科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域，即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域。这四个结构域在Ago蛋白系统发挥功能的过程中发挥重要的功能，缺一不可。原核短Ago不具备N端和PAZ结构域（图1a），因此原核短Ago在发挥功能时必须招募一些其他蛋白如SIR2和TIR蛋白，补偿N端和PAZ结构域的功能。与真核生物相比，原核生物的Ago不仅可以介导由DNA引导的靶向DNA干扰，而且可以介导由RNA引导的靶向RNA或者DNA干扰。因此，原核生物的Ago展示出更多的功能，如靶向干扰噬菌体入侵和外源质粒DNA扩增、阻碍外源基......阅读全文
首次！黄超兰：单碱基分辨率和单细胞层面的精准鉴定
2021年6月10日，北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队，与中国科学院生物物理研究所薛愿超团队、广东省第二人民医院孙青原团队，合作在Nature Cell Biology上发表了题为“Global profiling of RNA-binding protein targetsite
多年磨一剑！韩春雨团队等温PCR平台新突破
Argonaute促进的靶向是一种酶介导的、高保真的、高效的碱基配对过程，可以重新用于升级PCR技术。来自嗜热Caloramator sp.（CalAgo）的Argonaute蛋白在65°C的Tte-UvrD解旋酶存在下切割靶dsDNA，表明dmCalAgo（一种核酸酶失活突变体）在相同条件下与
病毒入侵时，生命体如何自我保护？
在生命体内存在在这样的一种英雄主义：细菌在杀死入侵病毒的那一刻“壮烈牺牲”，与其“同归于尽”，以完成保护生命体的重任。早在20世纪50年代，科学家们就通过间接的手段检测到了一种同归于尽的自我保护行为，但受限于当时的软硬件水平，这一过程的实现机制，一直是困扰科学家们的谜题。10月2日，《自然》杂志刊发
原核短Ago系统在病毒入侵后所发生变化获揭示
核糖核酸诱导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到至关重要的作用。自然界中的生命体无时无刻都需要应对各种外部入侵，如细菌、病毒等。为了应对这些入侵，生命体的细胞会产生一种叫做核糖核酸的分子。这些核糖核酸分子可以通过一种叫做转录后基因调控的过程，对我们的基因进行调控。 我们都知道基因
Nature重要论文：抗癌miRNA的抑制因子
近日来自德克萨斯大学MD安德森癌症和肿瘤中心的研究人员发现，癌症促生长因子受体EGFR即便是在被拖入到细胞内快要遭到破坏的情况下，在溶解之前它也能得到激活，转而阻止肿瘤抑制microRNAs (miRNAs)生成。这一重要的研究发现发布在著名期刊《自然》(Nature)杂志上。 肿瘤常
浙大：RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA
MicroRNAs（miRNAs）结合Ago形成RNA诱导沉默复合体，通过沉默靶mRNA调控基因表达。miRNA的RNA编辑可能影响miRNA的加工，Ago复合物的组装，以及靶mRNA的结合。然而，组装进Ago复合物的被编辑的miRNA的功能，还没有被深入研究过。 浙江大学生命科学学院章晓波教
研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程
中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上，发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现，HYL1蛋白除了介导m
科学家在miRNA调控水稻条纹叶枯病研究中取得进展
miRNA在植物与病原微生物之间的相互作用过程中发挥着重要的调节作用。通常成熟的miRNA会进入AGO蛋白组成的剪切复合体（RISC），通过指导靶mRNA的剪切或抑制蛋白质翻译而负调控基因表达。之前的研究表明水稻AGO18蛋白能够结合特异性结合miRNA成员，参与到水稻条纹叶枯病毒（RSV）的抗
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学
Nature：缺氧环境下EGFR阻止抗癌miRNA成熟的机制
近来，研究人员在Nature杂志上在线公布一项研究成果称：即使被破坏，一种促进癌症生长因子受体在它溶解之前仍能发送信号阻挠具有肿瘤抑制功能的microRNA发展。 德克萨斯大学MD Anderson癌症中心的科学家领导的一个国际研究小组发现在肿瘤氧饥饿条件下，表皮生长因子受体(EGFR
分子细胞中心等研发出系统性鉴定siRNA脱靶位点新方法
12月4日，Molecular Therapy–Nucleic Acids在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）吴立刚研究组，上海市计划生育科学研究所李卫华研究组与扬州大学赵雅研究组合作的研究成果Identifying Cleaved and Noncleav
－Gene－Dev：研究果蝇提示衰老相关疾病的发病机制
阿尔茨海默氏病和亨廷顿病通常都与老化相关，但她们之间的生物联系一直不甚明了。现在，Rutgers大学研究人员通过学习常见果蝇中小RNA分子，寻求解答上述问题。 Ammar Naqvi博士表示：利用果蝇，我们能够检测特定microRNA模式，当microRNA绑定到特定蛋白质时，会有助于
