北京生科院最新研究进展
4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析和高效挖掘的技术体系。 近年的研究表明，环形RNA在真核生物体内具有广泛的生物学功能。环形RNA序列与线性RNA相似度高，因此如何高效鉴定环形RNA特有的外显子结构，是环形RNA研究中的重要问题。针对这一问题，赵方庆团队前期提出了CIRI-AS算法（基于BSJ读段对比结果对环形RNA内部可变剪接结构进行识别）。后续研究开发了CIRI-full算法（通过识别双端250bp测序数据中反向重叠区特征，对500bp以内的环形RNA进行全长重构）。由于上述方法主要基于短读长测序技术，难以对长度500bp以上的环形RNA的全长......阅读全文
常见机器学习算法优缺点比较（一）
机器学习算法太多了，分类、回归、聚类、推荐、图像识别领域等等，要想找到一个合适算法真的不容易，所以在实际应用中，我们一般都是采用启发式学习方式来实验。通常最开始我们都会选择大家普遍认同的算法，诸如SVM，GBDT，Adaboost，现在深度学习很火热，神经网络也是一个不错的选择。假如你在
国际团队提出一种新量子算法
一个国际研究小组近日在美国《科学进展》杂志上介绍，他们设计了一种新型量子算法，有望推动量子计算在物理、化学等多个领域的应用。 据介绍，在复杂量子系统中存在能量较小的基态，还有能量较高的激发态。过去的量子算法只能对基态问题进行有效且精确求解。针对这个问题，英国布里斯托尔大学、美国微软公司、中国中
常见机器学习算法优缺点比较（三）
优点：实现简单，计算简单； 缺点：不能拟合非线性数据. 4.最近领算法——KNN KNN即最近邻算法，其主要过程为： 计算训练样本和测试样本中每个样本点的距离（常见的距离度量有欧式距离，马氏距离等）； 对上面所有的距离值进行排序； 选前k个最小距离的样本； 根据这k个样本的标签进行
“金融计算法”准确算出HIV病毒变化过程
金融数学(股票价格预测)和粒子的液体扩散可以生成更好的HIV疫苗？根据爱荷华大学的微生物学家希勒尔哈伊姆的说法，我们可以使用概念预测HIV表面蛋白质的进化，得到的信息可以用来设计更加优良的HIV疫苗。 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)是全球艾滋病流行的原因，据世界卫生组织统计，自1970年末
未来密钥安全－ 后量子密码算法来保护
早在量子计算时代到来前，互联网就已经进入了后量子时代。许多人对未来量子计算机破解现代生活所依赖的密钥的能力感到担忧，因为这些密钥保护着从智能手机银行应用到在线支付的一切流程。 据《自然》报道，近日，美国国家标准与技术研究院（NIST）正式公布了其认可的能够抵抗量子计算机攻击的4项密码技术，即C
准确预测身高？这种机器学习算法能做到
美国密歇根州立大学的研究人员近日开发出一种先进的算法，能够根据个人基因组来预测他们的身高、骨密度，甚至是教育水平。这项成果于近日发表在《Genetics》杂志十月刊上。 这项研究的负责人、密歇根州立大学的Stephen Hsu博士表示这仅仅是开始。“尽管我们现在验证了这一工具的这三个结果，但我
各大微波仿真软件介绍及算法和原理
1．引言微波系统的设计越来越复杂，对电路的指标要求越来越高，电路的功能越来越多，电路的尺寸要求越做越小，而设计周期却越来越短。传统的设计方法已经不能满足系统设计的需要，使用微波EDA软件工具进行微波元器件与微波系统的设计已经成为微波电路设计的必然趋势。随着单片集成电路技术的不断发展，GaAs、硅为基
Talanta：高灵敏和防污染的“准共聚焦”微液滴数字PCR阅读仪
清华大学医学院生物医学工程系郭永实验室在《分析学家》（Analyst）在线以封底（back cover）发表题为《一种双荧光四分类微液滴数字PCR数据的准确、可靠和自动分类方法——密度分水岭算法》（A density-watershed algorithm (DWA) method for ro
Analyst：数字PCR数据的准确、可靠、非监督自动分类新方法
清华大学医学院生物医学工程系郭永实验室在《分析学家》（Analyst）在线以封底（back cover）发表题为《一种双荧光四分类微液滴数字PCR数据的准确、可靠和自动分类方法——密度分水岭算法》（A density-watershed algorithm (DWA) method for ro
PCR
实验概要protocal for PCR实验步骤PCR 1) Add the following to a microfuge tube: 10 ul reaction buffer 1 ul 15 uM forward primer 1 ul 15 uM
PCR
PCRPolymerase Chain Reaction1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul templ
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(2)
1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫（C. elegans）反义RNA （antisenseRNA ）的过程中发现的，由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年，Guo等发现注射正义RNA （senseRNA ）和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(1)
Rnai最近由于RNA 干扰（RNA interference，RNA i）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA 干扰是
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA)：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸），由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员，激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA
