真核基因组的特点—多基因家族的基本介绍
真核基因组的另一特点就是存在多基因家族(multi gene family)。多基因家族是指由某一祖先基因经过重复和变异所产生的一组基因。多基因家族大致可分为两类:一类是基因家族成簇地分布在某一条染色体上,它们可同时发挥作用,合成某些蛋白质,如组蛋白基因家族就成簇地集中在第7号染色体长臂3区2带到3区6带区域内;另一类是一个基因家族的不同成员成簇地分布不同染色体上,这些不同成员编码一组功能上紧密相关的蛋白质,如珠蛋白基因家族。在多基因家族中,某些成员并不产生有功能的基因产物,这些基因称为假基因(pseudo gene)。假基因与有功能的基因同源,原来可能也是有功能的基因,但由于缺失,倒位或点突变等,使这一基因失去活性,成为无功能基因。与相应的正常基因相比,假基因往往缺少正常基因的内含子,两侧有顺向重复序列。人们推测,假基因的来源之一,可能是基因经过转录后生成的RNA前体通过剪接失去内含子形成mRNA,如果mRNA经反复转录产......阅读全文
我国学者阐述CBL和CIPK基因家族互作产物间剂量平衡策略
重复基因可通过全基因组加倍、串联重复、逆转录转座等机制形成,为生物新功能和新性状的产生提供了原始遗传材料,通常被认为是进化的加速器。基因组加倍或多倍化,同时复制基因组中所有的基因,是重复基因的一个重要来源。多项研究表明,多倍化后重复基因的保留具有偏好性,且与基因的功能密切相关。特别是一些参与编码
哈医大获胃癌细胞增殖研究新进展
在一项题为《Cx基因参与胃癌细胞增殖和药物敏感性机制研究》的课题中,哈医大附属肿瘤医院内七科主任吴瑾教授等人通过多种先进实验手段证实:Cx基因具有抑制胃癌细胞增殖的能力,同时还能增加癌细胞对抗肿瘤药物的敏感性。此项成果近日获得了黑龙江省医药卫生科技进步二等奖及中国老年学会第二届学术大会成果奖。
两篇Nature子刊:测序为寄生虫病研究提速
今日,两个多国研究团队分别对几种疟原虫基因组进行了测序,得到了其基因组组成的清晰图谱,研究指出了根除这一寄生虫疾病面临的新挑战,也为疟疾药物和疫苗研发提供了初步的路线图。 间日疟原虫Plasmodium vivax (P. vivax)是除非洲以外最广为传播的引发人类疟疾的寄生虫
中国科学家成功破译飞蝗基因组图谱
1月14日,由中国科学院动物研究所康乐院士领衔, 深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究,成功破译了飞蝗(Locusta migratoria)的全基因组序列图谱,这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息,这项研究还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。研究成果
Cell子刊颠覆经典教条,癌症表观遗传有新说
由澳大利亚Garvan医学研究所Susan Clark教授领导的一个研究小组在新研究中揭示:前列腺癌中基因组的大片区域(约达到2%)受到了表观遗传调控激活。这一成果发表在12月13日的《癌细胞》(Cancer cell)杂志上。 激活区域包含许多前列腺癌特异基因,例如前列腺癌最常见
中外学者发布里程碑测序成果
最近,一个国际研究小组对烟草天蛾的基因组序列进行了测序,这种毛虫在许多实验室被用于昆虫生物学研究。 康奈尔大学Boyce Thompson研究所的Gary Blissard教授,和堪萨斯州立大学的Michael Kanost教授,启动了这项研究,并且是这个大的国际项目的共同资深作者,该项目包括
我国学者揭示RAFs和SnRK2s介导植物渗透胁迫早期应答过程
1月30日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心王鹏程和朱健康研究组合作的研究论文“A RAF-SnRK2 kinase cascade mediates early osmotic stre
深圳先进院建立高效解析植物糖基转移酶功能的方法
近日,中国科学院深圳先进技术研究院研究员赵乔团队于Molecular Plant在线发表了题为Glycosides-specific metabolomics combined with precursor isotopic labeling for characterizating plant
PCR之歌+PCR十大常用网站+结果图剖析(一)
PCR作为老生常谈的一种实验技术,对实验新手而言却仍是一个不小的挑战,比如引物的设计、预测脱靶效率、PCR中的疑难杂症等等,其中任何一个问题都会让他们头疼一阵了。而本文推荐的十个常用网站基本囊括了PCR全方位攻略,你想知道的都可以在这里找到答案。 1.Primer3 网址:http://prime
RACEPCR克隆基因的几点建议
摘 要: RACE是一种快速克隆cDNA末端的方法,目前, 该方法被广泛应用于未知碱基序列基因的克隆,尤其是SMART RACE技术更为人们所青睐。本文总结了我们实验室用SMART RACE技术克隆基因的一些心得体会,希望对用RACE方法克隆基因的同行有些帮助。关键词: RACE; RNA提取;
实质等同性(转录组学)实验(一)
实验材料 小麦试剂、试剂盒 β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index.
