Nature:通过全球宏基因组分析,将已知的蛋白家族数量翻倍

想象一下,科学家们用手电筒探索一个黑暗的房间,却只能清楚地辨认出光束范围内的东西。说到微生物群落,他们历来无法看到光束之外的东西---更糟糕的是,他们甚至不知道这个房间有多大。 在一项新的研究中,来自美国劳伦斯伯克利国家实验室和加州大学伯克利分校等研究机构的研究人员通过研究微生物群落中的蛋白功能,以一种新颖的方法更好地了解微生物群落,从而凸显了微生物大量的功能多样性。相关研究结果于2023年10月11日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Unraveling the functional dark matter through global metagenomics”。 "论文第一作者 Georgios Pavlopoulos 现为亚历山大-弗莱明生物医学科学研究中心的研究主任。"这是用大规模并行计算对13亿个蛋白质进行的大规模分析"。 论文共同通讯作者Georgios Pavlop......阅读全文

核蛋白基因组指纹技术

Fine Mapping of Genomic Targets of Nuclear Proteins in Cultured CellsAchim Breiling and Valerio OrlandoDulbecco Telethon Institute, Institute of Genet

张文宏受聘南大!

  7月2日上午,南京大学病毒与感染病研究所正式成立。国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏,被聘为兼职教授和名誉所长,并现场做了《人类传染病的过去现在及未来》的主题演讲。  演讲中,张文宏提到,从人类与传染病的斗争史来看,病毒将长期存在,今天有新冠病毒,明天可能还会有其他病毒

宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用

  中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水(Acid mine drainage, AMD)中的微生物群落进行研究,相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。  本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样

《科学》:古老蛋白塑造细菌紧凑基因组

该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素  与人类相比,细菌不携带过多的“垃圾DNA”,它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA,而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现,细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R

张文宏:不是我说的

据东方网报道,12月20日下午开始,一段疑似张文宏的音频流传在微信朋友圈中,音频谈到当前新冠感染威胁、家庭防护推荐等多方面话题。但细心的网友发现,此段音频中包含有一些和张文宏医生之前观点相反的意见,甚至还有推销产品的嫌疑,因此,该段音频遭到质疑。这段音频是张文宏医生说的吗?张文宏向东方网回复:“不是

张文宏:莫忽视科研行为本身

  “创新本身不能被预先设计,也没有既定的方向。”近日,在复旦大学管理学院医疗健康产业峰会圆桌对话环节,国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏,围绕“细胞与基因领域技术创新的产业化和国际化”主题,发表了自己的看法。  创新转化为什么有时候很快,有时候又很慢?张文宏认为,如果仅仅

病毒蛋白与基因组RNA-构筑DNA蛋白复合结构多级可控构筑

  生物大分子在自然进化中发展出一套独特的“自下而上”自组装方式进行各种复合结构的可控装配,为多功能生物纳米材料的加工制备提供了绝佳范例。其中,核酸-蛋白质纳米复合体系的可控构筑,不仅将实现生物学上两种基本组装模式的有效结合,以提供愈加复杂的生物结构模板,还有助于体内生物大分子相互作用的深入理解,对

张文宏等获评2020“最美教师”

  为热烈庆祝第36个教师节,由中宣部、教育部、中央广播电视总台举办的“闪亮的名字——2020寻找最美教师”发布仪式日前在京举行。在发布仪式上,公布了10位最美教师、1个最美教师团队的先进事迹。 荣获2020年“最美教师”称号的教师有:复旦大学教授张文宏,中国人民大学教授王易,北京航空航天大学教

张文宏称新冠已成常驻病毒

  我们都知道新冠肺炎病毒已经存在长达大半年之久了,但是病毒依旧还在传染并未消停,更有消息表示新冠肺炎病毒以后将会成为常伴的病毒,近来张文宏称新冠已成常驻病毒跟着小编一起来看看是怎么回事吧!  转眼已是秋冬季,全球已与新冠病毒抗争了大半年。在预测第二波疫情成为必然、疫情还要延续相当长的时间之后,复旦

南京疫情跨省传播,@张文宏医生-解读!

  7月29日凌晨,@张文宏医生 在微博上发声:  南京疫情促使全国经受压力测试,为未来疫情防控提供更多思考。  近期南京疫情跨省传播,成为输入性疫情引发国内传播的新模式。在严格管控疫情和加速疫苗接种的今天发生多省疫情扩散引发公众对于未来的巨大不安,这份不安其实来自对于未来巨大不确定性的不安。  1

刘宏涛:做科普当先立品牌

  金秋十月,中国科学院武汉植物园一年一度的“斗菊”大赛又进入了白热化的阶段。   “我们每年都到社区里去,给老百姓赠送菊苗。到秋天举办菊花展时,市民再把自己养的菊花带过来,参加我们的斗菊擂台赛。”中科院武汉植物园园艺中心主任刘宏涛说,“几年下来,这个活动已经发展成很受欢迎的品牌。”   200

刘畊宏新书:别让健康走错路

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506304.shtm8月8日是我国第15个全民健身日,“全民健身,练就对了”新书首发发布会暨全民健身日活动在北京举办,活动邀请《练就自由:开启无限可能的人生》(以下简称《练就自由》)作者、健身教练刘畊宏和

陈啸宏:药师要确保合理用药

卫生部副部长陈啸宏发言  第二届中国药师大会在北京召开。卫生部副部长陈啸宏指出,广大药师要以深化医药卫生体制改革为契机,保证生产、流通、使用各环节的药品质量,开展以患者为中心的药学服务等方面发挥重要作用。  为了进一步落实医改各项政策,深入探讨我国医改过程中的有关问题,推动药品生产、经营、使用领域药

PNAS:特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”

  近日,发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中,来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点,研究人员发现了一种新型特殊蛋白,其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性。   文章中,研究者对T细胞和B细胞的发育也进行了深入研究,这两种细胞均是保

抑癌蛋白p53如何与基因组结合?

