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我国学者在纳米孔道多肽测序及酶串扰效应上取得进展

图 纳米孔道单分子检测及肾素-血管紧张素系统酶串扰效应示意图 在国家自然科学基金项目(批准号:22027806、21834001)资助下,南京大学龙亿涛教授团队基于精准设计的生物纳米孔道单分子界面、单分子多肽测序方法、自主研发的微弱电流测量系统及单分子快速定量方法,建立了复杂体系分子时序变化研究新技术,开展了肾素-血管紧张素系统串扰研究,揭示了新冠病毒对该串扰体系的干扰。研究成果以“蛋白质纳米孔道识别多肽单氨基酸差异以揭示肾素-血管紧张素系统串扰效应(Protein nanopore reveals the renin-angiotensin system crosstalk withsingle-amino-acid resolution)”为题,于2023年2月21日发表在《自然•化学》(Nature Chemistry)上。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41557-023-0......阅读全文

多肽合成蛋白测序仪介绍

433A多肽合成系统 —— 公认的经典高效全自动合成系统l         合成规模0.1-1.0 mmol,可采用Fmoc和tBoc两种方法l         特有的涡流混合式反应腔和NMP溶剂系统:活化氨基酸与肽充分反应,偶联率高达99%以上l         专利的零死体积阀门设计:去除交叉污

我国学者在纳米孔道多肽测序及酶串扰效应上取得进展

图 纳米孔道单分子检测及肾素-血管紧张素系统酶串扰效应示意图  在国家自然科学基金项目(批准号:22027806、21834001)资助下,南京大学龙亿涛教授团队基于精准设计的生物纳米孔道单分子界面、单分子多肽测序方法、自主研发的微弱电流测量系统及单分子快速定量方法,建立了复杂体系分子时序变化研究新

自动多肽/蛋白质测序仪

2007年实验室对蛋白质测序仪的需求       Edman降解法是测定蛋白质序列的经典方法,该方法由瑞士生物化学家佩尔·维克托于1950年创立。Edman降解法通常是以周期的形式来表征。对于一个完整的周期,异硫氰酸苯酯标记上指定肽段的N末端,环化,之后被标记的氨基酸在酸性条件下从肽链中游离出

纳米孔测序技术

测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”:他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本,然后就能在一个小时内现场进行谱系分析,甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信

纳米孔测序技术有望颠覆DNA测序市场?

 Scott Tighe(左)等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。  “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗?Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机

详解牛津纳米孔测序仪

 牛津纳米孔测序仪在美国人类遗传学学会年会上公布技术参数  2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行,有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示,技术之创新,令人震惊!21日下午,牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会,讲解了纳米孔的

详解牛津纳米孔测序仪

 2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行,有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示,技术之创新,令人震惊!21日下午,牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会,讲解了纳米孔的测试结果。  尺寸  MinION的尺寸之小,大大出乎我的

纳米孔测序技术发展简介

  随着对DNA结构和序列的研究,DNA测序技术不断发展,成为生命科学研究的核心领域,对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。  纳米孔测序技术发展简介  纳米孔检测技

纳米孔测序仪首次于失重环境下完成测序实验

  科学家们在失重环境下进行实验,首次证实掌上测序仪MinION可以在太空中使用。  Johns Hopkins大学的遗传学家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飞机,在模拟的失重环境下完成了遗传学实验。“我非常享受这种体验,感觉就像置身天堂,”Fe

Nature Methods:纳米孔测序仪潜力无限

  来自英国Oxford Nanopore公司的MinION是第一台商业化的纳米孔测序仪。它在带来无限希望的同时,也承受着高错误率的质疑。英国伯明翰大学的Nicholas J. Loman和爱丁堡大学的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文,称新开发的工具让纳米孔测

纳米孔技术有望颠覆DNA测序市场

  Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA,他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析,甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示

纳米孔测序仪真机现身ASHG

  英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION,性能强劲,价格给力,引发市场轰动。然而,大半年过去了,纳米孔测序仪却迟迟不见踪影,连更早发布的GridION也未上市。于是,生物界开始议论

纳米孔测序的过去、现在和将来

  纵观测序技术的发展历程,没有哪一个技术像纳米孔测序那样慢热,但也没有哪一个技术像纳米孔测序这么接近普罗大众。将单链DNA拉过蛋白孔,检测碱基穿过时电导的微小改变,纳米孔测序的这一基础理念已经有十几年历史了。  1996年哈佛大学的DanielBranton、加州大学的DavidDeamer及其同

Oxford Nanopore:纳米孔测序仪开放试用

  在上个月的美国人类遗传学协会年会上,英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次,它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。   根据这项试用计划,参与者须支付1,000美

