大连化物所等团队利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中科院分子细胞科学卓越创新中心(上海生物化学与细胞生物学研究所)研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。研究团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,确定了IκBα是FBP1......阅读全文

脂质是生物大分子吗?

  脂质不属于生物大分子。  脂质包括的范围广泛,其分类方法亦有多种。通常根据脂质的主要组成成分分为:简单脂质、复合脂质、衍生脂质、不皂化脂类。  脂质包括多种多样的分子,其特点是主要由碳和氢两种元素以非极性的共价键组成。由于这些分子是非极性的,所以和水不能相容,因此是疏水的。严格地说,脂质不是大分

分子生物学绪论(三)

  2 基因组研究的发展  目前分子生物学已经从研究单个基因发展到研究生物整个基因组的结构与功能。1977年Sanger测定了ΦX174-DNA全部5375个核苷酸的序列;1978年fiers等测出SV-40DNA全部5224对碱基序列;80年代λ噬菌体DNA合部48502碱基对的序列全部测出;一些

理化所:开发出痕量生物分子“捕手”

  近日,中科院理化技术研究所研究员王树涛团队与大连化学物理研究所研究员梁鑫淼团队合作,开发出一种具有亲水/疏水异质纳米孔的聚合物微球。该微球能在不同极性的溶剂中选择性吸附生物分子,进而从复杂样品中高效地分离出痕量的糖肽。相关研究成果发表于《先进材料》,研究工作得到了国家自然科学基金杰出青年基金、中

分子生物学先驱逝世

   近日,分子生物学先驱Sydney Brenner去世,享年92岁。Brenner最著名的成就之一是在20世纪六七十年代将秀丽隐杆线虫转变为人类疾病研究的模型系统,这带来了一个新的研究领域。  为此,他与生物学家John Sulston及Robert Horvitz分享了2002年诺贝尔生理学或

生物大分子的结构与功能

    生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二

脂质是生物大分子吗

  关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂

蛋白质磷酸化

Tyrosine Kinase Assay Using Synthetic Peptides (T. Miller)Small synthetic peptide substrates are especially well suited for applications such as assay

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串联质谱对磷酸

什么是去磷酸化?

去磷酸化:是磷酸基团的除去,对许多生物起着"开/关"作用。防止质粒载体的自身连接,最常用于质粒进行单酶切连接时。去磷酸化是由于DNA连接酶催化DNA连接时需要有磷酸基团的存在,载体在经酶切后会在切点端保留一个磷酸基团。载体去磷酸化后因自身5'端无磷酸基团,因而不可以和自身3'端连接。

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料测序级膜蛋白酶                                                          试剂、试剂盒二硫苏糖醇                                                                  碘代乙酰

自磷酸化的定义

当配体-受体结合时,受体胞外结构域构象变化导致相邻的单跨膜受体二聚化,以利于受体间的交互磷酸化,即自磷酸化。同时可以提供磷酸集团,和作为蛋白质激酶磷酸化的底物

磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型

了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型,可以限定可能的磷酸化位点,并因此简化(对多肽链中磷酸化残基的确认。磷酸化残基类型通常由磷酸氨基酸分析或磷酸氨基酸特异性免疫检测确定。磷酸氨基酸分析是对肽键进行气相或液相水解,此水解条件下要至少保留一段磷酸酯键完整。 32p标记的磷酸蛋白质或磷酸肽的水解产物与磷酸氨

磷酸化位点分析实验用酶和化学方法去磷酸化

实验材料蛋白样品实验步骤这种方法得到特别关注、但它能提供磷酸肽中磷酸化氨基酸的定位,可以在非磷酸肽占主导地位的混合物中鉴别磷酸肽,此方法使用的是磷酸酶 。用简单的 MALDI-TOF仪器就可以得到磷酸化蛋白水解后产生肽段的质量,同样的样品用磷酸酶处理后,除去了丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸上的磷酸,再分析其

磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型

            实验方法原理 实验材料 蛋白样品 实验步骤 了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型

磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型

实验材料蛋白样品实验步骤了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型,可以限定可能的磷酸化位点,并因此简化(对多肽链中磷酸化残基的确认。磷酸化残基类型通常由磷酸氨基酸分析或磷酸氨基酸特异性免疫检测确定。磷酸氨基酸分析是对肽键进行气相或液相水解,此水解条件下要至少保留一段磷酸酯键完整。 32p标记的磷酸蛋白质或

科学家首次揭示齿肋赤藓耐干响应的磷酸化分子调控机制

齿肋赤藓是极端耐干植物的典型代表,能够承受超过98%的细胞脱水,接近植物耐干能力的生理极限,并在遇水后几秒钟恢复光合作用等生理活动,能够快速响应水分的变化。在植物应对水分变化的过程中,蛋白质磷酸化是一种快速且可逆的翻译后修饰,在启动信号转导、调节蛋白功能中发挥着关键作用。然而,蛋白质磷酸化如何调控齿

微生物分子生物学检测新技术问世

  日前,中国地质科学院水环所经过积极探索,反复试验,建立了适合土样和地下水样的微生物分子生物学检测高新技术。   微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取,将提取的DNA进行扩增并识别,来确定样品中微生物的多样性和种属,具有先进性和准确性,免去了烦琐、需时长的培养过程,可检出传统

