研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制

日,中山大学生命科学学院教授施苏华、副教授何子文团队以红树植物杯萼海桑所在支系为对象,全面分析基因组进化轨迹,探索倍性变化(多倍化-重二倍化过程)在基因组进化中的作用,研究全球气候变化背景下的植物适应性进化机制。相关成果发表于《自然-通讯》。 该研究基于高质量的基因组数据,使用共线性分析、非同义突变率分布以及系统发育分析等方法多管齐下,准确鉴定千屈菜科多倍化事件的特征和位置。结果表明,杯萼海桑和大叶紫薇的共同祖先在距今约六千四百万年前经历了全基因组三倍化事件,与白垩纪-古近纪生物大灭绝事件时间重合。 研究人员通过整合多个物种的基因组数据,进一步将该全基因组三倍化事件锁定在两次相近的物种分化事件之间较为狭窄的一段时间内,这一模式与核心真双子叶植物早期多样化相关的γ-全基因组三倍化事件特征相似(均为全基因组三倍化)。相较于简单的全基因组加倍事件后的一份或两份拷贝,全基因组三倍化复制基因在基因组上存在更多的保留形式(一份、两份......阅读全文

研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制

  日,中山大学生命科学学院教授施苏华、副教授何子文团队以红树植物杯萼海桑所在支系为对象,全面分析基因组进化轨迹,探索倍性变化(多倍化-重二倍化过程)在基因组进化中的作用,研究全球气候变化背景下的植物适应性进化机制。相关成果发表于《自然-通讯》。  该研究基于高质量的基因组数据,使用共线性分析、非同

研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm

昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进

研究揭示人类世全球植物β多样性变化

  生物同质化,即不同地区生物群落日趋相似,导致生物独特性丧失,已成为生态学关注的核心问题。人类活动在多大程度上导致了全球植物群落的同质化,仍是一个悬而未决的科学问题。  中国科学院成都生物研究所研究团队整合全球范围内的相关研究,对涵盖256项研究的1604组观测与实验数据进行了荟萃分析,首次从分类

研究揭示人类世全球植物β多样性变化

生物同质化,即不同地区生物群落日趋相似,导致生物独特性丧失,已成为生态学关注的核心问题。人类活动在多大程度上导致了全球植物群落的同质化,仍是一个悬而未决的科学问题。中国科学院成都生物研究所研究团队整合全球范围内的相关研究,对涵盖256项研究的1604组观测与实验数据进行了荟萃分析,首次从分类、功能和

植物基因组DNA的RFLP多态性分析

一、原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的不同个体之间。RFLP多态性是指DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(restniction fragment length olymophorphism)。由于碱基顺序的差异,在不同的

CytoFLEX流式细胞仪用于检测植物叶片DNA倍性

植物的基因组大小机DNA倍性和植物的品系、性状及营养和药用价值有密切联系。检测植物的基因组大小和DNA倍性在植物的鉴定、杂交育种等领域有重要意义。流式细胞仪可在半小时内完成从样本制备染色、植物基因组大小和DNA倍性测定全过程,以其方便快捷得到广泛应用。CytoFLEX流式细胞仪具有优异的荧光分辨能力

全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

   中国南方喀斯特起源古老、分布广泛,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。  喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进

gRNA让CRISPR基因组编辑技术的准确性平均提高50倍

  在一项新的研究中,来自美国杜克大学的研究人员开发出一种方法,可将CRISPR基因组编辑技术的准确性平均提高50倍。他们认为它可以很容易地扩展到这种基因编辑技术的不断扩大的其他形式。这种方法给用于识别待编辑的DNA序列的向导RNA(gRNA)添加一条短尾巴。这条增加的尾巴折叠回来进行自我结合,从而

光合作用仪分析杏属植物的季节性变化

杏在退耕还林,山绿化挥了重要作用尤其是在果树种植结构调整中更加明显,扩大生产规模是至今的发展趋势,与此同时,国内外对杏的研究也越来越多,特别是与生产直接相关的光合作用仪对此的研究已经取得了很大的进步,并结合近年来的研究工作将总结杏植物的光合作用研究进展,旨在提供杏在中国生产的基础,为科学研究做参考。

研究揭示海口植物多样性和地上生物量时空变化

近日,海南大学热带作物学院副教授王华锋团队研究发现,海口市2015年的植物多样性和2021年的地上生物量对人类活动和社会经济学因素的反应具有时滞效应,该研究于12月14日在线发表于《生物学》。 据了解,城市植物多样性和地上生物量的驱动因素对于城市生态系统服务和生物多样性保护至关重要,但热带滨海城

叶绿素仪观察植物生长环境变化

    叶绿素仪是农户门经常用到的一款仪器,也是一款便携式植物生理检测仪器,它能快速测量植物叶片中的叶绿素含量,并记录保存测量的数据结构,方便工作随时进行野外作业。同时对指导农业生产指导氮肥使用,提升植物光合作用,促进植物生长发育有着重要的作用。     叶片叶绿素含量(Chl,uɡ/

