天津工生所发布反应酶挖掘与评估平台
在代谢路径设计领域，寻找能够催化非天然反应的候选酶是具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶，但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面存在不足，难以有效帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。 近日，中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了集成的反应酶挖掘与评估平台——REME（https://reme.biodesign.ac.cn）。该平台结合底物原子到产物原子映射、原子类型变化识别和反应相似性计算，实现了相似反应的计算、快速排序和可视化。用户可以根据功能基团筛选相似反应，并进一步通过酶号或序列同源性筛选或扩展候选酶。REME平台结合多种人工智能方法对候选酶进行多角度评估，帮助科研人员迅速识别潜在酶。REME平台为非天然反应的酶挖掘和评估提供了新的解决方案。 相关研究成果发表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。研究工作得到国家自然科学基金、中国科学院战略性先......阅读全文
天津工生所发布反应酶挖掘与评估平台
在代谢路径设计领域，寻找能够催化非天然反应的候选酶是具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶，但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面存在不足，难以有效帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。 近日，中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了集成的反应酶挖掘与评估平
酶促反应的反应特点
一、酶促反应具有极高的效率二、酶促反应具有高度的特异性酶的特异性是指酶对底物的选择性，有以下三种类型：1.绝对特异性 酶只作用于特定结构的底物，生成一种特定结构的产物。如淀粉酶只作用淀粉。2.相对特异性 酶可作用于一类化合物或一种化学键。例如磷酸酶可作用于所有含磷酸酯键的化合物。3.立体异构特异性
挖掘玉米“高产基因”
玉米的单株产量由玉米的每穗籽粒数目和穗粒重共同决定，挖掘控制玉米产量的“高产基因”，解析穗行数调控网络，可使玉米单产得到大幅度提高，对保障国家粮食安全有重大价值和现实意义。在国家自然科学基金重大研究计划“主要农作物产量性状的遗传调控网络解析”支持下，在山东农业大学教授张宪省等责任专家指导下，研究人员
双酶切反应
双酶切buffer的选择： 1、U ：Supplied with its own unique reaction buffer that is different from the four standard NEBuffers. Its compatibility with the fou
酶的反应特点
1 高效性：酶的催化效率比无机催化剂更高，使得反应速率更快；2 专一性：一种酶只能催化一种或一类底物，如蛋白酶只能催化蛋白质水解成多肽；3多样性：酶的种类很多，迄今为止已发现约4000多种酶，在生物体中的酶远远大于这个数量；4 温和性：是指酶所催化的化学反应一般是在较温和的条件下进行的；5 活性可调
酶切反应建议
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则，即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常，一个50μl的反应体系中，1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶，则可相应缩短反应时间；如果减少酶
DNA酶切反应
一、 DNA 酶切反应1、将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号，用微量移液枪分别加入DNA 1μg和相应的限制性内切酶反应10×缓冲液2μl，再加入重蒸水使总体积为19μl，将管内溶液混匀后加入1μl酶液，用手指轻弹管壁使溶液混匀，也可用微量离心机甩一下，使溶液集中在管
酶切反应心得
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则，即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常，一个50μl的反应体系中，1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶，则可相应缩短反应时间；如果减少酶的用
双酶切反应酶活性分析
同步双酶切是一种省时省力的常用方法。选择能让两种酶同时作用的最佳缓冲液是非常重要的一步。NEB每一种酶都随酶提供相应的最佳NEBuffer，以保证100%的酶活性。NEBuffer的组成及内切酶在不同缓冲液中的活性见《内切酶在不同缓冲液里的活性表》及每支酶的说明书。能在最大程度上保证两种酶活性的缓冲
聚合酶链反应PCR反应体系
PCR是20世纪80年代由美国西特斯公司的一批科学家、技术人员和商人发明的，主要发明者凯利·穆利斯（Kary Mullis）因此获得了1993年的诺贝尔化学奖。其他科学家和技术人员，包括厄立克（Henry Erlieh）、安海姆（Norman Arnheim）、才木（Ran—daliSaiki）、霍
聚合酶链反应的反应特点
特异性强PCR反应的特异性决定因素为：①引物与模板DNA特异正确的结合；②碱基配对原则；③Taq DNA聚合酶合成反应的忠实性；④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性，使反应中模
