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肿瘤细胞葡萄糖感知与代谢调控通路研究领域取得新进展

南方科技大学饶枫团队与天津医科大学赵丽团队、北京生命科学研究所王凤超团队合作在肿瘤细胞葡萄糖感知与代谢调控通路研究领域取得新进展,研究成果以“葡萄糖诱导CRL4COP1-p53信号轴促进糖代谢以驱动肿瘤发生(Glucose-induced CRL4COP1-p53 axis amplifies glycometabolism to drive tumorigenesis)”为题,于2023年6月29日在线发表于《分子细胞》(Molecular Cell)杂志。论文链接为https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(23)00432-X。 瓦博格效应(Warburg effect)是肿瘤细胞的特征性代谢方式。肿瘤细胞通过大量吸收葡萄糖进行糖酵解为增殖供能,同时为骤增的生物大分子合成提供中间产物。然而,瓦博格效应如何在各种异质性肿瘤细胞中广泛发生尚不清楚。p53......阅读全文

信使RNA转录的调控

  一、遗传信息的表达有时序调控和适应调控,转录水平的调控是关键环节,因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。  二、操纵子是细菌基因表达和调控的单位,有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于负调控。环腺苷酸通过其受体蛋白(CRP)促进转录,可促进许多诱导酶的合成。操纵子可构成综合性

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

RNA复制、转录与逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

eRNA与Super Enhancer RNA在转录调控中扮演的角色

增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件,能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录,产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具

“泛转录组”首次用于RNA测序分析

近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。 分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物不

“泛转录组”首次用于RNA测序分析

  近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。  分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物

RNA测序解析白血病转录组

  巴塞罗那基因组调控中心Dr. Roderic Guigó领导研究团队,对慢性淋巴细胞白血病进行了转录组分析,获得了CLL相关基因和突变的功能图谱。这项工作发表在Genome Research杂志上。   这一项目是西班牙慢性淋巴细胞白血病基因组联盟的最新成果,该联盟曾鉴定了涉及CLL发展的

“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项

  教育部、中科院:   为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》的部署,经研究,决定批准国家重大科学研究计划“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项。   根据国家科技计划管理的统一安排,这批项目将于2013年7月启动实施。请有关单位按照国家重点基础研

曹雪涛Nature子刊再发文 揭示m6A修饰促进树突状细胞活化

  近日,曹雪涛院士在Nature子刊再发文章,首次揭示了m6A修饰通过改变mRNA翻译水平调节DC的功能活化,对于深入理解RNA表观修饰调控免疫基因表达的机制,进一步阐明m6A修饰在免疫应答及炎症反应中的功能具有重要意义。  免疫应答的表观调控机制是近年来免疫学研究的前沿热点。RNA的N6-甲基腺

中国科大揭示光感知调控血糖代谢的神经机制

  对栖息于这颗蓝色星球上的生命而言,光是一切生命产生的源动力,也是生命体最重要的感知觉输入之一。同时生命体根据外界环境条件控制体内营养物质的代谢平衡是生存的必须,而代谢紊乱会产生严重疾病,哺乳动物已经进化出了精确和复杂的调控网络用于持续动态调控血糖代谢。大量公共卫生调查显示夜间过多光源暴露显著增加

四川大学最新综述:非编码RNA与代谢的研究进展

  生物通报道:非编码RNA是指不编码蛋白质的调节性RNA分子. 近年来的研究发现,非编码RNA,尤其是微小RNA和长非编码RNA,可以在基因转录、 RNA成熟和蛋白质翻译等水平调控基因表达,参与发育、分化和新陈代谢等几乎所有重要的生理生命过程,在人类疾病中发挥重要作用.肿瘤和糖尿病等代谢性疾病是人

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A

  说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A

说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

代谢组学 | 肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

单个循环肿瘤细胞RNA测序结果

  由麻省总医院,哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因,研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序,其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。  这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。  Androgendeprivationthe

分子细胞卓越中心发表关于环形RNA的综述文章

  5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队在Cell上,在线发表了题为Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RN

什么是翻译调控?

在mRNA翻译成蛋白质的水平上进行控制,包括控制蛋白质合成的速度、mRNA稳定性的控制、翻译起始的控制等。

首席科学家赵世民谈代谢物的生物调控功能

  编者按:生命的调控是在不同水平上进行的,包括基因水平、转录水平、蛋白质水平和代谢水平,这也是多组学研究的意义所在。为;此,围绕代谢与疾病,蛋白质翻译后修饰与蛋白组学等研究工作,生物谷专访了复旦大学生命科学院教授,国家蛋白质重大研究计划首席科学家赵世民。  生物谷:非常感谢您能参加生物谷在4月份主

科学家揭示生物钟调控代谢新方式

  近日,南京农业大学动物科技学院教授王恬团队与芝加哥大学合作在《细胞—报告》上在线发表研究论文,揭示了生物钟调控代谢的新方式,拓展了人们对生物钟、m6ARNA甲基化修饰和代谢相互关系的认识。  N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物RNA上最丰富的一种转录后修饰,在基因表达、RNA剪切、mRNA运输

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰

m6A RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用

  最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况,发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇,已经追平2019年整年度发表篇数,可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。   图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况( data from PubMe

长链非编码RNA调控肿瘤生长

  人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA),但是至今为止,人们只知道几十种lncRNA分子的功能。   加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明,两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因

胆汁酸与葡萄糖代谢

胆汁酸与葡萄糖代谢胆汁酸通过不同机制调节葡萄糖代谢。研究显示,2型糖尿病患者餐后血浆胆汁酸水平较血糖正常者明显升高。胰岛素能抑制胆汁酸合成的限速酶7α羟化酶,从而减少胆汁酸的合成.;而葡萄糖能刺激7α羟化酶,从而增加胆汁酸的合成。研究发现,牛磺酸结合的熊脱氧胆酸能够改善肥胖者胰岛素的敏感性,而胆汁酸

翻译水平上的调控

蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面:① 蛋白质合成起始速率的调控;② MRNA的识别;③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA,这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。真核生物mRNA的“扫描模式

真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录的区别

  真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程在总体上基本相同,但是,其过程要复杂得多,主要有以下几点不同:  1、真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是

体外转录测序揭示RNA-seq的终极误差

  高通量RNA测序(RNA-seq)是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq,我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析,而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本(编码RNA和非编码RNA)。  与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反,RNA-

RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?

  近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在

体外转录测序揭示RNA-seq的终极误差

  高通量RNA测序(RNA-seq)是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq,我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析,而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本(编码RNA和非编码RNA)。  与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反,RNA-

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思