陈玲玲研究员CellRes解析癌相关lncRNA

报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实,人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲(Ling-Ling Chen)研究员。其主要研究方向为长非编码RNA和干细胞。 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,因此起初被认为是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能。然而,近年来的研究发现,实际上lncRNA以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)影响了各种重要的生物过程,且与癌症的发生存在密切的关系。尽管这些研究的结果表明,lncRNAs有可能在肿瘤形成中充当了重要的调控因子,对于lncRNAs在特......阅读全文

基因调控的研究方法

  筛选突变型   这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。  激素诱导   在高等的真核生物中,除了离体培养的体细胞以

专家指南:如何研究基因调控(一)

随着基因组学研究的深入,人们已经不再满足于了解基因的功能,而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在,我们知道,DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因,microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工具也越来越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟该采用哪种方法来测定m

专家指南:如何研究基因调控(三)

  Q5:在定位蛋白-DNA相互作用时,为降低DNA污染和片段化所引起的假阳性,同时也避免太严格的数据过滤所引起的假阴性,您的主要方法是什么?   Marc Facciotti(加州大学戴维斯分校):   首先,从微生物的角度来看,我们选择对天然表达的转录因子开展ChIP实验。我们认为,这能够将

关于基因调控的研究方法介绍

  1、筛选突变型  这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。  2、激素诱导  在高等的真核生物中,除了离体培养的体

植物激素调控基因研究获进展

  中科院上海药物研究所徐华强与中科院遗传与发育生物学研究所李家洋、美国温安洛研究所Karsten Melcher等合作,在植物中发现了一个与人体中特定信号机制非常相似的重要的分子机制,该机制与人类早期胚胎发育和癌症等疾病有着密切联系。相关研究日前在线发表于《科学进展》。  植物中复杂的分子网络调控

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

中国科大基因转录调控研究取得进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现,秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55,共调控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等在内的数以千计的靶基因的表达,从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《

PNAS:基因调控网络建模研究获进展

  近日,国际学术期刊《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型,将基因调控网络的建模研究从编码基因推进

JCI:研究发现调控骨密度的关键基因

  近日,遗传学家们确定了在调节骨密度中发挥关键作用的两个基因,在对抗骨质疏松症战斗中迈出了重要一步。通过靶向这些基因,医生可能有一天能够操纵骨密度,以​​预防或治疗骨质脆弱。  该研究为了解骨质疏松症的发展提供了重要的依据。在美国,目前有超过1200万人被诊断患有骨质疏松症,另有3000万成为骨质

研究发现调控黄瓜低温高产的关键基因

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队发现调控黄瓜耐低温性和雌花形成的“枢纽”基因,首次阐明其协同驯化的分子机制,发掘出优异等位基因,为黄瓜耐低温高产分子育种提供重要理论依据和技术支撑。相关研究成果发表在《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journa

研究发现调控日本血吸虫生殖发育基因

  3月20日,记者从复旦大学获悉,该校生命科学学院胡薇团队,绘制了日本血吸虫从合抱至性成熟产卵过程的动态表达谱,解析了整个发育过程的基因表达特征和分子事件,发现了雌虫与雄虫在合抱后的发育过程中功能分化明显,到成熟阶段达到完美的功能互补,并鉴定了调控雄虫合抱的芳香族氨基酸脱羧酶及控制雌虫生殖系统发育

关于植物叶绿体基因组基因表达调控的研究的介绍

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

六倍体小麦调控组和亚基因组的分化调控研究

  普通小麦(Triticum aestivum L.)是经两次远缘杂交而形成的一种异源六倍体作物,含有A、B和D三个亚基因组。亚基因组分化对多倍体小麦基因组可塑性具有重要贡献,且成为其成功驯化的关键因素之一。然而,决定小麦亚基因组分化的时空特异性调控机制尚不清楚。中国科学院遗传与发育生物学研究所研

研究发现基因调控水稻细胞死亡新机制

近日,中国水稻研究所(以下简称水稻所)种质创新课题组研究发现病斑突变体基因ELL1通过影响叶绿体的发育来调控水稻中活性氧的稳态,进而触发由活性氧介导的细胞死亡。该项研究丰富了对植物中细胞程序性死亡产生与活性氧稳态之间联系的理解。相关研究成果在线发表在《植物学报》上。 水稻所副研究员任德勇介绍,细

联合研究发现调控棉花纤维伸长的新基因

利用基因编辑技术鉴定到影响棉花纤维伸长的GhMAH1基因。中国农科院供图  棉花是世界上重要的天然纤维作物。陆地棉和海岛棉(又称长绒棉)是棉花的两个主栽四倍体棉种,陆海种间杂交为棉花纤维长度性状改良提供重要资源,但关于陆海群体纤维动态伸长的遗传机理却鲜有报道。因此,研究棉花纤维快速伸长时期表达基因的

如何利用CRISPRdCas9来研究基因调控

  顺式调控元件(TRE)和反式调控元件(CRE)一直是人们感兴趣的对象,通常利用染色质免疫沉淀(ChIP)和染色质捕获技术来研究。不过,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员最近开发出一种新方法,结合CRISPR的靶定能力以及生物素-链霉亲和素的互作优势来鉴定TRE和CRE。  这种名为CAPTURE

西南大学研究人员发现调控寿命新基因

科技日报讯 (记者雍黎)记者9月9日从西南大学获悉,该校资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室教授代方银团队发现了调控寿命的新基因OSER1,并在家蚕、线虫、果蝇等多物种中进行研究,揭示了其调控机制。作为长寿基因FOXO(叉头框蛋白O)的靶基因,OSER1对寿命的影响得到人类受试者研究结果支持。相关论

什么是基因表达调控?基因表达调控有什么意义

意义:1.适应环境、维持生长和增殖:生物体赖以生存的外环境是在不断变化的,为了生存,所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应,调节代谢,以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化:多细胞生物调节基因的表达除为适

基因表达的调控

转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调

基因调控的介绍

  基因表达的主要过程是基因的转录和信使核糖核酸(mRNA)的翻译。基因调控主要发生在三个水平上,即①DNA水平上的调控、转录控制和翻译控制;②微生物通过基因调控可以改变代谢方式以适应环境的变化,这类基因调控一般是短暂的和可逆的;③多细胞生物的基因调控是细胞分化、形态发生和个体发育的基础,这类调控一

基因调控的简史

  1900年F.迪纳特发现在含有乳糖和半乳糖的培养液中培养的酵母菌细胞中有分解半乳糖的酶,但是在葡萄糖的培养液中培养的酵母菌细胞中没有相应的酶。1930年H.卡尔斯特伦在关于细菌的研究中也发现类似的现象,并把生物细胞中的酶区分为组成酶和适应酶(亦称诱导酶)两类,前者是在任何情况下都存在的酶,后者是

研究揭示莲雾果实成熟发育最重要的调控基因

莲雾,又名水蓊果,属桃金娘科蒲桃属热带常绿乔木果树。广泛种植在我国广西、海南、广东、云南、台湾等地。莲雾果实口感脆嫩、味道清甜,水分充足热量低,富含膳食纤维,具有较高的营养价值。莲雾作为新兴的热带水果,因其栽培历史较短,分布较局限,以致相关的基础研究较落后。由于缺乏栽培莲雾基因组序列以及相关遗传研究

研究发现调控桃树桃蚜抗性的关键候选基因

  近日,中国农业科学院郑州果树研究所核果类栽培生理创新团队发现了调控桃树桃蚜抗性的关键候选基因 PpRm3 ,该研究为桃树抗蚜性状筛选提供了可靠的分子标记,并为桃树抗蚜机制的研究提供借鉴。相关研究成果发表在《实验植物学杂志(Journal of Experimental Botany)》上。  桃

生物学家转移研究重点-开始关注基因调控

随着人类和许多其他物种基因组测序工作的完成,生物学家开始将研究重点转移到调控基因如何开启和关闭功能基因的表达上,该类研究的进行需要依靠新技术和新工具的发明应用。近期在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上发表的相关文章表明,美国佛罗里达州立大学国家高磁实验室研究人员与加拿大阿尔伯塔大

甘薯重要性状的基因剂量调控研究获突破

广东省农业科学院作物研究所甘薯研究团队同合作者,通过成功构建甘薯等位基因剂量变异图谱,首次揭示了23个关键农艺性状相关的剂量QTL,明确了剂量QTL对性状变异的贡献,阐明了等位基因剂量调控参与甘薯性状改良的遗传规律。相关成果12月12日发表于《自然-植物》(Nature Plants)。论文共同通讯