武汉植物园在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展,“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少,与主粮作物相比,其种质资源的研究及现代育种技术的应用滞后。菱角是典型的“孤儿作物”。新石器时代以来,长江流域的先民开始有意识地大规模采集、驯化菱角。在南宋时期,菱角已成为江南地区的主粮之一,仅太湖地区便形成了包括“乌菱”“南湖菱”等20多个栽培品种。随着基因组学技术的发展,泛基因组研究已成为探讨作物重要性状形成机制的重要手段,被广泛应用于作物育种改良。 近日,中国科学院武汉植物园东亚植物演化、保护与利用学科组研究员邱英雄团队,在《园艺研究》(Horticulture Research)上,以Research article形式,在线发表了题为Pangenom......阅读全文
武汉植物园在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展,“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少,与主粮作物相比,其种质资源
超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用
水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱
宁夏建成世界最大枸杞属种质资源库
1月14日从宁夏种业科技创新座谈会上获悉,宁夏目前已建成世界最大的枸杞属种质资源库——国家枸杞种质资源库。 种质资源库是利用仪器设备控制贮藏环境,使种质在几十年、甚至数百年之后仍具有原有的遗传特性和很高的发芽力,并长期贮存作物种质的仓库,又称基因库。其对于农作物品种改良、培育新品种、生物学理论
科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物,具有重要的经济价值和营养价值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足,限制了它的育种改良。5月29日,华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自然—遗传
科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物,具有重要的经济价值和营养价值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足,限制了它的育种改良。 5月29日,华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自
首个玉蜀黍属超级泛基因组助力玉米遗传改良
玉蜀黍属超级泛基因组特征 受访者供图8月24日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室和洪山实验室玉米团队最新研究成果。该团队利用721份玉蜀黍属材料的基因组数据,构建了首个玉蜀黍属“超级泛基因组(super pan-genome)”图
中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组
中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组,系统解析了苹果属数千万年的演化历程,并构建了首个苹果属图形泛基因组,发布了苹果属遗传多样性全景图。日前,相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂,分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域,是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全
中亚沙拐枣属植物研究及种质资源保护平台建设通过验收
沙拐枣植物田间种质资源圃 9月20日,受科技部国际合作司委托,新疆科技厅组织专家组在乌鲁木齐召开了由中国科学院新疆生态与地理研究所承担的国际科技合作项目“中亚沙拐枣属植物研究及种质资源保护平台建设”验收会。专家组审阅了项目有关材料、听取了项目组的汇报,经质询和充分讨论,一致同意该项
种质资源库对入库种质资源的要求是什么?
种植资源是人类的宝贵财富,种植资源中蕴藏着丰富多样的基因资源,是育种专家培育农畜新品种的重要素材来源。而为了保存这些种质资源,人们采用种质资源库这种保温隔湿的设备来保存,通过常年保持低温干燥的环境,来减缓种子新陈代谢的速度,延长种子寿命,使种子在几乃至近百年仍不丧失原有的遗传性和发芽能力。
小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474824.shtm 随着全球对特色咖啡需求的显著增加,开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的。近日,中国科学院武汉植物园的科研人员,通过基因组重测序等方式发现的SNPs,或与咖啡中重要农艺性状的重要基
种质资源研究技术方案
《史记》有云:“王者以民人为天,而民人以食为天。”粮食问题在中国历朝历代都占据着极其重要的位置。新中国成立后,解决粮食问题、保证14亿中国人民的粮食安全更是政府工作的重中之重。中共中央、国务院2004年至2020年已连续十七年发布以“三农”(农业、农村、农民)为主题的中央一号文件,强调了“三农”问题
海南椰子种质资源特点
椰子种质资源的特性是决定其开发价值的主要因素,因此科研人员针对海南椰子,选取了海南高种、马哇、文椰78F1、黄矮、绿矮和红矮6个品种作为分析对象。通过分析其特性,总结出了它们之间的差异性和稳定性。其中各类品种的椰子都能够从种质资源库得到。差异性对比主要分析海南椰子各品种间在形态特征、椰果组分和品质上
银杏种质资源保存方式
我们知道,种质资源的保存非常有必要,只有做好种质资源保护工作,才能为育种研究提供更多材料。以银杏种质资源来说,种质保存方式主要有三种:①就地保存。指在银杏生长所在地通过保护银杏原来所处的自然生态条件来保存银杏种质。种质就地保存主要有两个方面:一是适当地建立野生银杏的自然保护区,这是自然资源保存的永久
