Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展

近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱,为油松独特适应性和发育研究、生殖生物学研究及基因组辅助育种进化和基因组学研究提供了重要参考。安诺优达深度参与了本次研究,包括PacBio三代测序、Hi-C辅助组装以及RNA-seq、WGBS等多组学测序及该基因组的组装、注释等研究。 油松染色体基因组组装和注释 研究者首先通过Illumina测序,对油松基因组大小进行评估,随后利用PacBio测序数据进行自校正和组装,成功构建出24.4 Gb(96.1%,12条染色体)的油松高质量的染色体水平基因组。 针叶树中的基......阅读全文

Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展

  近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者,华

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染

“六谷”丰登?——首个染色体水平基因组组装完成

中国菰    中国农科院供图        中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。    近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研

首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成

 紫云英       中国农科院供图近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装,并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白,为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成

科学家揭示“中国松”的基因密码

    油松基因组扩张的“单程票”和特异的演化风景 北京林业大学供图    内蒙古黑里河油松林 贾黎明摄    钮世辉(左)与研究生正在做实验 北京林业大学供图  “松柏本孤直,难为桃李颜。”“大雪压青松,青松挺且直。”古往今来,人们不乏对松树高直品格的赞美。  作为我国特有的乡土针叶树种,油松的生

“六谷”之一菰米首个染色体水平基因组组装完成

中国菰    中国农科院供图          中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。    近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水

研究发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展

  报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物,具有非常丰富的物种多样性和特有性,是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图  中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下,以报春苣苔属植物为材料,率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行

研究团队在铝氧轮簇组装研究取得进展

  核能在保证能源供应安全、调整能源结构等方面发挥着重要作用,而核废料(如放射性碘污染物)的回收引起了全球性关注。因此,明确放射性元素吸附位点,探究吸附作用机制具有重要的科学意义。  中国科学院福建物质结构研究所结构化学国家重点实验室研究员张健和方伟慧等首次报道了一系列由铝氧轮簇组装的介孔材料,并系

蓝相液晶精细结构组装研究取得进展

蓝相液晶(BPLCs)是以双扭柱结构为基本组装单元,自组装形成的三维立方晶格超材料,具有独特的手性光学、全向光子带隙与快速电光响应特性,在超快显示、可调谐激光器及集成光子学领域前景广阔。实现蓝相液晶在微纳尺度上的精确图案化、单畴控制及相态操纵,是将其优异光学性能转化为高性能光子器件的关键,然而传统方

遗传发育所在植物着丝粒形成及其表观遗传学研究中获进展

  植物着丝粒含有大量的重复序列和反转座子,结构复杂并受表观遗传学调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所韩方普研究组长期从事植物着丝粒的表观遗传学研究,曾在植物中首次发现着丝粒的失活现象并初步分析失活着丝粒的调控机制可能与DNA甲基化状态相关。由于着丝粒的特殊表观遗传学调控机制,植物着丝粒的DNA序

Cell:预防登革热疫苗研究中取得进展

  黄病毒是一种可通过蚊子等昆虫迅速传播的世界流行性病毒,而登革病毒(DENV,包括1-4四种血清亚型)及寨卡病毒(ZIKV)为主要病原,目前尚无有效疫苗,病人感染后可能触发名为“登革出血热”等可致死性症状,同时病毒还能引起包括中枢抑制、嗜睡、意识模糊、癫痫发作、脑膜炎、脊髓炎、脑炎或脑病等严重神经

太平洋潜泥蛤染色体水平基因组研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516537.shtm

Cell-Stem-Cell-|-连续取得进展!

  下丘脑含有惊人的异质性神经元,可调节内分泌,自主神经和行为功能。然而,其分子发育轨迹和神经元多样性的起源仍不清楚。2021年4月21日,中国科学院遗传与发育生物学研究所吴青峰团队在Cell Stem  在线发表题为“Cascade diversification directs generati

化学所在新型介质调控有序组装研究方面取得进展

  有序组装体的结构与功能调控是具有重要理论和实际意义的研究课题。传统组装一般在水或有机溶剂中进行,超临界流体是具有许多独特性质的新型介质和功能流体。在国家自然科学基金委、科技部和中国科学院的大力支持下,中国科学院化学研究所胶体、界面与化学热力学实验室研究员张建玲等科研人员在新型介质调控有序组装研究

蒲瓜基因组组装和果实生长发育调控研究获进展

广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与北京市农林科学院研究员左进华团队合作,在广东省农业科学院科技创新战略专项资金(高水平农科院建设)项目等的资助下,研究揭示了蒲瓜基因组组成和进化关系及果实生长发育的分子调控机制。相关成果近日在线发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。广

