大连化物所等团队利用生物分子模拟预测代谢酶新功能
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中科院分子细胞科学卓越创新中心（上海生物化学与细胞生物学研究所）研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作，揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1（FBP1）能够行使蛋白磷酸酶的功能，并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。 有研究表明，磷酸化可溶性代谢物的代谢酶，可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物，进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。研究团队针对这一研究现象，拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学（MD）模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选，发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸（F-1,6-BP）水解为果糖6-磷酸（F-6-P）的关键代谢酶FBP1，可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此，合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析，确定了IκBα是FBP1......阅读全文
生物大分子的特点
生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如：某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步，但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致。
生物分子的溶剂提取法
一、生物分子的溶剂提取法原理：利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素： 1、溶剂的性质：根据相似相溶原理。 2、离子强度：离子强度是影响物质溶解度的主要因素，但离子强度对不同物质溶解度的影响不同，如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加，低离子强度下RN
生物细胞分子的常见基团
（一）羟基-OH 很多有机分子上含有羟基-OH，如醇、糖、核酸、蛋白质等。“羟”的字和音都由“氢氧”二字拼合而成。羟基与水有某些相似的性质，羟基是典型的极性基团，与水可形成氢键，因此，分子上羟基越多，亲水性就越大。羟基与电负性大的原子如-NH中的氮能形成氢键，氢键在维持蛋白质、核酸等大分子的空
什么是生物单分子技术
单分子技术是可孤立或用于实验或分析研究某一个分子。单分子研究，对比测量一个整体或大量分子，其中个体行为无法区分收集测量对比，只有一般特征才可以衡量。虽然大多数测量技术在观察单分子还不够灵敏，单分子荧光已成为一种探测尚不能充分理解的位于大量分子层面上，如肌球蛋白在肌肉组织或肌动蛋白丝运动，还有个体位于
生物分子的溶剂提取法
一、生物分子的溶剂提取法原理：利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素： 1、溶剂的性质：根据相似相溶原理。 2、离子强度：离子强度是影响物质溶解度的主要因素，但离子强度对不同物质溶解度的影响不同，如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加，低离子强度下RN
生物大分子的“相变”
编者按：生物大分子的“相变”或者说“相分离”应该说近几年来生命科学领域里面发展非常迅速的热门领域。然而很多同行却表示自己还没搞清楚“相分离”到底是怎么回事它就已经火了。为什么说火了？除了同行私底下交谈关于最新学术进展可以约莫了解一些之外，另一个风向标是观察以CNS为代表的杂志发表相关论文的情况。截止
上海生科院揭示细菌磷酸化利福平产生耐药性的分子机制
3月21日，《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所张鹏研究组题为Structural basis of rifampin inactivation by rifampin phosphotransferase 的研究论文。该研究通过解析利福平磷酸转
抗体磷酸化与非磷酸化的区别与关系
非磷酸化是测该蛋白的含量，不能知道其活性状态，抗体磷酸化是测该蛋白的磷酸化水平如何，侧重于了解该蛋白的一种活性状态。很多信号通路的蛋白在受到某些刺激后都是通过改变其磷酸化水平的改变而引起细胞的一系列反应，其蛋白含量并不见得会有多大的变化。首先要说明的就是检测的蛋白质在你检测的组织或者细胞中是表达的,
磷酸化和非磷酸化的抗体什么区别
1.磷酸化抗体的检测的是出于活性状态（磷酸化）的蛋白。2.磷酸化抗体只针对磷酸化位点设计，是一种位点特异性的多抗，这到有些单抗的特性。3.普通抗体的合成（多抗）：原核表达蛋白-〉纯化-〉免疫动物-〉收获抗体。4.磷酸化抗体合成：人工合成含磷酸化位点的多肽-〉人工体外磷酸化-〉链接半抗原-〉免疫动物-
磷酸化和非磷酸化的抗体什么区别
磷酸化和非磷酸化的抗体主要区别有： 1.磷酸化抗体的检测的是出于活性状态（磷酸化）的蛋白。 2.磷酸化抗体只针对磷酸化位点设计，是一种位点特异性的多抗，这到有些单抗的特性。3.普通抗体的合成（多抗）：原核表达蛋白-〉纯化-〉免疫动物-〉收获抗体。 4.磷酸化抗体合成：人工合成含磷酸化位点的
什么是磷酸化
磷酸化是将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质（protein）上的过程。其中除去磷酸基团的酶称为磷酸酶。 蛋白质磷酸化可发生在许多种类的氨基酸（蛋白质的主要单位）上，其中以丝氨酸为多，接着是苏氨酸。除了蛋白质以外，部分核苷酸，如三磷酸腺苷（ATP）或三磷酸鸟苷（GTP）的形成，也是经由二磷酸腺苷
磷酸化的和非磷酸化的抗体有什么不同
通常来说，磷酸化抗体芯片上检测某一个磷酸化位点会设置一对抗体，即：磷酸化的和非磷酸化的抗体。说到区别，可能从制备讲起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位点的保守性，对某一个磷酸化位点周边20个氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定带有磷酸基团，非磷酸化多肽就掉了这个磷酸基团。然后就是
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
在上期我们回顾了使用多重来成像磷酸化蛋白的技巧，在这部分中，我们将介绍使用Azurespot分析软件进行定量。 背景去除 背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。 > 如果背景不均匀，请使用 Rolling Bal
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法；磷酸化蛋白质被纯化，如果可能蛋白质要均一；磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物，其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列，定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法， 2D-PP 作图、 HPLC 或 l
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化 实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一
磷酸化的和非磷酸化的抗体有什么不同
通常来说，磷酸化抗体芯片上检测某一个磷酸化位点会设置一对抗体，即：磷酸化的和非磷酸化的抗体。说到区别，可能从制备讲起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位点的保守性，对某一个磷酸化位点周边20个氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定带有磷酸基团，非磷酸化多肽就掉了这个磷酸基团。然后就是
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
背景去除背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。> 如果背景不均匀，请使用 Rolling Ball。 类似指定半径的圆盘在泳道轮廓下“滚动”，对信号求平均，从而产生平滑小的变化。 半径越大，滚动越平滑。> 如果轮廓的末端与轮廓的其余部分没有
分子诊断在分子生物学中的应用
分子诊断可对多种病原体如细菌、病毒等进行快速、灵敏、准确的诊断，不仅能提早发现疾病，确定病因，还可以及时阻断细菌、病毒的传播，在感染病检测和预防方面有着较为明显的优势。目前主要应用在HBV、HCV、HIV、HSV、TB沙眼衣原体（CT）、淋球菌（NG）、解脲支原体等检测。 例如，
了解PCR生物学分子技术
1、PCR基本要素 PCR基本要素与DNA复制的基本要素是一致的。 ①DNA模板：待拷贝的 DNA 称为模板，它可以是双链 DNA 也可是单链DNA，最后扩增得到的产物是双链状态的。 ②引物：是 DNA 复制的先锋，就象结晶过程中的晶核，引导 DNA 的合成。在 PCR 扩增中
生物分子成功置于纳米弹簧中
据美国每日科学、物理学家组织网近日报道，美国俄勒冈州立大学研究人员在纳米弹簧中成功地放置了生物分子，该纳米弹簧在微型反应器中能最大限度地扩张药品同其他物质接触的表面积。它可作为一种高效催化剂载体，大大加快化学反应速度。详细研究成果发表在《生物技术进展》杂志上。 在纳米技术的
生物分子糖类核磁共振光谱
糖类核磁共振光谱解决糖类结构和构象的问题。
生物大分子单晶衍射仪
生物大分子单晶衍射仪是一种用于生物学领域的分析仪器，于2005年7月11日启用。 技术指标 Mar-X型生物大分子X射线衍射采集系统是新一代即开即用的X射线衍射仪，具有节能稳定、耗材少，操作简单、使用可靠，不需要维护等特点。 主要功能 晶体衍射方法是测定生物大分子空间结构解析的主要研究手
生物大分子的功能特点
生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如：某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步，但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致 。
生物分子核酸核磁共振光谱
“核酸核磁共振”是利用核磁共振光谱学获得关于多核酸如DNA或RNA的结构和动力学的信息。截至2003年，所有已知RNA结构中近一半已通过核磁共振波谱法确定。核酸和蛋白质核磁共振波谱相似但存在差异。核酸具有较小的氢原子百分比，这是在NMR光谱学中通常观察到的原子，并且因为核酸双股螺旋是刚性的且大致线性
生物大分子样品的保存
生物大分子制成品的正确保存极为重要，一旦保存不当，辛辛苦苦制成的样品失活、变性、变质，使前面的全部制备工作化为乌有，损失惨重，全功尽弃。影响生物大分子样品保存的主要因素有：⑴空气：空气的影响主要是潮解、微生物污染和自动氧化。空气中微生物的污染可使样品腐败变质，样品吸湿后会引起潮解变性，同时也为微生物
生物分子的透析分离法
一、生物分子透析分离的原理：天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子通过，当膜的两侧存在小分子浓度差时，小分子从高浓度一侧向低浓度一侧扩散直到平衡。通过离心机分离不断去除扩散出来的小分子，从而达到分离纯化的目的。二、影响生物分子透析分离的因素：1、半透膜的通透性：半透膜的通透性取决于膜孔径的大小
高效测量多个生物分子结合参数
方案优势 MicroCal Auto-iTC200集MicroCal iTC200的高灵敏度—量热仪的核心—和唾手可得的自动化于一身，以满足繁忙的研究和药物发现实验室的生产力需求。 系统直接测量生物化学结合过程中释放或吸收的热量，然后计算出结合亲和力（KD）、化学计量（n）、
脂肪是生物大分子吗
脂质是油、脂肪、类脂的总称。食物中的油性物质主要是油和脂肪，一般把常温下是液体的称作油，而把常温下是固体的称作脂肪。脂肪由C、H、O三种元素组成。脂肪是由甘油和脂肪酸组成的甘油三酯，其中甘油的分子比较简单，而脂肪酸的种类和长短却不相同。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘油酯，其中甘油的分子比较
生物分子的透析分离法
一、生物分子透析分离的原理：天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子通过，当膜的两侧存在小分子浓度差时，小分子从高浓度一侧向低浓度一侧扩散直到平衡。通过离心机分离不断去除扩散出来的小分子，从而达到分离纯化的目的。二、影响生物分子透析分离的因素：1、半透膜的通透性：半透膜的通透性取决于膜孔径的大小
分子生物学实验的品质选择——分子生物学实验用水
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