最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等机构组建的国际研究团队,完成了迄今为止最大动物基因组参考序列——南极磷虾基因组组装,并揭示了南极磷虾适应极端环境和群体历史演化的分子基础。北京时间3月3日,国际顶级学术期刊《细胞》(《Cell》)以“巨大高重复基因组图谱绘制揭示了南极磷虾环境适应机制及其群体演化历史”为题,在线发表了该研究成果。 研究团队利用新一代测序技术对南极磷虾开展了高深度的基因组测序、组装和分析,构建了迄今为止地球上最大的动物基因组参考序列,其大小为48Gb,约为人......阅读全文

科学家完成糜子全基因组精细图谱

  1月25日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图

科学家破译枸杞子基因组图谱

枸杞作为传统的药食同源植物,含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖(LBPPs)是重要的生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但对枸杞的遗传图谱、枸杞活性成份LBPPs的合成过程和调控机制知之甚少。这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展与推广。  近日,中国科学院院

科学家破译枸杞子基因组图谱

枸杞作为传统的药食同源植物,含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖(LBPPs)是重要的生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但对枸杞的遗传图谱、枸杞活性成份LBPPs的合成过程和调控机制知之甚少。这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展与推广。近日,中国科学院院士、

中国启动“世界三极”动物基因组研究项目

  这是继“国际大熊猫基因组计划”后的又一重大研究计划   中国科学家4月24日在深圳宣布启动“世界三极”动物基因组研究项目,对企鹅、北极熊和藏羚羊这三种分别生长于南极、北极和高海拔严酷环境下的动物展开基因组水平上的研究。该计划是继“国际大熊猫基因组计划”之后,中国科学家启动的生命科学领域又一重大

南极海冰面积创最小纪录

近日,记者从中国气象科学研究院青藏高原与极地气象科学研究所获悉,依据最新观测数据和综合分析,今年2月,南极海冰面积创下1979年有卫星观测以来最小面积纪录——为192万平方公里,南极异常高温导致的冰层不稳定引发科学家对南极生态、气候变化的担心。南极对气候变化最为直观的“回应”是其冰盖、冰山、海冰的变

中国科学家领衔完成第一张蒙古人基因组图谱

来自纽约9月14日的消息,由深圳华大基因研究院(Shenzhen Genomics Institute)领导的国际研究小组即将公布“蒙古人”的“第一张基因组测序图谱”。 深圳华大基因研究院即中科院北京基因组研究所的分支机构,对于此次测序活动,他们表示,对世界上超过20亿人口的蒙古人种进行测序得到

中国学者最新Nature-Genetics文章:破译又一关键基因组

  生物通报道:来自中国水产科学研究院黄海水产研究所等处的研究人员发表了题为“The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry”的文章,破译了日本牙鲆(Japanese

中国水产科学研究院东海所在大黄鱼抗逆性状机制解析方面取得系列进展

  中国水产科学研究院东海水产研究所在大黄鱼抗逆性状机制解析方面取得系列进展。大黄鱼是我国海水养殖产量最高的海洋经济鱼类。东海所大黄鱼遗传育种团队开展了不同生长发育阶段的大黄鱼(仔稚鱼、幼鱼)对酸化、低氧以及酸化低氧双重胁迫响应机制研究。研究发现酸化低氧双重胁迫对大黄鱼生理响应的影响要大于酸化或低氧

南极“猎手”还有的吃吗?

磷虾以浮游生物为食,是食物链的关键部分。 图片来源:AUSCAPE INTERN-ATIONAL PTY LTD  虽然磷虾是一种比香烟还小的甲壳类动物,但它在南极附近海洋的生态系统中扮演了非常重要的角色:企鹅、鲸和其他捕食者以这种虾类动物为食。如今,研究人员对磷虾在斯科舍海的主要栖息地进行了广泛的

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

科学家绘制高精度类人猿基因组图谱

一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制

日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起

科学家构建高质量金粟兰基因组图谱

11月26日,《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究,这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树,对了解被子植物的

