Science解开古老的遗传谜题
在中世纪的末期麻风的发病率为何会突然下降?为了解答这一问题,生物学家和考古学家们从经历几个世纪的人类古老坟墓中挖掘出了导致这一疾病的中世纪病原体菌株,对其基因组进行了重建,由此阐明了这一含糊不清的历史时期,并提出了了解流行病的一些新方法。他们的研究结果发表在6月13日的《科学》(Science)。 麻风在中世纪的欧洲是一种常见的疾病。麻风的阴霾至今仍牢牢扎根在我们的集体记忆之中:一个人用粗布裹身,在街上摇着铃向世人告知他的到来。这种景象并非是毫无依据的。据估计,当时在某些地区每30人中就有近乎1人感染这种疾病。 然而在16世纪之交,这一疾病突然从大多数的陆地上退去。这一事件非常的突然,且令人费解。难道是引起麻风的病原体进化到了一种危害较小的形式?为了寻找答案,生物学家和考古学家们联合组成了一个国际研究小组。他们通过挖掘中世纪坟墓中埋藏的人类遗骸,采集并繁殖麻风的致病菌,由此破译了来自5种麻风分枝杆菌菌株近乎完整的......阅读全文
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有
《PLoS病原体》:一致命隐球菌菌株在北美扩散
隐球菌通常只感染免疫力低下者,这种菌株似乎对其他人也有威胁 美国研究人员4月22日公布研究报告称,一种致命隐球菌菌株正在美国西北地区以及加拿大不列颠哥伦比亚省扩散。 研究人员表示,隐球菌通常只感染器官移植者、艾滋病患者等免疫力低下人群,但在北美传播的这种新菌株与之不同。
遗传分析揭示出食肉细菌病原体的进化
科研人员确定了把一种温和的微生物变成导致坏死性筋膜炎的病原体的进化路径。尽管已经进行了数十年的研究,流行病为人类健康带来了相当大的威胁,这部分是由于科研人员一直无法确定把一些微生物变成有毒力的病原体的关键分子事件的本质与时间安排。 James Musser及其同事把焦点放在了一种
苏州大学医学院周哲敏教授为中国疾控中心作学术报告
2023年12月13日,应中国疾控中心传染病所的邀请,苏州大学医学院周哲敏教授作了题为“基于遗传大数据的流行病主动防御技术研究”的科技学术报告,重点是微生物群体遗传学、生物信息学及微生物组学等领域的最新成果和创新方法,中心总部和相关直属单位的科研人员、研究生等参加学术活动。 周教授长期从事微生
Science:抵抗病原体的通用遗传学策略
平衡选择(balancing selection)能够在种群中维持遗传学多样性,而不是仅选择一个最有利的基因型。芝加哥大学和牛津大学的科学家对人类和猩猩进行了全基因组分析,找到了进化过程中平衡选择的新实例。他们发现,在至少六个基因组区域中,人类和猩猩共享着同样的基因突变组合。文章发表在二月十
成都生物所完成脱落酸高产菌株全基因组测序
3月8日,从中科院成都生物研究所科技处获悉,在上海人类基因组研究中心的协作下,该所完成了脱落酸高产菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因组测序及分析工作。 B. cinereaTBC-A是成都生物所经过多年改良筛选及系统研发的、具有自主知识产权
Science解开古老的遗传谜题
在中世纪的末期麻风的发病率为何会突然下降?为了解答这一问题,生物学家和考古学家们从经历几个世纪的人类古老坟墓中挖掘出了导致这一疾病的中世纪病原体菌株,对其基因组进行了重建,由此阐明了这一含糊不清的历史时期,并提出了了解流行病的一些新方法。他们的研究结果发表在6月13日的《科学》(Science)
水稻和白叶枯病菌相互适应的遗传机制被揭开
宿主植物与其病原体之间的共同进化可以最好地定义为一个动态过程,该过程涉及相互作用物种的互惠和适应性遗传变化。在现代农业系统中,作物与其许多病原体之间的关系通常以更极端的军备竞赛案例为代表,这些案例由经典的基因对基因理论遗传控制,并由基准“之字形模型”很好地解释植物免疫系统(PLOS PATHOG
《Genome-Research》:根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型,与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性,破坏宿主细胞膜和粘附的能力,粘附到人体组织的能力,是许多细菌病原体的主要毒力因子,包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,自从上世纪40
