新方法可全局性解析“修饰调控酶—底物”互作
近日,中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作,利用前期开发的PANAC光点击化学,发展了一种在活细胞内直接捕捉“修饰调控酶—底物”相互作用的时空可分辨解析新方法,为蛋白质相互作用和蛋白质翻译后修饰研究提供了新工具。相关研究发表于《自然—通讯》。 精确解析“修饰调控酶—底物”的动态互作对于深入理解蛋白质功能和靶标发现具有重要意义,但利用现有技术直接进行“修饰调控酶—底物”的时空动态全局性解析,尤其对动态和微弱相互作用产生的修饰底物、修饰位点的准确鉴定,非常具有挑战性。 作为直接捕捉“修饰调控酶—底物”动态互作策略的概念性验证,研究团队基于前期发展的化学生物学工具,发展了一种在活细胞中直接捕捉赖氨酸酰基化修饰酶的全局性底物新方法。通过整合酰基化修饰调控酶的催化机制及在酶活性口袋中定点引入的赖氨酸残基选择性交联的非天然氨基酸,研究人员实现了对多种原核系统的赖氨酸修饰调控酶和真核系统的赖氨酸修饰调控酶......阅读全文
皮肤干细胞端粒酶的调控
端粒酶的调控正常动物体细胞中端粒酶处于静止状态;而在干细胞中,端粒酶RNA表达较高,端粒酶处于活化状态,随着干细胞的分化,端粒酶活性逐渐降低,至终末分化细胞已检测不出端粒酶活性。缺乏端粒酶的小鼠到第六代时出现了脱毛、伤口上皮再生障碍、造血干细胞再生受阻等异常,表明端粒酶水平的高低直接影响上皮干细胞的
乙酰胆碱对酶活性的调控
乙酰胆碱在植物中的作用机理除参与调节膜对离子的通透性外,可能还涉及对植物体内某些酶活性的调控。乙酰胆碱对兵豆(Lens culinaris)根生长的抑制作用与体内过氧化物同工酶的活性变化密切相关,它可以刺激某些同工酶的活性而抑制另外一些同工酶的活性。 乙酰胆碱本身对于植物体内苯丙氨酸氨基裂解酶
蛋白水解酶的调控作用
体内很多重要的生理效应与蛋白酶的生物调控有关,如表中所列,当机体受到外界刺激作出相应的生理反应时就动员体内蛋白酶使原来不具有生理活性的某些多肽或蛋白质,迅速成为功能很强的相应产物,从而达到机体的防御、生存与繁殖的目的。有的动员过程较简单,可通过一次催化反应来完成。如胃肠道中无活性的胰蛋白酶原当其
m6A修饰在头颈鳞癌免疫微环境调控中的作用机制
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是RNA上丰度最高的修饰方式,属于转录后调控的重要机制,在各种生理和病理条件下发挥着关键作用,也给疾病治疗提供了崭新的靶点。然而,m6A在头颈鳞癌中的修饰状态以及作用模式尚不清楚。2022年4月,张志愿院士/何悦教授团队在肿瘤学权威期刊《分子癌症》(IF=41)在线发表题
遗传发育所细胞壁乙酰化修饰调控机制研究获进展
细胞壁是植物细胞特征性结构之一,不仅在形态建成、器官发育及信号传导中发挥重要作用,还是植物直立生长、营养运输、抵抗病虫害及适应逆境的物质基础。此外,细胞壁构成地球上最丰富的可再生资源,为人们提供赖以生存的食物、日常用品、建筑材料和工业原料等。 乙酰化是一种广泛存在于植物细胞壁上的修饰形式,介导
6mA甲基化修饰调控工业微藻油脂合成过程揭示
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初级生产力中贡献卓著,是颇有前景的合成生物学底盘细胞。为了探索工业固碳产油微藻的表观遗传机制和生理作用,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以海洋微拟球藻为模式,解析了野生型和6mA扰动突变株中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,6
我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控
近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。 CpG岛是指基
我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控
近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。 CpG岛是指基
可逆蛋白质修饰调控植物发育与免疫平衡机制获揭示
在国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的资助下,华南师范大学生命科学学院教授阳成伟/赖建彬团队研究揭示了BON1蛋白的可逆棕榈酰化修饰通过影响细胞内吞作用调控植物发育与免疫平衡的机制。10月10日,相关成果发表于《分子植物》(Molecular Plant)。面对自然界中病原体的侵袭,植物已进
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期,小编将为大家带来一篇1
植物所发现蛋白质SUMO化修饰调控植物的光形态建成
光形态建成是指植物发育过程中感受到光的存在之后所启动的一系列生物学变化过程。COP1作为一种泛素E3连接酶,在光形态建成的负调控中扮演核心角色。在黑暗下,COP1聚集在细胞核中并介导光形态建成的多个正向调节因子的泛素化修饰及降解;见光后,COP1活性降低,从而保证正常的光形态建成。然而,COP1
α微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果,以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons
种康院士团队揭示植物糖基化修饰调控开花新机制
蛋白质糖基化是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式,在复杂的生命活动中扮演重要角色。常见的糖基化,如N-糖基化和O-糖基化,蛋白质一般会被修饰上结构复杂的糖链。 然而,生物体中还存在一种常见但比较特殊的糖基化,它仅在蛋白质上修饰一个单糖。在此修饰中,N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)通过O-糖苷键连