微生物鉴别方法:分子生物学方法

1、DNA碱基比DNA碱基比[(G+C)mol%],以G+C物质的量分数(mol%)表示:(G+C)mol%=(G+C)/(A+T+G+C)%该比值的变化范围很大,原核生物变化范围是20-78%,真核生物的变化范围为30%-60%。目前已经测定了大量生物的DNA碱基组成这方便的结论有:①亲缘关系密切

基于生物分子构象变化的生物传感策略研究获进展

利用DNA分子构象变化发展新型生物传感策略  近日,权威化学综述杂志Accounts of Chemical Research发表了中国科学院上海应用物理研究所物理生物学实验室樊春海课题组撰写的邀请综述文章 (Target-responsive structures for nucleic acid

低温保存对生物样本及其生物大分子的影响

引言生物样本库主要是指收集和应用健康及疾病生物体的生物分子、细胞、组织和器官等,包括人体器官、组织、体液或处理过的样本(DNA、RNA、蛋白等),以及与这些样本相关的临床资料、质控、管理等生物应用系统。在医学研究中,生物样本是联系分子信息与疾病的桥梁。根据使用目的的区别,样本的保存要求也会有所差别。

生物活性分子体内原位构筑超分子组装体研究获新进展

  随着纳米生物技术和纳米医药的发展,生物活性分子体内原位构筑超分子组装体的概念越来越受人们的重视。实现对聚合物的可控组装调控,对改进材料在体内的生物效应和安全性,具有重大意义。但是,由于生物医用材料在体内的生物过程极其复杂,如何实现聚合物在病生理条件下的组装调控,是医用高分子领域极具挑战性的科学问

距今6.5亿年古生物分子化石现身

  据澳大利亚国立大学(ANU)官网8月17日消息,该校科研团队在澳大利亚中部古代沉积岩中找到了距今6.5亿年的古代生物分子化石,并据此认为此前的“雪球地球”时期与更复杂的生命演化有关。研究成果发表在最新一期的《自然》杂志上。  消息称,该校地球科学研究学院的科学家将古代沉积岩粉碎成粉末,并从中提取

双水相体系用于生物分子的分离

  双水相体系是一种高效的萃取体系,由于离子液体的可设计性,基于离子液体的双水相体系应用更加广泛。理想的双水相体系应具有优异相分离行为、较低粘度和高效萃取效率等特性,完全的两相分离是实现高选择性萃取的前提。然而在无机盐存在下,离子液体会出现盐析现象。浙江大学邢华斌教授课题组通过可逆加成-断裂链转移聚

噬菌体让生物分子进化增速100倍

  据美国物理学家组织网近日报道,美国科学家在《自然》杂志上撰文指出,他们利用噬菌体,在实验室中让生物分子的进化速度提高了100倍。新研究有望让制药业使用实验室培育出来的蛋白质、核酸和其他成分按需制药。   该研究的领导者、哈佛大学化学和生化教授戴维·刘说,大多数现代药物都由有机小分子制成,但某

深海微生物抗癌分子机制发现

北京3月22日,根据21日发表在《自然·化学生物学》上的论文,美国加州大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋研究所研究人员揭示了一种被称为salinosporamide A(又名马里佐米)的海洋微生物是如何制造出有效抗癌分子的,他们首次了解了激活该分子的酶驱动过程。    1990年,斯克里普斯海洋研究

葵花盘小分子肽-神奇的生物炸弹

  说起痛风,马上联想到的便是无法忍受的疼痛、肿胀的关节、无休止的结石,这还不是最可怕的,若发展到肾功能损害以至尿毒症便会危及生命。   “越是经济发达的国家,得痛风的就越多,经济发达,生活方式发生改变,所以痛风发病趋势正在上涨,尽管医疗水平日趋发达,但是针对痛风,依然束手无策。”吉林大学生命科学

分子技术快速检测食品有害微生物

食品污染大多数是因为病原微生物引起的,传统的检验病原体的方法主要依靠具体的微生物学和生物化学免疫识别技术,比如培养基方法、分子生物学方法和免疫技术检测,这些方法都能定量定性分析病原体,但它们耗时、花费大,且需要专业的技术人员。而新的分子技术如生物传感器、微阵列、电子鼻子和纳米装置等能更快更准确地检测

《自然》:研究揭示生物钟的分子“开关”

这是迄今为止得到的关于人体生理节奏研究最明确的信息 调节人体内部生物钟的遗传机制一直是科学家研究的热点问题。近日,美国科学家发现了触发这一机制的化学“开关”。这是迄今为止得到的关于人体生理节奏(circadian rhythms)研究最明确的信息,为失眠以及其它相关疾病的药物治疗确定了精确的标靶。

分子生物学指的是什么

分子生物学是指在分子水平上研究生命现象的科学,从生物大分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质。研究内容包括各种生命过程,如光合作用、发育的分子机制、神经活动的机理、癌的发生等。生物大分子,特别是蛋白质和核酸结构功能的研究,是分子生物学的基础。