大连化物所等发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法

近日,中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理(Ultra High Temperature treated,UHT)牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦味肽。 苦味肽是能够与细胞膜上的苦味受体结合进而引发苦味感知的一类小分子肽。UHT牛奶随储存时间的延长会发生变苦的现象,而蛋白质降解产生苦味肽可能是其诱因。除了对风味和营养的影响,苦味肽还被证实具有抗菌、抗炎、抗氧化等生物功能。因此,复杂基质中苦味肽的高通量筛选对营养研究和药物开发具有重要意义。 该团队构建了扩展的基准数据集和全新的特征因子组合,建立了基于轻量梯度提升机(Light Gradient Boosting Machine,LightGBM)算法的苦味肽分类预测模型(Classification Prediction M......阅读全文

机器学习能够有效筛选“苦味”

  苦味往往在食物味道中并不受欢迎,而引起这种苦味的重要因素之一是一种生物分子—苦味肽。苦味肽是能够与细胞膜上的苦味受体结合进而引发苦味感知的一类小分子肽,通常在食品加工、储存或消化过程中生成。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种

新进展!大连化物所等发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法

  近日,中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理(Ultra High Temperature treated,UHT)牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦

大连化物所发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法

  近日,中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理(Ultra High Temperature treated,UHT)牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦

大连化物所等发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法

  近日,中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理(Ultra High Temperature treated,UHT)牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦

大连化物所发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法

近日,中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作,发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理(Ultra High Temperature treated,UHT)牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦味肽

肽的分类

生物活性肽分布广泛,多来源于动、植物体。按其原料来源可分为:海洋生物活性肽和陆地生物活性肽。01 按照分子量大小分为小肽:又叫小分子肽,是指仅由2~4个氨基酸构成的高活性肽;寡肽:是指2-10个氨基酸组成的肽,分子量一般在1000道尔顿以下;多肽:10-50个氨基酸组成的肽;蛋白质:一般指51以上个

“深度学习”新方法能从母乳中筛选抗菌肽

  近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员靳艳团队与大连工业大学副教授刘俐团队、国家乳业技术创新中心正高级工程师何剑团队合作,发展了一种基于深度学习技术的乳源抗菌肽筛选新方法。团队利用该方法从母乳中筛选获得了新结构抗菌肽,并揭示了母乳初乳和成熟乳中抗菌肽的分布规律。相关成果发表在《食品化学》。  

ELISA检测筛选到的靶分子结合肽

【材料和试剂】 (1)酶标板,酶标仪 (2)湿盒 (3)吸水纸 (4)LB培养基 (5)PEG/NaCl (6)T (7)0.1M NaHCO3(pH 8.6) (8)HRP底物缓冲液 ABTS贮存液:在100ml 50mM的柠檬酸钠溶液(pH 4.0)中溶解22

种子筛选和播种预测技术助玉米增产

  最新收获数据显示,拜耳公司旗下气候公司(The Climate Corporation,以下简称气候公司)创新的玉米种子筛选和播种预测工具Seed Advisor,帮助农户显著提升收成。与未使用该工具的农户相比,使用者平均每亩增产约38公斤,该工具在田间试验中的赢率接近80%。  美国爱荷华州帕

母乳抗菌肽筛选新突破:基于深度学习技术的高效发现

近日,我所能源研究技术平台(DNL20)靳艳研究员团队与大连工业大学刘俐副教授团队、国家乳业技术创新中心何剑正高级工程师团队合作,发展了一种基于深度学习技术的乳源抗菌肽筛选新方法。团队利用该方法从母乳中筛选获得了新结构抗菌肽,并揭示了母乳初乳和成熟乳中抗菌肽的分布规律。世界卫生组织(WHO)和中国营

筛选到的靶分子结合肽的ELISA检测

实验概要本实验对筛选到的靶分子结合肽进行了ELISA检测。主要试剂1. LB培养基2. PEG/NaCl3. TBS4. 0.1M NaHCO3(pH8.6)5. HRP底物缓冲液6. ABTS贮存液:在100ml 50mM的柠檬酸钠溶液(pH4.0)中溶解22mgABTS,过滤除菌贮存在4℃。主要

筛选到的靶分子结合肽的ELISA检测

实验概要本实验对筛选到的靶分子结合肽进行了ELISA检测。主要试剂1. LB培养基2. PEG/NaCl3. TBS4. 0.1M NaHCO3(pH8.6)5. HRP底物缓冲液6. ABTS贮存液:在100ml 50mM的柠檬酸钠溶液(pH4.0)中溶解22mgABTS,过滤除菌贮存在4℃。主要

运用肽库筛选磷酸化激酶motif方法

Screening Kinase Phosphorylation Motifs Using Peptide LibrariesIsaac A. Manke and Michael B. YaffeCenter for Cancer Research, Massachusetts Institute

抗菌肽的结构分类

  抗菌肽依其结构可分为多种类型,其中Cathelicidin和Defensin为主要的类型;可将其分为5类:(1)单链无半胱氨酸残基的α-螺旋,或由无规卷曲连接的两段α-螺旋组成的肽;(2)富含某些氨基酸残基但不含半胱氨酸残基的抗菌肽;(3)含1个二硫键的抗菌多肽;(4)有2个或2个以上二硫键、具

Nature-Comm:基因融合筛选有助预测肺癌恶性程度

  目前开发肺癌有效的治疗已经具有相当大的挑战性,部分是因为许多基因突变在肺癌中发挥作用。通过分析肺癌的RNA和DNA,美国密歇根州综合癌症中心研究人员发现含大量基因融合的肺癌患者比只有较少基因融合的肺癌患者有更糟糕的结果。  此外,研究人员确定肺癌(包括有吸烟史的)患者的几个新遗传异常。肺癌是一个