新方法——让CRISPR基因组编辑技术的准确性提高50倍

  在一项新的研究中,来自美国杜克大学的研究人员开发出一种方法,可将CRISPR基因组编辑技术的准确性平均提高50倍。他们认为它可以很容易地扩展到这种基因编辑技术的不断扩大的其他形式。这种方法给用于识别待编辑的DNA序列的向导RNA(gRNA)添加一条短尾巴。这条增加的尾巴折叠回来进行自我结合,从而

整倍性的概念

中文名称整倍性英文名称euploidy定  义染色体组数是染色体基数的整数倍的现象。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

倍性育种的特点

1.同源多倍体植物的特点①育性差,结实率低.②大多数同源多倍体是无性繁殖的,多年生的.③同源多倍体基因型种类比二倍体多纯显性:AAAA;三显性:AAAa;双显性:AAaa;单显性:Aaaa;无显性:aaaa④同源多倍体达到遗传平衡的时间长⑤器官的巨型性2.异源多倍体植物的特点染色体配对正常,植株雌雄

异倍性的概念

异倍性 heteroploidy aneuploidy 指个体或系统所具有的染色体数目较之该种固有的基本染色体数x的整倍数多一条至数条,或少一条至数条的现象。此类具有不完整染色体组的个体称为异倍体。

亚倍性的概念

中文名称亚倍性英文名称hypoploidy定  义细胞或个体的染色体数目少于染色体组的整倍数的性质。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)

什么是细胞倍性?

真核生物细胞核中所含有的染色体组(n)的套数。

植物基因组DNA的RFLP

实验概要本实验介绍了植物基因组DNA的RFLP多态性分析的原理及操作步骤。通过本实验可了解不同植物或同一植物不同个体之间基因组DNA顺序的差异性,掌握DNA限制性酶切片段长度多态性研究的基本方法。实验原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的

植物基因组提取(CATB法)

一、实验目的 掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。 二、实验原理 通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

昆明植物所探索菌类植物对气候变化的响应

  松茸是名贵的野生食用菌,为重要的林副出口产品,在云南省年均出口创汇额达4000多万美元。松茸的产量逐年波动较大,其价格随产量波动而大幅涨跌,从而影响社区的资源管理和资源可持续利用。松茸产量的波动是森林、土壤、气候、菌落和采集方式等多个因素综合作用的结果,气候变化是其中的一个关键因素。   中国

解析四倍体攸茶(Camellia-meiocarpa-Hu)单倍型基因组

在植物的奇妙世界里,油茶作为重要的木本食用油料植物,有着超 2300 年的栽培历史,其用途广泛,在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶(Camellia meiocarpa Hu)是其中一员,它叶茂花大果丰,极具农业利用潜力。然而,四倍体攸茶的染色体水平基因组数据匮乏,且多倍体油茶物种高质量基因

气候变化促进中国的植物健康

[北京] 一项新的研究表明,气候变化促使中国陆生植物生长更加旺盛。 北京师范大学的科研人员研究了在1982年到1999年期间气候因素与植物净初级生产力变化之间的联系,植物净初级生产力指的是植物在生长周期中的能量净储备值。 该报告的第一作者,北京师范大学资源学院朱文泉说“如果植物净初级生产力越高,

昆明植物所在植物基因组印迹研究中取得进展

蓖麻基因组印迹以及其甲基化分析  基因组印记 (genetic imprinting)是一种非常重要的表观遗传学现象之一。在配子或合子发育过程中,来自亲本的等位基因或染色体发生了差异的表观修饰,导致了亲本等位基因的差异表达(即印迹基因)。在植物中基因组印迹主要发生在被子植物的三倍体胚乳组织

开花植物“统治”植物界或因基因组瘦身

  据英国广播公司(BBC)1月14日报道,开花植物为什么会后来居上超越蕨类植物等,传遍世界各地并成为最主要的陆生植物?这一问题曾让达尔文困惑不已。现在,美国微生物学家表示,“基因组瘦身”或是开花植物遍布地球的“秘密武器”。  1898年,达尔文在《物种起源》一书中提出一个令他颇为不解的问题。他说,

JAMA:人类基因组终生在变化

这一发现将有助于解释为什么疾病易感性会随着年龄增长而增加 图片说明:不同的家庭拥有不同类型的终生DNA变化。(图片来源:Getty) 美国科学家近日研究发现,人类DNA上的表观遗传(epigenetic)化学标记一生中不断变化,并且变化程度在家庭成员之间是相似的。科学家据此认为,表观遗传特

放大四千倍细胞解开基因组秘密

  基因调控是发生在分子水平上的过程,传统显微镜很难观察到。在最新一期《科学》杂志在线发表的一篇论文中,美国耶鲁大学研究人员开发了一种名为染色质扩张显微镜(ChromExM)的新技术,成功地将斑马鱼胚胎细胞核的物理体积扩大了4000倍,从而大幅提高了图像分辨率。这项技术让研究人员第一次看到了单个分子

版纳园在气候变化对植物入侵性影响方面取得新进展

人工气候室控制实验   当前,生物入侵已成为严重的环境问题,是全球变化的重要组成部分,入侵生态学尤其是与全球环境变化相结合,成为生态学研究的热点问题之一。   中科院西双版纳热带植物园生物入侵生态学组以紫茎泽兰原产地(墨西哥)种群、入侵地(中国)种群,以及本地近缘种白头婆为材料