《机器智能》：秒级预测蛋白质结构的大模型上线
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510009.shtm......阅读全文
中医药人工智能大模型正式启动
6月15日，在横琴粤澳深度合作区举行的中医药广东省实验室（以下简称横琴实验室）第一届学术委员会第一次会议暨首届横琴中医药科技创新大会上，中医药横琴大模型、中药新药智能自动化融合创新平台同时启动。这也是该实验室揭牌半年来取得的新进展。2023年12月，横琴实验室正式揭牌成立，成为广东省实验室体系中的一
通过计算模型预测先导编辑效率及脱靶率，拓展应用前景
CRISPR基因编辑技术自问世以来，就展现出无可比拟的优势，并深刻改变了基因编辑领域乃至整个生命科学的研究模式。近年来，基于CRISPR系统开发的先导编辑（Prime Editing，PE）引起科学家们的关注，有望引领基因编辑的全新变革。 先导编辑是由刘如谦（David Liu）实验室于201
国家超级计算天津中心发布“天河天元”大模型
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/501029.shtm5月20日，在第七届世界智能大会上，国家超级计算天津中心正式发布“天河E级智能计算开放创新平台”和“天河天元大模型”。近期，ChatGPT的爆火引发了信息技术领域的“大模型热”，国内多
蛋白质结构和功能的基础模型
蛋白质设计程序使用在体内环境中驱动蛋白质的分子力的计算机模型。为了使问题易于解决，蛋白质设计模型简化了这些作用力。尽管蛋白质设计程序相差很大，但它们必须解决四个主要的建模问题：设计的目标结构是什么，目标结构允许什么样的灵活性，搜索中包括哪些序列，以及将使用哪个力场来分数序列和结构。目标结构蛋白质功能
研究利用人工智能预测蛋白质“光学指纹”
蛋白质是生命的基石，生物的功能依赖于既稳定而又灵活可变的蛋白质结构。蛋白质的光谱响应信号，尤其是紫外光谱，可以称之为蛋白质骨架的“指纹”。这个“光学指纹”，经过理论模拟的解读，可以揭示出精确的蛋白质结构，为生命科学和医学诊断提供极其重要的信息。 然而，蛋白质的结构极其复杂多变，需要做大量的高精
蛋白质三级机构（空间结构）预测－从头预测法
H-P模型是基于三种简化的，即蛋白质中各个氨基酸残基的α碳原子都位于二维网格或三维网格的格点上，疏水作用是蛋白折叠中唯一的重要因素，同时通过计算疏水残基接触的数目代替构象的能量计算。虽然这样的处理非常简单，但是，通过H-P模型的计算分析，能够发现蛋白质折叠的一些机制。如果在蛋白质模型中取消氨基酸定位
超大规模人工智能模型“悟道1.0”发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454887.shtm 3月20日，北京智源人工智能研究院（简称“智源研究院”）在京发布了超大规模人工智能（AI）模型“悟道1.0”。据悉，该模型是我国首个超大规模人工智能模型系统，可谓是人工智能应用的
蛋白质三级机构预测－同源模型化法1
蛋白质结构预测的生物学意义生物信息学研究的一个主要目标是了解蛋白质序列与三维结构的关系，但是序列与结构之间的关系是非常复杂的。人们已经掌握了一些蛋白质序列与二级结构之间的关系，但是对于蛋白质序列与空间结构之间的关系了解得比较少。预测蛋白质的二级结构只是预测折叠蛋白的三维形状的第一步。一些结构不是很规
蛋白质三级机构预测－同源模型化法2
5、构建目标蛋白质的环区：在第2步的序列比对中，可能加入空位，这些区域常常对应于二级结构元素之间的环区，对于环区需要另外建立模型。一般也是采用经验性方法，从已知结构的蛋白质中寻找一个最优的环区，拷贝其结构数据。如果找不到相应的环区，则需要用其它方法。6、优化模型：通过上述过程为目标蛋白质U建立了一个
IDC、智源最新一期大模型评测结果出炉
6月17日记者获悉，由北京智源研究院（以下简称智源）打造的FlagEval天秤大模型评测平台实现了全面升级，并公布202406期FlagEval模型评测排行榜单。最新一期榜单显示，百度文心大模型、字节跳动“云雀”和“豆包”大模型的综合评分在闭源对话模型中位列前三，GPT-4o、百川、零一万物、kim
IDC、智源最新一期大模型评测结果出炉
6月17日记者获悉，由北京智源研究院（以下简称智源）打造的FlagEval天秤大模型评测平台实现了全面升级，并公布202406期FlagEval模型评测排行榜单。最新一期榜单显示，百度文心大模型、字节跳动“云雀”和“豆包”大模型的综合评分在闭源对话模型中位列前三，GPT-4o、百川、零一万物、k
清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法
研究背景 随着计算生物学的快速发展，我们正处于一个由数据驱动的生物信息学新时代。蛋白质，作为生命活动的执行者，其结构和功能预测一直是科学研究的核心问题。近年来，深度学习技术的突破性进展，尤其是蛋白质语言模型的兴起，为研究者们提供了一个全新的视角来了解蛋白质在生命体内所扮演的角色。 蛋白质语言
我国科学家研发天文耀发预测大模型FLARE
记者5月27日从中国科学院自动化研究所获悉，研究所携手中国科学院国家天文台，基于一站式智能科研平台ScienceOne，联合研发天文耀发预测大模型FLARE，为天文学研究提供全新工具。 中国科学院自动化研究所研究员陈盈盈介绍，恒星耀发是恒星大气中磁场能量的快速释放过程，对于理解恒星结构、演化、
蛋白质结构预测和分子动力学
作为结构基因组研究的互补，蛋白质结构预测的目标是发展出有效的能够提供未知结构（未通过实验方法得到）蛋白质的可信的结构模型。目前最为成功的结构预测方法是同源建模；这一方法是利用序列相似的蛋白质（已知结构）的结构作为“模板”。而结构基因组的目标正是通过解析大量蛋白质的结构来为同源建模提供足够的模板
Meta公司AI预测6亿蛋白质结构
ESM宏基因组图谱数据库包含6.17亿个蛋白质的结构预测。图片来源：ESM宏基因组图谱 谷歌旗下人工智能（AI）公司Deep Mind今年公布了2.2亿个蛋白质的预测结构，几乎涵盖了DNA数据库中已知生物的所有蛋白质。现在，另一个科技巨头正在填补蛋白质宇宙中的暗物质。 Meta公司（前
“复杂生物系统群智演化模型”－通过成果鉴定
5月6日上午，由中国科学院沈阳自动化研究所承担的“复杂生物系统群智演化模型与优化的基础理论及方法”科技成果鉴定会在该所举行，所党委书记兼副所长桑子刚、科技处处长孙海涛等参加了成果鉴定会。 鉴定会上，信息服务与智能控制技术研究室主任朱云龙研究员就生物群智计算研究课题组的研究工作做了总体汇报。
预测蛋白质结构只是开始－AI或为生命科学领域带来巨变
蛋白质结构预测是生物学的重要“圣杯”，也是人工智能落子生命科学领域最炙手可热的研究之一。 近日，我国自研深度学习蛋白质折叠预测平台TRFold传来好消息，其基于2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛（CASP14）蛋白质测试集的成绩仅次于“阿尔法折叠的迭代版”（AlphaFold2），排名全
预测蛋白质结构只是开始－AI或为生命科学领域带来巨变
蛋白质结构预测是生物学的重要“圣杯”，也是人工智能落子生命科学领域最炙手可热的研究之一。 近日，我国自研深度学习蛋白质折叠预测平台TRFold传来好消息，其基于2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛（CASP14）蛋白质测试集的成绩仅次于“阿尔法折叠的迭代版”（AlphaFold2），排名全
机器学习模型预测中风？
中风的诊断可能很棘手，因为患者并不总是表现出典型的症状，而且其他疾病也可能模仿它。研究人员利用现有数据开发了一种机器学习模型，可以准确预测中风，并可能使诊断变得更容易。诊断错误是一个主要的公共卫生问题，造成了可预防的病人伤害和卫生超支。由于诊断错误而导致的可预防的中风死亡比误诊的心脏病发作要常见30
蛋白质三级机构（空间结构）预测－从头预测法...1
