PNAS发布人类胎盘甲基化组

甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体组织中70%的基因组都被高度甲基化。 基因组并非孤军作战,还有许多其他因素影响着基因的启动和关闭,甲基化就是其中之一。这种表观遗传学修饰会通过给DNA添加甲基,来调节基因的表达。这种机制对于人类发育、癌症和环境的生物学影响,都具有深远的意义。 此前,科学家们只在细胞系中发现过PMD,让不少人怀疑它们是否真正存在于体内。而这项研究首次在正常人体组织中发现了PMD,证实它们存在于胎盘组织,是研究胎儿发育的重要窗口。这不仅能增进我们对表观遗传学的理解,还可以为癌症研究带来启示,并且帮助阐明环境因素对胎儿发育的影响。 “胎盘......阅读全文

甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性

  近日,一篇刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自澳大利亚悉尼加文医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱,其可以帮助

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的程序介绍

  1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能

看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

寿命能推算吗?加州大学科学家提出“预测方法”

  从古至今,从国内到国外,从炼丹术到现代科学,长生不老似乎一直是人类乐此不疲的追求。  但若要延缓衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大学洛杉矶分校(UCLA)生物统计学家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)发现了一种预测一个人生命周期的方法:基于300~500个DNA甲基化标记,

PNAS发布人类胎盘甲基化组

  甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体

PNAS发布人类胎盘甲基化组

  甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体

Nat-Med:恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破

  胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性,但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此,来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述,相关研究成果与近日

Nat-Med:恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破

  胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性,但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此,来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述,相关研究成果与近日

精准医疗:再吸金€6.7亿,4篇Nature奠定临床新技术

  近年来,随着基因组学技术在医疗领域的广泛应用,全球范围内对疾病的诊疗能力有了很大的提高,各国政府也纷纷制定了相关的医疗计划,并投入大量的资金。近日法国首次宣布启动《法国基因组医疗2025》计划,精准医疗再度吸来重金。疾病诊疗技术是精准医疗得以实现的关键,6月27日,Nature平台连发四篇文章证

Science:表观遗传学调控颠覆性别差异老观点

  英国生物信息学研究所EMBL-EBI和德国Max Planck免疫表观遗传学研究所MPI的研究人员发现了细胞同时调节多种不同基因活性的方式。这一研究成果发表在Science杂志上,揭示了性别差异背后的重要机制,颠覆了此前的普遍观点。   该研究分析了果蝇调控一系列重要基因的机制。雌性果蝇拥

用于治疗癌症的“自然杀伤”细胞的表观遗传学开关

自然杀伤细胞是免疫系统中的即时杀手,能够即时杀灭外来侵入物和癌细胞。尽管科学家就如何利用这些细胞的潜在能力所开展研究已经有三十多年,但对这些自然杀伤细胞是如何从非免疫细胞转化而来的这个问题几乎没有取得任何进展。目前,研究者发现了一种酶,能够利用一种外遗传途径(一种能够修改细胞中DNA的读取方式,而不

JCI:表观遗传学重编程诱导脐血干细胞扩增

  患有白血病、淋巴瘤和其他血液相关疾病的成年人,可能受益于常用于儿科患者的救生治疗方法。目前,西奈山伊坎医学院的研究人员研制出一种新技术,能使脐血(cord blood,CB)干细胞大量地产生,使其在成人移植中更加有用。相关研究结果发表在《The Journal of Clinical Inves

AKG调控肝脏糖代谢的表观遗传学机制获揭示

  近日,华南农业大学动物科学学院江青艳/束刚教授团队初步揭示了α-酮戊二酸调控动物肝脏糖代谢的分子机制。相关研究在线发表于《科学进展》(Science Advances)。  据悉,束刚教授和江青艳教授为该论文通讯作者,华南农业大学博士后袁业现、朱灿俊副教授和西北农林科技大学王永亮副教授为第一作者

2016上半年表观遗传学最受关注的成果

  即将进入2016年盛夏,今年也将过去一半,在这几个月里,表观遗传学研究取得了许多成果,让我们来一起回顾下:  Neil DNA glycosylases promote substrate turnover by Tdg during DNA demethylation  “表观遗传标记如何被从

张毅Cell子刊发表表观遗传学重要成果

  几年前汤姆森科技信息集团旗下《科学观察》(Science Watch)评出的高影响力论文数量最多的研究人员中,哈佛大学医学院的张毅(Yi Zhang)教授成为分子生物学和遗传学领域高影响力论文的数量最多的前十位顶级科学家之一。其大量文章被Nature、Science和Cell等世界顶级生物科

Nature子刊:表观遗传学修饰调控染色体数

  众所周知,染色体数的异常往往与癌症发展有关。日前瑞典卡罗琳斯卡医学院的科学家们发现,一个微小的表观遗传学改变,在染色体的正确分离中起到了至关重要的作用。这项研究于二月十六日提前发表在Nature Structural and Molecular Biology杂志的网站上。   在正常情况

清华团队Nature、Cell子刊连发多项表观遗传学成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,对于人类发育和人类疾病有深远的意义。组蛋白修饰是一种重要的表观遗传学修饰,包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、ADP-核糖基化等等。  组蛋白修饰可以调控许多关键的细胞过程。不过,人们一直不清楚组蛋白的这些标签是否能从哺乳动物生殖细胞传