节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究获新进展

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与中国水稻研究所副研究员鲁宏伟合作,在节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究方面取得新进展。相关成果发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。节瓜A36基因组组装。研究团队供图节瓜属葫芦科冬瓜属冬瓜种,是华南特色蔬菜作物,其营养丰富,

-Cell-Sci:组织发育研究取得新进展

  英国科学家日前在对组织发育的认识上取得重要进展,并被认为对癌症研究具有重要意义。由东安格利亚大学的科学家取得的这一研究成果显示,EB2蛋白质是细胞内管状结构“微管”的一个关键调控因子,它对正常组织的发育和功能发挥至关重要。   科学家表示,这项研究成果是人们在寻找治愈肠癌、乳腺癌和胰腺癌等多种

遗传发育所在植物染色体分离和取向研究中取得进展

  染色体正确分离和精确的取向是保证生物体的发育、基因组的稳定及配子正确形成的前提。植物细胞有丝分裂在中期染色体形成双取向(bi-orientation),减数分裂I同源染色体配对形成二价体染色体的取向是单取向(mono-orientation),减数分裂II中期染色体形成类似有丝分裂的染色体取向。

研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律

  染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以

化学所纳米粒子精确图案化组装研究取得进展

  纳米粒子作为构筑精细结构和器件的基本材料单元,在光电器件等领域具有巨大的应用前景。因而纳米粒子的精确组装与图案化组装成为纳米科技研究领域的一个热点。  在国家自然科学基金委、科技部和中国科学院的大力支持下,中国科学院化学研究所绿色印刷重点实验室和有机固体重点实验室的科研人员在纳米粒子制备、组装和

化学所在二维材料自组装研究中取得进展

  二维过渡金属二硫族化合物(TMDs),由于量子限域效应,展示了许多与其块体材料不同的光、电、磁性质。具有本征带隙的二维TMDs,作为零带隙石墨烯材料的互补材料,为新型场效应晶体管与光电器件提供了新的可能。最近关注的焦点集中于它们本征的或者平面异质结结构的制备及其性质、应用的研究,尤其是在二维尺度

研究发现激光热效应组装柔性纤维器件取得进展

  近年来,基于多功能纤维材料科技的快速发展,更多种类的纤维具备了传感、光电转换、能量收集及储存等功能。随着对织物类可穿戴电子产品需求的不断增加,多功能纤维状器件与智能纤维织物为其提供了一种新的解决方案。但目前柔性纤维内部各种功能材料的精确高效定位、连接与组装等难题,阻碍了纤维器件的大规模应用。  

DNA蛋白质多级可控组装研究中取得进展

  生物大分子在自然进化中发展出一套独特的“自下而上”自组装方式进行各种复合结构的可控装配,为多功能生物纳米材料的加工制备提供了绝佳范例。其中,核酸-蛋白质纳米复合体系的可控构筑,不仅将实现生物学上两种基本组装模式的有效结合,以提供愈加复杂的生物结构模板,还有助于体内生物大分子相互作用的深入理解,对

遗传发育所在纺锤体组装研究中取得重要进展

  在细胞分裂过程中纺锤丝与着丝粒起初会以随机方式相连接,使得前中期存在许多错误的连接方式。比如一个着丝粒同时受到来自相反方向的纺锤丝牵引,这种现象被称作merotelic连接。如果这些错误的连接不被纠正,将会导致着丝粒间的拉力异常,引起染色体的不同步分离。因此,真核生物采用了一种监控机制来延迟染色

细胞器基因组组装软件开发研究获进展

  真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体(包括叶绿体、白色体等)的全部DNA分子,是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内,有多个(甚至成千上万个)细胞器基因组单元的拷贝,使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展,测序成本下降,低

染色体水平冬瓜参考基因组发布

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基

小麦基因组编辑抗病育种研究取得进展

民为国基,谷为民命。粮食安全是国家安全的重要基础,是关乎国运民生和社会稳定的头等大事。植物病害每年造成全球作物减产可达30%,全球气候变化、耕作制度改变及种植品种单一化等多种因素的叠加,致使植物病害更加频繁发生,严重威胁全球和我国粮食安全。选育和推广抗病新品种是防治作物病害经济、有效和环境友好的策略

科学团队研究组装无患子染色体级别高质量基因组

近日,中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队在《经济作物和产品》(Industrial Crops & Products)上发表了研究论文。该研究组装了无患子的染色体级别高质量基因组,分析挖掘了油脂合成候选基因,开发验证了一套特异分子标记,为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价