从头预测模型的基本思想在既没有已知结构的同源蛋白质、也没有已知结构的远程同源蛋白质的情况下，上述两种蛋白质结构预测的方法都不能用，这时只能采用从头预测方法（Abinitio），即（直接）仅仅根据序列本身来预测其结构。在1994年之前，还没有一个从头算方法能够预测蛋白质的空间结构。从那以后，人们陆续提
MOFormer：无需3D结构、基于Transformer的预测语言模型
金属有机框架（MOF）是具有高比表面积、高孔隙率和结构可设计的结晶性多孔材料，可用于气体吸附、气体储存、气体分离、催化剂等领域。 然而，MOF 的化学空间非常巨大。发现适合特定应用的最佳 MOF 需要对无数潜在候选材料进行高效、准确的搜索。快速且低成本地为特定任务选择性能最佳的 MOF 一直具有挑
人工智能成功预测蛋白质的相互作用
美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出，他们利用人工智能和进化分析，绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型，首次确定了100多个可能的蛋白质复合物，并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型，深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。 研究负责人之一、美国西南大学人类发
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
iScience：利用蛋白质组学构建预测模型识别未知底物
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子功能研究组研究员朴海龙团队基于生物信息学方法，揭示了癌症中关键的去泛素化与泛素化分子相互作用网络。 去泛素化与泛素化作用是生命体内至关重要的转录后修饰作用，参与到细胞周期、免疫调控、信号传递等几乎所有的生物学通路过程中。同时，该作用体系对
人工智能先驱预测未来媒体十大趋势
新闻将不再是用来“读”的,而是用来“体验”的 科技日报北京10月26日电 (记者李钊)10月25日,2016未来媒体峰会在京举行,人工智能先驱皮埃罗·斯加鲁菲于峰会中发布《2017未来媒体报告》,指出未来媒体的十大趋势,并预言将来的新闻是用来体验的,而非仅仅阅读。 《报告》提出的十大趋势分别
人工智能先驱预测未来媒体十大趋势
人工智能先驱预测未来媒体十大趋势新闻将不再是用来“读”的,而是用来“体验”的 10月25日,2016未来媒体峰会在京举行,人工智能先驱皮埃罗·斯加鲁菲于峰会中发布《2017未来媒体报告》,指出未来媒体的十大趋势,并预言将来的新闻是用来体验的,而非仅仅阅读。 《报告》提出的十大趋势分别是:用户体验
百奥几何获千万美元天使轮融资，驱动大分子药物研发
AI大分子制药公司百奥几何已完成千万美元天使轮融资，投资方为高榕资本；另外，团队也发布了首个针对大分子药物研发的开源机器学习平台TorchProtein。据介绍，百奥几何成立于2021年，致力于开发几何深度学习、深度生成模型等下一代人工智能技术，用于大分子药物研发。目前，公司正打造人工智能大分子药物
专业与通用大模型融合是数智化医院建设的关键
随着DeepSeek、Manus等人工智能（AI）大模型的爆火，今年全国两会期间，“AI”“科技”等成为“热词”。 2025年政府工作报告提出，持续推进“人工智能+”行动，将数字技术与制造优势、市场优势更好结合起来，支持大模型广泛应用，大力发展智能网联新能源汽车、人工智能手机和电脑、智能机器人
用AI赋能全流程患者管理－“智医随行”大模型发布
7月11日，中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）医学人工智能联合实验室正式推出“智医随行”大模型，用AI赋能全流程患者管理。据悉，该模型通过本地化部署，深度融合讯飞星火医疗大模型的专病管理路径知识库与中国科大附一院专科知识库，为医护人员打造覆盖患者“预防-治疗-康复-随访”全周期的AI助手。