关节炎滑膜组织基因表达调控图谱，揭示关节炎风险位点的功能特征
关节炎是一种常见的关节病变，主要表现为滑膜增生、软骨变性及软骨下骨增生，造成关节功能丧失和生活质量下降，在60岁以上人群发病率超过50%，全球范围内有数亿人受到影响。全基因组关联研究（Genome-wide association study, GWAS）已鉴定数百个与关节炎相关的风险变异，但90%以上位于基因组非编码区，其调控功能和致病机制尚不明确。表达数量性状基因座(expression Quantitative Trait Loci, eQTL)能够鉴定易感变异与基因表达的关联，是解析GWAS非编码区变异位点功能的有力工具。然而，eQTL分析具有明显的组织特异性，滑膜作为关节的重要组成部分，是炎症性关节病的主要靶组织，目前还没有大规模滑膜组织的eQTL数据，为解析关节炎风险位点的作用机制带来了极大挑战。 针对上述问题，西安交通大学生命科学与技术学院杨铁林教授团队通过整合关节炎患者人群滑膜基因组、转录组和染色质可及性特征，......阅读全文
找出病变基因当“靶点”
提起最佳的射击，很多人的答案都是正中靶心。对于癌症病人来说，能够准确地找到病变原因，不仅能够实现真正的对症下药，还能大大减轻病人身体上所受的痛苦。在青岛市中心医院肿瘤综合治疗科，通过检测基因序列，发现病变基因，来揭示病人患上癌症的核心“密码”，尤其是对于癌症晚期病人来说，无疑是黑暗中的“柳暗花明
类风湿性关节炎治疗发现新靶点
多年来，我们一致认为时不时地手指、脚趾僵硬、关节肿胀疼痛等都是衰老的表现。如今，我们知道这可能是类风湿性关节炎的早期症状。在美国，130万30至60岁的成年正受到该疾病的困扰。类风湿性关节炎不仅会损伤关节，更严重的是，会增加心脏病、中风及感染的可能性。 大部分类风湿性关节炎可通过免疫抑制，减少
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果，但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子，在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
PCR技术要素模板(靶基因)核酸
模板(靶基因)核酸 模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别
Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片
2012年11月6日，来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码：AFFX)推出了 Axiom® miRNA靶基因分型芯片，唯一一款可在全基因组范围评估microRNA(miRNA)靶基因位点的高密度基因分型工具。这些新的芯片将实现全面研究，以阐明miRNA调控
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
基因融合或许成为重要药物靶点
基因融合（Fusion gene），由两个不同的基因异常结合而引起的，在癌症的发生过程中起着重要的作用。通常，它们被用作为预测特定癌症患者药物反应以及预后的诊断工具，以评估患者的最佳治疗结果。它们也是一些最新癌症治疗的重要药物靶点。 到目前为止，研究人员已经确定了大约20,000个基因融合，但
m5C－RNA修饰靶基因验证
技术简介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技
骨转移为靶点、同时保留骨组织的癌症治疗方法
加州大学欧文分校(university of california，Irvine，UCI)的研究人员开发了一种治疗方法并在老鼠身上测试，这种方法利用工程干细胞来靶向并杀死骨组织中的癌症转移灶，同时保存骨头。发表于EBioMedicine的这一新方法，为工程的间充质干细胞配备了靶向剂，促使它们转移
Nature子刊：骨关节炎的发展与蛋白HPIP相关
骨关节炎（Osteoarthritis，简称OA）是中老年人中常见的一种退行性关节疾病。根据美国疾控中心的统计，在美国65岁以上的人群中，大约80%患有关节炎。软骨退化影响了骨关节炎的治疗。 近日，中国人民解放军总医院王岩教授和军事医学科学院北京生物工程研究所叶棋浓教授等人领导的研究团队
研究发现骨关节炎的发展与蛋白HPIP相关
骨关节炎（Osteoarthritis，简称OA）是中老年人中常见的一种退行性关节疾病。根据美国疾控中心的统计，在美国65岁以上的人群中，大约80%患有关节炎。软骨退化影响了骨关节炎的治疗。 近日，中国人民解放军总医院王岩教授和军事医学科学院北京生物工程研究所叶
【综述】脂肪组织巨噬细胞：免疫治疗肥胖的新靶点？
一、引言 巨噬细胞广泛分布于人体多个组织器官，它能识别外来病原体，在固有免疫、炎症反应中发挥重要作用。1993年Hotamisligil等发现肥胖动物模型脂肪组织的肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α，TNF-α)分泌增加，首次将肥胖与炎症相联系，直到2003年Xu
蠕虫基因组研究发现潜在药物靶点
研究人员在对一种特殊的寄生性蠕虫的基因组研究后发现决定其抗药性的基因。他们定位了捻转血矛线虫相关基因并确定了五种其生存必须的酶。其中有两种已经被用作药物靶点，另外三种有希望用于开发新的抗寄生虫药物。
Nature子刊：骨关节炎的发展与蛋白HPIP相关
