Nature:利用几何指纹解开蛋白表面相互作用之谜

在一项新的研究中,来自瑞士生物信息学研究所的研究人员使用一种生成蛋白表面“指纹”的几何深度学习工具来描述对蛋白-蛋白相互作用至关重要的几何和化学特征。他们指出,他们假设的“指纹”导致了分子识别和新蛋白相互作用的重要方面的新见解。相关研究结果发表在2023年5月4日的Nature期刊上,论文标题为“De novo design of protein interactions with learned surface fingerprints”。蛋白是生物学的物理机器,是使有机生命发挥作用的齿轮、弹簧和阀门。它们让细胞正常运转,药物与生物系统相互作用,以及大多数疾病与生物系统的相互作用。凭借对蛋白的高超掌握,科学可能能够治愈大多数疾病。在过去的十年里,机器学习与蛋白质组学、基因组测序和分子生物学一起,极大地加速了蛋白研究,使得我们可以预测几乎所有现有的功能结构,设计任何构型的新结构,并合成制造任何可以想象的蛋白。就蛋白质组学在过去十......阅读全文

乳制品指纹图谱技术介绍

乳制品指纹图谱技术应用情况对于食品行业来说,什么问题都不如安全来得重要。而如果想要知道食用的东西是否安全,产品的来源追溯就显得特别关键。一种可以追溯奶源的新技术——牛奶指纹图谱识别受到了广泛的关注。牛奶指纹图谱识别技术通过光谱分析和精密计算快速准确获取牛奶成分的异常信息,并通过先进的质谱分析准确获取

指纹识别技术也不安全:德国防部长指纹轻易被伪造

  据德国之声(Deutsche Welle)网站报道,在德国汉堡举行的第31届混沌电脑俱乐部(Chaos Computer Club)年度大会上,大会演讲者扬·克里斯勒(Jan Krissler)演示了如何只利用几张照片就能伪造指纹的过程。他警告称,世界对于某些安全技术的依赖存在危险性。  克里斯

-DNA甲基化:癌症共有的“指纹”

  8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中,研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化,DNA甲基化标记,它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。  约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinber

检测癌症分子“指纹”可改进早期诊断

《分子细胞》杂志11日发布了一项研究,指出不同类型的癌症拥有独特的分子“指纹”,这些特征可以在疾病早期被检测到。这项由巴塞罗那基因组调控中心进行的研究发现,利用小型便携式扫描仪只需几个小时,就能以极高的精度获取这些“指纹”,为开发新的非侵入性诊断测试铺平了道路。这种测试能够比现有方法更快、更早地识别

牧草DNA指纹图谱应用前景看好

  牧草品种的真假和种子质量的优劣直接关系到草业生产安全、农民增收和农(牧)区社会稳定。随着农牧业生产对优良牧草品种需求的提高,每年进入市场的育成牧草新品种数量也在快速增加,各种优良牧草品种越来越受到青睐,种植面积越来越大。而一些不法商家在利益驱动下,在种子生产经营过程中以假乱真、以次充好,坑农害农

什么是基因组指纹图?

中文名称基因组指纹图英文名称genome fingerprinting map定  义用短串联重复序列探针与经限制性内切酶完全酶切的基因组DNA杂交,电泳后显现的杂交条带图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

微生物鉴定方法代谢指纹法

目前常见的微生物鉴定原理有以下几种:1. 酸碱反应:细菌代谢碳水化合物,一般产生酸性物质;分解蛋白质或氨基酸,则产生碱性物质,根据不同细菌的理化性质不同,测定细菌的分解底物导致PH值变化而产生的不同颜色,来判断菌种。2. 酶谱分析:根据细菌生长产生酶的特性,在测定底物中加入基质。使其与细菌生长过程中

新技术识别大脑“指纹”只需100秒

  瑞士洛桑联邦理工学院研究团队发现,我们每个人都有一个独一无二的大脑“指纹”,而且该指纹会随着时间推移而不断变化。他们的新技术只需1分40秒就可识别大脑“指纹”。相关论文发表在最近的《科学进展》杂志上。  洛桑联邦理工学院医学图像处理实验室和神经假体中心研究人员通过核磁共振成像技术检查了受试者大脑