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
酶促反应的定义
酶促反应（Enzyme catalysis）又称酶催化或酵素催化作用，指的是由酶作为催化剂进行催化的化学反应。
酶促反应的特点
特点1、酶促反应具有极高的效率2、酶促反应具有高度的特异性酶的特异性是指酶对底物的选择性，有以下三种类型：（1）绝对特异性酶只作用于特定结构的底物，生成一种特定结构的产物。如淀粉酶只作用淀粉。（2）相对特异性酶可作用于一类化合物或一种化学键。例如磷酸酶可作用于所有含磷酸酯键的化合物。（3）立体异构特
什么是酶促反应？
酶促反应（Enzyme catalysis）又称酶催化或酵素催化作用，指的是由酶作为催化剂催化进行的化学反应。
酶促反应的概念
由酶催化发生的化学反应。
什么是酶促反应？
酶促反应（Enzyme catalysis）又称酶催化或酵素催化作用，指的是由酶作为催化剂进行催化的化学反应。生物体内的化学反应绝大多数属于酶促反应。酶作为一种生物催化剂在催化一个化学反应时，既具有一般的催化剂的特征，又具有不同于一般催化剂的特殊性。
影响酶反应的因素
酶反应动力学主要研究酶催化反应的过程与速率，以及各种影响酶催化速率的因素，定量时的观察对象是总单位时间内底物的减少或产物增加的量。影响酶作用的因素包括底物的浓度、酶反应的最适pH、最适温度、酶的抑制作用，另外还包括试剂中表面活性剂的作用等因素。
酶电极的反应机理
酶电极是将- 种或一种以上的生物酶涂布在通常的离子选择性电极的敏感膜上，通过酶的催化作用,试液中待测物向酶膜扩散，并与酶层接触发生酶催化反应，引起待测物质活度发生变化,被电极响应;或使待测物产生能被该电极响应的离子,间接测定该物质。如尿素酶电极是以NH3 电极为指示电极，把脲酶固定在NH3电极的敏感
酶促反应的概念
酶促反应（Enzyme catalysis）又称酶催化或酵素催化作用，指的是由酶作为催化剂进行催化的化学反应。生物体内的化学反应绝大多数属于酶促反应。酶作为一种生物催化剂在催化一个化学反应时，既具有一般的催化剂的特征，又具有不同于一般催化剂的特殊性。
酶催化的反应简介
酶是一种具有特异性的高效生物催化剂,绝大多数的酶是活细胞产生的蛋白质。酶的催化条件温和,在常温、常压下即可进行。酶催化的反应称为酶促反应,要比相应的非催化反应快103-107倍。酶促反应动力学简称酶动力学,主要研究酶促反应的速度和底物(即反应物)浓度以及其他因素的关系。在底物浓度很低时酶促反应是一级
酶的反应特点介绍
1 高效性:酶的催化效率比无机催化剂更高，使得反应速率更快;2 专一性:一种酶只能催化一种或一类底物，如蛋白酶只能催化蛋白质水解成多肽;3多样性:酶的种类很多，迄今为止已发现约4000多种酶，在生物体中的酶远远大于这个数量;4 温和性:是指酶所催化的化学反应一般是在较温和的条件下进行的;5 活性可调
酶的反应特点介绍
1 高效性:酶的催化效率比无机催化剂更高,使得反应速率更快;2 专一性:一种酶只能催化一种或一类底物,如蛋白酶只能催化蛋白质水解成多肽;3多样性:酶的种类很多,迄今为止已发现约4000多种酶,在生物体中的酶远远大于这个数量;4 温和性:是指酶所催化的化学反应一般是在较温和的条件下进行的;5 活性可调
ATP酶的反应机制
ATP酶与ATP水解反应耦合的转运是一个严格的化学反应，即每分子ATP水解能够使一定数量的溶液分子被转运。例如，对于钠钾ATP酶，每分子ATP水解能够使3个钠离子被运出细胞，同时2个钾离子被运入。跨膜ATP酶需要ATP水解所产生的能量，因为这些酶需要做功：它们逆著热力学上更容易发生的方向来进行物质运
酶切反应的建议
酶切反应建议一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则，即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常，一个50μl的反应体系中，1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶，则可相应缩短反应时间；如
酶的细胞化学反应的反应过程
酶细胞化学反应实际上就是孵育反应的过程，孵育液的成分主要有酶的底物、捕捉剂，保证孵育液pH的缓冲液以及有关的添加剂等。孵育的温度和时间可根据不同的酶和组织通过实验而确定。电镜酶细胞化学的样品在孵育反应后需经锇酸后固定、梯度乙醇脱水、环氧树脂包埋和超薄切片，至电镜下观察。
酶催化反应的过程催化反应
酶催化反应的过程催化反应分两步，首先酶（e）和底物（s）形成酶一底物复（络）合物（es），然后进行化学反应；生成的产物（p）从酶的活性部位解析下来，酶又可重新作用。2个过程都是可逆的，而且是在于定条件下处于动态平衡状态。 e+s→es→p＋e由于es的形成，使底物的反应键变形（或极化），并且被固定在
酶促反应一级反应与二级反应
酶促反应进程一般包括3个阶段：延滞期、线性期和非线性期。反应经过延滞期后，进入了酶促反应速率基本保持恒定的线性期。此时相对底物而言，为反应速率与底物浓度的零级反应，即反应不受底物浓度的影响，而只与酶活性浓度成正比。非线性期若为单底物的反应，则此时反应速率与单底物浓度的一次方成正比，为一级反应。如果反
系统挖掘中草药抗癌潜力
中科院昆明动物所黄京飞课题组在从传统中草药中发掘抗癌植物和化合物研究中取得进展。相关成果日前在线发表于《科学报告》杂志。 我国传统中药数据库记录了2000多种药用植物。但在传统中草药中，只有小部分药用植物被充分系统地研究过。 针对这一现状，黄京飞课题组首先建立了一个抗肿瘤药物
挖掘“不可用药”宝库
最近，Thomä和Ebert课题组探索了其他转录因子是否也可以通过类似的机制降解，在新发表于《Science》杂志的文章中，他们介绍了改性沙利度胺可以降解不同锌指转录因子，这是设计潜力药物的第一个步骤。图片来源于网络 大多数FDA批准小分子药物都是用来抑制生物催化化学反应的蛋白质机器“酶”的