怎样用david数据库进行基因功能分析
Pathway功能分析及显著性判断对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。2. Pathway中基因相关性分析根据每两个基因共出现在同一pathway中的次数统计，绘制基因共相关点线图，进而得到不同pathway上基因的关联情况。在分析工具上点击“cell differentiation”，在“Term Information”中描述了细胞分化术语的基本信息，包括树形及与父结点、子节点关系。对于未知基因名的序列，可以用序列直接检索GO数据库。点击AmiGO首页上方的“BLAST”，进入检索界面。在检索框输入氨基酸或核酸序列或上传序列文件，检索工具能自动识别并相应地选择BLASTP或BLASTX来与数据库中的序列进行比对。以大肠杆菌DNA聚合酶Ⅱ基因polB为例，“High......阅读全文
怎样用david数据库进行基因功能分析
Pathway功能分析及显著性判断对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。2. Pathway中基因相关性分析根据每两个基因共出现在同一pa
怎样用人工气候箱对水稻进行培养？
水稻是草本稻属的一种，也是稻属中作为粮食的zui主要zui悠久的一种，又称为亚洲型栽培稻，简单来说也可以说是稻。为一年生，禾本科植物，单子叶，性喜温湿，成熟时约有1米高，叶子细长，约有50到100厘米长，宽约2到2.5厘米。水稻喜高温、多湿、短日照，对土壤要求不严，水稻土。幼苗发芽zui低温度10～
关于基因功能分析的内容介绍
基因功能分析，是指利用生物信息学和不同表达系统对基因的功能进行的预测、鉴定和验证。基因功能是在细胞组成的多层次复杂生命体中实现的，因此对基因功能的研究将极大程度上依赖于对模式生物的研究。基因功能研究的方法有：基因的生物信息学分析，基因的时空表达谱分析（mRNA水平的表达谱分析和蛋白质水平的表达谱
David－Liu首次通过AAV病毒载体在动物体内进行碱基编辑作用
碱基编辑器用于研究和治疗遗传性疾病的成功取决于将其体内传递给相关细胞类型的能力。通过腺相关病毒（AAV）的传送受AAV打包能力的限制（AAV的基因组包装大小限制为≤5kb），因此无法使用全长碱基编辑器。 2020年1月14日，博德研究所David Liu团队在Nature Biomedical
David－Liu团队发表新型基因编辑工具，有效减少脱靶效应
目前，CRISPR–Cas9基因编辑工具虽然可以轻松地改变基因组，但其容易导致脱靶效应等意想不到的编辑后果。为更好地控制基因编辑的进行，科学家们在开发不同的替代方法方面进行了不懈的努力。 2019年10月21日，单碱基编辑技术开创者、Broad研究所David Liu教授研究团队在顶级学术期刊
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成，人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era)，向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析，研究相应基因在生物体内的功能，
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成，人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era)，向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析，研究相应基因在生物体内的功能
烟草转录调控因子WRKY基因家族基因功能分析取得进展
大量研究工作证实，植物WRKY基因家族的主要生物学功能是调控植物抗病反应及其信号转导途径的建立。WRKY转录调控因子在植物的抗病性方面，如抗病毒、抗细菌、抗机械伤害等方面参与了植物对逆境的应答反应，对高盐、干旱、高温、低温等非生物逆境因子的抗性也具有重要作用，这些对于一生保持原地不
张锋与David－Liu共同创立－基因疗法新锐今日启航
今日，业内传来重磅新闻：由知名华人学者张锋教授和David Liu教授等人共同创立的Beam Therapeutics正式启航，将以革命性的基因编辑技术开发精准的遗传疗法。值得一提的是，这家新锐也是首个利用CRISPR单碱基编辑技术开发全新疗法的公司。 华人学者强强联手带来突破性基因疗法 这
David－Liu课题组运用基因编辑有望治疗遗传性耳聋
音乐家贝多芬本人也从未能听过他的名曲《欢乐颂》，但是谢谢有和他同样名字的小鼠模型，我们离治疗遗传性听力疾病又近了一步。12月20号，华人科学家Xue Gao（高雪）、Yong Tao以及其他共同作者在Broad Institute 的David Liu教授（2017《自然》十大人物发布，基因编辑
Cell子刊：单倍体干细胞加速基因功能分析
科学家们开发了全面鉴定基因功能的快速方法，这一技术能够大大增进我们对许多疾病的理解，例如心脏病、肝脏疾病和癌症等。 该方法利用只含一组染色体的干细胞，为研究人员揭示了干细胞分化时发生的遗传学改变。研究指出，该方法还可以用来研究许多其他的生物学过程。 胚胎干细胞通过特定的基因作用路径，
棉花耐盐相关基因－GhVP－的表达及功能分析
土壤盐渍化是世界范围内限制农作物产量和品质的重大问题。棉花是改良盐碱地的先锋作物。培育棉花耐盐品种，开发利用大面积盐碱地是棉花种植的必然趋势，通过分子生物学手段挖掘棉花耐盐相关基因，创新棉花种质资源，对棉花耐盐性研究尤为重要。系统进化分析表明 GhVP 与盐生植物盐爪爪、灰绿藜的亲缘关系最近，进一步
棉花耐盐相关基因－GhVP－的表达及功能分析
土壤盐渍化是世界范围内限制农作物产量和品质的重大问题。棉花是改良盐碱地的先锋作物。培育棉花耐盐品种，开发利用大面积盐碱地是棉花种植的必然趋势，通过分子生物学手段挖掘棉花耐盐相关基因，创新棉花种质资源，对棉花耐盐性研究尤为重要。系统进化分析表明 GhVP 与盐生植物盐爪爪、灰绿藜的亲缘关系最近，进一步
