两篇Nature子刊：测序为寄生虫病研究提速
今日，两个多国研究团队分别对几种疟原虫基因组进行了测序，得到了其基因组组成的清晰图谱，研究指出了根除这一寄生虫疾病面临的新挑战，也为疟疾药物和疫苗研发提供了初步的路线图。 间日疟原虫Plasmodium vivax (P. vivax)是除非洲以外最广为传播的引发人类疟疾的寄生虫，而食蟹猴疟原虫Plasmodium cynomolgi (P. cynomolgi)是P. vivax近亲，它感染亚洲的旧大陆猴。研究人员分别对这两种疟原虫进行了基因组分析，文章均发表在这两项研究均发表在Nature Genetics杂志上。 “坏消息是间日疟原虫P. vivax基因组中存在的突变比我们预想的要多得多，这使其更容易规避我们使用的药物和疫苗武器，”两篇文章共同的资深作者，纽约大学基因组和系统生物学的Jane Carlton教授说。“不过，现在我们也对自己所面临的风险更加了解，可以更深入分析间日疟原......阅读全文
对疟原虫的单细胞基因组测序
美国圣安东尼奥，2014年5月8日——美国德克萨斯生物医学研究所的科研人员和他们的同事开发出了一种分离单个疟原虫细胞然后对其基因组测序的新方法。这一进展将让科学家能够改进他们识别病人感染的多种类型的疟原虫的能力，而且还可带来最佳的经设计的药物何疫苗以应对这种主要的全球性杀手。疟疾仍然是全世界最致
两篇Nature子刊：测序为寄生虫病研究提速
今日，两个多国研究团队分别对几种疟原虫基因组进行了测序，得到了其基因组组成的清晰图谱，研究指出了根除这一寄生虫疾病面临的新挑战，也为疟疾药物和疫苗研发提供了初步的路线图。 间日疟原虫Plasmodium vivax (P. vivax)是除非洲以外最广为传播的引发人类疟疾的寄生虫
寄生虫全基因组测序:为寄生虫疾病提供新的解决方案
我们一直没什么办法研究顶复门寄生虫所有基因的功能，”Whitehead研究所的Sebastian Lourido说。“现在我们找到了一个好方法。这种方法可以研究寄生虫的各种问题，从获取营养、应答免疫压力到遗传学互作，是相关领域的一次重要飞跃。”弓形虫（Toxoplasma gondii）是一种寄生在
关于恶性疟原虫的破译遗传密码概述
10月3号Nature杂志发表了对恶性疟原虫的基因组分析的论文并与啮齿目动物疟疾寄生虫约氏疟原虫（P.yoeliiyoelii）的基因组做比较。这是一个重要的里程碑，标志着人类已经破解了致死性最高的致病寄生虫的复杂的遗传密码。 对恶性疟原虫的基因组进行测序花费了6年的时间。疟原虫的遗传密码如此
寄生虫感染的免疫检测之疟原虫感染
1.抗原检测：常采用放射免疫试验和固相放射免疫抑制试验检测受感染红细胞内的疟原虫抗原，主要用于恶性疟疾的诊断。 2.抗体检测 ①间接荧光抗体试验： 是目前国内外应用最为广泛的一种检测方法。一般认为受检测血清阳性在1:20以上才有意义。 ②间接红细胞凝集试验： 这种方法测定的抗体只有属特
Cell子刊：甲基化暴露疟原虫致命弱点
说到疟疾大多数人想到的只是蚊子，其实疟原虫才是罪魁祸首，蚊子只是携带者。2010年，全球有两亿多人受到疟原虫的感染，其中约六十六万人死亡。更令人头疼的是，这种寄生虫对青蒿素也显示出了抗性，青蒿素曾是治疗感染者的最有效药物。 现在，加州大学的研究人员发现了疟原虫的潜在弱点。研究显示，基因组中
Nature人物：爱好研究和潜水的寄生虫学家
利用模式生物进行遗传杂交是一种基本实验室操作，“在小鼠中很容易完成这种操作，但是在病原体寄生虫中这几乎就是不可能完成的任务，”来自美国西雅图传染性疾病研究中心（CIDR）的寄生虫学家Stefan Kappe说，Kappe主要从事恶性疟原虫的研究，同时他从教于华盛顿大学全球健康学院。 Kappe
科学家阐释疟疾如何“走出非洲”
由间日疟原虫引起的疟疾感染了亚洲人和美洲人。图片来源：Xinhua/eyevine/Redux 本报讯 间日疟原虫并不像它的致命近亲恶性疟原虫那样为人所知，后者在撒哈拉以南非洲地区占据着主导地位。但是这种在非洲很少见的“其他疟疾”每年却在亚洲和美洲导致约7500万人患病。如今，新的遗传学证
科学家阐释疟疾如何“走出非洲”
间日疟原虫并不像它的致命近亲恶性疟原虫那样为人所知，后者在撒哈拉以南非洲地区占据着主导地位。但是这种在非洲很少见的“其他疟疾”每年却在亚洲和美洲导致约7500万人患病。如今，新的遗传学证据揭示了这种寄生虫是如何登上历史舞台的，即它们在非洲感染了类人猿和人类，随后搭着早期人类迁移的便车离开了这块大
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
近期最热门的基因组测序成果
生物通报道：The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。 种属：甜瓜（Cucumis melo） 西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分
科学家测序脑寄生虫基因
近日，《卫报》报道称，英国研究人员测序了一种“罕见”寄生虫的基因序列。这种寄生虫在一名男子的大脑中生活了4年时间。这种名为猬迭宫绦虫的寄生虫通常寄居在甲壳类动物和两栖动物身上，很少感染人类。这是英国首次记录的人感染猬迭宫绦虫病例。研究人员怀疑该患者是在旅行中感染了这种寄生虫。 在4年里，这条1
疟疾细胞图谱，极大加快疟疾研究和疗法开发
疟原虫是疟疾的致病因子，是具有不同形态发育阶段的单细胞生物，每个阶段都专门生活在极其不同的环境和宿主细胞类型中。这种形态多样性的基础是对它的紧凑基因组的严格调控，不过大约40％基因的功能仍然未知，这阻碍了有效药物和疫苗开发的速度。单细胞RNA测序（scRNA-seq）允许构建发育过程、细胞多样性