利用纳米孔测序在100天内测序100种番茄

  约翰霍普金斯大学的研究人员Michael Schatz概括了目前所做的工作和进展情况,而贝勒医学院的研究人员Fritz Sedlazeck介绍了样本选择和结构变异检测的详细信息。  番茄是最有价值的经济作物之一,在世界各地广泛栽培。根据联合国粮农组织的统计,2016年番茄产量达到1.77亿吨,价

基于多肽的脑靶向纳米传递系统的最新成果

  10月11日,国际学术期刊Nature Communications(《自然-通讯》)在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院巫林平课题组和英国纽卡斯尔大学教授Moein Moghimi研究团队共同合作,基于多肽的脑靶向纳米传递系统的最新成果“Crossing the blood-brain

国内首个菊花脑基因组测序-纳米孔测序再发高分论文

  菊属植物种类繁多,又含多种栽培种,兼具观赏和药用价值,且染色体组结构从2n=18到8n=72之间,十分复杂,多年来难以攻破。  中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组,分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动,该基因

国家纳米中心在核酸与多肽交叉研究中取得进展

  近日,中国科学院国家纳米科学中心李乐乐课题组报道了一种方法学以实现利用蛋白酶调控核酸功能,并以此为基础实现了两种肿瘤促转移标志物的空间选择性成像分析。  蛋白酶是一类具有蛋白水解活性的酶,参与调节几乎所有的生理过程。蛋白酶活性的异常与多种病理有关。例如,许多蛋白酶在癌细胞中过表达,被认为是恶性肿

纳米孔测序搞定超级难搞的基因

  Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。  对于MinION,众多讨论

纳米孔测序搞定超级难搞的基因

  Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。  对于MinION,众多讨论

纳米孔测序仪为何迟迟不见踪影?

  今年2月,英国Oxford Nanopore Technologies公司(以下简称Oxford)宣布推出一款便携式的基因组测序仪MinION,约摸只有U盘大小,价格低于900美元,立即引发市场轰动。同时,该公司另一测序平台GridION有望在15分钟内完成人类基因组测序,费用约为1,500

武汉大学研发纳米孔靶向测序检测方法

  记者从武汉大学获悉:该校组建的联合团队创新性开发的纳米孔靶向测序检测方法,能够大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠病毒和其他10类40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变,有助于破解临床疑似病例难以确诊的问题。  据介绍,既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测,但是该方法显示出较高的假阴性

纳米孔测序发现DNA损伤的新策略

  最近,美国犹他大学的化学家们,设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤,DNA损伤有时会导致基因突变,引发许多疾病,包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《NatureCommunications》。  本文通讯作者、化学教授CynthiaBurrows说:“我们更进一步了解了

2013值得关注的技术:纳米孔测序仪

  《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时,杂志还介绍了2013年值得关注的技术,包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func

纳米孔测序发现DNA损伤的新策略

最近,美国犹他大学的化学家们,设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤,DNA损伤有时会导至基因突变,引发许多疾病,包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《Nature Communications》。延伸阅读:科学家解开DNA修复的谜团。本文通讯作者、化学教授Cynthia

纳米孔测序的最低DNA量是多少

第三代测序技术则是基于纳米孔的单分子读取技术,全基因组的测序以及RNA-seq测序有DNA测序和RNA测序,之前比较早的测序是以芯片为基础,这种方法读取数据更快,现在常用的是二代测序。随之而来的是第三代测序技术、有望大大降低测序成本。望满意,目前比较高级的还有单细胞测序

小小纳米孔破解蛋白质测序难题

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503589.shtm

PNAS:新技术实现纳米孔内快速测序DNA

  据《每日科学》近日报道,由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术,可在纳米孔内对DNA进行快速测序,而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)。  论文主要作者

牛津纳米孔测序将全面升级,回避IlluminaZL之战

  一直以来,牛津纳米孔公司对其核心产品的微通道都持有保密态度,然而自测序巨头Illumina公司对其进行专利诉讼之后,牛津纳米孔透露了其最新设备的驱动因子——细菌孔隙,似乎有意回避Illumina的专利之战。  纳米孔测序被誉为是一个比传统测序更便携和实惠的技术,根据单核苷酸通过孔隙产生的电流变化

纳米孔测序首次实现1 Mb的读长

  高通量测序的产量让人惊叹不已,但读长却屡屡遭人诟病。不过,从100 bp到1 kb,读长始终在进步。近日,测序界传来了一个激动人心的消息,澳大利亚Garvan研究所的研究人员利用Oxford Nanopore测序技术实现了> 1 Mb的读长,这堪称测序历史上的一个里程碑。  Kinghorn临床