病原体构建的“生命之树”问世
美国北卡罗来纳州立大学开发出全球首个用于植物病原体的新在线工具,将帮助研究人员识别、检测和监测疫霉属物种,这些“植物破坏者”病害造成了1840年代毁灭性的爱尔兰马铃薯饥荒,以及目前仍在美国西海岸蔓延的橡树群体性死亡。研究发表在最新一期《公共科学图书馆·综合》上。疫霉属第一个物种于1876年得到描述和命名。疫霉存在于空气、土壤和水中,可导致粮食作物、观赏植物和树木患病。自2000年以来,研究人员已经确定了大约150种新的疫霉属物种。这是一个异常大量的植物病原体物种,许多疫霉属物种具有广泛的宿主范围,因此它们可在更广泛的区域“移动”。此次构建的“生命之树”提供了关于超过192个正式描述的物种中的大量信息,包括它们的进化历史和群体内的关系,以及30多个其他非正式描述的分类单元。它还包括来自每个物种的遗传蓝图或基因组上多个位置的基因序列数据。其他重要数据包括每个物种的全球位置、承载病原体的植物以及病原体在其植物宿主之中或之上的位置。患病......阅读全文
病原体构建的“生命之树”问世
美国北卡罗来纳州立大学开发出全球首个用于植物病原体的新在线工具,将帮助研究人员识别、检测和监测疫霉属物种,这些“植物破坏者”病害造成了1840年代毁灭性的爱尔兰马铃薯饥荒,以及目前仍在美国西海岸蔓延的橡树群体性死亡。研究发表在最新一期《公共科学图书馆·综合》上。疫霉属第一个物种于1876年得到描述和
病原体构建的“生命之树”问世
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497782.shtm 科技日报北京4月3日电 (记者张梦然)美国北卡罗来纳州立大学开发出全球首个用于植物病原体的新在线工具,将帮助研究人员识别、检测和监测疫霉属物种,这些“植物破坏者”病害造成了184
植物病原体的生命之树
一个开创性的植物病原体在线资源已经被开发出来,旨在帮助全世界的研究人员识别、检测和监测嗜酸菌的种类。这些病原体引起了各种植物疾病,从19世纪40年代灾难性的爱尔兰土豆饥荒到正在影响西海岸橡树的橡树猝死。 这个创新的病原体"生命之树"提供了超过192个官方认可的物种的广泛信息,如它们的进化史和群
最新研究重写鸟类家谱,构建鸟类生命之树
鸟类是恐龙的后裔。所有其他类群的恐龙在白垩纪末期的大灭绝事件中走向了终结,但绝大多数现生鸟类的祖先却在不到1000万年时间里快速繁衍,分化出非常多的新类群,堪称演化奇迹。在过去一个多世纪里,现生鸟类家谱的内部关系问题一直悬而未决,这成为构建生命之树的代表性难题。4月2日,以我国科学家为发起方和主要参
科学家构建新的生命树
4月11日在《Nature Microbiology》发表的一项研究中,科学家们构建了了一种新的生命之树,显示了所有已知生物之间的关系,通常分类学家们分成三个领域:真核生物、细菌和古生菌。这个新的生命树的最大分支,是由对科学界来说全新的细菌组成。延伸阅读:首个包含230万种物种的生命之树发布;
从全基因组水平构建鸟类物种生命树
近日,“第一届万种鸟类基因组(B10K)项目国际研讨会——鸟类复杂性状的进化解析与调控”在北京召开。会议由中国科学院昆明动物研究所主办,中国科学院动物研究所协办。会议组织委员会主席由昆明动物所特聘讲座研究员张国捷和动物所研究员雷富民担任。 据悉,由中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所
鸟瞰地球奇景:从大热泉到非洲生命之树
北京时间12月12日消息,据国外媒体报道,地球是人类赖以生存的家园,然而,由于人为活动,地球正遭受污染和气候变暖等诸多环境问题的威胁。以下是法国著名航空摄影师、自然保护主义者阿瑟斯-波特兰德(Arthus-Bertrand)从空中拍摄的一组地球照片。 1.美国黄石公园大热泉 美国黄石公
大规模基因研究重新绘制开花植物的生命之树
植物学家利用9500多个物种的基因组数据,绘制了开花植物之间的进化关系图。新绘制的生命之树将帮助科学家拼凑出开花植物的起源,并为未来的植物保护工作提供信息。相关研究已发表于《自然》。 大约1.5亿年前,地球上的生命开始了一次彻底的革新,这要归功于一个巨大群体的迅速崛起:开花植物或被子植物。木兰
全球科学家携手重建被子植物“生命之树”