PCR常用优化策略
PCR过程中如果没有找到zui佳的扩增条件将会导致产生许多不确定的、不需要的产物,有时甚至没有目的产物;而在另一个极端,又可能没有扩增到任何产物。这时改变已知对引物-模板的忠实性和引物延伸有影响的诸多参数中的一两个,将会达到优化扩增的目的。其中zui主要的优化变量包括 Mg2+浓度、缓冲液pH值和
Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展
近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了
RACE的原理、应用和优缺点(二)
三、RACE 的应用 RACE技术主要是应用于对全长cDNA序列的获得,但对该技术进行一定的修改后,也可在其它方面显示出极高的应用价值。 首先,RACE技术可用于cDNA文库的构建及筛选。Belyavaasky等(1989)用10个骨髓瘤细胞分离的总RNA,通过TdT加同聚尾、(dT)
中国科学家成功破译树鼩基因组
2013年2月6日,中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树进行了全基因组测序,并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。树基因组的完成,将为其在生物医学研究中用作动物模型奠定重要的遗传学基础,进而使其更好的应用于生物医药研究。研究成果在《自然•通讯》(Nature Communi
RACE(rapidamplification-of-cDNA-ends)技术2
具体的实验步骤cDNA第一条链的合成:我们建议进行cDNA合成的对照反应,这样可以对样品的 cDNA的合成进行鉴定。加入各种试剂之后,在气浴中42度保温一个小时。注意: 在水浴或酒精浴中保温回减少反应体积,从而降低第一链的合成效率。将管放于冰上,以终止第一链的合成反应。直接进行第二链的合成。cDNA
RNA介导的基因沉默实验
实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体 DNA 模板 试剂、试剂盒d
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列
蛋白酪氨酸磷酸酯酶概述
T细胞活化中所发生的多种蛋白分子酪氨酸磷酸化提示必需有蛋白酪氨酸磷酸酯酶(protein tyrosine phosphatase,PTPase)来拮抗这种作用,通过负反馈来维持机体生理功能的平衡。PTPase基因是一个多基因家族,主要位于人第20号染色体上,不同来源的PTPase
实质等同性(转录组学)实验
实验材料小麦试剂、试剂盒β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index. htm
深部真菌感染主要病原真菌的致病机理研究进展
上海第二军医大学长征医院 廖万清 李秀丽现在机会性深部真菌感染的发病率急剧上升,你知道主要有哪些因素吗?自80年代以来,深部真菌感染的发病率在逐年上升,尤其是免疫抑制等高危患者的增加,以及耐药真菌和新出现真菌的日益普遍,显著改变了深部真菌感染的流行情况,如曲霉菌及其他霉菌的感染不断增加,非白念珠菌成
隐球菌病分子生物学研究进展
一、核酸提取技术的改进 进行分子生物学研究的前提是取得高数量和高质量的核酸,即DNA和RNA。由于隐球菌细胞壁外有一层厚厚的荚膜,为破除真菌细胞壁造成很大困难。可靠地提取隐球菌DNA的方法建立于20世纪80年代后期,研究者先后建立了玻璃珠方法、超声粉碎、液氮冷冻研磨等破壁技术。
实质等同性(转录组学)实验
实验材料:小麦 试剂、试剂盒:β-巯基乙醇 氯仿
隐球菌病分子生物学研究进展
一、核酸提取技术的改进进行分子生物学研究的前提是取得高数量和高质量的核酸,即DNA和RNA。由于隐球菌细胞壁外有一层厚厚的荚膜,为破除真菌细胞壁造成很大困难。可靠地提取隐球菌DNA的方法建立于20世纪80年代后期,研究者先后建立了玻璃珠方法、超声粉碎、液氮冷冻研磨等破壁技术。后来,发展酶学方法取代物
v隐球菌病分子生物学研究进展
分子生物学技术有助于从核酸水平研究隐球菌的流行病学和病原学特性,为隐球菌的诊断、治疗和预防提供分子依据。 一、核酸提取技术的改进 进行分子生物学研究的前提是取得高数量和高质量的核酸,即DNA和RNA。由于隐球菌细胞壁外有一层厚厚的荚膜,为破除真菌细胞壁造成很大困难。可靠地提取隐球菌DNA的方法建
关于PCR你了解多少?
实验原理 PCR是体外人工选择性扩增DNA的一种方法,它类似于生物体内DNA的复制。在生物体内DNA复制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而体外PCR反应同样需要类似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工设计的特定序列,实现对特
蛋白质组学在植物科学研究中的应用
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen