天津工生所发布反应酶挖掘与评估平台
在代谢路径设计领域，寻找能够催化非天然反应的候选酶是具有挑战性的工作。虽然现有一些方法可以根据相似反应识别潜在酶，但在反应类型识别和后续酶筛选评估等方面存在不足，难以有效帮助实验科学家快速筛选候选酶进行实验验证。 近日，中国科学院天津工业生物技术研究所生物设计中心发布了集成的反应酶挖掘与评估平台——REME（https://reme.biodesign.ac.cn）。该平台结合底物原子到产物原子映射、原子类型变化识别和反应相似性计算，实现了相似反应的计算、快速排序和可视化。用户可以根据功能基团筛选相似反应，并进一步通过酶号或序列同源性筛选或扩展候选酶。REME平台结合多种人工智能方法对候选酶进行多角度评估，帮助科研人员迅速识别潜在酶。REME平台为非天然反应的酶挖掘和评估提供了新的解决方案。 相关研究成果发表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。研究工作得到国家自然科学基金、中国科学院战略性先......阅读全文
聚合酶链[式]反应
中文名称聚合酶链[式]反应英文名称polymerase chain reaction;PCR定 义通过DNA互补双链解链、退火和聚合延伸的多次循环来扩增DNA特定序列的方法。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞生物学技术（二级学科）
酶促反应的主要特性
普遍性1、酶与一般催化剂一样，只催化热力学允许的化学反应（即可逆反应）2、可以加快化学反应的速率，而不改变反应的平衡点，即不改变反应的平衡常数3、作用机理都是降低反应的活化能4、在反应前后，酶没有质和量的改变，且微量的酶便可发挥巨大的催化作用。特殊性但是酶也具有不同于其他催化剂的特殊性。在酶促反应中
脱氢酶的反应原理
大多数脱氢酶的天然受体是NAD+或NADP+〔以下用NAD（P）+表示〕，例如苹果酸脱氢酶，异柠檬酸脱氢酶等 。脱氢酶的底物经这类脱氢酶的催化使NAD（P）+还原生成NAD（P）H。另一些脱氢酶以黄素为辅基，辅基在催化反应中进行氧化还原。例如琥珀酸脱氢酶，还原型烟酰胺腺嘌岭二核苷酸（NADH）脱
酶促反应体系最适pH
pH可以影响酶与底物的亲和力，也影响酶的稳定。测定酶活性浓度时一定要选择在最适pH.多数酶的最适pH在5～8之间。最适pH时酶反应速度最大，测定灵敏度最高；要使pH值保持稳定在测定酶活性时要使用缓冲液。
酶促反应体系最适pH
pH可以影响酶与底物的亲和力，也影响酶的稳定。测定酶活性浓度时一定要选择在最适pH.多数酶的最适pH在5～8之间。最适pH时酶反应速度最大，测定灵敏度最高；医学教育|网搜集整理要使pH值保持稳定在测定酶活性时要使用缓冲液。
免疫多聚酶链反应
实验概要免疫多聚酶链反应(PCR)是一种抗原检测系统，将一段已知序列的DNA片段标记到抗原抗体复合物上，再用PCR方法将这段DNA扩增，然后用常规方法检测PCR产物。由于PCR具有强大的扩增能力，因而比常规的免疫学检测法，如ELISA和放射免疫测定(RIA)的敏感性提高好几个数量级。实验原理免疫PC
何谓连接酶链反应？
连接酶链反应(ligase chain reaction, LCR)属于一种探针扩增技术，是依赖靶核苷酸序列的寡核苷酸探针的连接技术。这种方法应用4种寡核苷酸探针(即两对互补的引物)，当它们在体外结合到靶序列上以后，用耐热DNA连接酶将它们连接起来。两条探针被连接上以后又可以作为新的模板。由于使
萤光素酶的生产反应
萤光生成反应通常分为以下两步：萤光素 +ATP→ 萤光素化腺苷酸（luciferyl adenylate） +PPi萤光素化腺苷酸 +O2→ 氧萤光素 +AMP+ 光这一反应非常节省能量，几乎所有输入反应的能量都被转化为光。与之形成鲜明对比的是人类使用的白炽灯，只有约10%的能量被转化为光，剩余的能
反向聚合酶链反应