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点，大部分的研究人员在立项之初，通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析，获得了合适的研究对象，但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因：1. 找错了转录本；2. ncRN
北大，中科院最新Nature子刊揭示miRNA的新调控作用
生物通报道：中科院遗传与发育生物学研究所，北京大学生科院的研究人员发现了一个单子叶植物所特有的、受RSV侵染抑制的水稻负调控抗病因子miR528，这项研究揭示了miR528及其调控的靶基因在水稻与病毒相互作用过程中的抗病机制。 这一研究成果公布在Nature Plants杂志上，文章的通讯作者
在生物学中RITS和RISC的含义
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。RNA-induced
PNAS：植物病原真菌抑制宿主小RNA跨界干扰增强毒力机制
通过生物活性分子相互作用的生物之间的交流在自然界中很普遍，并且在各种生物过程中发挥着关键作用。小 RNA (sRNA) 可以在宿主植物和丝状病原体之间传播，以触发受体细胞中的跨界 RNA 干扰 (RNAi) 并调节植物防御和病原体毒力。然而，很少有关于真菌病原体如何对抗跨界抗真菌 RNAi 的报
－Genes－－Devel：科学家揭示老化和神经变性之间的内在关联
阿尔兹海默氏症和亨廷顿氏症等疾病经常和老化相关，但是其两者之间的关系却一直并不清楚，近日，来自美国罗格斯大学的研究人员通过对常见果蝇的小RNA分子进行研究来揭示疾病发生和老化之间的关系，相关研究成果刊登于国际杂志Genes & Development上。 Ammar Naqvi教授
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
最新发现两种肠道微生物的Ago酶，能够常温切割DNA
2019年7月30日，中科院动物研究所王皓毅团队和中科院北京生命科学研究院赵方庆团队合作，在 Cell Discovery 杂志发表了题为：Argonaute proteins from human gastrointestinal bacteria catalyze DNA-guided cl
内蒙古大学哈达组：miRNA在大豆感染SMV病毒中的作用
植物通过几种不同的防御机制保护自己免受病毒感染。RNA干扰（RNAi）是一个突出的抗病毒机制，需要AGO（Argonaute）和Dicer / DCL（Dicer-like）蛋白的参与。效应物触发免疫（ETI）是由抗性（R）基因介导的抗病毒机制，其中大部分编码NBS-LRR家族蛋白。microR
蛋白质组学揭示油菜卷叶机理（二）
图4. 差异表达蛋白的COG注释分析 图5. 差异表达蛋白的KEGG富集分析5. 为了进一步对这些差异蛋白的功能进行分类分析，作者进行了功能富集分析。通过对差异蛋白的富集分析结果发现，这些发生上调的蛋白能够改善Bndcl1株的光合性
Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN
Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新
Cell公布2012最佳论文中国学者占三篇
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN
LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法
在真核细胞中，RNA可以“形单影只”，也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白，它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合？将怎样作用于人类的发育、疾病？这都是悬而未解的难题。 6月10日，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA
微生物所发现真菌跨界Small－RNA作用新机制
自然界中，不同物种间进行着广泛的生物大分子交流，包括蛋白、DNA和RNA等(Zhao and Guo, 2019)。近年来，由跨界传递的small RNA（sRNA）介导的RNA沉默（RNA silencing or RNA interference，RNAi）受到了广泛关注。 RNAi是真核
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称，他们设计出了一种替代性的小干扰RNA（small interfering RNA，siRNA）前体，将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
北大，中科院Nature－Plants发表新成果：RNA沉默与病毒防御
生物通报道：来自北京大学生科院，中科院遗传发育所的研究人员通过分子生物学、遗传学以及生物信息学等手段，发现了一个单子叶植物特有、且能够被病毒侵染所抑制的水稻负调控抗病因子miR528，揭示了该miRNA及其调控的靶基因在水稻与病毒相互作用过程中的抗病机制，并进一步发现该机制具有广谱抗病毒功能。
科学家发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因
近日，中国农业科学院郑州果树研究所瓜果质量安全监测与控制技术创新团队发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因。相关研究成果发表于《分子植物病理》（Molecular Plant Pathology）。ClAGO1和ClAGO5沉默加重了黄瓜绿斑驳花叶病毒的症状，病毒积累量增加。中国农科院供图黄瓜绿斑驳花叶