科“分子生物学”。人们怀着满腔热忱,期待这一学科能够对那些机理不清的疾病予以新的认识。众多科学家经过了半个世纪的努力,终于用分子生物学方法整理出一批单基因病等和基因相关的疾病。随着基因基础

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN

生物分子自调节的特点

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

什么是生物分子自调节?

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

生物大分子的概念

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

什么是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN

生物大分子的“相变”

编者按:生物大分子的“相变”或者说“相分离”应该说近几年来生命科学领域里面发展非常迅速的热门领域。然而很多同行却表示自己还没搞清楚“相分离”到底是怎么回事它就已经火了。为什么说火了?除了同行私底下交谈关于最新学术进展可以约莫了解一些之外,另一个风向标是观察以CNS为代表的杂志发表相关论文的情况。截止

生物大分子的特点

生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如:某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步,但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致。

生物大分子的形成

在原始地球条件下,有两条路径可以达到脱水缩合以形成高分子:其一是通过加热,将低相对分子量的构成物质加热使之脱水而聚合;其二是利用存在于原始地球上的脱水剂来缩合。前者常常是在近于无水的火山环境中进行,后者则可以在水的环境中进行。生物大分子都可以在生物体内由简单的结构合成,也都可以在生物体内经过分解作用