PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体组织中70%的基因组都被高度甲基化。 基因组并非孤军作战,还有许多其他因素影响着基因的启动和关闭,甲基化就是其中之一。这种表观遗传学修饰会通过给DNA添加甲基,来调节基因的表达。这种机制对于人类发育、癌症和环境的生物学影响,都具有深远的意义。 此前,科学家们只在细胞系中发现过PMD,让不少人怀疑它们是否真正存在于体内。而这项研究首次在正常人体组织中发现了PMD,证实它们存在于胎盘组织,是研究胎儿发育的重要窗口。这不仅能增进我们对表观遗传学的理解,还可以为癌症研究带来启示,并且帮助阐明环境因素对胎儿发育的影响。 “胎盘......阅读全文
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(二)
3、数据分析标准分析:(1)DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的介绍
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(一)
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-
Nature-Methods发表单细胞重亚硫酸盐测序技术
Babraham研究所和Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们开发了一个单细胞表观遗传学检测技术,并将其发表在七月二十日的Nature Methods杂志上。这一成果可以帮助人们解读,环境怎样影响人类的发育和遗传性状。 “表观遗传学标志”是指DNA上的化学或蛋白标签,它们在
程晓东《自然》文章揭示表观遗传学研究的新线索
来自美国Emory大学华裔教授程晓东(Xiaodong Cheng)领导的研究组发现了小鼠基因组中DNA序列的一种特殊模式,该模式在DNA分子调节基因表达的方式中起到基础性作用。该研究组与来自德国Jacobs大学的同事在8月22日的的《自然》杂志网络版上公布了这些发现。 自从科学家破解了构成人类
Nature子刊:表观遗传学研究的强大工具
西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)的科学家们开发了一个新技术,可以更精确地揭示细菌群体的表观遗传学异质性。这项研究发表在六月十五日的Nature Communications杂志上,为人们提供了表观遗传学研究的新工具,有助于解决愈演
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔5月9日电(记者潘革平)比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DN
何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及
表观遗传学研究揭示植物器官大小的奥秘
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517290.shtm
Nature子刊:发现全新表观遗传学基因调节机制
一个由KAUST领导的国际团队在研究成年人基因组及其所处环境相互作用的过程中发现了一种调节基因活性的表观遗传学机制。 来自KAUST的Valerio Orlando实验室一直在研究Ezh1的作用,该基因在成熟组织中的功能研究在近25年来毫无进展。和它的姊妹基因Ezh2一样,Ezh1及其伴侣蛋白
简述单倍体胚胎干细胞的表观遗传学特性
单倍体胚胎干细胞的表观遗传学特性—在Gu等对于Tet3 DNA加双氧酶在卵母细胞表观遗传重编程的作用的研究中,发现了一些单倍体细胞的表观遗传学特性。即在5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethyl -cytosine, 5 hmC)信号能使DNA特定区段发生甲基化。这在“激活”进入去核卵子的
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
Nature重要论文:表观遗传学突破性研究发现
研究组蛋白尾部的翻译后修饰是表观遗传学领域最大研究方向之一。增进对于这些修饰添加、识别和移除机制的认识是了解基于表观遗传的人类疾病基本机制,发现这些疾病新疗法的必要条件。标记负责染色质修饰的酶和蛋白质活性的一种方法就是采用它们的化学活性抑制剂。尽管这种方法在揭示组蛋白修饰调控机制方面具
表观遗传学研究揭示植物器官大小的奥秘
近日,中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组团队与作物科学研究所合作,发现了调控植物器官大小的表观遗传新机制。相关研究成果发表在《植物通讯》(Plant Communications)上。 器官大小尤其是种子大小是植物重要的农艺性状,也是影响农作物产量的主要因素之一。植物器官大小受到遗传、
中科院参与发表Nature表观遗传学新成果
在动植物的发育过程中,配子和胚胎会发生表观遗传学状态的重编程,这是正确发育必不可少的一步。 植物的生殖细胞来自于花的体细胞组织,需要消除植物发育或应答外界刺激时积累的染色质修饰。如果这一过程不能有效进行,那么上一代的表观遗传学状态就会错误的遗传下去。不过在绝大多数情况下,上述表观遗传学修饰都能
