软件所青联举办“大数据”交流研讨会
研讨交流 3月7日下午，由中科院软件研究所青年联合会和软件所团委主办的“大数据”交流研讨会举行。本次交流研讨会旨在通过头脑风暴、聚焦和研讨的方式促进青年科技工作者在大数据领域的相互交流，分享经验与资源，推动大数据领域的学科交叉与合作。来自软件所多个部门的20余位青年职工参加了研讨。研讨会由软件所青年联合会副主席杨达主持。 参会人员分别介绍了对大数据的看法，以及正在从事或希望从事的与大数据相关的研究，包括：软件用户行为数据挖掘以及淘宝网合作数据挖掘的工作；大数据在自然语言处理、实体关系抽取方面研究；智慧城市检索与数据库建设方面研究；交通数据、物联网数据分析挖掘方面研究；物联网传感时效性数据分析、异常识别方面研究；软件过程数据挖掘与软件质量预测方面研究；大数据可视分析和数据关系发掘方面研究；非结构化数据处理，大规模视频数据自动分析处理技术方面研究；大数据相关流程控制方面研究；大数据关系挖掘、自动推理方面研究；......阅读全文
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
数据学与数据科学国际研讨会在京举办
5月29日至30日，由中国科学院虚拟经济与数据挖掘研究中心主办的主题为“探讨数据科学的原理、结构与应用”的“第二届数据学与数据科学国际研讨会”在北京举行。原全国人大副委员长、中国科学院虚拟经济与数据科学研究中心主任、中国科学院研究生院管理学院院长成思危先生担任本次会议的荣誉主席，中国科学院虚拟经
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多专
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
Eppendorf－参加全国公安机关DNA数据库建设应用研讨会
中国 海口(2011年10月21日)2011年10月18-20日，全球领先的生物技术公司Eppendorf 作为主要赞助商成功参加了在海口举办的第二届全国公安机关DNA数据库建设应用研讨会。 全国公安机关DNA数据库建设应用研讨会是由公安部物证鉴定中心主办的专项会议。
数据平台让水稻更易“读懂”－以水稻为研究对象的数据库
水稻生物学数据库众多、信息量大，但大多是生物学原始数据；国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能；国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者，一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”（http://www.riced
怎样用david数据库进行基因功能分析
Pathway功能分析及显著性判断对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。2. Pathway中基因相关性分析根据每两个基因共出现在同一pa
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所（国家生物信息中心）了解到，该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作，建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory，旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安
建立临床数据库的好处有哪些？
建立临床数据库具有以下诸多好处： 1. 提高医疗质量：通过对大量病例数据的分析，可以发现治疗过程中的优势和不足，从而优化治疗方案，提高医疗效果和患者的预后。 2. 支持临床研究：为医学研究提供丰富的数据资源，有助于发现疾病的发病机制、危险因素和新的治疗靶点，推动医学科学的发展。 3. 促进个性
英特尔将建帕金森患者数据库
帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录，以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨，我虽然正视自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情？说起来容易做起来难！ 好消息是，现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐，帕金森病患者运
Nature：癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断
去年，美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效，美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现，尽管当时她的研
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
全球最大地震数据库建成
国际地震学中心绘制的2万次地震数据集。 2004年苏门答腊岛地震、2008年中国汶川地震、2010年海地地震、2011年日本地震，在每次灾难中，故事都是相同的：一场地震在毫无征兆的情况下发生，夺走成千上万条生命，并且摧毁了像沙子城堡一样的建筑。 地球科学家依然无法预测一场大地震
我国首个寻亲DNA数据库在京建立
科技日报消息，我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍，通过该库，寻亲工作将变得方便快捷。同时，该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助，包括港澳台地区。 据悉，该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国
全球最大自闭症数据库上线
总部位于美国纽约的Simons基金会日前宣布，全球最大的自闭症数据库（SSC）正式上线并向全球科学家开放。目前已有来自美国、加拿大、中国、法国、冰岛、澳大利亚、爱尔兰、巴西和卡塔尔等17国家相关机构的自闭症研究人员，通过云端查询等方式使用了这一数据库。 SSC包含近2600个家庭的基因组序列数
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
天津建成食品污染物数据库
日前从天津市卫生计生委、市卫生监督所获悉，为了扩大食品污染物及有害因素监测覆盖面，实现对食源性疾病的主动监测，该市食品安全风险监测区域已覆盖全市16个区县，食源性疾病监测哨点医院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物数据库。 根据目前在食品安全领域担负的职责，该市卫生计生部门规划建立了
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安全措施
单细胞数据挖掘算法方面取得新进展
图 SEVtras高效识别单细胞转录组数据中的胞外小囊泡 在国家自然科学基金项目（批准号：32025009、32130020等）资助下，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在单细胞数据挖掘算法方面取得新进展，研究成果以“SEVtras识别单细胞转录组中液滴分辨率的胞外小囊泡（SEVtras de
人工智能与数据挖掘驱动的肿瘤新药研发
人工智能作为一种旨在模拟、延伸和扩展人的智能的科学，人工智能正在以前所未有的广度和越来越快的速度改变着世界的面貌。而在普瑞基准创始人季序我和梁晗看来，人工智能可以帮助我们更好地回答那些医学中最为本质的问题，对于新药研发、临床诊疗和医学基础研究，都有着不可估量的价值。 道路 在癌症诊治的过程中，
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
TPC：中国数据库性能破世界纪录
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497431.shtm
武汉将建温室气体排放因子数据库
武汉碳减排协会今天发布消息称，作为国家确定的7个碳排放权交易试点之一的武汉碳交易系统今年内将全面上线。 武汉碳减排协会会长程致舜说，交易系统技术层面的准备已经完成，不同物品在各环节的碳排放量都可以清楚地查询到。 据介绍，根据与法国波尔多市签署的友城合作协议，一个中法温室气体排放试点评
学术数据库免费时代何时来临
“北大买不起知网，研究者看不起论文”，逐年上涨的论文数据库使用费令学术界叫苦不迭。26日是第16个世界知识产权日，让我们探讨一下如何在保护知识产权的同时，解决商业数据库“坐地起价”之怪现状。 学术资源的“商业化” 本月初，北京大学官网发布了通知，称因中国数据库商涨价过高，图书馆将停用“中国知
全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