被子植物,即有花植物,占据陆地植物种类的90%,其起源和早期快速演化问题被达尔文称为“恼人之谜”,也成为植物学、进化生物学和古生物学家持续关注的热点问题。最近30多年来,科学家们尝试利用DNA序列重建了被子植物的生命之树,极大地改变了我们对被子植物进化历史的认识。近期,英国皇家植物园邱园植物和菌物生
质粒构建之酶切位点的选择
结论:一定要选择具有相同buffer的两个酶 技术背景: 克隆目的基因,并把其装入表达载体转化/转染原核细胞/真核细胞中,是获取目的蛋白/研究基因功能的经典方法,也是目前科研工作者常用的方法。其中酶切是该技术不可缺少的一部分,随着载体设计技术的发展,双酶切以其独特的优点而逐渐取代了单酶切 。 具体
多重序列比对及系统发生树的构建
【实验目的】1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程,获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识;2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法;3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。【实验原理】在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的
神舟飞船的“生命之伞”
神舟十一号飞船从距离地球393公里的太空返回地球,所用时间并不长。这期间,除了两位航天员的身体状况备受瞩目,就属最后时刻展开的那把巨大的生命之伞了。 所谓生命之伞,是指神舟十一号飞船所携带的“主伞”,约1200平方米大,全部展开后可以覆盖3个篮球场,拉直长度超过70米,能够横跨足球场。其主要
细胞的“生命之液”:血清
细胞培养是现代生物学研究中一项重要的技术,广泛应用于基础研究、药物开发、疾病模型构建等领域。在细胞培养过程中,血清是不可或缺的关键成分之一。血清是一种复杂的生物液体,含有多种生物活性物质,能够为细胞提供生长、增殖和维持生理功能所需的营养和环境支持。一、血清的定义与来源血清是指血液凝固后,在血浆中去除
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理 在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 实验步骤
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤:1. 以FASTA格式准
PNAS:科学家构建肿瘤“进化树”
一个肿瘤内的个体细胞并不全是相同的。这可能听起来像是一个现代医学真理,但很久以前并不是这样,当时医生认为,从患者肿瘤采集的单一活检标本,能准确地反映整个肿瘤的生理和遗传构成。 研究人员开始意识到,癌症这种疾病是由相同的“适者生存”力量所驱动的,达尔文提出,适者生存推动了地球上生命的进化。然而,
多重序列比对及系统发生树的构建实验(一)
实验方法原理在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤:1. 以FASTA格式准
多重序列比对及系统发生树的构建实验(二)
2. 文件outfile改为infile。点击DNADIST程序。选项M是输入刚才设置的republicate的数目,输入D选择data sets,输入200。设置好条件后,输入Y确认参数。程序开始运行,并在EXE文件夹中产生outfile,部分内容如下:将outfile文件名改为infile,为
培育单倍体干细胞-找寻生命树成长“钥匙”
胎盘是维持胎儿生命的重要器官,被誉为“生命树”。日前,南开大学药物化学生物学国家重点实验室帅领研究团队利用可诱导过表达转录因子CDX2的方式在体外获得单倍体滋养层干细胞,该新型单倍体干细胞只有一套基因组,可在体外无限增殖并具备分化成为胎盘谱系各种细胞的潜能。因此该研究犹如找到了生命树成长发育的
疫苗存储有了“生命之桶”