Science聚焦：球形RNA让RNA疗法重获新生
几十年来，RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过，随着新型RNA（球形核酸SNA）在人体试验中取得成功，这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。 RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上，研究人员
什么叫做外源性RNA和内源性RNA
核糖核酸（缩写为RNA，即RibonucleicAcid），存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种，即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶，其中，U（尿嘧啶）取代了DNA
什么是RNA？RNA的作用是什么？
核糖核酸（缩写为RNA，即Ribonucleic Acid），存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种，即A（腺嘌呤）、G（鸟嘌呤）、C（胞嘧啶）、U（尿嘧啶），其中，U（尿
纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA
实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织，直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织（0.05~0.3 g）在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿，混合均匀，冰浴 15 分钟
T细胞花环形成试验的注意事项有哪些
一、抽血前的注意事项 1、抽血前一天不吃过于油腻、高蛋白食物，避免大量饮酒。血液中的酒精成分会直接影响检验结果。 2、体检前一天的晚八时以后，应禁食，以免影响第二天空腹血糖等指标的检测。 3、抽血时 应放松心情，避免因恐惧造成血管的收缩、增加采血的困难； 有晕血史者请提前说明，另作特别安
T细胞花环形成试验的临床意义是什么
E花环值减低： ①见于免疫缺陷病（如Digeorge综合征，Wiskott－Aldrich综合征，Nezelof综合征）以及原发性细胞和体液免疫同时缺乏性疾病。上述这些病当用胸腺素等治疗后，EaRFC可明显增高。 ②某些恶性肿瘤、麻疹、麻疹脑炎、腮腺炎、带状疱疹、系统性红斑狼疮、皮肌炎、瘤型
T细胞花环形成试验的抽血后注意事项
1、抽血后,需在针孔处进行局部按压3-5分钟，进行止血。注意：不要揉，以免造成皮下血肿。 2、按压时间应充分。 各人的凝血时间有差异，有的人需要稍长的时间方可凝血。所以当皮肤表层看似未出血就马上停止压迫，可能会因未完全止血，而使血液渗至皮下造成青淤。因此按压时间长些，才能完全止血。如有出血倾向
免疫学实验鼠红细胞花环形成试验介绍
鼠红细胞花环形成试验介绍： B淋巴细胞与抗体合成有关，是体液免疫反应的效应细胞。B细胞表面带有膜表面免疫球蛋白(SmIg)、Fc受体及补体受体等。它可与抗原抗体复合物的Fc段牢固结合。选用鸡或羊红细胞，用相应的抗红细胞抗体致敏成EA复合物，B细胞的Fc受体能与EA结合形成花环，称EA花环。如果EA
临床化学检查方法介绍T细胞花环形成试验介绍
T细胞花环形成试验介绍： T细胞表面有绵羊红细胞（SRBC）的受体，可与SRBC形成花环样细胞，称为红细胞玫瑰花环形成或E玫瑰花环形成。T细胞花环形成试验正常值： EtRFC64.4±6.7％； EaRFC23.6±3.5％； EsRFC3.3±2.6％。T细胞花环形成试验临床意义： E花
环形电子对撞机100公里大环已成型
“环形正负电子对撞机（CEPC）的预研工作还有两三年就可以全部完成。目前，多数设备部件已研制成型，并达到设计指标要求，有一两项没有达到要求的，我们正在继续努力。”两会期间，全国人大代表、中国科学院院士、中科院高能物理所所长王贻芳在接受科技日报记者采访时表示。CEPC是2012年中国科学家提出的关于未
T细胞花环形成试验的抽血前注意事项
1、抽血前一天不吃过于油腻、高蛋白食物，避免大量饮酒。血液中的酒精成分会直接影响检验结果。 2、体检前一天的晚八时以后，应禁食，以免影响第二天空腹血糖等指标的检测。 3、抽血时 应放松心情，避免因恐惧造成血管的收缩、增加采血的困难； 有晕血史者请提前说明，另作特别安排
胶粘带环形初粘力的简单试验步骤解析
胶粘带环形初粘力，是以一定速度将环形胶粘带材料（胶面向外）与一定面积的标准试验板接触后的分离力。这是我国以及欧美国家广泛使用是初粘力评价指标之一。GB/T 31125-2014《胶粘带初粘性试验方法 环形法》标准中规定了测试法方法A-拉力试验机法，大致测试原理示意图如下： 胶粘带环形初粘力的简单试验
环形变压器的样品的性能测试及优点
样品的性能测试 为检验设计方法的准确性，对按设计参数制成的环形变压器样品进行了性能测试，结果如下。 1 空载特性测试 测量电路如图8所示。测得的数据列于表4，按照表4的数据，绘出图9所示的空载特性曲线。 从变压器的空载特性看出设计符合要求，在额定工作电压220V时(工作点为A)，变压器的空载
PCR技术－PCR技术的应用
一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。
实时荧光定量PCR（realtime－PCR）
实验方法原理 实时荧光定量PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 实验材料
PCR技术－PCR技术的应用
一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。