微生物“指纹”:城市的新坐标

美国纽约的“能抗辐射”、南非开普敦的“有海洋咸味”……你知道吗,每个城市都有自己独特的微生物“指纹”。 一个国际联盟从全球60个城市的公共交通系统和医院收集了样本,并进行测序和分析,同时对所有已确定的微生物物种进行了全面注释,包括之前未记录的数千种病毒、细菌以及两种古细菌。5月27日,相关论文刊

DNA指纹的生物学上的应用

  DNA指纹技术能够从DNA分子水平给每个玉米品种一个“身份证号码”,以其准确可靠、简单快速、易于自动化的优点越来越多的应用于品种管理。  玉米DNA指纹,是从DNA分子水平给予每个玉米品种一个能够准确表明其身份的代码,就像每个人都有一张身份证,DNA指纹就是玉米的“分子身份证”。   玉米的‘分

微生物鉴定方法——代谢指纹法

目前常见的微生物鉴定原理有以下几种:1. 酸碱反应:细菌代谢碳水化合物,一般产生酸性物质;分解蛋白质或氨基酸,则产生碱性物质,根据不同细菌的理化性质不同,测定细菌的分解底物导致PH值变化而产生的不同颜色,来判断菌种。2. 酶谱分析:根据细菌生长产生酶的特性,在测定底物中加入基质。使其与细菌生长过程中

快速指纹鉴定食品中的香精成分

  目的   使用一种无需进行样本萃取、过滤、稀释和色谱分离的简单而快速的技术对食品中的香精成分进行成功鉴定。   背景   对包括嗅觉、味觉和口感在内的各种感官有吸引作用的香精是促成食品成功销售的最重要因素之一。每个食品制造商都创造并保持自己的风味特征,从而与竞争者的产品区别开来。不同食品中

DNA指纹图谱分析[DNA-Fingerprinting-]

一. 实验目的1. 掌握DNA指纹图谱技术的概念、原理和基本操作过程2. 学习DNA的限制性酶切的基本技术3. 掌握琼脂糖凝胶电泳的基本操作技术,学习利用琼脂糖凝胶电泳测定DNA片段的长度,并能对实验结果进行分析。二. 实验原理1984年英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的

基因指纹的运用发展和普及

基因指纹用于现代侦破技术。虽然历史还很短,但已经收到了特别的重视。用它来寻找和捉拿罪犯的效果绝对不容小窥。如今,基因指纹已成为了警方破案和捉拿罪犯的一员不可缺少的大将。

巧用“基因检测”破解网站“指纹”识别难题

  “基因检测”算法可以运用于网站“指纹”的精准识别?这看似跨度很大的想法却在电子科技大学计算机科学与工程学院2013级直博生卓中流的努力下变为了现实。  由于受到生物医学领域的基因序列检测算法的启发,卓中流提出了一种高效的网站指纹检测算法,弥补了传统模型无法对多级页面跳转进行建模的缺陷,同时提高了

“好奇”号首次成功鉴定火星“矿物指纹”

  美国航天局(NASA)宣布,火星漫游车“好奇”号已经完成了对火星土壤矿物学的初期实验。结果显示,火星土壤和美国夏威夷火山源周围的风化玄武岩土壤相似。   “好奇”号于美国东部时间8月6日在火星盖尔陨石坑中心山脉的山脚下成功着陆,不久前才取得了火星土壤样本,本次是首次对该样本进行矿物学鉴定。印第

微生物鉴定方法代谢指纹法

目前常见的微生物鉴定原理有以下几种:1. 酸碱反应:细菌代谢碳水化合物,一般产生酸性物质;分解蛋白质或氨基酸,则产生碱性物质,根据不同细菌的理化性质不同,测定细菌的分解底物导致PH值变化而产生的不同颜色,来判断菌种。2. 酶谱分析:根据细菌生长产生酶的特性,在测定底物中加入基质。使其与细菌生长过程中

DNA-指纹的图谱相关内容

  取决于所用探针的核心序列(即重复序列中的重复单位)。目前所用的探针有两种,即探针33.15 。其核心序列为AGAGGTGGGCAGGTGG, 和33.6 ,即AGGGCTGGAGG 。这就是说这两种序列在人体基因组中不同的位置上分别重复不同的次数,而在不同个体的基因组中,对应位置上这两种核心序列