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
绘测疟原虫在整个生命周期中的转录物组
研究人员报告称，他们利用单细胞RNA测序创建了第一个全面且具高分辨率的致疟寄生虫在其整个复杂生命周期中的转录图谱：疟疾细胞图谱。该研究的结果揭示了该寄生虫基因功能和调控的新线索，它同时也为研究涉及多种疟原虫物种的致疟寄生虫以及新药研发和抗感染策略提供了一个宝贵的可开放性获取的新型参考数据集。疟
Cell：CRISPR/Cas9再获重要突破
Whitehead研究所的科学家们首次对顶复门（Apicomplexa）生物进行了全基因组筛选。这项重要的研究成果于九月二日发表在Cell杂志上。顶复门的单细胞寄生虫会引起疟疾、巴贝斯虫病、隐孢子虫病和弓形虫病，但我们对这些家伙还知之甚少。 “我们一直没什么办法研究顶复门寄生虫所有基因的功能，
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器，于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库，从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道，以节约试剂用量。
PNAS：甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值，日前西班牙的九个研究中心通力合作，利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组，科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组，文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
认识泛基因组测序
什么是泛基因组？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念（pangenome，pan源自希腊语‘παν’，全部的意思），泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年，Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接，发现了个体独有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
关于全基因组测序的测序指标介绍
一、全基因组测序的测序指标— 深度 测序深度（Sequencing depth）是指测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体，如果采用的是双末端或Ma
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
研究发现疟原虫躲避人体免疫系统新线索
美国一项新研究发现，恶性疟原虫可通过关闭自身关键基因等方式，使其长时间不被人体免疫系统发现。该研究成果或为解决疟疾的慢性无症状感染问题提供新思路。 疟疾是一种由疟原虫引起、可通过蚊子叮咬传播给人类的严重传染病。美国康奈尔大学韦尔医学院等机构的研究人员近期在英国学术期刊《自然-微生物学》上发表论
厦大苏新专教授联手王荣福教授mBio发表疟疾研究成果
生物通报道：近期，来自厦门大学、休斯敦卫理公会研究所、美国国家过敏与感染性疾病研究院和康奈尔大学等处的研究人员证实，FOSL1可通过阻断TBK1和TRAF3/TRIF之间的相互作用，抑制I型干扰素对疟疾和病毒感染的反应。相关研究结果发表在1月3日的《mBio》杂志。 厦门大学“长江学者”讲座教
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部（DOE）与美国国家卫生研究院（NIH），分别在1986年与1987年加入人类基
基因组测序的具体过程
讲起来很复杂哈，简单来说，就是边合成边测序，把所要测序的序列通过各种手段来建库，然后加上5‘和3’都加上接头，放在一个小玻璃片一样的芯片上，上面一般是8个lane，把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合（之前的建库时加的接头与之反向互补），然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇，然
Nature完成桉树基因组测序
一个横跨五大洲的科学团队宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成，巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。 巨桉生长速度快，可以用作燃料和木材，是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东
简化基因组测序好做吗
简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度，进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD（Restriction site Associated DNA）和GBS（Genotyping By Sequencing）。这些技