Nature特别关注:争议中前行的表观遗传学
人们居住的地区和他们的价值观,都会对后代产生影响。那么抽烟、经历饥荒或者在战争中服役,这些经历是否会给后代留下独特的印记呢? Emory大学的Brian Dias在小鼠中对这类问题进行了研究。他发现,与特殊气味关联的恐惧可以影响小鼠后代的大脑。他将雄性小鼠暴露在苯乙酮中,同时给予一定的
清华Nature子刊发表表观遗传学新成果
生物通报道:高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。 最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu
任兵教授Nature发表表观遗传学新成果
母型-合子型转变(MZT)对于新个体形成是必不可少的。虽然早期胚胎发育的基因表达和DNA甲基化分析已经取得了不少进展,但人们对MZT过程依然知之甚少。奥斯陆大学和加州大学的研究团队最近在Nature杂志上发表文章,揭示了组蛋白H3K4me3对小鼠卵母细胞MZT的调节作用。文章通讯作者是加州大学的
Nature子刊发布大脑表观遗传学重要图谱
表观遗传修饰的重要性越来越被人们所认识,但在人类大脑中的作用并不是很清楚,实际上在胚胎和成人大脑中,神经干细胞增殖并通过一些受到高度调控的过程生成神经元和神经胶质,包括DNA和组蛋白修饰以及非编码RNAs调控在内的表观遗传学机制在神经发生的不同阶段发挥至关重要的作用。另一方面异常的表观遗传调控也
全国首个医学表观遗传学协同创新中心成立
6月17日,由天津医科大学联合南开大学、瑞典卡罗林斯卡分子医学中心组建的天津医学表观遗传学协同创新中心揭牌成立。这是全国首个医学表观遗传学协同创新中心。 据介绍,表观遗传是生物学和基础医学研究的重要领域之一,被定义为“在基因组序列不变的情况下,可以决定基因表达与否并可稳定遗
靶向表观遗传学调控,或成癌症治疗新热点
一队由约翰霍普金斯大学、哈佛医学院、帕维亚大学和波士顿大学医学院的研究人员组成的团队采用一种新开发的化合物,靶向特定表观遗传修饰蛋白后,成功地抑制了黑色素瘤细胞的生长。 最近他们在《Nature Communications》发表题为“Targeting the CoREST Complex
骨髓增生异常综合征表观遗传学修饰治疗
5-阿扎胞苷(Azacitidine,AZA)和5-阿扎-2-脱氧胞苷(Decitabine,地西他滨)可降低细胞内DNA总体甲基化程度,并引发基因表达改变。两种药物低剂量时有去甲基化作用,高剂量时有细胞毒作用。阿扎胞苷和地西他滨在MDS治疗中的具体剂量方案仍在优化中。高危MDS患者,是应用去甲
两篇Nature论文挑战流行表观遗传学观点
Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究团队,确定了沿着基因组设置表观遗传学标记的决定因素。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的新研究表明,基因活性和DNA序列在对表观遗传标记的调控中发挥了比以往认为更大的作用。这对流行的观点:外
DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰
DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一,是正常发育、分化所必需的,具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)
中科院Cell发表表观遗传突破性发现
来自中科院北京基因研究所的研究人员在斑马鱼实验中证实,早期胚胎过程中维持了精子而非卵母细胞的DNA甲基化组(Methylome)。这一突破性的研究发现以封面文章形式发表在5月9日的《细胞》(Cell)杂志上。 来自中科院北京基因研究所的刘江(Jiang Liu)博士和慈维敏(Weimin
Nature子刊:基于纳米孔的新甲基化检测技术
Mayo诊所与Illinois大学的研究人员合作,开发出了一种检测甲基化DNA的新单分子检测技术,这种技术以固态的纳米孔为基础。文章发表在Nature旗下的Scientific Reports杂志上。 表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。甲基化是表观遗传学修饰的一
续写十大科学突破-Science公布重要甲基化图谱
来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项最新研究中,重构了尼安德特人与丹尼索瓦人的DNA甲基化图谱,并将其进行了比对,这对于深入探索表观遗传学调控机制,以及表观遗传差异造成的形态学差异具有重要意义。 2010年,2012年Science十大科学突破接连聚焦于古人类的DNA基因组序列测定结果,
棉花“甲基化基因图谱”首次绘成
30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。 几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基