Science解开古老的遗传谜题
在中世纪的末期麻风的发病率为何会突然下降?为了解答这一问题,生物学家和考古学家们从经历几个世纪的人类古老坟墓中挖掘出了导致这一疾病的中世纪病原体菌株,对其基因组进行了重建,由此阐明了这一含糊不清的历史时期,并提出了了解流行病的一些新方法。他们的研究结果发表在6月13日的《科学》(Science)。 麻风在中世纪的欧洲是一种常见的疾病。麻风的阴霾至今仍牢牢扎根在我们的集体记忆之中:一个人用粗布裹身,在街上摇着铃向世人告知他的到来。这种景象并非是毫无依据的。据估计,当时在某些地区每30人中就有近乎1人感染这种疾病。 然而在16世纪之交,这一疾病突然从大多数的陆地上退去。这一事件非常的突然,且令人费解。难道是引起麻风的病原体进化到了一种危害较小的形式?为了寻找答案,生物学家和考古学家们联合组成了一个国际研究小组。他们通过挖掘中世纪坟墓中埋藏的人类遗骸,采集并繁殖麻风的致病菌,由此破译了来自5种麻风分枝杆菌菌株近乎完整的......阅读全文
PNAS:全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染
最近,发表在PNAS的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。 该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早期发现和遏
全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染情况
最近,发表在《PNAS》杂志上的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。 该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早
应用基因组学的诊断方法-识别严重传染病爆发中的微生物
芝加哥 – 据4月10日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究披露;在一项用宏基因组学(对从复杂的微生物样品中提取的DNA进行直接测序)对2011年德国产志贺毒素型大肠杆菌爆发所做的分析中,研究人员成功地对一个疾病爆发菌株的基因组序列进行了重建;这些结果表明用这种方法具有比基于细菌培养的方法更快识
FDA斥资17000万购Illumina测序仪检测病原体
美国FDA采购Illumina公司1700万美元MiSeq测序仪及试剂用于病原体检测 2012年9月18日,来自美国圣地亚哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司(纳斯达克代码:ILMN)今天宣布,它赢得了一份来自美国食品药品监督管理局(FDA)的合同,为该机构提供MiSe
4种松露遗传路径与基因组公布
科学家公布了4个松露物种的遗传路径及基因组。这是为期5年的“1000种菌物全基因组测序计划”的一部分,该计划将填补我们对生命树最大分支之一的认识空白。 松露对生长环境的要求极其苛刻,且无法人工培育,产量稀少。它其实是生长在植物根部真菌的长满孢子的子实体,能形成松露的真菌种类,已经独立演化了一百
全基因组测序揭示蒙古族遗传结构
内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。 历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响
全基因组测序揭示蒙古族遗传结构
内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。 历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响其他
4种松露遗传路径与基因组公布
英国《自然·生态与演化》杂志14日在线发表的一篇论文中,科学家公布了4个松露物种的遗传路径及基因组。这是为期5年的“1000种菌物全基因组测序计划”的一部分,该计划将填补我们对生命树最大分支之一的认识空白。 松露对生长环境的要求极其苛刻,且无法人工培育,产量稀少。它其实是生长在植物根部真菌的
遗传学大牛Science发现基因组新奥秘