心理所构建伪装表情数据库并进行基准评价
面部表情是眉毛、眼睛和嘴角等区域的面部肌肉运动传递自身情绪感受的外在表达。除了常见的自然表情，人们还可以表现出伪装的面部表情从而达到掩饰或抑制内心真实情绪状态的目的。伪装表情时有发生：比如家长面对着孩子潦草的作业心里很窝火，但为了不挫伤孩子的自信心，故作开心地继续辅导；又比如一些窗口部门的工作人
IEEE－Access：构建伪装表情数据库并进行基准评价
面部表情是眉毛、眼睛和嘴角等区域的面部肌肉运动传递自身情绪感受的外在表达。除了常见的自然表情，人们还可以表现出伪装的面部表情从而达到掩饰或抑制内心真实情绪状态的目的。 伪装表情时有发生：比如家长面对着孩子潦草的作业心里很窝火，但为了不挫伤孩子的自信心，故作开心地继续辅导；又比如一些窗口部门的工
David－Liu发布新prime编辑系统：在细胞中插入了完整的基因
一种基于CRISPR的基因编辑技术称为twin prime editing，它可能是一种新的更安全的基因治疗方法。（Ricardo Job-Reese, Broad Communications） 麻省理工学院(MIT)和哈佛大学(Harvard)布罗德研究所(Broad Institute)
如何理解基因富集分析以及富集
1.Pathway功能分析及显著性判断 对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。 2.Pathway中基因相关性分析 根据每两个基因共
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章？
玩转数据库，助你发牛文！ 癌症研究究竟有多难？让我们来捋一下基本思路：首先，要有一定数量的高质量肿瘤临床样本；其次……等一下，是不是在“首先”这一步就卡住了？癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织，还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不
如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章？
玩转数据库，助你发牛文！癌症研究究竟有多难？让我们来捋一下基本思路：首先，要有一定数量的高质量肿瘤临床样本；其次……等一下，是不是在“首先”这一步就卡住了？癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织，还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不间断的随访信
分子生物学常用数据库汇总及推荐
分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式；主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用，可能参与哪些生物学行为等进行一些初步
泡泡男孩David与抗癌明星Emily的故事
今天讲的是两个小朋友的故事——David & Emily。他们都曾身患重疾，分别是罕见病重症综合性免疫缺陷（SCID）和急性淋巴细胞白血病（ALL），并且都使用了领域内最前沿的治疗方案：不完全匹配的骨髓移植和CAR-T免疫疗法，受到了许多民众关注，可谓是两个疾病领域内的“童星”。 尽管Davi
心理所关于疾病相关非编码区域的研究取得新进展
遗传学因素在精神类疾患发生发展过程中的重要性已经得到公认。此外，影像遗传学证据显示，正常心理学现象中的行为/认知加工过程也表现出一定程度的遗传相关性。目前已有大量精神疾患及行为/认知加工相关易感基因鉴定工作发表在心理学主流杂志上，但是这些易感基因的功能分析，尤其是针对非蛋白质编码区域的功能研究有
全球药典草药基因组数据库已上线
近期，中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志，标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后，再利用DNA扩增的方式原理，在扩增的同时借由侦测萤光的方式（将不同碱基原料接上萤光讯号，只要这有接讯号的碱基被合成了，即会发出不同强度的萤光讯号）即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
众包个体基因数据库缓慢发展
Yaniv Erlich 计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前，他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。 早在2013 年，Erlich 团队就发表了一篇论文，介绍了如何利用公共资源，通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身
大型衰老相关基因表达谱数据库建成
英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称，包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现，衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致，但与癌症的相反。 对衰老及衰老相关疾病的研究，一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定，衰
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属，因芳香多汁、营养丰富受到喜爱，在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体，基因组复杂，杂合度高。 2019年，《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高