昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进化的主要驱动力之一。竹子包含二倍体草本竹子、四倍体木本竹子和六倍体木本竹子。核型研究发现,少数古热带木本竹子如乌脚绿拥有104条染色体。这些物种表现出非整倍性。然而,这些竹种的倍性水平以及非整倍性的原因尚不清楚。中国科学院昆明植物研究所李德铢团队利用二代测序技术、三代测序技术和染色质构象捕捉技术,组装获得乌脚绿高解析度的单倍型参考基因组。研究显示,基因组大小为3.36G,contig N50为14.81M,杂合度为7.3%,挂载得到104条染色体,141,732个编码基因获得注释。通过禾本科BOP分支的水稻、巨龙竹、麻竹的基因组共线性......阅读全文

昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进

科学家揭示木本竹类独特性状演化之谜

“竹子开花,立马搬家”——我国一些地区传言,竹子开花之后不就后死亡,预示着坏事发生。从科学的角度来看,传言不攻自破。竹子分为木本竹类和草本竹类,只有木本竹类开花后死亡。木本竹类茎秆高大,木质化程度高、营养生长几十甚至上百年,最长的可达120年,之后才开花死亡。相比之下,草本竹类一般仅几十厘米高,木质

昆明植物所揭示竹类植物生活史转变和物种多样化遗传机制

多倍化或称基因组加倍是植物演化史上的永恒主题,广泛发生于被子植物(有花植物)的各个演化阶段,特别是在与重要地史和气候事件相关的演化节点上,并伴随着整个被子植物和诸多大科大属的兴起。然而,在亚基因组水平上,关于多倍化如何促进植物适应性演化以及物种多样性形成的认识仍然不足。现有研究集中在新近(五百万年内

全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究

  禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,约有12000种,是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源,也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时,禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科(竹子)是禾本科的12个亚科之一,与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP

研究揭示竹子茎秆快速生长的遗传机制

  演化创新(evolutionary innovation)贯穿于整个生命之树(Tree of Life),如被子植物的花和鸟类的羽毛分别为植物和鸟类开拓和适应新的生态位提供了重要前提,其如何产生是演化与发育生物学研究的基本问题和主要挑战之一。越来越多研究表明,新基因是演化创新的主要驱动力之一。几

DNA甲基化调控竹笋快速生长研究方面取得新进展

竹类植物作为一种特殊的禾草,其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注,但以往的研究主要集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,主要参与转座子沉默和基因的表达调控,在植物生长发育中发挥着重要的调控作用。然而,目前尚不清楚DNA甲基化是

昆明植物所在DNA甲基化调控竹笋快速生长研究中获进展

  竹类植物作为一种特殊的禾草,其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注,但以往研究集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰,主要参与转座子沉默和基因的表达调控,在植物生长发育中发挥重要的调控作用。然而,目前尚不清楚DNA甲基化是否影响竹

昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定

  竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。  中国科学院昆明植物研究所李德

竹类组学和分类学信息平台发布

日前,中国科学院昆明植物研究所研究员李德铢带领的研究团队在《分子植物》上在线发表论文,发布了“竹类组学和分类学信息平台(BambooBase,https://bamboo.genobank.org/)”。BambooBase收录了竹类植物18个基因组、476个转录组和16个表观基因组的数据,以及13

我国科学家成功绘出高质量木本棉基因组图谱

  我国科学家成功绘制出高质量的木本棉基因组图谱,并对棉属进化机制及重要经济性状功能基因进行了分析。对四倍体棉种及其它多倍体物种的形成过程的揭示,为研究棉花纤维质量和抗病虫灾害等重要农艺性状奠定了遗传学基础。研究成果近日发表在《自然·遗传学》杂志上。  棉花是全球最重要的经济作物之一,棉花属共包括4

我国科学家成功绘制出高质量木本棉基因组图谱

  我国科学家成功绘制出高质量的木本棉基因组图谱,并对棉属进化机制及重要经济性状功能基因进行了分析。对四倍体棉种及其它多倍体物种的形成过程的揭示,为研究棉花纤维质量和抗病虫灾害等重要农艺性状奠定了遗传学基础。研究成果近日发表在《自然·遗传学》杂志上。  棉花是全球最重要的经济作物之一,棉花属共包括4

核基因和形态学证据揭示我国梨藤竹属的分类学谜团

  竹亚科是禾本科适应森林生境的主要分支之一,广泛分布于亚洲东南部、中南美洲和非洲地区,具有重要的经济、生态和文化价值。为适应多样的生存环境,竹子演化出了多种多样的植株类型,包括乔木状、灌木状和草本竹,其中,有一类竹子因具有攀爬或攀援习性,被称为“藤本竹”。在我国记录过具攀爬或攀缘习性的竹子有6个属

横断山高山竹类的快速辐射演化和物种多样性的形成机制

  高山竹类是竹亚科青篱竹族(温带木本竹类)一个独特的分支,包括箭竹属(Fargesia)、玉山竹属(Yushania)、筱竹属(Thamnocalamus)、香竹属(Chimonocalamus)、冷箭竹属(Sarocalamus,即“alpine Bashania”),以及Bergbambos,

一根科技竹-种出万千竹农共同富裕路

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508506.shtm近日,广东省韶关市与浙江农林大学举行了战略合作协议签约仪式。今后,浙江农林大学将充分发挥人才科技优势,集聚学校顶级的竹子研究专家团队力量,为韶关市竹产业发展和乡村振兴事业发展贡献智慧和

昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组

  同动物的线粒体基因组相比,植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式,如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前,植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序,需要耗费大量的人力和物力,严重限制了植物线粒体基因组的测序,进而导致对其独特进化方式的研究

昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记

  温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约600种,分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种,是其多样化中心,其中中国西南特有种

南林大联合多家单位完成簸箕柳全基因组测序

  近日,南京林业大学长江学者尹佟明教授团队联合国内外多家单位完成了簸箕柳的全基因组测序。通过基因组比较研究显示,杨树和柳树起源于共同的古四倍体祖先,这一古四倍化事件发生在距今约5800万年前,比迄今发现的化石记录早了约1300万年。   杨树和柳树是重要的造林绿化和用材树种,在全球分布极为广泛。化

清峻有节气若竹

小檗科:南天竹(Nandina domestica) 张叔勇摄 我第一次真正关注南天竹是在乌镇的茅盾故居,小院的墙根下种有一丛南天竹,据说是1934年茅盾先生亲手所植。 ■张叔勇 我们小区的草坪上有一块巨石,旁边种植有一株南天竹,竹石相依,很有东方的意象,闲暇的时候我总会去看上几眼

中科院华南植物园发现竹类新属——以礼竹属

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498478.shtm近日,中科院华南植物园植物中心副研究员童毅华等科研人员在国家自然科学基金项目和广东省基础与应用基础研究基金项目的支持下,发现竹类一新属——以礼竹属。相关研究发表于国际植物分类学期刊Ph

版纳植物园揭示壳斗科植物的基因组大小进化

  物种的基因组大小是物种形成和多样化中最近处的性状。通过测定物种的基因组大小,有助于了解物种的染色体倍性和基因组进化,为全基因组测序提供基础数据,提高基因组多样性的生物信息学研究的效率。前人对植物基因组大小进化的研究多集中于温带草本类群,并且未与系统发育和地理分布相关联,对热带木本植物的基因组大小

木本观赏植物组织培养研究进展

  对木本观赏植物组织培养的研究现状进行了概述,总结了外植体类型、基本培养基种类、不同植物生长调节物质、环境条件等因素对木本观赏植物组织培养的影响,并分析讨论了组织培养过程中常见污染、褐化和玻璃化问题及其解决方法。植物组织培养是指在无菌条件下,将离体的植物器官(根、茎、叶、花、果实、种子等)、组织(

科学家解析温带竹子分支系统发育关系

 温带竹子分支(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约546种,主要分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)和东南亚地区,少数种类分布到印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加,以及北美洲东部的低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该分支近500种,是其多样化中心,中国西南特有

木本植物蛋白质提取实验

实验材料树皮                                                          试剂、试剂盒沉淀缓冲液                                                                  漂洗缓冲液    

木本植物蛋白质提取实验

实验材料树皮试剂、试剂盒沉淀缓冲液漂洗缓冲液溶解缓冲液仪器、耗材离心管实验步骤3.1 提取总蛋白质 (见注释 5)( 1 ) 将去塞的 10 ml 空离心管称重。我们选用韧性好的聚碳酸酯旋盖圆底高速离心管。( 2 ) 细胞碎裂:500 mg 新鲜组织(保存在 -80°C ) 在液氮中用研钵和杵捣成粉

木本植物蛋白质提取实验

实验材料 树皮试剂、试剂盒 沉淀缓冲液漂洗缓冲液溶解缓冲液仪器、耗材 离心管实验步骤 3.1 提取总蛋白质 (见注释 5)( 1 ) 将去塞的 10 ml 空离心管称重。我们选用韧性好的聚碳酸酯旋盖圆底高速离心管。( 2 ) 细胞碎裂:500 mg 新鲜组织(保存在 -80°C ) 在液氮中用研钵和

云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定

  6月6日,由云南省科技厅主持,邀请有关专家,对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定,经专家组认真审查有关认定资料,听取了团队带头人李德铢的工作汇报。   专家组认为,该创新团队通过三年的实施培养,建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研

竹柏根的药理作用

  从竹柏根皮中分离出的化合物2α -羟基 竹柏 内酯F在12种微生物试验中,只抑制了啤酒糖酵母菌的生长,其MIC( 最低抑菌浓度)为800μg/ml。从竹柏种子分离得到的竹柏内酯A、1 -脱氧-2β,3β-环氧竹柏内酯A、1-脱氧-2α-羟基竹柏内酯A、竹柏内酯苷A等成分,前三种化合物在10μg/

解读‘山竹’起名-取名全凭爱好

   听说台风‘山竹’要被除名?”“下一个名字还会是水果么?”9月16日17时左右,气势汹汹的第22号台风“山竹”在广东省台山沿岸登陆。深圳天气微博更是@中央气象台,表示申请除名“山竹”。台风的名字为何千奇百怪?又在什么情况下会被除名?对此,中国气象局台风与海洋气象预报中心首席预报员高拴柱进行了解读

大叶锦竹草的简介

  大叶锦竹草为热带地被植物,多年生常绿,主要用于观叶,多作为室内观赏性吊篮吊链植物。属鸭跖草科锦竹草属,起源国家为墨西哥,主要分布在热带和亚热带部分地区。在越南,大叶锦竹草经常被人们用于降低体温、减轻疼痛和缓解消化不良。

大叶锦竹草的介绍

  大叶锦竹草属鸭跖草科锦竹草属,热带地被植物,多年生常绿,主要用于观叶。叶色有较多变化:深红,黑,青铜绿或者斑纹状。当暴露于强烈阳光下时,叶片会变为紫色。该植物喜阴,虽为室内植物,但是在野外,气温较高和湿润及营养较高的土壤也能生存。在越南,大叶锦竹草经常被人们用于降低体温、减轻疼痛和缓解消化不良。