骨关节炎（Osteoarthritis，简称OA）是中老年人中常见的一种退行性关节疾病。根据美国疾控中心的统计，在美国65岁以上的人群中，大约80%患有关节炎。软骨退化影响了骨关节炎的治疗。 近日，中国人民解放军总医院王岩教授和军事医学科学院北京生物工程研究所叶棋浓教授等人领导的研究团队
关节炎中的表观遗传学基因开关
一项新研究发现DNA甲基化是控制MMP13酶基因的开关，而MMP13酶具有重要的软骨破坏作用。文章发表在FASEB Journal杂志的网站上。 骨关节炎是一种退行性关节疾病，该疾病的典型症状是患者关节软骨持续不可逆的损失，这主要是由于基质金属蛋白酶MMP13破坏基质中的II型胶原引起
学者为延缓骨关节炎治疗开辟新途径
暨南大学附属第一医院教授查振刚、教授张还添团队与暨南大学化学与材料学院教授曾戎团队合作，探究了一种延缓骨关节炎进展的新型治疗方案。相关成果1月27日发表于《生物材料》。 “我们首先在临床上收集了正常和骨关节炎的滑膜样本，结果发现骨关节炎滑膜中巨噬细胞沉积及BRD4表达远高于正常滑膜，二者存在较
Plos－Genetics：靶基因Windpipe对果蝇肠道稳态调控机制
肠道稳态维持是通过肠干细胞的增殖分化实现的。由于外界病原微生物感染，饮食等环境压力，肠道上皮细胞不断受损，肠干细胞通过自我更新、增殖和分化来维持肠道上皮的完整性。果蝇中肠系统是研究干细胞和组织稳态的重要模型。其稳态受到多种信号通路的综合调控，包括Notch、JAK/STAT、Wnt等。然而，这些
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波，抛开这次事件而言，作为一项生物研究技术，基因敲除在药物研发领域应用也很广泛，今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧！ 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索，每年都会有作用于新靶
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波，抛开这次事件而言，作为一项生物研究技术，基因敲除在药物研发领域应用也很广泛，今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧！ 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索，每年都会有作用于新靶
学者为延缓骨关节炎治疗开辟新途径
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517126.shtm暨南大学附属第一医院教授查振刚、教授张还添团队与暨南大学化学与材料学院教授曾戎团队合作，探究了一种延缓骨关节炎进展的新型治疗方案。相关成果1月27日发表于《生物材料》。“我们首先在临床
脊柱关节炎的发病原因及病理改变
发病原因 脊柱关节炎包括的所有疾病中B27抗原均显著增高。惠普尔病和白塞病由于缺乏与HLA-B27的相关性和具有其它的特征已经不再包括在脊柱关节炎疾病范畴中。非基因致病因子中，以感染较多。转基因鼠生活在无菌环境中并不发生强直性脊柱炎，提示环境因素是HLA-B27相关疾病发生不可缺少的条件。肿瘤
基因组算法立功！发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表达模式与侵
Sci－Rep：揭秘新基因功能及癌症疗法靶点
弗吉尼亚联邦大学医学院的研究人员最新发现，精子相关抗原6(SPAG6) 有了某些新的功能， 以前这种基因被认为只对纤毛的能动性有重要作用。该基因的缺陷与男性不育相关，尽管新的发现可能会对某些癌症的诊断和治疗有影响。 “精子抗原6调节成纤维细胞的生长、形态、迁移和纤毛发生。”该研究发表在11月
基因组算法立功！发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表达模式与侵
ERBB2基因组有望成为PDAC治疗靶点
2019年5月2日，国际肿瘤学学术期刊《Carcinogenesis》在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所-长征医院联合转化医学中心王跃祥研究组题为“Oncogenic ERBB2 Aberrations and KRAS Mutations Cooperate to Promote Pan
EZH2基因或为白血病治疗新靶点
新加坡一项研究显示，他们发现了一个3-Deazaneplanocin A（DZNep）介导细胞凋亡的新的分子机制，并提出EZH2基因可能是AML治疗的一个潜在的新靶点。研究报告2011年7月6日在线发表于《》（Blood）杂志。 DZNep是一种组蛋白甲基转移酶抑制剂。之前已经有几项研究表明，D
植物组织制备基因组DNA实验
氯化铯法 CTAB法 实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
组织特异性基因敲除的定义
中文名称组织特异性基因敲除英文名称tissue-specific gene knockout定 义在特定组织细胞类型中使基因功能完全丧失的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），发育遗传学（二级学科）
从动物组织提取基因组DNA
实验概要本实验以哺乳动物新鲜组织为材料，学习基因组DNA提取的一般方法。实验原理基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