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶，切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段，将切出的DNA区段环化，然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
酶促反应速率的公式
米氏方程（Michaelis-Menten equation）是表示一个酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程。
酶促反应的主要特性
普遍性1、酶与一般催化剂一样，只催化热力学允许的化学反应（即可逆反应）2、可以加快化学反应的速率，而不改变反应的平衡点，即不改变反应的平衡常数3、作用机理都是降低反应的活化能4、在反应前后，酶没有质和量的改变，且微量的酶便可发挥巨大的催化作用。特殊性但是酶也具有不同于其他催化剂的特殊性。在酶促反应中
关于复制酶的反应简介
对反应来说，Mg++是必要的，而且模板的特异性高，例如大肠杆菌Qβ噬菌体的酶只能以Qβ或类绿的噬菌体RNA为模板。反应生成物具有与模板完全相同的结构。反应分两个阶段进行，首先合成与模板 RNA（+链）有互补的核苷酸序列的RNA（-链），继之以此（—）链为模板合成（+）链。Qβ噬菌体的酶由一种来源
ATP酶的反应机制介绍
ATP酶与ATP水解反应耦合的转运是一个严格的化学反应，即每分子ATP水解能够使一定数量的溶液分子被转运。例如，对于钠钾ATP酶，每分子ATP水解能够使3个钠离子被运出细胞，同时2个钾离子被运入。 跨膜ATP酶需要ATP水解所产生的能量，因为这些酶需要做功：它们逆著热力学上更容易发生的方向来进
脱氢酶的反应原理
大多数脱氢酶的天然受体是NAD+或NADP+〔以下用NAD（P）+表示〕，例如苹果酸脱氢酶，异柠檬酸脱氢酶等 。脱氢酶的底物经这类脱氢酶的催化使NAD（P）+还原生成NAD（P）H。另一些脱氢酶以黄素为辅基，辅基在催化反应中进行氧化还原。例如琥珀酸脱氢酶，还原型烟酰胺腺嘌岭二核苷酸（NADH）脱氢酶
酶触反应的主要应用
它的原理是细菌在繁殖过程中可合成并释放某些特异性酶，按酶的特性，选用相应的底物和指示剂将这些其配制在相关的选择性培养基中，根据细菌培养后培基的颜色变化，确定待分离的可疑菌株。这种技术是将传统的细菌分离与生化反应有机的结合起来，这样有助于细菌的快速鉴定。 主要应用:
免疫多聚酶链反应
实验概要免疫多聚酶链反应(PCR)是一种抗原检测系统，将一段已知序列的DNA片段标记到抗原抗体复合物上，再用PCR方法将这段DNA扩增，然后用常规方法检测PCR产物。由于PCR具有强大的扩增能力，因而比常规的免疫学检测法，如ELISA和放射免疫测定(RIA)的敏感性提高好几个数量级。实验原理免疫PC
PCR－(多聚酶链反应)
【实验目的】掌握PCR技术的原理，学习PCR技术的基本方法，了解PCR技术的应用范围与意义。【实验原理】详见14章第2节。【实验对象】特定的DNA序列。【试剂与器材】引物(primer)，根据需扩增的DNA设计相应的引物；TagDNA聚合酶； 10×PCR缓冲液(随酶一起购买)；5mmol/L dN
木瓜酶与美拉德反应
纯木瓜蛋白酶是由212个氨基残基组成的单条肽链，相对分子量23406。木瓜蛋白酶制品可含有木瓜蛋白水解酶、木瓜凝乳酶和溶菌酶。是一种巯基蛋白酶，其专一性差！能分解比胰脏蛋白酶更多的蛋白质。木瓜凝乳酶相对分子量36000，约占可溶性蛋白酶的45%，溶菌酶相对分子量2500，约占可溶性蛋白酶的20%。木
酶促反应动力学
一、酶促反应1913年，Michaelis和Menten根据Henri等提出的酶-底物复合物学说，用简单的快速平衡或准平衡概念推导了单底物的酶促反应方程，即米-曼氏方程（Michaelis-Menten equation）。酶促反应可表示为：k1 k2 E + S ------------- ES
果胶酶的反应途径
果胶酶通过水解、反式消除和去酯化反应过程解聚果胶，分解将果胶中的羧基和甲基结合在一起的酯键。内聚半乳糖醛酸酶通过以下途径的反应进行：1,4-α-D-半乳糖醛酸)n+m+H2O=(1,4-α-D-半乳糖醛酸)n+(1,4-α-D-半乳糖醛酸)m
酶切反应注意事项
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则，即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常，一个50μl的反应体系中，1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶，则可相应缩短反应时间；如果减少酶的用
脱氢酶的反应原理
大多数脱氢酶的天然受体是NAD+或NADP+〔以下用NAD（P）+表示〕，例如苹果酸脱氢酶，异柠檬酸脱氢酶等 。脱氢酶的底物经这类脱氢酶的催化使NAD（P）+还原生成NAD（P）H。另一些脱氢酶以黄素为辅基，辅基在催化反应中进行氧化还原。例如琥珀酸脱氢酶，还原型烟酰胺腺嘌岭二核苷酸（NADH）脱氢酶
定量聚合酶链反应
中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定 义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应，对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞生物学技术（二级学科）
酶按反应性质的分类
根据酶所催化的反应性质的不同,将酶分成七大类:氧化还原酶类(oxidoreductase)促进底物进行氧化还原反应的酶类,是一类催化氧化还原反应的酶,可分为氧化酶和还原酶两类。转移酶类(transferases)催化底物之间进行某些基团(如乙酰基、甲基、氨基、磷酸基等)的转移或交换的酶类。例如,甲基
酶促反应动力学
一、酶促反应1913年，Michaelis和Menten根据Henri等提出的酶-底物复合物学说，用简单的快速平衡或准平衡概念推导了单底物的酶促反应方程，即米-曼氏方程（Michaelis-Menten equation）。酶促反应可表示为： k1 k2
酶促反应动力学
一、酶促反应1913年，Michaelis和Menten根据Henri等提出的酶-底物复合物学说，用简单的快速平衡或准平衡概念推导了单底物的酶促反应方程，即米-曼氏方程（Michaelis-Menten equation）。酶促反应可表示为： k
酶催化反应的特征
特征酶催化反应还表现出一种在非酶促反应中不常见到的特征，即可与底物饱和。当底物浓度增加时，酶反应速率达到平衡并接近一个最大值Vm（见图）。公式简介1913年L.迈克利斯和L.M.门顿发展了关于酶的作用和动力学的一般理论，假定酶E首先与底物S结合形成酶－底物复合物ES；然后此复合物在第二步反应中分解形
萤光素酶的反应机制
萤光生成反应通常分为以下两步：萤光素 +ATP→ 萤光素化腺苷酸（luciferyl adenylate） +PPi萤光素化腺苷酸 +O2→ 氧萤光素 +AMP+ 光这一反应非常节省能量，几乎所有输入反应的能量都被转化为光。与之形成鲜明对比的是人类使用的白炽灯，只有约10%的能量被转化为光，剩余的能
酪氨酸酶的反应方式
酪氨酸酶是一种氧化酶，且是调控黑色素生成的限速酶。这种酶参与黑色素合成的两个反应：第一步将单酚羟基化为二酚，第二步将邻二酚氧化为邻二醌。邻二醌再经过几步反应后就变为黑色素。酪氨酸酶是一种含铜的酶，存在于植物与动物组织中，催化生成由酪氨酸氧化而来的黑色素以及其它色素，如使剥皮或切片的马铃薯暴露在空气中
酶促反应动力学
一、酶促反应1913年，Michaelis和Menten根据Henri等提出的酶-底物复合物学说，用简单的快速平衡或准平衡概念推导了单底物的酶促反应方程，即米-曼氏方程（Michaelis-Menten equation）。酶促反应可表示为： k