来自斯坦福大学,霍德华休斯医学院的一组研究人员发现,当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候,通常这些基因会丢失,但如果能被留下来(也就成为了多余基因),就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论,而在哺乳动物中受到保护。 这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦
著名遗传学家:用CRISPR重塑基因组
美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项研究显示,用CRISPR/Cas9修饰垃圾DNA中的一个碱基,会改变基因组大量片段的折叠方式。这意味着CRISPR/Cas9有望用于治疗以基因组错误折叠为特征的疾病。 “实施靶向性手术可以重塑人类基因组,精确控制其折叠形式,”文章的通讯作者,Baylo
科学家在细菌和真菌这类微生物耐药性中发现新机制
图显示了从药物敏感酵母菌落中新发现的药物耐药性。 细菌和真菌这类微生物,可以通过基因突变来抵挡抗菌素或抗真菌剂等药物的“攻击”,这些永久的突变一度被认为是耐药菌株发展进化的唯一途径。现在,一项新的研究成果认为,微生物可以通过对药物靶点进行“暂时静默”来获得抗药功能给其带来的好处,这种行为被称为“表
水稻与白叶枯病菌之间的“军备竞赛”
近日,中国农业科学院作物科学研究所水稻分子设计技术与应用创新团队揭示了水稻与白叶枯病菌相互适应的遗传机制,为作物与其病原菌的共适应模式和相关机制研究提供了新线索。研究成果发表于《植物细胞》(The Plant Cell)。 寄主植物与其病原物之间的协同进化是一个动态过程,涉及相互作用物种间的互
Nat-Micro:真菌生物膜结构影响肺病发生
近日,达特茅斯医学院的研究人员发表在《自然微生物学》上的一项研究揭示了人类真菌病原体形成菌落的方式,以及对病原体致病能力的影响。 通过形成“生物膜”结构,烟曲霉能够在严苛的条件下生长和繁殖,从而对患者的肺部造成感染。“对于健康人来说,由于我们的免疫系统十分完备,使我们能够抵抗环境中的真菌,因此
标准储备菌株的制备
标准储备菌株是标准菌株经过一次传代后制备的多份相同的菌株。 将检查完纯度的复活后的培养物制备成菌悬液,液体选用TSB、兔血或脱脂牛奶,加入甘油,使甘油终浓度10%~15%。将菌悬液分装到多个无菌、带螺旋盖的塑料小管中。标准储备菌株要制备多份,然后先在0℃~4℃冰箱中预冷30min,再在-25℃
小菌株酝酿大产业
近年来,一家英国公司和一家中国公司频繁到访中国科学院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所),他们有一个共同的目标——枯草芽胞杆菌HF1。 日前,枯草芽胞杆菌HF1成果研发及转化项目负责人、遗传发育所分子农业中心研究员胡赞民和高级工程师陈宇红在接受《中国科学报》记者采访时,解释了被两家企业
常用微生物菌株
常用微生物菌株 /质控菌株/对照菌株 菌种编号菌种名称菌种编号菌种名称ATCC 16404黑曲霉CMCC(B) 51105痢疾志贺氏菌CMCC(F) 98003黑曲霉CMCC(B) 51572福氏志贺氏菌As 3.2788桔青霉CMCC(B) 51592宋氏志贺氏菌MIG3.104绳状青霉ATCC
简述菌株的保存使用
1、新引进的菌种经形态、染色、培养性状、生化特性等的鉴别确定后作记录,并进行保存。 2、长期保存的储存菌株以冷冻干燥保藏为主,特殊要求的菌种可用其它方法进行保存,保存期可长达几年至几十年。 3、半储存菌株以含20%甘油的肉汤或液体石腊封存的半固体琼脂为主,在0℃以下保存,保存期为3-6个月。
取用菌株时操作原则
菌种保存复苏的原则,要求慢冻快融,之所以要求快速,是因为在菌种复苏的过程中, 长时间的溶解过程会对所保存的菌种造成损伤,建议遵循菌种的保存复苏原则,保证所复苏菌种的复苏率。
菌株原理及保存方法
菌株原理:耐药菌株是指在长期的抗生素选择之后出现的对相应抗生素产生耐受能力的菌株。细菌的耐药性,是指细菌多次与药物接触后,对药物的敏感性减小甚至消失,致使药物对耐药菌的疗效降低甚至无效。耐药菌株的出现增加了感染性疾病治愈的难度,并迫使人类寻找新的对抗微生物感染的方法。菌株保存使用:1、新引进的菌种经
常用微生物菌株
常用微生物菌株 /质控菌株/对照菌株 菌种编号菌种名称菌种编号菌种名称ATCC 16404黑曲霉CMCC(B) 51105痢疾志贺氏菌CMCC(F) 98003黑曲霉CMCC(B) 51572福氏志贺氏菌As 3.2788桔青霉CMCC(B) 51592宋氏志贺氏菌MIG3.104绳状青霉ATCC
关于益生菌菌株的不同
益生菌产品都是以菌株为主,一些益生菌产品选用一种菌株,而更多益生菌产品则会添加几种菌株混合,以叠加产品功效。 益生菌菌株,多来自动物体内,如两歧双岐杆菌、鼠李糖杆菌,瑞士乳杆菌、植物乳杆菌等等。 两歧双歧杆菌,是人体自出生就产生的,具有较高稳定性,有助提高钙铁磷的利用率,舒缓腹泻便秘,抑制有
关于菌株的分类介绍
菌株又称品系,表示任何由一个独立分离的单细胞(即单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其后代。因此,一种微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。根据菌株的定义,菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志,一旦菌株发生变异,均应标上新的菌株名称。当进行菌种保藏、筛选或科学研究时,在
研究发现老鼠可能是致命疾病的传播者
悄然穿梭在城市街区之间的老鼠,很可能是致命疾病的传播者。美国塔夫茨大学的一项为期六年的研究显示,不同地区的老鼠群体携带着各自独特的钩端螺旋体菌株,当老鼠迁徙时,这些致命细菌也随之扩散,并通过老鼠尿液污染环境后间接感染人类。相关研究成果近日发表在《科学公共图书馆-被忽视的热带病》。捕获疾病传播链钩端螺
Sanger采用SMRT测序技术获得-NCTC-3,000株细菌基因组图谱
英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作,其中包括一些世界上最危险的细菌,如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA,研究人员能够更好地了解细菌
猪的沙门氏菌或源自人类
猪很可怜,不仅成为食物进人类的肚子,我们还指责它在2012年给人类带来了“猪流感”(研究显示,猪流感病毒也是一种冠状病毒)。此外,猪还是沙门氏菌的宿主,这种细菌可以进入人体并引起肠胃不适和伤寒。 不过,现在看来,几千年前似乎是人类首先感染了沙门氏菌,而后又将其传染给了无辜的猪。 据《科学》报
肺炎致病菌可快速“改头换面”
最新研究显示,引起肺炎和脑膜炎的细菌会非常快速地改头换面,灵敏地产生对抗菌素和疫苗的抵抗力。古往今来,肺炎链球菌一直是造成人类死亡的一个主要原因。出现在全世界的肺炎链球菌西班牙23F菌株是一个对多种抗菌素有抵抗力的特别棘手的菌株。幸运地是,这一世系的菌株分离物自1984年以来已经在全世界多个地点被收
死神的无声低语:英国在人类遗址中发现四千年前鼠疫DNA
在一项重大发现中,来自弗朗西斯-克里克研究所的研究人员与牛津大学、莱文斯地方历史小组以及韦尔斯和门迪普博物馆合作,发现了迄今为止英国最古老的鼠疫证据。该小组在萨默塞特和坎布里亚的人类遗骸中发现了三个4000年前的鼠疫耶尔森氏菌(导致鼠疫的细菌)病例。弗朗西斯-克里克研究所的研究人员在今天(5月30日
测序技术助力国家致病菌识别网对细菌性传染病的监测
近期,国家疾控传染病防控领域的专家在China CDC Weekly杂志发表国家致病菌识别网(China Pin)专题系列文章,通过六篇分析文章和应用报告,系统介绍了国家致病菌识别网的功能和使命。其中高通量测序技术对于识别网的功能实现,发挥了非常重要的作用。中国疾控中心传染病预防控制所阚飙所长在专刊
新测序技术将加快植物抗病育种
最近,英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室(TSL)和基因组分析中心(TGAC)的一个科学家小组,开发出一种新方法,可加速植物抗病基因的分离。该研究小组也在龙葵(Solanum americanum,马铃薯的一个野生近缘种)中发现了一个全新的枯萎病抗性基因。 植物病原体(如晚疫病)能够快速进化以战胜宿
新测序技术将加快植物抗病育种
最近,英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室(TSL)和基因组分析中心(TGAC)的一个科学家小组,开发出一种新方法,可加速植物抗病基因的分离。该研究小组也在龙葵(Solanum americanum,马铃薯的一个野生近缘种)中发现了一个全新的枯萎病抗性基因。 植物病原体(如晚疫病)能够快速进化以战胜宿