基于X射线荧光的指纹元素成像

中国科学院高能物理研究所王萌研究员  中国科学院高能物理研究所王萌研究员发表主题为“基于X射线荧光的指纹元素成像”的精彩报告。指纹中化学元素可为科学研究和应用提供丰富信息。应用同步辐射X射线荧光仪可分析指纹元素,生成元素成像图。课题组分析了在不同基底上的防晒霜指纹,得到了钛和锌的指纹成像图以及元素比

DNA指纹图谱分析(图)(二)

DNA指纹图谱法的基本操作:从生物样品中提取DNA(DNA一般都有部分的降解),可运用PCR技术扩增出高可变位点(如VNTR系统,串联重复的小卫星DNA等)或者完整的基因组DNA,然后将扩增出的DNA酶切成DNA片断,经琼脂糖凝胶电泳,按分子量大小分离后,转移至尼龙滤膜上,然后将已标记的小卫星DNA

Nature新文章:鉴别疾病“指纹”的新技术

  来自凯斯西储大学和凯斯西储大学医院医学中心的研究人员在《自然》(Nature)杂志上报告称,他们开发了一种磁共振成像(MRI)新方法,可以早期常规筛查某些特异的癌症、多发性硬化症、心脏病及其他疾病。   科学家们说,每个身体组织和疾病都具有一种独特的指纹,可用于快速诊断问题。利用新的MRI技术

高变区DNA与DNA指纹的关系

人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段(10bp 左右)多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后,用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ,然后将样品进行

细胞系的多位点DNA指纹检测

细胞系 Southern 印迹 DNA 的制备 经标记的 M13 噬菌体 DNA 的制备 杂交             实验方法原理 细胞中提取的 DN

DNA指纹在生物学领域的应用

DNA指纹技术能够从DNA分子水平给每个玉米品种一个“身份证号码”,以其准确可靠、简单快速、易于自动化的优点越来越多的应用于品种管理。玉米DNA指纹,是从DNA分子水平给予每个玉米品种一个能够准确表明其身份的代码,就像每个人都有一张身份证,DNA指纹就是玉米的“分子身份证”。玉米的‘分子身份证’则是

视网膜血管“指纹”可预测中风风险

1月16日一项在线发表于最新一期《心脏》杂志的研究发现,眼部后方的感光组织层——视网膜上的血管“指纹”可以预测中风风险,准确度与传统风险因素(如高血压、高胆固醇等)相当。视网膜复杂的血管网络与大脑血管系统具有共同的解剖和生理特征,因此是评估全身性疾病(如糖尿病)所致损伤的理想对象。此次,包括澳大利亚

合成指纹让塑料颗粒成为安全密钥

  被挤到细小塑料颗粒表面的微观皱纹能够被用于制造难以复制的安全密钥。  美国宾夕法尼亚州圣文森特学院的Derek Breid说,这些随机形成的皱纹很像人类的指纹。由于每组皱纹都完全是独一无二的,这些粒子可被用于替代安全卡或是指纹来识别个人身份。它们还被用于珍贵的艺术品,这样以来人们将能确保交易的是

复旦半年内有望找到曹操遗传“指纹”

  因目前对国内曹姓男性志愿者报名参与Y染色体检测情况进展顺利,一开始就对“用DNA测试方式辨别真假曹操”信心满满的复旦大学现代人类学实验室的人士昨天(2月23日)表示,这项研究最快半年内就可完成。     网上报名者已达到数百人   复旦大学现代人类学实验室博士生导师、现代人类学国家重点实验

创建“液体指纹库”将味觉“注入”智能设备

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506537.shtm智能传感设备已在诸多领域得到应用,但让智能传感设备模拟人类味觉器官感受物质的能力仍面临挑战。为解决这一问题,中国科学院北京纳米能源与系统研究所王中林院士和吴治峄研究员团队从人类舌头感知

关于肽指纹图谱测定的相关介绍

  质谱技术作为蛋白质组研究的三大支撑技术之一,除了用于多肽,蛋白质的分子量测定外,还广泛的应用与肽指纹图谱测定及氨基酸序列测定。  肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting PMF)测定是对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库

指纹、虹膜、人脸?哪种生物识别最靠谱

         随着生物识别技术的快速发展,用户经常会产生一个疑问:生物识别技术这么多类别,选择哪种才是最合适的?人脸识别、虹膜识别和指纹识别,哪种技术更好?  指纹识别价格相对便宜,功能性较强,也是非常可靠的一种验证方式。但是,如果你需要更高级的安全选项,指纹仪+智能卡或者指纹仪+密码