徐国良院士Nature发表表观遗传学重要成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶(DNMT)介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰,在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此实现

清华、中大Cell子刊发表表观遗传学重要成果

  种系特异性基因(lineage-specific gene)的表观遗传学调控对于T细胞的分化和功能非常重要。DNA甲基化是一种常见的表观遗传学修饰,广泛参与了细胞对基因表达的控制。  近几年,科学家们的研究重心逐渐从4种基本碱基转移到其他经过修饰的碱基,从5-甲基胞嘧啶(5mC)、5-羟甲基胞嘧

《PLOS-Genetics》:表观遗传学可解释2型糖尿病

  2型糖尿病,原名叫成人发病型糖尿病,多在35~40岁之后发病,占糖尿病患者90%以上。2型糖尿病患者体内产生胰岛素的能力并非完全丧失,有的患者体内胰岛素甚至产生过多,但胰岛素的作用效果较差,因此患者体内的胰岛素是一种相对缺乏,可以通过某些口服药物刺激体内胰岛素的分泌。大约8%的美国人和全球超过3

甲基化试验有助于区分原发肿瘤类型

  未知性癌症(CUP)在转移性肿瘤患者中占比10%,然而这些癌症的原发肿瘤位置通常无法确定。由于无法分辨究竟是哪种肿瘤类型,这些患者的生存率很低。  “传统方法只能鉴定30%不明病灶的转移性肿瘤的原发肿瘤位置,一些分子生物学方法可以提高这一比例,但往往造价昂贵,并且,所使用的RNA样本比较脆弱容易

免疫系统和表观遗传学调控:一个新的前沿领域

   表观遗传学(epigenetics)研究转录前基因在染色质水平的结构修饰对基因功能的影响,这种修饰可通过细胞分裂和增值周期进行传递。表观遗传学已成为生命科学中普遍关注的前沿,在功能基因组时代尤其如此。免疫系统被认为是一个解析表观遗传学调控机制的良好模型,而且免疫细胞伯分化及功能表达和表观遗

NSMB:表观遗传修饰家族又添新成员

  最近,来自剑桥大学的研究人员发现了一种新的表观遗传学修饰,进一步壮大了表观遗传修饰的"队伍"。这项发表在国际学术期刊Nature Structural and Molecular Biology上的最新研究表明在人类,小鼠以及其他脊椎动物中存在的DNA修饰种类可能比我们想象的更多。  表观遗传学

南京农业大学国家重点实验室联合发表《Genome-Biology》

  中国南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室、美国德州大学和德州A&M大学的科学家们分析了驯养的异源四倍体棉花和其4倍体和2倍体亲缘植物的1200万个差异甲基化胞嘧啶的综合表观基因和功能。  生物通报道:中国约有2000年的棉花种植历史,是世界三大产棉国之一。长绒棉(纤维柔长)是纺高支纱的关

Cell子刊:DNA甲基化的不完全重置

  Babraham研究所的科学家们揭示了生殖细胞(卵子和精子)发育时DNA重置的机制。众所周知,表观遗传学修饰是指不改变DNA序列的DNA修饰,DNA上添加这样的小基团会改变基因的活性。在人们的一生中(包括在子宫内的发育),表观遗传学修饰都在不断积累和变化,环境也能够对表观遗传学修饰发生影响。

清华大学Cell子刊发表表观遗传学新成果

  组蛋白修饰和DNA甲基化是重要的表观遗传学修饰,决定着基因组的表观遗传学景观。组蛋白修饰和DNA甲基化能共同起作用调控基因的表达,但人们并不清楚它们在作用机制和功能上的具体关联。  清华大学和洛克菲勒大学的研究团队发现,改变DNA甲基转移酶的组蛋白识别区域会影响表观遗传学景观和小鼠的胚胎干细胞。

Nature遗传学综述:何川教授详解RNA甲基化

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现, mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。   RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,它

GenomeResearch:双生子表观基因组研究

  基因决定了人生命中的方方面面,不过环境也能对基因产生强烈的影响,这种影响在人出生前就已产生,而且其造成的影响将会伴随人的一生。日前,研究人员首次展示了子宫内环境对新生儿表观遗传学图谱的影响,即我们出生时就带有的DNA化学修饰,这项研究将为人们提供宝贵的疾病风险信息。文章发表在7月16日的Geno

PLoS-Medicine:子宫内膜癌最新研究进展

  来自英国伦敦大学学院妇女癌症部的研究人员在11月12日的PLOS Medicine杂志上发表了一项最新研究:发现HAND2基因是子宫内膜癌中的一种差异甲基化热点,这个基因的表观遗传学修饰在子宫内膜癌的发展中起着关键的作用。   作为一种能够引起全球13%死亡人数的疾病,癌症能够在人体的任何

生活环境和生活方式会影响你的表观基因组

  法国巴斯德研究所和CNRS领导的一项基因组研究,首次证实生活环境和生活方式能够影响我们的表观基因组。表观基因组控制着我们基因的表达,但不影响基因的序列。  研究人员发现,从森林迁移到城市对人类免疫应答的表观遗传学模式有深远的影响。而生活方式(定居耕种或游牧狩猎)主要影响较为持久的机能,比如发育相