日前,由比尔·盖茨投资发起的科研机构Global Good与中国冰箱生产商澳柯玛公司开展密切合作,开发出一款能够将疫苗保持在合适温度下长达一个月或更长时间、能够重复取用疫苗且无需消耗电力的设备。世界卫生组织已经将该被动式疫苗存储设备通过预认证,认定该产品符合其性能、质量和安全项目所规定的相关标准
揭开衰老之谜,寻找生命之钥
在“十三五”科技创新成就展上,刚走进“面向世界科技前沿”的基础研究展区,就会看到一个叫做“解密衰老”的展台。不论男女老少,大家总喜欢在这里驻足一会儿,问些最关心的问题:“到底什么是衰老?”“我怎么知道自己有多老?”“怎样才能老得慢一点?” 这些问题看似简单,实则极其复杂。 过去10年间
国产新型生命探测仪问世-20米内能捕捉生命迹象
在地震、泥石流等灾害面前快速准确搜寻到被掩埋的生命信号,第一时间挽救生命是世界各国抗灾救援工作的技术难题之一。7月21日,湖南省公安消防总队和湖南华诺星空电子技术有限公司联合研发的“警用超宽带雷达式生命探测仪”在长沙市通过科技成果鉴定。主持鉴定的中国工程院院士何继善等专家认为,该成果性能良好,最
哺乳动物生命树演化结构研究取得新成果
在爬行动物到哺乳动物的演化过程中,存在两个重要的形态和功能变化,即牙齿从简单到复杂以增加食物的摄取能力,以及下颌头骨关节变为中耳听骨组合以提高听觉效力。近期,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员毛方园和张驰,联合内蒙古自然博物馆、云南禄丰自然资源局、楚雄禄丰恐龙化石保护研究中心以及美国和澳大利亚
夏军:水是生命之源-生产之要-生态之基
2011年中央一号文件强调了水利事业在国家发展中的核心地位。以一号文件的形式关注水利事业,凸显了党和政府对水利事业的高度关注。这是水利事业的发展机遇,也是科技工作者沉甸甸的责任与义务。本报特约请水利、农业、政策领域的有关学者解读文件,提出建议,以科学引领经济社会持续、健康发展。今天刊登第一篇。
守护“生命之河”:你的血管健康吗?
四通八达的血管如同河流,随着心脏的跳动,血液奔流不息,维持着生命的循环。在世界心脏日来临之际专家提示,血管健康和生命健康密切相关,莫让“生命之河”成为“定时炸弹”。 中国医学科学院阜外医院血管外科中心主任舒畅介绍,血管疾病中最常见的,也是最为可防可治的就是动脉粥样硬化,可以理解为血管的管壁弹性
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究,展示了如何利用蛋白质三维形状,解开生命中古老的“历史密码”,揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合,提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”(艺术概念图)。图片来源:《
森林里有一个“科学之树”小画展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/480150.shtm “科学之树”画展 西湖大学供图 “科学之树”画展 西湖大学供图 一老一小观众看画展 西湖大学供图 一个来自于小朋友的画展“科学之树”,6月1日在杭州植物
盘点2021:耐心积蓄力量-让科学之树长青
盘点2021年,中国科技界正在发生深刻而影响深远的变革。总结下来,其一,科技发展路径的变革;其二,科研范式的转型。这两场变革一旦完成,将决定中国科技未来几十年的发展。只有厘清过往,未来才会清晰。我们不妨先把这些变革的征兆与迹象简单梳理出来。关于科技发展路径的变革,从长期信奉单一应用研究模式开始向加强
森林里有一个“科学之树”小画展
一个来自于小朋友的画展“科学之树”,6月1日在杭州植物园开幕,展出将持续5天。 在杭州植物园,有一片挺拔秀气的水杉林,清晨时间雾气迷蒙,小朋友的80多幅画,就在林间展出。 在水杉和水杉之间,悬挂的童画上是一个个千奇百怪的科学梦。人们生活在树里;冰淇淋长在树上;小女孩面朝大海,鲸鱼在陆地上游泳
-胰腺癌疫苗问世-免疫疗法拯救生命
据英国《每日邮报》2月28日报道,英国科学家已经研发出胰腺癌疫苗,并在临床试验中结合传统的化学疗法共同对抗癌症。 这项研究由Clatterbridge癌症研究中心(ClatterbridgeCancerCentre)的专家和英国的其他研究人员进行。 胰腺能产生和释放人体所需要的重要物