科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱

《科学》:有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行

科学家破译茶枝柑基因组遗传图谱

茶枝柑属于芸香科柑橘属宽皮橘物种,是历经700多年驯化栽培的柑橘变种,其果皮制干即为中药“广陈皮”,含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是“广陈皮”中关键的药用成分,但目前对其生物合成的遗传基础及调控机制知之甚少。近日,我国科学家在“广陈皮”活性成分合成调控机制研究方面取得重要进展,他们通过多组学技术

黄海所在南极磷虾来源木糖异构酶开发利用方面取得新进展

木糖异构酶(Xylose isomerase)是生物质转化、稀有糖合成及高果糖浆生产中的关键酶,在食品、医药和生物能源等领域具有广泛应用。然而,目前大多数商业化木糖异构酶来源于嗜热微生物,其催化反应通常需在70–95 ℃条件下进行,不仅能耗高,还易产生美拉德反应副产物,影响产品色泽与风味。因此,开发

深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱

揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布,大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成,这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍,大熊猫有二十一对染色体,基因组大小与人相似,约为三十亿个碱基对,包含二到

中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱

  科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。  此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。  基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和

长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成

  日前,长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成,并筛查得到与重要性状相关的基因或信号通路,在国际上填补了冠轮动物基因组学研究空白。  这是在国家863计划支持下,由中国海洋大学、中国科学院海洋研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国科学院南海海洋研究所、威海长青海洋科技股份有限公司、大连獐子

中国第28次南极科学考察队凯旋

  在欢快的锣鼓声中,中国第28次南极科学考察队凯旋。4月8日,在中国极地考察国内基地码头,国家海洋局与上海市政府举行了简朴而热烈的欢迎仪式。  中国第28次南极科学考察历时163天,圆满完成“一船三站”考察任务。“雪龙”号极地科学考察船安全完成天津港——澳大利亚弗里曼特尔港——中山站——

中国第38次南极科学考察队出征

  中国第38次南极科学考察队首批154名队员,11月5日搭乘“雪龙”号极地科学考察船从上海出征,执行中国第38次南极科学考察任务,预计2022年4月中旬返回国内。  中国第38次南极科学考察将围绕应对全球气候变化,开展大气成分、水文气象、生态环境等科学调查工作,执行南大洋微塑料、海漂垃圾等新型污染

生态环境中心参加中国第27次南极科学考察

  中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室李英明博士参加我国第27次南极科学考察,于11月29日到达中国南极长城站,开始为期两个月的极地科考项目“南极地区持久性有机污染物生物富集效应”研究。   本次科考将在第26次南极科考研究的基础上,通过对南极地区大气、海水

中科院李英明博士参加南极POPs科学考察

  中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室李英明博士参加我国第27次南极科学考察,于11月29日到达中国南极长城站,开始为期两个月的极地科考项目“南极地区持久性有机污染物生物富集效应”研究。  本次科考将在第26次南极科考研究的基础上,通过对南极地区大气、海

中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉

每个人的基因都能刻成盘? 采访人:记者  余建斌 点评人:浙江大学遗传与基因组医学中心主任  祁  鸣 来源:人民网-《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“DNA之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品:一张含有组成他基因的30亿个DNA单位详细信息的光盘,颁奖仪式31

科学家对大小黄鱼的景观基因组学研究获新突破

小黄鱼基因组特征   课题组供图小黄鱼和大黄鱼的种群结构和种群动态历史  课题组供图 小黄鱼和大黄鱼基因组异质性分化分布图   课题组供图近日,中国水产科学研究院黄海水产研究所、新加坡淡马锡生命科学研究院和中山大学等单位在大黄鱼、小黄鱼的景观基因组学研究取得重要进展,该成果发表在生态学和进化生物学期

多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱

  近日,来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,绘制

科学家成功绘制-首幅小麦基因组物理图谱

一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传

我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源

  甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交,其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文,提出了甜橙起源这一新理论。   专家表示,甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架,也将在应用上为果实品质包括色

我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱

  由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱,日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。   自1985年大黄鱼人工养殖