  最近,来自比利时鲁汶大学的遗传学家表明,肿瘤蛋白TP53知道应该结合到我们DNA上的哪个确切位置,来防止癌症。一旦与这个特定的DNA序列结合,这个蛋白质就可以激活正确的基因来修复受损的细胞。相关研究结果发表在国际著名期刊《Genome Research》。  体内所有的细胞都有相同的DNA,但是

张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作

  来自美国哥伦比亚大学,同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方

《科学》杂志精选:人类基因组蛋白产物仍是谜

  几近完成的普通小麦基因组测序  研究人员已经展示了普通小麦基因组的序列草图,从而在通往创制世界上种植最广泛谷物作物之一的完整参考序列的道路上到达了一个主要的里程碑。他们的工作给了科学家们一个可在小麦个体染色体上快速定位特定基因的工具,这一资源可帮助他们改良小麦育种以满足从未有过的对食物的更高需求

蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制

  慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程,受到机体的系统性调控,基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响,目前这方面的研究报道较少,亟待深入探究。同时,新药研

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图

  据《科学》杂志近日发表的一项最新研究,研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合,绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图,显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。通过创建基因组蛋白质组图,科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。   蛋白质故障会导

蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图

  据《科学》杂志近日发表的一项最新研究,研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合,绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图,显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。  通过创建基因组蛋白质组图,科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。  蛋白质故障会

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

聚光科技财务总监匡志宏辞职

聚光科技(杭州)股份有限公司关于高管辞职的公告  本公司及董事会全体成员保证公告内容真实、准确和完整,没有虚假记载、误导性陈述或重大遗漏。  聚光科技(杭州)股份有限公司(以下简称“公司”)董事会于2012年4月16日收到公司财务总监匡志宏先生的书面辞职申请。匡志宏先生因为个人身体原因,申

陈宏础:重视血常规的复检工作

   目前血细胞分析仪己经普及到县医院或卫生院,这对提高血细胞常规的准确性和重复性,减轻工作人员劳动强度起促进作用。但是我们应该认识到血细胞分析仪还是一个过筛工具,至今最先进的全自动血细胞分析仪还不能完全取代人工检查,仍然有部分标本需要复检。据我所知有的医院有了血细胞分析仪,把人工操作的工具

许智宏:翩翩江南客-依依草木情

许智宏,1942年10月出生于江苏无锡,植物生理学家,中国科学院院士。现任中国人与生物圈国家委员会专家咨询委员会主席、中国植物园联盟咨询委员会主任、北京大学现代农学院教授;曾任中国科学院副院长、北京大学校长、国际植物组织培养和生物技术协会主席、中国植物生理学会理事长、中国细胞生物学会理事长、北京大学

张文宏:中国不会盲目地开放和封锁

  第五届海南国际健康产业博览会11月12日开幕。复旦大学附属华山医院感染科主任、国家传染病医学中心主任张文宏在博览会的医疗健康产业高峰论坛上做“传染病消除:挑战与未来”演讲。他表示,新冠疫情不会彻底消失,即便疫苗接种达到非常高的水平,还得继续实施非常强大的公共卫生政策。多国经验证明疫苗虽然无法完全

周宏灏:推行个体化治疗势在必行

  “从千人一药、千人一量的对症下药,到量体裁衣的对人下药,这是未来医学的发展趋势。”日前,签约进入重庆医科大学院士专家工作站后,中国工程院院士接受了本报记者专访。  他强调:“未来医生给病人开药,应根据病人的遗传变异情况量体裁衣,推行个体化药物治疗。”  作为我国遗传药理学的开拓者和带头

何宏轩:鼠疫,全是跳蚤惹的祸

   7月16日,甘肃省玉门市一人因为接触了死旱獭,感染鼠疫,3日后医治无效死亡。疫情一出,当地立即采取措施,暂时封闭城市,隔离了相关人员。同时,这件事也让这种发病急剧、传染性强、死亡率高的自然疫源性疾病重回公众视线。  在人类历史上,鼠疫曾经夺走不少人的性命。引起鼠疫的鼠疫杆菌直到1894年方被发

张文宏谈乘飞机回国注意事项

  居家隔离时吃什么?孩子在学校内不便戴口罩怎么办?坐飞机时能吃东西吗?张文宏对此一一作答。  5月28日下午,中国驻贝尔法斯特总领馆与上海市外办、上海市卫健委联合组织防控新冠肺炎疫情视频讲座,邀请上海新冠肺炎医疗救治专家组组长、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏教授与在英国北爱尔兰的中资企业、华

纪宏斌《自然》发现新抑癌基因

来自美国波士顿和北卡罗莱纳州的研究人员合作发现一种特殊的基因能够抑制小鼠肺癌进程的关键步骤。研究人员将这些发现公布在8月5日的《自然》杂志的网络版上。这种叫做LKB1的基因在小鼠中不但是非小细胞肺癌的一种肿瘤抑制基因,而且其功能还可能比其他已知的抑制因子更加强大。  原文检索:Nature 44