农科院种质资源所解析绿豆基因组及驯化机制
种质资源所农作物种质资源收集保护和评价创新团队在绿豆(Vigna radiata)基因组组装及驯化机制研究上取得新进展。研究论文“Telomere-to-telomere, gap-free genome of mung bean (Vigna radiata) provides insights
我国科学家首次绘制出葡萄属超级泛基因组图谱
2月26日,记者从北京大学现代农业研究院获悉,该院叶文秀研究员和郭立研究员团队绘制了全球首个涵盖葡萄属的欧亚、北美和东亚世界三大种群的72个葡萄种质材料的单倍型超级泛基因组图谱,从而揭示葡萄属丰富遗传多样性和杂交历史。相关成果发表在国际期刊《自然·遗传学》上。葡萄样品全球地理分布及其果实和叶片形态。
木荷种质资源库确定为国家林草种质资源库
日前,国家林业和草原局发布公告,中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)支撑建设的浙江省龙泉林科院木荷种质资源库新增为国家级林木种质资源库。这是目前全国唯一的国家木荷种质资源库,意味着亚林所收集保存的木荷育种资源得到了国家认可。这批新增的国家林木种质资源库是国家围绕“绿化、彩化、珍贵化”
采取林木种质资源保存库开展种质资源离体保存的重要性
林木种质资源是良种选育的基础材料,也是国家重要的战略资源,近年来为了更好的收集和保存林木种质资源,建立完善的林木种质资源普查信息管理体系,林木种质资源保存库的应用变得越来越重要,尤其是在种质资源离体保存方面,发挥了其重要的作用。 林木种质资源保存的原则是: 第一,以保护濒危树种不灭绝,
桑黄菌的种质资源
关于桑黄菌种质,目前已经作为产品提供的鉴定标本中被当作桑黄菌使用的物种就有很多,但所述桑黄菌均属于木层孔菌(Phellinus Quél)。该属很多子实体都具有褐色蹄形的共同点,因此宏观上很多种具有相似之处。[1]
种质资源库应用价值
随着气候环境和社会环境的改变,越来越多的农作物、林木种质资源等需要被保护,以避免消失的厄运。虽然我国对种质资源的认识起步较晚,但是由于种质资源的价值非常高,因此种质资源的保护和挖掘利用也得到了足够的重视,不少地区更是建立了专业的种质资源库来进行保存和保护。下面就来简单介绍一下种质资源库的应用价值。种
高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成
9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。
我国牵头完成高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析
9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支
大豆“走失”的基因“回家”了
左上为栽培大豆种子,其余为多年生野生大豆种子。山东农大供图 多年生野生大豆植株 山东农大供图从又黑又小的野生大豆,到又黄又大的栽培大豆,3月15日《自然—植物》在线发表的论文证实,在这个过程中丢失了约70%的基因位点。现在,科学家让这些丰富的遗传资源“回家”了。论文通讯作者、山东
基因工程“番”新种质资源
我国是番茄第一生产大国。随着全球气候变暖趋势加剧,高温严重影响番茄的生长发育。此外,从品种培育的角度来看,我国番茄种业也面临着原始创新能力不足、原创性成果少等问题。因此,通过基因工程手段培育抗高温的作物新品种成为重要途径之一。 近年来,扬州大学生物科学与技术学院教授丁海东课题组在番茄抗盐方面已
种质资源库的设计原则
设计总原则: 安全性、可靠性、前瞻性和布局合理实用,符合环保要求,在保证安全性的前提下考虑先进性(Ellis et al., 1990; 陈叔平1995)。由于种质资源库的设计专业性非常强,因此,在工程设计过程中,必须始终贯彻上述设计思想与原则。1、 安全性植物种质资源是在不同生态条件下经过自然界长
认识泛基因组测序
什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
种质资源库管理系统软件在砂梨种质资源管理中的应用
种质资源库管理系统软件是专门为种质资源库管理开发的软件,它能实现育种资源的预警提醒、动态出入库管理与远程检索查询,更加方便了育种信息化管理。 此前,就有农业人士专门利用了种质资源库管理系统软件对砂梨种质资源进行了收集、整理、鉴定评价和创新利用,加强了种质资源规范化管理,促进资源信息交
广东初步建立4大种质资源库-30多万份种质资源得以保护
农业种质资源是保障国家粮食安全与重要农产品供给的战略性资源。12日,记者从广东种业大会了解到,广东初步建成作物、畜禽、水产、微生物4大种质资源库,30多万份种质资源得以保护。 广东省农业种质资源丰富,开展农业种质资源保护时间早、规模大。目前,广东建有国家级作物种质资源圃6个、省部级种质资源库1
千种野生种质资源汇聚两园
红色的锦带花、白色的冰菊、粉红色的芍药、五颜六色的鲁冰花开得正艳,野苹果、野杏子、野欧洲李挂满枝头,望峰湖、醉心湖、翠月湖、平宁湖流水潺潺…… 盛夏时节,年近70岁的中国科学院新疆生态与地理研究所(以下简称“中科院新疆生地所”)伊犁植物园主任管开云站在伊犁植物园内,脸上满是收获的喜悦。 经过
种质资源库的类型及特点
植物种质资源库是 指以植物种质资源为保护对象的保存设施。至1996年, 全世界已建成了1 300余座植物种质资源库, 在我国也已建成30多座作物种质资源库。种质入库保存类型也从单一种子形式, 发展到营养器官、细胞和组织, 甚至是DNA 片段等多种形式。保护的物种也从有性繁殖植物, 扩展到无性繁殖植物
保护牧草种质资源迫在眉睫
牧草种质资源更新繁殖 中国农科院草原所供图 中国天然草原面积近60亿亩,占国土面积的41.7%,牧草种子和植株的保存数量位居世界第二位,保存5.6万份,但乡土草种质资源仅占20%~30%,保存数量较少。 近日,国家牧草种质资源中期库开工建设。中国农业科学院草原研究所(以下简称草原所)草资源与