AI打通基因与药物筛选体系-精准预测细胞响应

中南大学计算机学院教授李敏团队联合腾讯生命科学实验室研究员姚建华团队,提出统一的细胞扰动建模框架UniPert-G2CP,从分子表征到表型建模两个层面连接遗传与化学扰动筛选,为虚拟细胞构建提供新的计算方法。研究成果近日在线发表于《细胞》(Cell),中南大学为论文第一完成单位。近年来,随着大规模生物

生物活性肽的分类相关介绍

  生物活性肽的分类可按保健功能来划分。按照功能来分有生理活性肽、食品感官肽等多种 。以下是常见的几种生物活性肽的简介:  1.生理活性肽  抗菌肽  又称抗微生物肽,广泛分布于自然界,在原核生物和真核生物中都存在。如植物、微生物、昆虫和脊椎动物在微生物感染时迅速合成而得,也可采用基因克隆技术生产,

概述抗菌肽的结构分类

  抗菌肽依其结构可分为多种类型,其中Cathelicidin和Defensin为主要的类型;可将其分为5类:  (1)单链无半胱氨酸残基的α-螺旋,或由无规卷曲连接的两段α-螺旋组成的肽;  (2)富含某些氨基酸残基但不含半胱氨酸残基的抗菌肽;  (3)含1个二硫键的抗菌多肽;  (4)有2个或2

肽类色谱仪分类方法

肽类色谱仪分类有多种。1、按功能可分:分析型肽类色谱仪和制备型肽类色谱仪。2、按分离目的可分:实验室肽类色谱仪和工业肽类色谱仪。3、按灵敏性可分:微量肽类色谱仪和痕量肽类色谱仪。4、按分离原理可分:肽类液相色谱仪和肽类毛细管电泳色谱仪等。5、按分离规模可分:微型肽类色谱仪、小型肽类色谱仪和大型肽类色

新研究揭示苦味之谜

TAS2R14-Ggust-scFv16 的代表性冷冻电镜图(左)和模型(右),根据每个亚基 TAS2R14 进行着色;绿色,Gαi1;紫色,Gαgust;粉红色,Gβ1;天蓝色,Gγ2;黄色,scFv16;灰色的。美国北卡罗来纳医科大学研究人员揭开了TAS2R14苦味受体的详细蛋白质结构,还发现了

苦味感知影响咖啡饮用

  近日,澳大利亚研究人员发表的一项研究指出,人们对苦味物质的感知与拥有某组特定基因有关,这种感知会影响他们对咖啡、茶或酒精的偏好。相关论文刊登于《科学报告》。  昆士兰医学研究所的Jue-Sheng Ong、Liang-Dar Hwang及同事运用英国生物样本库中40多万名参与者的样本,通过分析与

【卡梅德生物】噬菌体展示肽库构建与筛选

噬菌体是一种感染细菌的病毒,具有能够在其表面展示外源肽或蛋白质的能力。通过基因工程方法,研究人员可以将外源DNA序列插入到噬菌体外壳蛋白的编码区,使得外源肽与外壳蛋白共同表达,形成展示在噬菌体表面的融合蛋白。噬菌体展示技术是一种重要的生物技术,它可以用于发现新的药物靶点、疫苗设计以及研究蛋白质-蛋白

定制+预测,科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台

5月16日,中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术,搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能(AI)平台KinomeMETA,为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关,激酶靶向抑制剂是

定制+预测,科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台

中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术,搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能(AI)平台KinomeMETA,为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关,激酶靶向抑制剂是一类极具价值

定制+预测,科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台

  5月16日,中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术,搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能(AI)平台KinomeMETA,为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。  蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关,激酶靶向抑

黄瓜苦味成分能抗癌降糖

  美国《科学》杂志刊登的一项新研究发现,黄瓜中苦味化合物具有防治癌症和糖尿病的功效。   新研究中,美国加州大学研究人员确定了使野生黄瓜产生强烈苦味的基因。包括黄瓜、南瓜、冬瓜、西瓜和西葫芦在内的野生葫芦科植物都含有产生苦味的“葫芦素”化合物。野生葫芦科瓜果及叶子在印度和中国入药已有几千年历史,通

关于抗菌肽按来源分类的介绍

  (1)昆虫抗菌肽 昆虫是种群最大的生物种类,抗菌肽的数量难以估量。现在,仅在鳞翅目、双翅目、鞘翅目和蜻蜓目等8个目的昆虫中发现超过200多种昆虫抗菌肽类物质,仅从家蚕这一种昆虫获得了40个抗菌肽基因。  (2)哺乳动物抗菌肽 1989年, 首次从猪小肠中分离到哺乳动物抗菌肽Cecropin P1

抗体人源化设计/基于胰岛素肽的设计和筛选

实施效果来源:计算模拟平台通过Discovery Studio中的Antibody Modelling, Predict Humanizing Mutations模块对鼠源抗体进行人源化。DS中的Predict Humanizing Mutations模块会寻找人的Germline序列,

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predi

利用双杂交系统相互作用阱/筛选特定蛋白的肽适配体...

利用双杂交系统相互作用阱/筛选特定蛋白的肽适配体实验实验方法原理 实验材料 DNA酵母株试剂、试剂盒 PCR 引物聚乙二醇甘油存储液Tris·ClX-gal 平板完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板仪器、耗材 30℃ 和 42℃ 培养箱或水浴实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其