我国首次发现RNA甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟
我国科研人员在国际上首次发现脊椎动物的配子成熟需要甲基转移酶mettl3催化的m6A甲基化修饰,从而揭开了该甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟这一此前尚未为人所知的秘密。(2018(第二届)模式动物与重大疾病动物模型研究与应用研讨会) 记者13日从中国科学院水生生物研究所了解到,该所科研人员以模
中山大学发现m6A修饰调控细胞自噬重要机制
中山大学生命科学学院崔隽和任间课题组研究发现,m6A去甲基化酶FTO能够去除自噬相关基因修饰,抑制ULK1的降解,从而促进细胞自噬流的进程。相关研究近日发表在《细胞研究》上。 细胞自噬是通过真核细胞内形成双层膜包裹细胞质组分的自噬小体,捕获包括毒性的蛋白聚集物、功能失常和不再需要的细胞器以及侵
NLRP3磷酸化修饰与炎症小体通路激活的调控机制
9月21日,Molecular Cell在线发表了国家生物医学分析中心李涛研究员和周涛研究员合作的题为“NLRP3 phosphorylation is an essential priming event for inflammasome activation”的最新研究成果。该文报道了磷
染色质修饰如何调控基因表达?-中国学者提出新见解
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心的研究人员最新发表两篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遗传、组学及结构生物学等研究方法,分别揭示了植物特有染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的SHL和EBS形成BAH-EMF1复合体而介导植物基因沉默
揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院
Cell子刊:报道poly(A)化修饰对能量稳态调控的关键作用
任职于上交大医学院附属一院临床转化研究院的单佩佩、范广建和孙莲慧三位博士为论文第一作者,王传贵教授和张胜萍副研究员是这篇论文的通讯作者。 该论文不仅首次论证了poly(A)化可作为一个标签,实现真核细胞蛋白质合成的整体把控,而且首次把RNA转运引入到能量代谢稳态调控领域,为能量代谢紊乱相关疾病
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛
Protein-Cell:病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控
天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线,在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰(non-hi
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期,小编将为大家带来一篇
α微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果,以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons
揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究获进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN
SUMO化修饰通过调控相分离影响DNA修复和肿瘤耐药的机制
DNA作为遗传信息的主要载体,其结构的完整与功能的完善对于维持基因组的稳定性和保障生命体正常生理活动具有重要意义。不同类型的DNA损伤修复对于维持基因组稳定性至关重要,针对最严重的DNA双链断裂损伤(DSB),细胞主要通过非同源末端连接(NHEJ)与同源末端重组(HR)进行修复。 泛素E3连接
谢旗研究组发表泛素化修饰调控植物低磷胁迫响应的综述
磷是植物生长发育必需的大量元素之一,土壤中低磷胁迫会影响植物的生长并影响作物的产量。我国是世界上磷肥使用量最大的国家,施用磷肥在提高作物产量的同时也带来了一系列环境污染问题。因此,解析植物对低磷胁迫的响应机制并培育磷高效利用的作物是作物育种上的一个重要研究方向。 泛素化修饰是一种重要的蛋白质翻
内质网膜修饰的杂化纳米复合物调控siRNA胞内命运
权威国际期刊Nature Communications(IF="11.965)在线发表了北京大学中国天然药物及仿生药物国家重点实验室王坚成教授团队的最新研究成果“Regulating Intracellular Fate of siRNA by Endoplasmic Reticulum Mem
OGlcNAc糖基化修饰SNAP29调控自噬小体的成熟
中科院生物物理所张宏研究组最近在《Nature Cell Biology》杂志上发表题为O-GlcNAc-modification of ?SNAP-29 regulates autophagosome maturation的文章介绍了他们关于O-GlcNAc糖基化修饰SNAP-29并调控自噬小
赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能调控作用中期总结召开
7月29日,科技部重大科学研究计划“赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能的调控作用”项目中期总结会议在中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所学术报告厅召开。会议由项目首席科学家、健康所研究员秦樾主持。科技部基础研究管理中心朱庆平副处长和健康所主持工作的副所长孔祥银研究员出席会议并讲话。 孔祥银