小麦病害全球传播令科学家担忧
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498340.shtm 一株感染瘟病的小麦(左)与一株健康小麦进行对比。图片来源:Nature and Science/Alamy科学家警告说,一种威胁南美洲小麦生产的真菌病原体即将向全球传播。4月
Nature子刊:细菌之间的遗传物质交换引发疾病大爆发
近日,一项新研究首次向人们揭示了,细菌间相互交换遗传物质的能力是如何直接影响全球重要传染病的出现和传播的。DOI:10.1038/s41467-018-03949-8 相关成果于4月13日以“Horizontal antimicrobial resistance transfer drives
菌株的分类
菌株又称 品系,表示任何由一个独立分离的单细胞(即单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其后代。因此,一 种 微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。根据菌株的定义,菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志,一旦菌株发生 变异,均应标上新的菌株名称。当进行 菌种保藏、筛选或科学
什么是菌株
菌株又称品系,表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其后代。因此,一种微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。根据菌株的定义,菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志,一旦菌株发生变异,均应标上新的菌株名称。当进行菌种保藏、筛选或科学研究时,在
线粒体基因组遗传表现出典型的母系遗传特点
只有女性患者可将致病基因传递给后代,而后代无论男女均可发病。而患病男性不能向下传递致病突变。线粒体病具有量效现象,即小量的线粒体DNA突变可能不出现临床症状,随着突变线粒体比例增高,出现临床表现,且临床严重程度可能和突变比例成正相关。精子的线粒体外膜上存在有泛素,当精子进入卵子后,受精卵以一种主
揭开面包小麦基因组的遗传蓝图
美国马里兰州伯赛大,2014年7月18日 国际小麦基因组测序协作组织今日在国际知名杂志《科学》上公布了普通小麦的基因组草图。作为世界上种植最广泛的谷物作物,这份基于单条染色体而绘制的基因组草图为揭示其复杂而庞大的基因组之结构、组织及进化特征提供了新的视角。 对于植物科学研究者和育种家来说,这份
科学家发现霍乱的生存策略
骗子:霍乱弧菌持续交换基因从而确保生存机会 霍乱弧菌具有进化成更健壮形式的能力的秘密已经被首次对过去一个世纪收集的霍乱菌株进行遗传比较的科学家揭示出来。 这组科学家比较了23个霍乱菌株,并证明了这种细菌的秘密技巧在于继续交换与混合基因。他们在本周(8月31日)的《美国科学院学报》
将菌株反复冻存,到底对菌株有什么影响?
低温会使菌株细胞内的水分形成冰晶,从而引起细胞结构尤其是细胞膜的损伤。细胞体积大者一般要比较小者对低温更为敏感,而无细胞壁者则比有细胞壁者敏感。如果放到低温(不是一般冰箱)进行冷冻时,会产生冰晶,冰晶呈针状,极易导致细菌的严重损伤。用电镜观察,可见细菌的核膜上有大量针尖样小孔,当从低温下移出并开始升
宏基因组测序技术助力腹泻暴发调查中病原体识别
腹泻病一直是世界范围内主要流行和重要的致死性疾病之一,同时也是导致5岁以下儿童死亡和营养不良的第二大原因。不论在发达国家还是发展中国家,病原体导致的腹泻是食品安全最主要的问题、以及人群健康的重要威胁。另外,虽然人类医学条件得到了极大的提升,但因为腹泻发病率高、病原体耐药率高,使腹泻病的治疗和防控
怎样做好质控菌株
一.建立信心:首先要自信,渊博的知识和丰富的经验是必需的,但如果是初次操作,也不要惊慌失措,就把质控当作一份普通的标本对待,鉴定可严格按照科-属-种的思路,药敏严格按照新的CLSI/NCCLS进行.(这就要求大家平常就要重视专业知识的学习和经验的积累.)做错了没关系,谁都有第一次,谁都不能保证永远正
菌株的保藏方法
1、传代保存法:有些微生物当遇到冷冻或干燥等处理时,会很快死亡,因此在这种情况下,只能求助于传代培养保存法。传代培养就是要定期地进行菌种转接、培养后再保存,它是最基本的微生物保存法,例如酸奶等常用生产菌种的保存。传代保存时,培养基的浓度不宜过高,营养成分不宜过于丰富,尤其是碳水化合物的浓度应在可能的
菌株的保藏方法
1、传代保存法:有些微生物当遇到冷冻或干燥等处理时,会很快死亡,因此在这种情况下,只能求助于传代培养保存法。传代培养就是要定期地进行菌种转接、培养后再保存,它是最基本的微生物保存法,例如酸奶等常用生产菌种的保存。传代保存时,培养基的浓度不宜过高,营养成分不宜过于丰富,尤其是碳水化合物的浓度应在可能的
标准菌株怎样保存
可使用冻干保藏、利用多孔小珠(磁珠)在-70℃保藏或使用液氮保藏等方法。菌株不同保藏方法也不尽相同,应根据文献资料选择最佳保藏方法。对于从标准菌种冷藏中心或经ISO9000 质量管理体系认证或其它有效的认证的商业机构获得原包装的质控菌株,复苏和使用应按照制造商提供的使用说明进行。
菌株的保存使用
1、新引进的 菌种经形态、染色、培养性状、生化特性等的鉴别确定后作记录,并进行保存。 2、长期保存的储存菌株以 冷冻干燥保藏为主, 特殊要求的菌种可用其它方法进行保存,保存期可长达几年至几十年。 3、半储存菌株以含20%甘油的肉汤或液体 石腊封存的半固体琼脂为主,在0℃以下保存,保存期为3-
什么是标准菌株?
亦称模式菌株 。在给某细菌定名,分类作记载和发表时,为了使定名准确和作为分类概念的准则,以纯粹活菌(可繁殖)状态所保存的菌种。相当于动植物分类中的模式标本。在进行细菌等的分类和鉴定时,生理学和生物化学特性十分重要,但若就这些性质进行试验,就必须应用许多纯分离的新细胞。因此,作为分类标准的菌种,也有必
细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)
· Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are
PNAS:比较基因组分析揭示熊猫遗传奥秘
中国科学院动物研究所的魏辅文研究员长期从事濒危动物保护生物学研究,是大熊猫和小熊猫保护生态学等领域的权威科学家,2006年有关大熊猫分子生态学的研究成果曾入选了年度美国Discover杂志12大生物科技新闻,去年其研究组还在Science上发文揭示大熊猫维持异常低能量代谢的机制。最新一期的《美国
Sanger研究所测序3,000种危险细菌
对于人类而言,细菌扮演着多重角色,有时是亲密的伙伴,有时是致命的敌人。英国著名的Wellcome Sanger研究所近日与Pacific Biosciences(PacBio)合作,测序了3,000多种细菌的基因组,其中包括一些世界上最危险的细菌。 这些细菌是由英国国家菌种保藏中心(NCTC
基因测序让科学家解码历史上的致命疾病
中世纪,一个侍者在清洗麻风病患者的褥疮。 利用新方法,研究人员分析了提取自受害者骨头和牙齿的历经数世纪之久的病原体。 去年8月,Johannes Krause进行了一个鲜有人尝试的“壮举”:他对一具700年历史的人体骸骨进行了遗传尸检。Krause从一个死于14世纪丹麦麻风病人隔离区
-基因测序让科学家解码历史上的致命疾病
利用新方法,研究人员分析了提取自受害者骨头和牙齿的历经数世纪之久的病原体。 去年8月,Johannes Krause进行了一个鲜有人尝试的“壮举”:他对一具700年历史的人体骸骨进行了遗传尸检。Krause从一个死于14世纪丹麦麻风病人隔离区的年轻女性牙齿中提取了DNA,并计算了来自细菌、污染
古老DNA追溯黑死病起源
一项对古代基因组的研究显示,14世纪在现在的吉尔吉斯斯坦暴发的一场瘟疫中,许多人死于引起鼠疫的耶尔森氏菌菌株,该菌株产生的病原体在几年后又导致了黑死病。 “这就像找到了所有菌株聚集的地方。”该研究的共同负责人、德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的古遗传学家Johannes Kraus